Actualités
Deuxièmes Rencontres R, Lyon, 27-28 juin 2013 (juin 2013)
Dans la lignée de la conférence internationale Use’R et suite à la première édition qui a eu lieu à Bordeaux les 2 et 3 juillet 2012, les Deuxièmes Rencontres R auront lieu les 27 et 28 juin 2013 à Lyon (http://r2013-lyon.sciencesconf.org).
L’esprit de ces rencontres est de fournir à l’échelle nationale un lieu d’échange et de partage d’idées sur l’usage du logiciel R dans différentes disciplines (visualisation et graphiques, statistique appliquée, biostatistique, statistique bayésienne, bioinformatique, (…)
13-15 mai 2013 : SBIP 2013 -Systems Biology Approach to Infectious Processes (mai 2013)
Dans le cadre du programme thématique "Mathematical Biology " le laboratoire participe à l’organisation de la conférence SBIP 2013, sur le campus de la Doua, Villeurbanne, du 13 au 15 mai 2013.
Inscription gratuite mais obligatoire via le site web de la conférence.
Le réchauffement climatique ne fait pas les affaires de la marmotte alpine ! (avril 2013)
La couverture du dernier numéro d’Ecology est consacrée à un article co-écrit par des membres du département Ecologie Evolutive et traitant de l’effet du réchauffement climatique sur une population de marmottes.
En milieu montagnard, le changement climatique se traduit par un déneigement plus précoce mais il s’accompagne aussi d’une diminution régulière de la couverture neigeuse hivernale et d’une augmentation des épisodes de froid. L’effet défavorable des changements hivernaux, qui se manifeste par un (…)
Dominique Mouchiroud à l’honneur. (avril 2013)
Dominique Mouchiroud, professeure à l’Université Claude Bernard Lyon 1, directrice de l’UMR CNRS 5558 - LBBE "Biométrie et Biologie Évolutive", vient d’être nommée Chevalier dans l’Ordre National de la Légion d’Honneur (promotion du 30 mars 2013), sur proposition du Ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche.
Le LBBE recrute un maître de conférences en modélisation à l’interface entre la génétique et l’écologie évolutives. (avril 2013)
L’IUT de biologie de Lyon1 propose au concours 2013 un poste de maître de conférences dont la partie enseignement s’effectuera à l’IUT et la partie recherche dans le laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (UMR CNRS 5558) de Lyon1, département d’Ecologie Evolutive.
Le profil recherché est un(e) théoricien(ne) qui travaillera sur une approche de modélisation à l’interface de l’écologie et de la génétique évolutive (pour davantage de détail : cf profil ci-dessous).
Le(la) candidat(e) intégrera (…)
Dans la forêt de Chizé, les chevreuils sous étroite surveillance (avril 2013)
Le journal "Le Monde" relate une session de capture de chevreuils dans la forêt de Chizé à laquelle participaient plusieurs membres du laboratoire dont Christophe Bonenfant.
La zone atelier de Hwange sur France 2 (mars 2013)
Dans le cadre de "Grandeurs Nature", France 2 diffuse dimanche 24 mars à 16h25 le documentaire "J’ai marché sur la terre : au Zimbabwe". Ce film de 52 minutes est consacré à la zone atelier de Hwange où des scientifiques français étudient les relations complexes entre les éléphants, de plus en plus nombreux, les autres herbivores et leurs prédateurs.
Il est possible de revoir cette émission à (…)
Décès de Roland Allemand (mars 2013)
Roland Allemand, chercheur CNRS au LBBE nous a quitté le 8 mars des suites d’une longue maladie.
Tous les membres du LBBE qui l’ont côtoyé durant toutes ces années n’oublieront pas ses grandes qualités humaines, l’attention qu’il savait porter à chacun, ses conseils avisés et son humour discret ainsi que sa passion pour les insectes qu’il faisait partager à l’ensemble de la communauté scientifique mais également au grand public.
Ses funérailles auront lieu mercredi 13 mars à 14h45 à l’église du (…)
Le hasard et le monde vivant (février 2013)
Alain Pavé sera l’un de deux invités de l’émission la tête au carré de France Inter, mardi 26 février 2013 à 14h. Le sujet est Le hasard et le monde vivant.
Relation entre diversité des communautés bactériennes du sol et diversité environnementale (février 2013)
Le déterminisme spatial et les différentes échelles de variation de la distribution de la diversité des macro-organismes ont été mis en évidence depuis plus d’un siècle. Pour les micro-organismes par contre, et en particulier pour les bactéries du sol, cette question fondamentale nécessite des recherches plus approfondies, car peu d’informations ont été publiées à ce jour sur ce sujet. En appliquant la théorie de la relation aire-espèce au plus grand échantillon de sol spatialement référencé disponible en (…)
XACT, un ARN non-codant généré par le chromosome X de l’Homme (février 2013)
Un long ARN non-codant susceptible de contrôler l’activité du chromosome X humain dans un contexte embryonnaire vient d’être mis au jour par l’équipe de Claire Rougeulle au Centre épigénétique et destin cellulaire (CNRS/Université Paris Diderot). Cette découverte publiée dans Nature Genetics en association avec le Laboratoire de biométrie et biologie évolutive (CNRS/Université Lyon 1) et l’Institut André Lwoff (CNRS/Inserm/Université Paris Sud) devrait avoir un impact majeur, non seulement dans le (…)
Rencontre ALPHY 2013 - Mercredi 6 - Jeudi 7 février 2013 - Villeurbanne - Campus de la Doua (février 2013)
Les rencontres Alphy sont un colloque national annuel qui a lieu depuis 15 ans autour des mots clés Alignement, Phylogénie, Génomique Comparative et Bioinformatique. L’idée est de favoriser les échanges informels dans un champ fortement interdisciplinaire, et, notamment, de permettre aux jeunes chercheurs du domaine de s’exprimer.
Comme chaque année, la réunion se tiendra sur deux jours, et comprendra deux exposés longs invités (Philippe Deschamps et Matthieu Legendre) et 15 à 20 exposés de 20 minutes (…)
Le Label MBE Citation Classic pour un article du LBBE (janvier 2013)
L’article SeaView version 4 : A multiplatform graphical user interface for sequence alignment and phylogenetic tree building - Manolo Gouy, Stéphane Guindon and Olivier Gascuel Mol Biol Evol (2010) 27 (2) : 221-224 (324 citations) a obtenu le label "MBE Citation Classic
http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/1/3.full
La zone atelier de Hwange à l’honneur (janvier 2013)
L’année 2013 voit les Zones Ateliers misent en valeur en tant que dispositif innovant de l’INEE. A cette occasion, l’INEE a organisé une visite de presse sur la Zone Atelier Hwange (Zimbabwe), en fin d’année 2012 et fait sa ’une’ sur cet événement (voir).
Cette information a été largement reprise dans la presse généraliste via plusieurs brèves issues de l’AFP (cf. liste ci-après), dans le cahier Sciences des Echos ( reportage de Yann Verdo) , ou encore dans deux grands reportages diffusés sur RFI (…)
SMPGD 2013 - 24-25 janvier 2013, VU University-Amsterdam (janvier 2013)
Le LBBE est coorganisateur du meeting Statistical Methods for (post-) Genomics Data (SMPGD) qui se tiendra les 24 et 25 janvier 2013 sur le campus de la VU University à Amsterdam http://www.smpgd2013.nl/
Modélisation dans le développement du médicament - 10-11 décembre 2012 (décembre 2012)
L’équipe EMET (Evaluation et Modélisation des Effets Thérapeutiques) organise un séminaire : « Modélisation dans le développement du médicament » qui aura lieu à l’université Claude Bernard Lyon 1 au Domaine de la Buire (Laennec) dans Bâtiment A (Amphithéâtre A4) le 10 et le 11 décembre 2012.
Pour plus de renseignements, veuillez vous connecter sur le site internet du master EUDIPHARM : (…)
Séminaire DIPEE - Ecologie et Société - 30 novembre 2012 (novembre 2012)
Les quatre UMR du DIspositifs de Partenariat en Écologie et Environnement de Lyon (5600 EVS, 5023 LEHNA, 5557 Écologie microbienne et 5558 LBBE) organisent un séminaire commun sur le thème "Écologie & Société" dans le but de susciter des interactions interdisciplinaires. Cette journée vise à présenter des regards disciplinaires croisés (géographie, écologie, mathématiques…) sur des thématiques de recherche susceptibles de fédérer les laboratoires.
Date limite appel à communication : 30 septembre 2012 (…)
Axe méthodologique — 29 novembre 14h (novembre 2012)
La prochaine scéance de l’axe méthodo sera consacrée à la présentation de librairies R développées au laboratoire.
Elle aura lieu en salle de formation PRABI, le jeudi 29 de 14h à 17h. Contact : anne-beatrice.dufour@univ-lyon1.fr
Programme détaillé :
- F. Picard : cghseg Analyse de données de microarrays CGH par des méthodes de segmentation.
- F. Picard : curvclust Analyse de données fonctionnelles : modèles fonctionnels à effets mixtes, classifications de courbes, avec des techniques d’ondelettes.
- (…)
Le prix "La Recherche" 2012 attribué à Mathieu Groussin et Manolo Gouy (novembre 2012)
Le mardi 23 Octobre 2012, Mathieu Groussin et Manolo Gouy de l’équipe Bioinformatique et Génomique Évolutive ont reçu le prix La Recherche 2012 mention « Biologie » pour leur travail publié en 2011 dans la revue Molecular Biology and Evolution concernant l’adaptation des Archées, un des trois grands domaines du vivant, à leur température environnementale (Adaptation to Environmental Temperature is a Major Determinant of Evolutionary Rates in Archaea).
Dans ce papier, les auteurs ont reconstruit (…)
GDRE "Comparative Genomics" - 22 et 23 novembre 2012 (novembre 2012)
La prochaine réunion du GDRE "Comparative Genomics" aura lieu le 22 et 23 novembre 2012 à l’Amphi de la Délégation du CNRS. Cette année, nous aurons plusieurs invités qui nous parlerons de "Comparative Epigenomics".
Christoph Grunau (Perpignan) Frank Johannes (Netherlands) Oliver Bossdorf (Switzerland) Eduardo Eyras (Barcelona) Denis Tagu (Rennes)
Le programme est disponible sur le site http://gdrera.univ-lyon1.fr/
L’inscription est gratuite et fortement appréciée. Nous comptons sur votre (…)
Carlos Bernstein - Lauréat du prix RAICES (octobre 2012)
Le 23 novembre, le Ministre des "Sciences, Technologie et Innovation" d’Argentine remettra à Carlos Bernstein, Directeur de Recherche émérite (CNRS) au LBBE le prix RAICES ("Racines"). Ce prix récompense les personnalités scientifiques d’origine Argentine qui, à l’étranger, œuvrent pour le développement des collaborations scientifiques et le rayonnement de la Science en Argentine
14 novembre 2012 - Journée de l’axe "Modélisation et SHS" de l’ARC Environnement (octobre 2012)
L’Axe “Modélisation et SHS” de l’ARC Environnement de la région Rhône-Alpes organise une journée ouverte de rencontres et d’échanges scientifiques sur le thème de la Directive cadre EAU. Mercredi 14 novembre, Institut des Sciences de l’Homme, Lyon
Contact : sandrine.charles@univ-lyon1.fr
Centre d’Eté Mathématique de Recherche Avancée en Calcul Scientifique 2012 : Méthodes numériques et algorithmes pour architectures pétaflopiques (août 2012)
Vincent Miele, ingénieur de recherche au LBBE fait partie du comité d’organisation de l’édition 2012 du CEMRACS (Centre d’Eté Mathématique de Recherche Avancée en CalculScientifique) qui se tient à Marseille du 16 juillet au 24 août 2012 au CIMR.
Pour plus d’informations http://smai.emath.fr/cemracs/cemracs12/
61ème conférence de la Wildlife Disease Association / 10ème conférence biennale de la European Wildlife Disease Association (juillet 2012)
La 61ème conférence de la Wildlife Disease Association et la 10ème conférence biennale de la European Wildlife Disease Association seront organisées conjointement à Lyon (France) du dimanche 22 Juillet au vendredi 27 Juillet 2012. Le thème de la conférence sera « convergence en faune sauvage ». Le comité d’organisation et le comité scientifique incluent des membres du laboratoire et souhaitent réunir des experts de la santé de la faune sauvage d’horizons et d’expertise très variés.
Les workshops auront (…)
Atelier de travail : la notion de modèle (juillet 2012)
Jean-Sébastien Bolduc et Pascal Maire organisent le lundi 2 juillet, 9h, en salle de formation, un atelier sur la notion de modèle. Les membres du laboratoire qui souhaitent contribuer aux échanges et partager leur expérience sont bienvenus ; tout comme celles et ceux qui souhaiteraient prendre part à un projet de réflexion sur la modélisation et la notion de modèle. Avec les interventions ( de 9h30 à 12h30) de P. Maire, E. Desouhant, O. Perru, J-P.Flandrois et G. Carret.
Contact : Pascal Maire ou (…)
Rencontre APPLIBUGS (juin 2012)
Le 26 juin 2012 se tiendra à Lyon la prochaine rencontre APPLIBUGS (Applications du Bayesian Unified Group of Statisticians) de 9h30 à 16h35 en salle de conférences de la bibliothèque universitaire, campus de la Doua.
http://w3.jouy.inra.fr/unites/miaj/public/matrisq/Contacts/applibugs.rencontres.html
Cette journée est soutenue par la Faculté des Sciences et Technologies de l’Université Lyon 1.
Au programme de cette journée :
Fabien Subtil (LBBE, Lyon)
Anne Sabourin (LSCE, Saclay et LCJ, Lyon) (…)
Céline Brochier nommée membre junior de l’IUF (juin 2012)
Céline Brochier Professeur des Universités au LBBE) vient d’être nommée membre junior de l’IUF. Sa thématique de recherche est l’étude de l’évolution ancienne, et plus précisément la période évolutive ayant vu l’émergence et la diversification des trois domaines du vivant (Archaea, Eucarya et Bacteria). Elle aborde cette problématique au travers des axes : (1) l’inférence des relations de parentés entre les organismes et (2) la reconstruction de l’histoire évolutive des systèmes et processus (…)
Workshop Lyon 14 juin : présentation du package R Pmetrics pour la modélisation en pharmacologie (juin 2012)
L’Equipe Evaluation et Modélisation de Effets Thérapeutiques de l’UMR CNRS 5558 (Pr. F Gueyffier) et le service pharmaceutique du Groupement Hospitalier de Gériatrie des Hospices Civils de Lyon (Dr. P Maire) organise un atelier à l’occasion de la venue à Lyon du Pr. Roger Jelliffe et du Dr. Michael Neely du Laboratory of Applied Pharmacokinetics (University of Southern California, Los Angeles) Le workshop est une introduction à l’utilisation de Pmetrics, un package R pour la modélisation (…)
Journée Biodiversité et Bioinformatique (juin 2012)
Vendredi 8 juin 2012, Villeurbanne - Campus de la Doua.
Date limite d’inscription : 20 mai 2012
http://lbbe.univ-lyon1.fr/jbb/
Les développements récents des techniques de séquençage ouvrent de perspectives immenses dans les domaines de l’écologie et de l’évolution, mais soulèvent également des problèmes méthodologiques très importants. Nous organisons à Villeurbanne la 3ème édition de la journée "Biodiversité et Bioinformatique". Les objectifs de ce colloque sont de réunir les chercheurs à l’interface entre bioinformatique, modélisation et écologie ou (…)
PRACE - 571 années de calcul allouées au LBBE sur le supercalculateur CURIE (mai 2012)
Le projet "Thousands of trees for 4 billion years of life evolution on Earth" proposé par Bastien Boussau et collègues a été sélectionné lors du 4è appel à projet européen PRACE [http://www.prace-project.eu/] (consortium fédérant les 3 plus puissants supercalculateurs européens).
Ainsi, le LBBE se voit alloué 5.000.000 heures de calcul (soit 571 années) sur le nouveau supercalculateur français CURIE [http://www-hpc.cea.fr/fr/complexe/tgcc-curie.htm] (installé au Très Grand Centre de Calcul du CEA à (…)
Médaille de Bronze du CNRS pour Gabriel Marais (mai 2012)
Gabriel Marais, chargé de recherche CNRS au LBBE et membre de l’équipe Bioinformatique et Génomique Evolutive est lauréat de la médaille de bronze du CNRS pour l’année 2012.
7ème Symposium de Morphométrie et Evolution des Formes (mai 2012)
Le 7ème Symposium de Morphométrie et Evolution des Formes se tiendra à l’Université Lyon 1, sur le site de la Doua à Villeurbanne les 24 et 25 mai 2012.
Ce symposium rassemble celles et ceux qui mobilisent des outils de quantification des formes biologiques pour l’étude de l’évolution sous ses différentes facettes : biologie évolutive, écologie, biologie du développement, archéologie, paléontologie… Ce symposium est ouvert à tous, après inscription et dans la limite des places disponibles. Les (…)
EPICLIN - Journée des Statisticiens des CLCC - 9-11 mai 2012 (mai 2012)
Plusieurs membres du LBBE organisent La 6e Conférence Francophone "Epidémiologie Clinique - EPICLIN6" associée aux 19e Journée des Statisticiens des Centres de Lutte contre le Cancer qui se tiendra à Lyon du 9 au 11 mai 2012 à l’Ecole Normale Supérieure de Lyon (ENS).
Les 4 demi-journées seront consacrées aux Actualités Méthodologiques en Recherche Clinique.
Le programme détaillé du congrès, l’appel à communications et les modalités d’inscription se trouvent sur le site de la Plate-forme d’Aide à la (…)
Décès du Pr Jean Marie Legay (avril 2012)
Le LBBE a la très grande tristesse de vous faire part du décès du Professeur Jean Marie Legay survenu dimanche 8 Avril à l’âge de 87 ans. Illustre membre de notre UMR et de l’Université Lyon 1, le professeur Jean Marie Legay a été le fondateur de l’école lyonnaise des recherches effectuées sur les populations naturelles animales, végétales et humaines, en y associant le développement d’outils mathématiques et statistiques. Cette école lyonnaise de Biométrie s’est concrétisée par la création d’une Unité (…)
Attention Reporté : Axe Méthodologique : présentation des libraires R développées au LBBE (avril 2012)
Report dans les 15 premiers jours de juin
L’axe Méthodologique se réunira jeudi 26 avril à 14h, salle de formation du PRABI, pour présenter les différents paquets R développés au laboratoire. Venez nombreux !
Contact : Anne-Béatrice Dufour
Statistiques et enseignement : le LBBE à l’honneur (avril 2012)
Anne-Béatrice Dufour est conférencière invitée au CFIES 2012, colloque francophone international sur l’enseignement de la statistique, qui se déroulera à Angers du 12 au 14 septembre de cette année. Elle est invitée à parler des liens entre l’analyse de données, l’enseignement et le logiciel R et y confèrera avec d’autres grands noms du domaine, comme R. Sabatier et Y. Saint-Pierre.
Elle a également été sollicitée par Marthe-Aline Jutant, Présidente du groupe Enseignement de la Société Française de (…)
Le transfert horizontal de gènes éclaire l’arbre de la vie (avril 2012)
Un article du LBBE dans PNAS
Les Bactéries et les Archées intègrent de l’ADN étranger dans leurs génomes par le phénomène connu sous le nom de transfert horizontal de gènes. Maintenant largement accepté comme un facteur clé de l’évolution procaryote, ces transferts posent aux biologistes évolutionnistes un problème fondamental : sont-ils compatibles avec une représentation des relations entre espèces sous forme de l’arbre du vivant ? Sophie Abby et al. (pp. 4962-4967) ont cherché à savoir si ces transferts brouillent l’information dans (…)
Demi journée du département BioMaths-Santé (avril 2012)
La demi journée du département BioMaths-Santé aura lieu le mardi 24 avril de 8h30 à 13h00 - Salle de Conférence de la Bibliothèque à la Doua Ci-dessous le programme de cette demi journée.
Evolution des chromosomes sexuels humains : le X à la rescousse du Y. (avril 2012)
Eugénie Pessia, Marc Bailly-Bechet et Gabriel Marais viennent de publier un article dans la revue PNAS sur l’évolution des chromosomes sexuels humains. La dégénérescence de gènes sur le chromosome Y amène à un sous-dosage des gènes liés au sexe chez les mâles. Un mécanisme appelé « compensation de dosage sur le chromosome X » a évolué chez plusieurs organismes pour rétablir un dosage correct chez les mâles. Chez les mammifères, le mécanisme supposé est compliqué et passe par une étape de doublement de (…)
Le LBBE et l’Unité de Virologie Humaine (ENS-Lyon) co-pilotent du LabEx "ECOFECT" (avril 2012)
Le projet ECOFECT (dynamique éco-évolutive des maladies infectieuses) a été retenu lors du second appel à projets Laboratoire d’Excellence. Son originalité est de considérer la relation hôte-pathogène comme un réseau complexe d’interactions, du niveau moléculaire et cellulaire jusqu’aux individus, populations et communautés. Dans ce cadre, l’ambition est de développer des projets d’interface entre dimensions infectiologiques, épidémiologiques, écologiques et évolutives des interactions.
Ce projet (…)
Le projet ABS4NGS sélectionné au programme Grand Emprunt Bioinformatique (avril 2012)
Porteur : Institut Curie, E. Barillot. Porteur LBBE Franck Picard.
Le LBBE participe au projet ABS4NGS (Solutions Algorithmiques, Bioinformatiques et Logicielles pour le Séquençage Haut Débit). Ce projet réunit des biologistes, des bioinformaticiens, des algorithmiciens, des statisticiens et des informaticiens pour proposer de nouveaux développements méthodologiques et computationnels répondant aux défis posés par l’analyse des données fournies par les nouvelles technologies de (…)
ALPHY : conférence Bioinformatique et Génomique Evolutive, édition Franco-Espagnole, 19-21 mars 2012, Banyuls-sur-Mer. (mars 2012)
ALPHY is an annual meeting, organized in France since 1995, dedicated to the field of Bioinformatics and Comparative Genomics (ALPHY = ALignments and PHYlogeny). The main goal of this meeting is to promote informal communication in this highly multidisciplinary field, and to encourage young scientists to present their work.
This year, ALPHY is co-organized by Spanish and French scientists, in the nice city of Banyuls, with the hope of enhancing scientific exchanges between research groups (…)
Les réserves naturelles attirent le gibier… et les chasseurs (mars 2012)
Vincent Tolon et Stéphane Dray ont participé à une étude franco-suisse visant à analyser l’impact des réserves naturelles sur l’occupation de l’espace par des sangliers mais aussi par les chasseurs. Il ressort que ces zones refuges attirent le gibier mais aussi, à leur périphérie, les prédateurs humains, ce qui peut rendre ces réserves plus risquées pour les animaux qu’il n’y paraît. Ce travail à paraître en mars 2012 dans la revue Ecological Applications à fait l’objet d’un communiqué de presse du (…)
Concours printemps 2012 (mars 2012)
Le LBBE recrute au printemps 2012, deux enseignants chercheurs et trois personnels BIATOSS. Le LBBE est une des unité d’accueil potentielle pour un poste CR2 CNRS fléché sur Lyon. Voir les différents profils dans la rubrique "emploi".
Poste CR2 CNRS fléché à Lyon sur des thématiques à l’interface : Mathématique et Diversité Génétique (INEE-INSMI).
Poste Maître de Conférence, Lyon 1 : Modélisation quantitative à visée prédictive, écotoxicologie.
Poste Professeur, Lyon 1 : Modélisation et (…)
Le projet CESAB AfroBioDrivers financé (février 2012)
Un projet CESAB, intitulé AfroBioDrivers, a été retenu pour financement par la FRB. Ce projet piloté par Hervé Fritz (LBBE) et Patrick Duncan (CEBC) a pour objectif de comprendre, à une échelle macro-écologique, les grands déterminants sociétaux et écologiques de l’érosion de la biodiversité chez les grands mammifères terrestres africains. Les programmes CESAB, inspirés des projets NCEAS américains, sont structurés autour de la mise en réseau de scientifique ayant des bases de données et des expertises (…)
Prix Roberval pour le livre "Concepts et méthodes en phylogénie moléculaire" (janvier 2012)
Le LBBE a le plaisir d’annoncer que l’ouvrage "Concepts et méthodes en phylogénie moléculaire", rédigé par deux membres du laboratoire (Céline Brochier & Guy Perrière) a été sélectionné pour le 25ième prix Roberval, et qu’il a reçu la mention du jury pour la catégorie Enseignement Supérieur lors de la cérémonie qui s’est tenue le 30 novembre dernier au Palais de la découverte à Paris.
Pour en savoir plus : http://prixroberval.utc.fr/palmares_2011.html ou (…)
Création d’un Laboratoire International Associé entre le LBBE-UMR5558 et le Laboratório De Bioinformática du LNCC/MCT, Brésil (janvier 2012)
Un Laboratoire International Associé (LIA – voir https://dri-dae.cnrs-dir.fr/spip.php ?article46) vient d’être approuvé entre le LBBE-UMR5558 et le Laboratório De Bioinformática du LNCC/MCT, Brésil, dirigé par le Dr Ana Tereza Vasconcelos (http://www.labinfo.lncc.br/). Le LIA s’intitule Laboratoire InteRnational de recherche en bIOformatique (acronyme LIRIO) et sera créé officiellement à partir du 1er Janvier 2012 pour une durée de 4 ans (avec possibilité de demander un renouvellement une fois). (…)
Atelier Statistiques pour les données de post-génomique : 26-27 janvier (janvier 2012)
Le LBBE organise l’edition 2012 de l’atelier Statistics for Post Genomic Data (SMPGD). Cet atelier annuel est dedie aux methodes statistiques pour l’analyse des donnees post-genomiques. L’objectif est de presenter des travaux allant des statistiques mathematiques aux statistiques appliquees, mais aussi de presenter de nouveaux domaines de la biologie a haut debit qui pourraient avoir besoin de nouveaux developpements statistiques, ou de nouvelles methodes statistiques qui pourraient (…)
Séminaire "Politiques et Décisions dans les Systèmes de Santé" (janvier 2012)
Dans le cadre du Master "Santé Publique" porté par le LBBE, un séminaire autour de la problématique des liens entre les nouveaux enjeux en santé et la maîtrise médicalisée des dépenses aura lieu à Lyon du 5 au 7 janvier 2012
Lors de la 2e journée, des applications de la modélisation mathématique pour l’aide à la décision dans les systèmes de santé seront abordées.
La plaquette du séminaire est (…)
Séminaire "Évaluation des médicaments pour les maladies rares" - 1-2 mars 2012 (décembre 2011)
Catherine CORNU, de l’équipe EMET du LBBE, co-organise le séminaire "Évaluation des médicaments pour les maladies rares".
Cette formation se déroulera en anglais à l’Université Claude Bernard Lyon 1 le 1er et le 2 mars 2012.
Pour plus de renseignements, veuillez vous connecter sur le site d’Eudipharm : http://www.eudipharm.net/claroline141/RARE/
Colloque Génomique Environnementale les 28-29-30 Novembre 2011 à Lyon. (novembre 2011)
Les réseaux thématiques Génomique environnementale (RTP GE, INEE) et Ecologie Microbienne (EcoMic, INRA) organisent conjointement les 28-29-30 novembre 2011 à Lyon un colloque national ouvert aux thématiques relevant de l’écologie, de l’évolution, et du fonctionnement des organismes, populations et communautés (des procaryotes aux eucaryotes) en s’appuyant sur les nouvelles technologies de séquençages (NTS). La première partie abordera la génomique environnementale tous organismes et approches confondus, (…)
GDRE Comparative Genomics : meeting 2011 (novembre 2011)
La prochaine réunion du GDRE "Comparative Genomics" aura lieu à Lyon, le 24 et 25 novembre 2011, à la Bibliothèque de l’INSA
Jubilé Biométrie 2011 (novembre 2011)
Le LBBE organise son Jubilé Biométrie 2011 en l’honneur de Carlos Bernstein, Christian Biemont, Christian Gautier et Alain Pavé le jeudi 17 novembre 2011 à partir de 14h00 (amphi Istil EPUL)
Des sangliers s’adaptent à la pression de la chasse en naissant plus tôt dans l’année (màj) (novembre 2011)
Une étude française à laquelle ont participé des chercheurs du Laboratoire (Jean-Michel Gaillard, Marlène Gamelon) a montré que, sur une population de sangliers, la pression exercée par les chasseurs avait conduit les marcassins à naître plus tôt dans l’année. Les résultats de ce travail ont été publiés dans la revue Evolution et évoqués sur le site de l’INEE
Le journal L’Humanité Dimanche a également consacré une double page à ce (…)
Evolyon 2011 (novembre 2011)
La prochaine édition de la conférence EvoLyon se tiendra le 10 novembre prochain, sur le site de l’ENS. Cette conférence vise à rassembler toutes les équipes de la place lyonnaise travaillant sur le thème de l’évolution. L’inscription est gratuite.
Le programme et toutes les informations pratiques sont disponibles sur le site web d’EvoLyon : http://evolyon.universite-lyon.fr/
Séminaire "Evaluation des produits médicamenteux chez l’enfant" (novembre 2011)
Le Pr. Behrouz Kassaï de l’équipe EMET du LBBE co-organise le séminaire "Evaluation des produits médicamenteux chez l’enfant". Cette formation se déroulera en anglais à l’université René Descartes Paris V du 21 au 24 février 2012 et du 27 au 30 mars 2012.
Pour plus de renseignements et les documents d’inscription, veuillez vous connecter au site d’Eudipharm : http://www.eudipharm.net/claroline141/EM3/
Statistics for Post Genomic Data (SMPGD 2012) (octobre 2011)
Le LBBE organise l’édition 2012 de l’atelier Statistics for Post Genomic Data (SMPGD). Cet atelier annuel est dedié aux méthodes statistiques pour l’analyse des données post-génomiques. L’objectif est de présenter des travaux allant des statistiques mathématiques aux statistiques appliquées, mais aussi de présenter de nouveaux domaines de la biologie a haut débit qui pourraient avoir besoin de nouveaux développements statistiques, ou de nouvelles méthodes statistiques qui pourraient être (…)
Rencontres Scientifiques France Grilles 2011 (octobre 2011)
Simon Penel (IE CNRS au pôle informatique du LBBE) vient de recevoir le prix de la meilleure contribution lors des premières rencontres scientifiques du GIS France Grilles organisées le 19 Septembre 2011 au palais des congrès de Lyon. Sa présentation qui portait sur l’utilisation de grilles de calcul pour la génomique comparative est disponible ici.
Les antidiabétiques oraux et l’hémoglobine glyquée sur la sellette : résultats décevants et effets secondaires sérieux (septembre 2011)
Depuis la mise en évidence d’un lien entre le diabète de type 2 et l’augmentation du risque de maladie cardiovasculaire, plusieurs essais cliniques ont étudié l’effet de traitements visant à réduire la glycémie dans le but de réduire simultanément les risques associés à cette maladie. Les résultats de ces études sur le bénéfice de tels traitements sont cependant discordants, en particuliers sur les types d’événement cardiovasculaire impliqués, l’une des études les plus récentes ayant été interrompue (…)
La course de la gazelle - Biologie et écologie à l’épreuve du hasard (septembre 2011)
par Alain Pavé (LBBE)
Comme la gazelle face à son prédateur, les êtres vivants sont soumis au hasard et l’utilisent. Hasard de la rencontre, hasard de la course pour éviter d’être mangés. Aléas de l’environnement, hasard pour survivre. Plus généralement, quelles sont les différentes facettes du hasard ? Est-il favorable ou défavorable ? Quelles sont ses origines ? Quel rôle joue-t-il ? La vie et son évolution sont-elles tout simplement possibles sans hasard ? La biodiversité n’est-elle pas une fille du hasard ?
Autant de (…)
Séminaire sur les biomarqueurs et sur les marqueurs de substitution : les 22 et 23 septembre 2011 (septembre 2011)
Le prochain séminaire EUDIPHARM (master en médecine pharmaceutique) sur les biomarqueurs et sur les marqueurs de substitution se tiendra à UCB Pharma à Bruxelles les 22 et 23 septembre 2011. Il est organisé par l’équipe EMET du laboratoire LBBE.
Pour toute information complémentaire, veuillez cliquer sur ce lien http://www.eudipharm.net/claroline141/BIO/
Suite au séminaire de modélisation en pharmaco-thérapeutique (septembre 2011)
Suite au séminaire de modélisation en pharmaco-thérapeutique intitulé "Modélisation Mathématique en Pharmaco-Thérapeutique : Passé, Présent et Futur" qui a eu lieu le Mercredi 7 Septembre 2011, un livret PDF des diaporamas présentés est accessible par le lien ci-dessous.
http://ftp-hcl.chu-lyon.fr/download/Vamg3OwFKyrOBgIz1YdNpRHuIWQIzA/
Pour tout renseignement, contacter Sylvain Goutelle : (…)
Prix de la Societé de Toxicologie (septembre 2011)
Un article* co-écrit par Marie-Laure Delignette-Muller (équipe MEPS) et Régis Pouillot (chercheur à la FDA, USA) vient de recevoir le prix ’Best Published Paper Demonstrating an Application of Risk Assessment’.
L’évaluation quantitative des risques est apparue récemment comme un outil précieux pour renforcer la base scientifique des décisions réglementaires dans le domaine de la sécurité alimentaire. Dans cet article l’utilisation deux nouveaux packages R, spécialement conçus pour aider les (…)
Séminaire de modélisation en pharmaco-thérapeutique (septembre 2011)
Un séminaire de modélisation en pharmaco-thérapeutique intitulé "Modélisation Mathématique en Pharmaco-Thérapeutique : Passé, Présent et Futur" est organisé par l’ADCAPT – Service Pharmacie, Groupement Hospitalier de Gériatrie des HCL et l’UMR CNRS 5558, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive, Université Claude Bernard Lyon 1.
Cette journée sera consacrée à l’utilisation des modèles et autres approches quantitatives pour optimiser l’utilisation des médicaments en pratique clinique. Les (…)
Des badges pour étudier la propagation des épidémies (août 2011)
Les participants d’un congrès ont été badgé durant deux jours, par une équipe franco-italienne impliquant notamment des chercheurs du CNRS, de l’Inserm, de l’Université Claude Bernard Lyon1 et du CHU de Lyon , afin d’étudier leurs mouvements et les interactions au sein d’une population. Les données récoltées permettent d’envisager la simulation de la propagation du risque infectieux au sein d’une population, voire même l’optimisation de la réponse face à l’expansion d’une épidémie. Les résultats de ces (…)
Sandrine Charles nommée membre junior de l’IUF (juillet 2011)
Sandrine Charles (Maître de Conférences au LBBE et membre du Conseil Scientifique de l’UCBL) vient d’être nommée membre junior de l’IUF. Ses recherches s’inscrivent dans le cadre de l’évaluation quantitative du risque en écotoxicologie par le développement de méthodes et d’outils visant à identifier les substances potentiellement dangereuses, à définir des seuils de concentrations acceptables aux différents niveaux d’organisation biologiques (individu - population - communauté), à élaborer des (…)
Perturbateurs endocriniens et biodiversité (juillet 2011)
Au sein de l’équipe MEPS du LBBE se développent des modèles dynamiques et des méthodes statistiques dédiés à l’évaluation quantitative des risques en écotoxicologie. Un des objectifs est de contribuer à la compréhension des mécanismes induits sur les écosystèmes par une exposition à un ou plusieurs contaminants (chimiques, biologiques et/ou physiques).
Cet article paru dans Le Monde, le 14 mai 2011, résume l’ensemble des problèmes que soulève l’étude des perturbateurs endocriniens, problèmes tant (…)
17ème Congrès National sur les Eléments Transposables (juillet 2011)
Le LBBE organise le 17ème Congrès National sur les Eléments Transposables. Le congrès se déroulera sur le campus de la Doua à l’amphithéâtre de l’Ecole Polytechnique Universitaire de Lyon 1 (Istil) du 4 au 6 juillet 2011. Il s’agit de la réunion annuelle d’équipes dont les thèmes de recherche porte de près ou de loin sur les éléments transposables.
Inscriptions et détails pratiques à l’adresse suivante :
http://lbbe-dmz.univ-lyon1.fr/spip_cnet/spip.php
Clôture des inscriptions le 31 mai (…)
Le LBBE pilote du projet "investissement d’avenir" ANCESTROME (juin 2011)
Les résultats de l’appel d’offre "investissement d’avenir"/ANR Bioinformatique ont été annoncés le 18 mai 2011.
Le projet ANCESTROME a été retenu. Son but est le développement de méthodes utilisant les données de la génomique et de la post-génomique sur un large spectre phylogénétique pour reconstruire l’évolution des organismes et les processus qui l’ont façonnée.
ANCESTROME est piloté par le LBBE, et implique l’ISEM à Montpellier, le laboratoire DYOGEN à l’ENS Paris, le LCB à Marseille et le laboratoire (…)
Poste NOEMI CNRS - Ingénieur de recherche BAP E (mai 2011)
Le LBBE propose en NOEMI un poste d’ingénieur de recherche BAP E CNRS.
La date de clôture pour les candidatures est fixée au 30 mai 2011.
Vous trouverez dans le document joint le détail du poste
Pour postuler cliquez sur le lien suivant http://web-rh.dsi.cnrs.fr/afip/owa/consult.accueil
Journée du Département Génétique et Génomiques Evolutives - lundi 23 mai 2011 (mai 2011)
la prochaine journée du département GGE aura lieu le lundi 23 mai 2011, dans l’amphi du CNRS. Vous trouverez ci-dessous le programme de cette journée
ISMB/ECCB 2011 (mai 2011)
Parmi les deux communications françaises acceptées à ISMB/ECCB 2011 cette année à Vienne… deux viennent du LBBE.
La plus grande conférence de bioinformatique et biologie computationnelle se tient cette année à Vienne. Le LBBE y sera bien représenté, avec les communications orales de Sara Berthoumieux et Eric Tannier
Attractivité et longueurs des doigts (mai 2011)
Le ratio de la longueur du second doigt (index) sur celle du quatrième doigt (annulaire), également appelé ratio 2D:4D, est un indicateur de l’exposition prénatale à la testostérone chez les humains. En conséquence, le ratio 2D :4D est corrélé avec un certain nombre de caractéristiques physiques et comportementales qui sont dépendantes de la testostérone. Dans une étude parue récemment dans les Proceedings of the Royal Society-B , Jean-François Lemaitre (LBBE) et ses collaborateurs ont mis en évidence (…)
Génétique des communautés (avril 2011)
Un numéro spécial de Philosophical Transaction of the Royal Society B Biological Sciences consacré à la génétique des communautés vient de sortir. Il comprend une synthèse par J. Ferrari et F. Vavre (LBBE) montrant comment les symbiotes d’insectes constituent un système modèle pour cette discipline. Premièrement, ils modifient les interactions de leurs hôtes avec d’autres espèces. Deuxièmement, ils constituent eux-mêmes des communautés aux propriétés particulières.
Plus de détails ici
L’IUF célèbre ses 20 ans à Lyon ! (avril 2011)
Le 30 et 31 mai à l’ENS de Lyon.
Ce colloque est ouvert à tous, gratuit et demande uniquement l’inscription sur le site internet. (http://iuf20ans.org/)
Il s’agit d’un colloque interdisciplinaire. La thématique de cette année est "Les ressources". Regardez le programme sur le site. Pour plus d’informations contacter Cristina Vieira au LBBE
Offres de master (avril 2011)
Dès la rentrée 2011, le LBBE ouvre deux nouvelles offres de master : Vous pouvez télécharger le dossier de candidature ci-après : Inscription :
le master "Ecoscience, Microbiologie"
et le master "Santé publique"
Pour plus d’informations, voir la rubrique "enseignement" du site web.
Recrutement de 3 enseignants-chercheurs (2 PR - 1 MC) au LBBE (avril 2011)
3 postes d’enseignants-chercheurs seront mis au concours (avril-mai) pour intégration au LBBE
poste PR : Phylogénomique des systèmes biologiques (voir profil ci-joint). Le poste est affecté au département Génétique et Genomique Evolutives du LBBE.
poste PR : Ecologie Comportementale (voir profil ci-joint). Le poste est affecté au département Ecologie Evolutive du LBBE.
poste MC : Génomique fonctionnelle et évolutive (voir profil ci-joint). Le poste est affecté au département Génétique et Génomique (…)
Journée d’animation de l’axe "Interactions durables" - Infectiologie - mercredi 16 mars (9h00 - 18h00) - Amphithéâtre du CNRS (mars 2011)
Cette journée sera l’occasion de prendre connaissance et d’échanger sur les différents thèmes et approches utilisés dans le laboratoire sur les relations hôtes-symbiotes au sens large. Les thèmes suivants seront notamment abordés :
(1) la diversité et les communautés de microorganismes ;
(2) l’épidémiologie ;
(3) l’expression du phénotype étendu ;
(4) les interactions fonctionnelles.
Biodiversité(S). Nouveaux regards sur le vivant. (mars 2011)
Christophe Bonenfant (Chercheur CNRS au LBBE) fait partie des auteurs de cet ouvrage sur la biodiversité, aux éditions Le cherche midi.
Initié par l’INEE, cet ouvrage regroupe la diversité des regards portés par les jeunes chercheurs du CNRS sur leur objet d’étude, la biodiversité. Abordés à travers le travail du philosophe, et du juriste au biologiste en passant par l’éthno-botaniste ou l’économiste, les différents chapitres illustrent toute la difficulté de définir ce terme, de la mesurer, de lui (…)
Demi-journée du Vendredi 11 Février 2011 - Amphi du CNRS : Statistique Bayésienne au LBBE (février 2011)
Qu’est-ce que la Statistique Bayésienne ? Peut-elle vous apporter un plus dans votre recherche ? Venez découvrir ses bases théoriques et diverses applications actuellement en cours au laboratoire.
PROGRAMME
1) Aspects théoriques
14:00 - 14:30 : René Ecochard « Concepts généraux de la Statistique Bayésienne »
14:30 - 15:00 : Laurent Guéguen « MCMC et algorithmes d’échantillonnage »
14:30 - 15:00 : Marie-Laure Delignette « Les Priors en Statistique Bayésienne »
15:30 - 15:45 Discussion
15:45 - 16:00 : Pause (…)
Colloque ALPHY (février 2011)
Le LBBE organise le colloque ALPHY les 9 et 10 février 2011. Ce colloque national annuel rassemble des chercheurs de multiple disciplines autour des thèmes Alignement, Phylogénie, Génomique Comparative et Bioinformatique.
Pour toute information, consultez le site Alphy : http://lbbe.univ-lyon1.fr/alphy/
Statistical Methods in Genomics (janvier 2011)
Franck Picard (LBBE) is one the organizers of the 2011 edition of the workshop on Statistical Methods for Post Genomic Data.
The 2011 edition of the workshop on Statistical Methods for Post Genomic Data (SMPGD) will be held in the Curie Institute (Paris) on January 27-28. This workshop gathers statistician who are interested in methodological developments devoted to the analysis of high throughput biological data. Speakers are mainly statisticians that present their work and the tools (…)
Transposable elements and genome evolution (janvier 2011)
A comprehensive review on 60 years of research on transposable elements by Christian Biémont (LBBE) has been recently published in Genetics.
Transposable elements initially considered as ‘‘junk’’ and ‘‘selfish’’ pieces of DNA are now seen as major components of genomes that have played a significant role in evolution. The history of these genomic elements provides one of the best examples of how scientific concepts in biology emerge and then evolve into new concepts.
The idea that some genetic (…)
Modelling signaling networks (janvier 2011)
A work on signaling networks by Marc Bailly-Bechet (LBBE) et al. has just been released by PNAS.
Marc Bailly-Bechet et al. have developed a new algorithm for the signaling network inference problem, and applied it to transcriptomic and proteomic data in yeast. The predictions of the new algorithm are confirmed experimentally. This new method can be applied to many network inference problems, and the algorithm performance in terms of speed and complexity make it able to treat large-scale (…)
Election au conseil d’UMR (janvier 2011)
Les élections au conseil d’UMR auront lieu le mardi 18 janvier de 9h00 à 17h00 selon les modalités suivantes :
Nombre de sièges à pourvoir : Collège A : 4 Collège B : 6 BIATOS-ITA : 3 Doctorant : 1 + 1 suppléant Postdoctorant - CDD : 1 + 1 suppléant
Précisions :
Premier tour mardi 18 janvier 2011 de 9h à 17h, secrétariat de l’UMR à la doua et lieu à préciser pour le secteur médical (contact JP Flandrois) Deuxième tour vendredi 21 janvier 2011 si nécessaire Réunion des élus au nouveau conseil le mardi 25 (…)
Sortie de l’ouvrage " Biologie Evolutive" (Editions De Boeck) (janvier 2011)
Plusieurs chercheurs du LBBE sont auteurs de chapitres dans cet ouvrage (D. Allainé, C. Bernstein, V. Daubin, B. Doligez, L. Duret, H. Fritz, J.M. Gaillard., M. Gouy, G. Marais)
La communauté francophone de chercheurs et enseignant-chercheurs en biologie évolutive, forte de sa richesse et sa diversité, a souhaité produire un ouvrage de référence destiné aux chercheurs francophones et aux étudiants en Master et Doctorat. BIOLOGIE EVOLUTIVE aborde tous les grands thèmes de la Biologie évolutive, tels (…)
NOCEBO (janvier 2011)
L’effet Nocebo ou lorsqu’une thérapeutique objectivement inoffensive semble nuisible ; par P. Maire (LBBE).
S’il semble aisé d’interroger le placebo, ausculter les phénomènes nocebo apparaît de prime abord comme une mission impossible. Les différents éclairages (historique, littéraire, médical, pharmacologique, philosophique, psychologique) de cet ouvrage permettent de souligner ombres et lumières du pharmakon (remède et poison).
P. Maire Ed. Collection "Theriaka, remèdes et rationalité". Code ISBN : (…)
Amazonie, une aventure scientifique et humaine du CNRS (janvier 2011)
Par Alain PAVE (LBBE) et Gaëlle FORNET
Que savons-nous aujourd’hui de l’Amazonie, de son histoire naturelle et humaine, de sa biodiversité ? A.Pavé (LBBE) et Gaëlle Fornet tentent de répondre à cette question avec cet ouvrage et donnent ainsi au lecteur curieux de la science de nouvelles clés pour réfléchir sur les concepts d’environnement, de biodiversité ou de développement durable.
L’Amazonie est une région mythique, à laquelle se rattache tout un imaginaire originel : forêt vierge, terre nourricière, harmonie entre la nature et les peuples (…)
Telomere and evolution in drosophila (janvier 2011)
The team led by Benjamin Loppin (CGMC - CNRS, U. Lyon 1) in collaboration with Gabriel Marais (LBBE - CNRS, U. Lyon 1) has shown in a paper recently published in Current Biology (advertised in the cover) that the protein K81 from in Drosophila melanogaster is a key protein for protection of sperm telomeres, which evolved by duplication in this species and some close relatives.
Specialization of a Drosophila capping protein essential for the protection of sperm telomeres R Dubruille, G (…)
CNRS positions available (janvier 2011)
377 CNRS positions are available this year. These are permanent, 100%-research positions and are open to non-French Scientists.
Assistant to Associate Professor positions (CR2 and CR1) are available in Ecology, Evolution, Genomics/Bioinformatics. The application (dossier, interview) can be done in English. If you are interested to apply for a CNRS position in our Institute, please contact us, we can help you to prepare your application.
DEADLINE for submitting application online : January (…)
Télomère et évolution chez la drosophile (janvier 2011)
L’équipe dirigée par Benjamin Loppin (CGMC - CNRS, U. Lyon 1) en collaboration avec Gabriel Marais du LBBE (CNRS, U. Lyon 1) vient de montrer dans un article paru dans Current Biology (et qui en fait la couverture) que la protéine K81 de Drosophila melanogaster est une protéine clé dans la protection des télomères dans les spermatozoïdes, qui a évolué spécifiquement par duplication dans cette espèce et quelques espèces proches.
Specialization of a Drosophila capping protein essential for the protection (…)
Concepts et méthodes en phylogénie moléculaire (décembre 2010)
Par Guy Perrière et Céline Brochier-Armanet
Enfin un ouvrage complet en français sur la phylogénie moléculaire ! Le livre de Guy Perrière (LBBE) et Céline Brochier-Armanet (université de Provence) dresse le panorama de l’une des disciplines les plus actives de la bioinformatique. Essentiel pour ceux, étudiants et chercheurs, qui veulent comprendre comment reconstruire l’histoire des espèces à l’age de la génomique.
Ce livre a pour ambition de brosser un panorama complet de l’une des disciplines les plus actives de la bioinformatique : la (…)
IPG 2010 - 25th and 26th November 2010 (novembre 2010)
IPG (Integrative Post-Genomics), Lyon’s International Multidisciplinary Meeting on Post-Genomics is taking place on 25th and 26th November 2010 on the campus of La Doua, here in LYON
For more information, visit the official site.
Conseil d’UMR - Lundi 8 novembre 2010 (novembre 2010)
Le prochain conseil de laboratoire aura lieu le lundi 8 novembre 2010 à partir de 12h00
Du 21 au 24 Octobre 2010, le laboratoire BBE participe à la fête de la Science. Venez nous retrouver au village des sciences expérimentales au double mixte, sur le campus de la Doua. (octobre 2010)
La biodiversité contemporaine est le résultat d’un long processus d’évolution, toujours à l’oeuvre. Aujourd’hui, l’étude génétique permet de reconstruire l’histoire des organismes vivants et les relations de parenté entre l’ensemble des espèces actuelles. Venez parcourir la sculpture « L’arbre de la vie » et découvrir les travaux et méthodes des chercheurs spécialistes des arbres phylogénétiques du vivant.
Téléchargez le programme : (…)
Assemblée générale (octobre 2010)
L’assemblée générale du laboratoire dédiée à la présentation des nouveaux entrants aura lieu le lundi 4 octobre 2010 à partir de 16h00 - Amphi 5 - Déambulatoire
SMBE 2010 - 4-8 juillet 2010 - Lyon France (juillet 2010)
Le LBBE organise le congrès annuel de la société internationale d’évolution moléculaire (SMBE), veuillez trouver le site officiel du congrès SMBE 2010 ici http://smbe2010.univ-lyon1.fr/en
Conseil d’UMR (avril 2010)
Le prochain conseil d’UMR aura lieu le jeudi 22 avril 2010
Ordre du jour :
1. Suite évaluation AERES
2. Finances : bilan 2009 – budget 2010
3. Bilan concours recrutement (CNRS, MCU, ITA)
4. Projet Grand Emprunt
5. Composition du conseil (2011-2014)
6. Questions Diverses
postes ouverts au concours au printemps 2010 (avril 2010)
Liste des postes : ; Poste MCF intitulé : Ecologie évolutive - stratégies de reproduction Affiché dans le département « Ecologie Evolutive » du LBBE ; Poste MCF intitulé : Génétique et Génomique des adaptations chez les insectes avec l’activité d’enseignement effectuée à l’IUT A ; Poste PR intitulé : Dynamique des éléments transposables dans les populations naturelles Affiché dans le département « Génomique et Génétique Evolutives » ; (…)
Postdoc Positions - Symbionts-host dialog (janvier 2010)
MATHS/ALGORITHMICS for BIOLOGY POSTDOC POSITIONS
INRIA at BBE Lab, University of Lyon 1, France
Two postdoctoral positions (2 years with possible extensions) are available in the BAMBOO Team led by Marie-France Sagot in the framework of a new project funded by the European Research Council starting from March 2010 or later.
We are seeking highly qualified and motivated applicants with strong skills in mathematics and algorithmics and an equally strong interest for biological problems (…)
Conseil d’UMR - Jeudi 26 novembre 2009 (novembre 2009)
Le prochain conseil d’UMR aura lieu le jeudi 26 novembre 2009 de 12h30 à 14h30 - salle de formation du PRABI
Ordre du jour :
1. Election "Département de Biologie"
2. Finances UMR, gratification des stagiaires
3. Informations CNRS (postes, AERES, ATIP,….)
4. Questions diverses
EvoLyon’2009 - 150 après Darwin : Questions ouvertes sur l’évolution (novembre 2009)
Mercredi 25 novembre 2009 – Villeurbanne - Campus de la Doua – Bâtiment ASTREE
Il y a 150 ans, la publication par Darwin de "L’origine des espèces" a marqué un tournant majeur dans l’histoire des sciences. Au cours du XXème siècle, grâce aux travaux scientifiques dans les domaines les plus divers (génétique moléculaire, écologie des populations, paléontologie, biomathématiques, etc.), notre compréhension des processus de l’évolution a considérablement progressé. Ces connaissances constituent le socle sur (…)
Habilitation à diriger des recherches (novembre 2009)
Gabriel Marais présentera ses travaux intitulés « Evolution du génome et recombinaison : le cas des chromosomes sexuels » - Jeudi 19 novembre 2009 à 10h30 - Amphithéâtre du CNRS
Composition du jury
Monsieur GALTIER Nicolas, Directeur de Recherche CNRS, ISEM - Université Montpellier 2
Madame GIRAUD Tatiana, Directeur de Recherche CNRS, ESE - Université Paris 11
Madame HEARD Edith, Directeur de Recherche CNRS, GBD, Institut Curie - Paris
Madame MOUCHIROUD Dominique, Professeur des Universités, (…)
Présentation du Pôle Informatique de l’UMR - 22 octobre 2009 (octobre 2009)
La présentation du pôle informatique aura lieu le jeudi 22 octobre 2009 de 14h00 à 16h00 dans la salle de formation du PRABI.
4ème réunion du GDRE "Comparative genomics" les 15-16 octobre 2009, Lyon (octobre 2009)
Ce GDRE est le fruit de collaborations entre équipes françaises et des équipes de Genève, Milano, Barcelona et Valencia. La réunion consistera en la présentation de points forts en génomique comparative, avec des communications de personnalités invitées extérieures au GDRE (voir l’affiche jointe). La réunion est ouverte à tous participants extérieurs.
Information et inscription sur le site (…)
Assemblée Générale "Nouveaux entrants" (octobre 2009)
L’assemblée générale "nouveaux entrants" du laboratoire aura lieu le jeudi 1er octobre 2009 à partir de 16h00 - Amphi 1 du déambulatoire ( Bât Mendel)
Nouvelle proposition de post doc (juin 2009)
Postdoctoral position on the origin and evolution of young plant sex chromosomes
Habilitation à diriger des recherches (juin 2009)
Fabrice Vavre présentera ses travaux intitulés "Evolution des interactions symbiotiques chez les insectes : à quel niveau de sélection se vouer ? " - Mercredi 24 juin 2009 à 10h30 - Amphithéâtre du CNRS
Composition du jury :
Mme SHYKOFF Jacqui, DR CNRS/UMR8079, Université Paris-Sud XI
M. BOURTZIS Kostas, Pr Associé, Université d’Ioannina, Agrinio, Grèce
M. RIGAUD Thierry, DR CNRS/UMR5561, Université de Bourgogne
M. COUBLE Pierre, DR CNRS/UMR5534, Université Lyon1
M. FLEURY Frédéric, PU, Université Lyon (…)
Un poste de MCU "Modélisation des réseaux biologiques" est mis au concours dans l’équipe BAOBAB du LBBE (mai 2009)
En effet, un effort massif devra être mis en place dans les prochaines années afin de développer les algorithmes, combinatoires et/ou probabilistes, permettant de cribler, structurer, modéliser et analyser de façon fiable et de plus en plus fine les réseaux biologiques (réseaux génique, métabolique, interactome). Le candidat devra posséder une formation interdisciplinaire, avec une forte composante en mathématiques (principalement mais pas exclusivement théorie des graphes, si possible à la fois (…)
Nouvelle proposition de post doc (mai 2009)
PostDoc "integrative algorithms for multi-gene phylogenetics", Lyon France
5èmes rencontres écologie & comportement (avril 2009)
Suite à leur succès à Chizé (2005), Strasbourg (2006), Montpellier (2007) et Toulouse (2008), Lyon a le plaisir cette année d’accueillir la cinquième édition des rencontres scientifiques « Écologie et Comportement ».
Vous êtes doctorant ou post-doctorant, votre thématique de recherche touche à l’écologie comportementale ? Ce colloque s’adresse avant tout à vous. Venez présenter vos travaux dans une ambiance conviviale, face à un public international de jeunes chercheurs. Ne vous souciez pas de l’aspect (…)
Axe transversal "Interactions durables" (février 2009)
Une journée est organisée le mardi 17 février - salle 10 (mezzanine) sur le thème "ID et comportements". Programme ci dessous
Les présentations de l’AG-Nouveaux Entrants 2008 (novembre 2008)
L’assemblée générale du laboratoire dédiée à la présentation des nouveaux entrants a eu lieu le mercredi 8 octobre 2008. Si vous désirez revoir les présentations projetées, elles sont cette année disponibles ici. ; Les Nouveaux Entrants en poste ; - Marc Bailly-Bechet ; - Eric Bonnefoy ; - Gilles Bourgouin ; - Marie-Laure Delignette-Muller ; - David Fouchet ; - Vincent Miele ; - Lionel ZENNER ; Les pôles ; - Secrétariat ; - Pôle Biotech ; (…)
Conseil d’UMR (novembre 2008)
Le prochain conseil d’UMR aura lieu le mercredi 12 novembre 2008 à 12h00 - salle de formation du PRABI. Vous trouverez l’ordre du jour ci-dessous
La journée du Département BioMaths-Santé se déroulera le lundi 22 septembre 2008 - Amphithéâtre du CNRS (septembre 2008)
Vous pouvez consulter le programme ci-dessous
Workshop Change-Points Detection Methods and Applications - Paris, 11-12 of September 2008 (septembre 2008)
organisé par : Emilie Lebarbier (agroparistech, Paris), Franck Picard (UMR 5558, CNRS, LBBE) Lieu : AgroParisTech, Paris 5eme
Pour avoir plus d’information vous pouvez cliquer ici
Prix Walter Fitch (juillet 2008)
Jean-François Gout, doctorant en génomique comparative, est le premier doctorant français à remporter l’édition 2008 du prix Walter Fitch de la société internationale d’évolution moléculaire (SMBE) depuis sa création en 1993. Ce prix est remis à l’issu d’un concours opposant 10 doctorants/postdoctorants (pré-sélectionnés sur dossier parmis plusieurs centaines de candidatures) sur la base de la présentation orale de leurs travaux. J. Gout est le premier français à remporter ce prix depuis sa création en (…)
La journée du Département Génétique et Génomique Evolutives se déroulera le mercredi 25 juin 2008 - Amphi 1 - Déambulatoire - Bât Mendel (juin 2008)
Vous pouvez consulter le programme ci dessous
Conseil UMR (juin 2008)
Le prochain Conseil d’UMR aura lieu le mardi 17 juin à 10h00 - salle hygiène 2C du Laboratoire d’Epidémiologie et Santé Publique (escalier C - 4ème étage - Rockefeller)
Vous pouvez consulter l’ordre du jour ci dessous
Offre Post-Doc - Date limite de dépôt des candidatures : vendredi 28 mars 2008 (mars 2008)
L’UMR CNRS 5558 - Biométrie et Biologie Evolutive recrute un post doc sur le thème :
Diversité et conséquences épidémiologiques de l’infection des arthropodes vecteurs de pathogènes par des bactéries symbiotiques : cas des acariens hématophages
Les candidats doivent contacter par mail :
Frédéric Fleury : fleury@biomserv.univ-lyon1.fr
ou
Lionel Zenner : l.zenner@vet-lyon.fr
Ils devront envoyer un CV accompagné de la liste de leurs publications pour le vendredi 28 mars 2008.
Pour avoir plus (…)
L’UMR va financer en 2008 4 projets de recherche "nouveaux entrants" (mars 2008)
Vous pouvez prendre connaissance de ces projets sous l’intranet du site dans la rubrique "Vie du labo"
Elections au Conseil d’Administration de FInovI - Mardi 11 mars 2008 (mars 2008)
Les élections des représentants des chercheurs et des enseignants-chercheurs au Conseil d’Administration de FInovI se dérouleront le mardi 11 mars 2008 de 9 h 00 à 17 h 00 au secrétariat de l’UMR (La Doua)
Listes des candidats :
Collège 1 - Enseignants-Chercheurs :
Patrice André, Professeur-Praticien Hospitalier, CHU Lyon Nord, Laboratoire Immunité, Infection et Vaccination - U851 INSERM HCL
Dominique Pontier, Professeur, Université Lyon 1, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive UMR CNRS (…)
Conseil d’UMR (mars 2008)
Le prochain conseil d’UMR aura lieu le lundi 3 mars 2008 à 12h30 - Salle de formation - PRABI - Bât Mendel
Ordre du jour ci-dessous
Appel d’offres "Nouveaux entrants" (février 2008)
Nous renouvelons cette année l’appel à projet "nouveaux entrants". L’objectif est (1) de donner aux entrants, chercheurs et enseignant- chercheurs, les moyens d’initier un programme de recherche et (2) de faire connaitre cette nouvelle thématique dans l’unité. Les projets seront mis sur le site de l’unité. Aucune censure ne sera faite mais les projets seront financés en fonction des moyens demandés à hauteur maximale de 5000 €.
Voir modalités (…)
Assemblée Générale du laboratoire (février 2008)
Une assemblée générale est organisée le lundi 11 février 2008 de 10h00 à 11h00 - Amphi 2 - Déambulatoire - Bâtiment Mendel (la Doua)
Elections du 12 février aux 3 conseils de l’Université
Information sur le CNRS ?
Journée de l’IFR 41 (février 2008)
La journée de l’IFR 41 aura lieu dans l’amphi 1 du déambulatoire le 5 février. Vous pouvez consulter le programme ci-joint
Journée du département "Ecologie Evolutive" (janvier 2008)
La journée du département Ecologie Evolutive aura lieu le 29 Janvier 2008 dans l’amphi 4 au Déambulatoire. Vous trouverez dans le fichier pdf joint, le programme de cette journée.
RTRA : axe épidémiologie (janvier 2008)
Présentation des thèmes des équipes Le 28 janvier l’après-midi Salle du Prabi, Domaine de la Doua UCB - Lyon 1 - bat. G. Mendel- 2ème étage. Vous trouverez dans le fichier pdf joint, le programme et le plan de localisation.
Developpeurs de paquetages R (janvier 2008)
Une nouvelle rubrique est disponible ici : pour ceux qui s’intéressent au développement de paquetages R.
Prix Victor Noury (décembre 2007)
Laurent Duret DR CNRS a reçu le Prix Victor Noury décerné par l’Académie des Sciences pour ses travaux en génomique comparative. Le prix Victor Noury de l’Institut de France, est décerné sur proposition de l’Académie des sciences, pour encourager le développement de la science dans ses manifestations les plus diverses. Il est attribué alternativement dans le ressort de la division des sciences mathématiques et physiques et leurs applications et dans celui de la division des sciences chimiques, (…)
Conférence de Mme Guérillot-Maire (décembre 2007)
Dans le cadre du Master Santé-Population filière M2 B2G, nous organisons Mardi 18 Décembre une conférence dans la salle de formation du Prabi de 10h à 12h avec comme intervenant Mme Guérillot-Maire qui nous présentera le service de Biomathématiques de la sociéte BioMérieux. Cette conférence est ouverte à tous les membres du laboratoire.
Réunion annuelle du GDR « Génomique des populations » (décembre 2007)
3-4 décembre 2007, Université Lyon 1 Amphithéâtre CNRS, Avenue Albert Einstein, Villeurbanne (campus La Doua)
Loi d’autonomie des universités (décembre 2007)
Voici le texte paru le 11-08-2007 au Journal Officiel de la loi d’autonomie des universités. Vous pouvez télécharger le fichier au format pdf. Bonne lecture.
Journée du département "Écologie Évolutive" (novembre 2007)
La journée du département "Écologie Évolutive" aura lieu le 21 novembre en amphi 2.
Appel d’offres 2007 "Nouveaux entrants" (octobre 2007)
L’UMR 5558 propose des Aides pour les Nouveaux Entrants sur projet. Ces Aides sont destinées à financer des projets de recherche « initiés » par les nouveaux entrants dans l’unité.
Dossiers à déposer en document attaché par email à arba@biomserv.univ-lyon1.fr
Date limite de dépôt : le 15 octobre 2007
La demande (3 pages maximum) comportera : le nom du porteur, l’équipe d’accueil, la date d’installation, un résumé du projet de recherche, les outils et moyen utilisés.
Une demande de 5 000 € par projet est (…)
Assemblée Générale - Nouveaux entrants (octobre 2007)
L’assemblée générale de l’UMR 5558 dédiée à la présentation des nouveaux entrants aura lieu le Mercredi 3 octobre 2007 de 16 heures à 18 heures Amphi 2 – Déambulatoire – Bât Mendel.
Nous comptons sur la présence de tous ceux et de toutes celles qui appartiennent à l’UMR.
Qui devra se présenter ? Les étudiants de M2. Les étudiants en première année de thèse. Les personnels qui ont intégré l’UMR en 2007.
La présentation de chacun doit se situer entre 2 minutes et 3 minutes. Un rétroprojecteur et un vidéo (…)
Forum (juillet 2007)
Un forum a été mis en place dans la partie "intranet". Toutes les personnes du laboratoire sont automatiquement inscrites sur ce forum, avec les mêmes authentifiants que pour l’accès à la partie privée du site. L’idée est de proposer une zone d’échange libre et informelle pour échanger sur différents sujets.
Organigramme (juin 2007)
L’onglet "organigramme" disponible dans le menu du haut pointe désormais vers un organigramme dynamique (construit en direct-live en fonction du contenu de la base de donnée du personnel) et cliquable à tous les niveaux (départements, équipes, personnes). Bel exploit technique de Lionel…
Phase de test (juin 2007)
Une première partie du futur site web du labo entre en phase de test. Il s’agit de la partie concernant les pages perso et les pages équipes. Les pages perso sont accessibles soit par l’annuaire soit via les pages équipes. Les pages perso contiennent par défaut 2 sous-rubriques :
la rubrique closed qui contient 2 articles générés automatiquement :
* un article "Administratif" généré à partir des données d’ordre administratif collectées par le secrétariat. Les modifications d’ordre administratives (…)
