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Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Les recherches de l’équipe MEPS s’articulent autour de la modélisation de systèmes dynamiques mécanistes, à visée cognitive et prédictive et de l’inférence statistique pour l’évaluation du risque environnemental. L’écotoxicologie est le domaine d’application prioritaire des développements méthodologiques de l’équipe mais des activités connexes dans le domaine du risque alimentaire permettent d’apporter des éléments de réflexion complémentaires dans le cadre conceptuel global de l’aide à la décision pour la gestion des risques collectifs. L’écotoxicologie s’intéresse aux effets toxiques, causés par des polluants naturels ou synthétiques, sur les constituants des écosystèmes, animaux (y compris l’Homme), végétaux et microbiens, dans un contexte intégré. Elle se doit aujourd’hui de fournir des méthodes et des outils, prédictifs d’une part, pour une évaluation a priori du risque, et diagnostiques d’autre part pour une identification a posteriori des effets et leur contrôle. Elle pourra ainsi quantifier l’exposition à des substances potentiellement dangereuses, évaluer les relations dose-réponse pour définir des concentrations seuil, comprendre les mécanismes biologiques et écologiques sous-jacents, et élaborer des indicateurs de la qualité environnementale. Le scepticisme actuel des organismes de réglementation et de l’industrie, utilisateurs et décideurs potentiels, face à la diversité et à la complexité de ces méthodes et outils, impose parallèlement de réfléchir à leur standardisation.
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Dessin de Sergio AQUINDO, http://sergioaquindo.blogspot.com/ |
L’équipe MEPS s’est définie cinq axes de recherche, chacun répondant à une question biologique propre mais tous contribuant à des avancées méthodologiques nécessaires pour arriver à une vision intégrative des effets des contaminants d’un niveau d’organisation à l’autre. Axe 1 : Modélisation des effets des contaminants sur les traits d’histoire de vie individuels : optimisation de l’acquisition des connaissances, méthodes d’analyse et d’interprétation des données individuelles.
Axe 2 : Caractérisation et prise en compte des variabilités inter-spécifiques, pour un contaminant ou une famille de contaminants.
Axe 3 : Prise en compte des facteurs écologiques pour extrapoler les effets au niveau de la population.
Axe 4 : Prise en compte des relations trophiques et plus généralement des interactions écologiques pour prédire les effets au niveau des communautés.
Axe transversal : Développement et mise à disposition d’un ensemble de méthodes et outils dédiés à l’évaluation des risques en écotoxicologie (modèles dose-réponse intégrant la composante temporelle et méthodes d’inférence associées, couplage de ces modèles aux modèles de distribution de sensibilité des espèces, systèmes dynamiques de population et de communauté…).
L’équipe MEPS participe également au développement et au maintien d’un certain nombre de packages R déjà existants (nlstools, fitdistrplus et mc2d), et projette d’en développer de nouveaux plus spécifiquement dédiés à l’écotoxicologie. Les travaux de l’équipe MEPS contribueront significativement à la mise en place dès 2013 du Département Modélisation de la plateforme de recherche en toxicologie environnementale et écotoxicologie de ROVALTAIN. Nos principaux collaborateurs sont l’Irstea (Laboratoire d’écotoxicologie de Lyon), l’ENTPE (équipe IPE du LEHNA, Vaulx-en-Velin) et l’INRA de Rennes.
Membres
Responsable : | Charles Sandrine PU UCBL |
- Gestin Ophelia doctorant UCBL
- Lopes Christelle MCU UCBL
- Pavé Alain PU émérite UCBL
- Ratier Aude post-doc CNRS
+Anciens membres -Anciens membres
- Attard Jean Christophe stagiaire UCBL
- Ballot Clement CDD UCBL
- Baudrot Virgile post-doc CNRS
- Bigot Thomas CDD CNRS
- Bigot Thomas CDD UCBL
- Billoir Elise post-doc autre
- Biron Pierre-Albin M2 UCBL
- Charret Quentin stagiaire UCBL
- Ciric Catalina doctorant UCBL
- Codet Marie stagiaire UCBL
- Coulaud Romain doctorant UCBL
- Elie-Dit-Cosaque Kevin stagiaire UCBL
- Forfait Carole doctorant UCBL
- Granjeon-Noriot Solène stagiaire UCBL
- Kon Kam King Guillaume doctorant UCBL
- Lamonica Dominique doctorant UCBL
- Lamonica Dominique doctorant UCBL
- Luong Ngoc-Du M2 UCBL
- Mariani Laurent doctorant UCBL
- Mounier Florence M2 UCBL
- Pave Alain PU émérite UCBL
- Pavé Alain PU émérite UCBL
- Preux Sara M2 CNRS
- Rincourt Sarah-Laure stagiaire UCBL
- Rincourt Sarah-Laure stagiaire CNRS
- Ruiz Philippe CDD CNRS
- Severin Jaloustre Séverine doctorant UCBL
- Terrisse Hugo M2 UCBL
- Wu Dan CDD CNRS
+Publications -Publications
Baudrot V, Charles S (2018)
Recommendations to address uncertainties in environmental risk assessment using toxicokinetics-toxicodynamics models, Peer Community In Evolutionary Biology, vol. pp.1-26.
Baudrot V, Preux S, Ducrot V, Pave A, Charles S (2018)
New Insights to Compare and Choose TKTD Models for Survival Based on an Interlaboratory Study for Lymnaea stagnalis Exposed to Cd, Environmental science & technology, vol. 52 pp.1582-1590.
Baudrot V, Veber P, Gence G, Charles S (2018)
Fit reduced GUTS models online: From theory to practice, Integrated environmental assessment and management, vol. 14 pp.625-630.
Larras F, Billoir E, Baillard V, Siberchicot A, Scholz S, Wubet T, Tarkka M, Schmitt-Jansen M, Delignette-Muller ML (2018)
DRomics: A Turnkey Tool to Support the Use of the Dose-Response Framework for Omics Data in Ecological Risk Assessment, Environmental science & technology, vol. 52 pp.14461-14468.
Ockleford C, Adriaanse P, Berny P, Brock T, Duquesne S, Grilli S, Hernandez Jerez AF, Bennekou SH, Klein M, Kuhl T, Laskowski R, Machera K, Pelkonen O, Pieper S, Smith RH, Stemmer M, Sundh I, Tiktak A, Topping CJ, Wolterink G, Cedergreen N, Charles S, Focks A, Reed M, Arena M, Ippolito A, Byers H, Teodorovic I (2018)
Scientific Opinion on the state of the art of Toxicokinetic/Toxicodynamic (TKTD) effect models for regulatory risk assessment of pesticides for aquatic organisms, EFSA Journal, vol. 16 pp.1-188.
Quezada-Romegialli C, Jackson AL, Hayden B, Kahilainen KK, Lopes C, Harrod C, Golding N (2018)
tRophicPosition an R package for the Bayesian estimation of trophic position from consumer stable isotope ratios, Methods in Ecology and Evolution, vol. 9 pp.1592-1599.
Wigh A, Aït-Aïssa S, Creusot N, Terrisse H, Delignette-Muller ML, Bergé A, Vulliet E, Domenjoud B, Gonzalez-Ospina A, Brosselin V, Devaux A, Bony S (2018)
Assessment of Ozone or Not-Treated Wastewater Ecotoxicity Using Mechanism-Based and Zebrafish Embryo Bioassays, Journal of Environmental Protection, vol. 09 pp.325-346.
Charles S, Veber P, Delignette-Muller ML (2017)
MOSAIC: a web-interface for statistical analyses in ecotoxicology, Environmental science and pollution research, vol. 25 pp.11295-11295.
Delignette-Muller ML, Ruiz P, Veber P (2017)
Robust Fit of Toxicokinetic-Toxicodynamic Models Using Prior Knowledge Contained in the Design of Survival Toxicity Tests, Environmental science & technology, vol. 51 pp.4038-4045.
Henry Y, Piscart C, Charles S, Colinet H (2017)
Combined effect of temperature and ammonia on molecular response and survival of the freshwater crustacean Gammarus pulex, Ecotoxicology and environmental safety, vol. 137 pp.42-48.
Ashauer R, Albert C, Augustine S, Cedergreen N, Charles S, Ducrot V, Focks A, Gabsi F, Gergs A, Goussen B, Jager T, Kramer NI, Nyman AM, Poulsen V, Reichenberger S, Schafer R B, Van den Brink PJ, Veltman K, Vogel S, Zimmer EI, Preuss TG (2016)
Modelling survival: exposure pattern species sensitivity and uncertainty, Scientific reports, vol. 6 pp.29178-29178.
Babut M, Persat H, Desmet M, Lopes C, Mourier B, Tronczynski J (2016)
Les PCB dans le Rhône
in: PCB environnement et santé, , pp.473-496.
Charles S, Ducrot V, Azam D, Benstead R, Brettschneider D, De Schamphelaere K, Filipe Goncalves S, Green JW, Holbech H, Hutchinson TH, Faber D, Laranjeiro F, Matthiessen P, Norrgren L, Oehlmann J, Reategui-Zirena E, Seeland-Fremer A, Teigeler M, Thome JP, Tobor Kaplon M, Weltje L, Lagadic L (2016)
Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis, Regulatory toxicology and pharmacology, vol. 81 pp.47-56.
Lamonica D (2016)
Capturer les interactions écologiques en microcosme sous pression chimique à travers le prisme de la modélisation .
Lamonica D, Clement B, Charles S, Lopes C (2016)
Modelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm, Ecotoxicology and environmental safety, vol. 128 pp.252-65.
Lamonica D, Herbach U, Orias F, Clément B, Charles S, Lopes C (2016)
Mechanistic modelling of daphnid-algae dynamics within a laboratory microcosm, Ecological Modelling, vol. 320 pp.213-230.
Baty F, Ritz C, Charles S, Brutsche M, Flandrois JP, Delignette-Muller ML (2015)
A Toolbox for Nonlinear Regression in R: The Package nistools, Journal of Statistical Software, vol. 66 pp.1-21.
Buffet P E, Zalouk-Vergnoux A, Poirier L, Lopes C, Risso-de-Faverney C, Guibbolini M, Gilliland D, Perrein-Ettajani H, Valsami-Jones E, Mouneyrac C (2015)
Cadmium sulfide quantum dots induce oxidative stress and behavioral impairments in the marine clam Scrobicularia plana, Environmental toxicology and chemistry, vol. 34 pp.1659-64.
Ferrandiz-Rovira M, Bigot T, Allaine D, Callait-Cardinal MP, Cohas A (2015)
Large-scale genotyping of highly polymorphic loci by next-generation sequencing: how to overcome the challenges to reliably genotype individuals?, Heredity, vol. 114 pp.485-93.
Kon Kam King G (2015)
Revisiting species sensitivity distribustion: modelling species variability for the protection of communities .
Kon Kam King G, Delignette-Muller ML, Kefford BJ, Piscart C, Charles S (2015)
Constructing Time-Resolved Species Sensitivity Distributions Using a Hierarchical Toxico-Dynamic Model, Environmental science & technology, vol. 49 pp.12465-73.
Kon Kam King G, Larras F, Charles S, Delignette-Muller ML (2015)
Hierarchical modelling of species sensitivity distribution: Development and application to the case of diatoms exposed to several herbicides, Ecotoxicology and environmental safety, vol. 114 pp.212-21.
Buffet P E, Poirier L, Zalouk-Vergnoux A, Lopes C, Amiard J C, Gaudin P, Risso-de Faverney C, Guibbolini M, Gilliland D, Perrein-Ettajani H, Valsami-Jones E, Mouneyrac C (2014)
Biochemical and behavioural responses of the marine polychaete Hediste diversicolor to cadmium sulfide quantum dots (CdS QDs): waterborne and dietary exposure, Chemosphere, vol. 100 pp.63-70.
Coulaud R, Geffard O, Coquillat A, Queau H, Charles S, Chaumot A (2014)
Ecological Modeling for the Extrapolation of Ecotoxicological Effects Measured during in Situ Assays in Gammarus, Environmental science & technology, vol. 48 pp.6428-36.
Delignette-Muller ML, Lopes C, Veber P, Charles S (2014)
Statistical handling of reproduction data for exposure-response modeling, Environmental science & technology, vol. 48 pp.7544-51.
Ducrot V, Askem C, Azam D, Brettschneider D, Brown R, Charles S, Coke M, Collinet M, Delignette-Muller ML, Forfait-Dubuc C, Holbech H, Hutchinson T, Jach A, Kinnberg K L, Lacoste C, Le Page G, Matthiessen P, Oehlmann J, Rice L, Roberts E, Ruppert K, Davis J E, Veauvy C, Weltje L, Wortham R, Lagadic L (2014)
Development and validation of an OECD reproductive toxicity test guideline with the pond snail Lymnaea stagnalis (Mollusca Gastropoda), Regulatory toxicology and pharmacology, vol. 70 pp.605-14.
Kon Kam King G, Veber P, Charles S, Delignette-Muller ML (2014)
MOSAIC_SSD: a new web tool for species sensitivity distribution to include censored data by maximum likelihood, Environmental toxicology and chemistry, vol. 33 pp.2133-9.
Besse JP, Coquery M, Lopes C, Chaumot A, Budzinski H, Labadie P, Geffard O (2013)
Caged Gammarus fossarum (Crustacea) as a robust tool for the characterization of bioavailable contamination levels in continental waters: Towards the determination of threshold values, Water Research, vol. 47 pp.650-60.
Bigot T (2013)
Recherche automatisée de motifs dans les arbres phylogénétiques .
Bigot T, Daubin V, Lassalle F, Perrière G (2013)
TPMS: a set of utilities for querying collections of gene trees, BMC Bioinformatics, vol. 14 pp.109-109.
Cornu C, Kassai B, Fisch R, Chiron C, Alberti C, Guerrini R, Rosati A, Pons G, Tiddens H, Chabaud S, Caudri D, Ballot C, Kurtatova P, Castellan AC, Bajard A, Nony P (2013)
Experimental designs for small randomised clinical trials: an algorithm for choice, Orphanet Journal of Rare Diseases, vol. 8 pp.48-48.
Coulaud R, Mouthon J, Queau H, Charles S, Chaumot A (2013)
Life-history phenology strongly influences population vulnerability to toxicants: A case study with the mudsnail Potamopyrgus antipodarum, Environmental Toxicology and Chemistry, vol. 32 pp.1727-36.
Forfait C (2013)
Vers une amélioration de l`analyse des données et une optimisation des plans d`expérience pour une analyse quantitative du risque en écotoxicologie .
Groussin M, Boussau B, Charles S, Blanquart S, Gouy M (2013)
The molecular signal for the adaptation to cold temperature during early life on Earth, Biology Letters, vol. 9 pp.20130608-20130608.
Guéguen L, Gaillard S, Boussau B, Gouy M, Groussin M, Rochette N, Bigot T, Fournier D, Pouyet F, Cahais V, Bernard A, Scornavacca C, Nabholz B, Haudry A, Dachary L, Galtier N, Belkhir K, Dutheil J Y (2013)
Bio++: Efficient Extensible Libraries and Tools for Computational Molecular Evolution, Molecular Biology and Evolution, vol. 30 pp.1745-1750.
Jaloustre S, Guillier L, Poumeyrol G, Morelli E, Delignette-Muller ML (2013)
Efficiency of a reheating step to inactivate Clostridium perfringens vegetative cells: How to measure it?, Food Control, vol. 29 pp.422-428.
Kafer J, Talianova M, Bigot T, Michu E, Guéguen L, Widmer A, Zluvova J, Glemin S, Marais GA (2013)
Patterns of molecular evolution in dioecious and non-dioecious Silene, Journal of Evolutionary Biology, vol. 26 pp.335-46.
Artigas J, Arts G, Babut M, Caracciolo Barra A, Charles S, Chaumot A, Combourieu B, Dahllöf I, Despréaux D, Ferrari B, Friberg N, Garric J, Geffard O, Gourlay-Francé C, Hein M, Hjorth M, Krauss M, De Lange H J, Lahr J, Lehtonen K K, Lettieri T, Liess M, Lofts S, Mayer P, Morin S, Paschke A, Svendsen C, Usseglio-Platera P, Van den Brink N, Vindimian E, Williams R (2012)
Towards a renewed research agenda in ecotoxicology, Environmental Pollution, vol. 160 pp.201-206.
Babut M, Lopes C, Pradelle S, Persat H, Badot PM (2012)
BSAFs for freshwater fish and derivation of a sediment quality guideline for PCBs in the Rhone basin France, Journal of Soils and Sediments, vol. 12 pp.241-251.
Billoir E, Delhaye H, Forfait C, Clément B, Triffault-Bouchet G, Charles S, Delignette-Muller M-L (2012)
Comparison of bioassays with different exposure time patterns : The added value of dynamic modelling in predictive ecotoxicology, Ecotoxicology and Environmental Safety, vol. 75 pp.80-86.
Biron P-A, Massarin S, Alonzo F, Garcia-Sanchez L, Charles S, Billoir S (2012)
Population-Level Modeling to Account for Multigenerational Effects of Uranium in Daphnia magna, Environmental Science & Technology, vol. 46 pp.1136-1143.
Ciric C (2012)
Conception et développement d`un nouveau modèle d`écosystème aquatique adapté pour décrire la dynamique des espèces dans des mésocosmes lotiques .
Ciric C, Ciffroy P, Charles S (2012)
Use of sensitivity analysis to identify influential and non-influential parameters within an aquatic ecosystem model, Ecological Modelling, vol. 246 pp.119-130.
Coulaud R (2012)
MODELISATION ET CHANGEMENT D’ECHELLES POUR L’EVALUATION ECOTOXICOLOGIQUE : APPLICATION A DEUX MACROINVERTEBRES AQUATIQUES GAMMARUS FOSSARUM (CRUSTACE AMPHIPODE) ET POTAMOPYRGUS ANTIPODARUM(MOLLUSQUE GASTEROPODE) .
Forfait C, Charles S, Billoir E, Delignette-Muller M-L (2012)
Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations methods and models. What should we use?, Ecotoxicology, vol. 21 pp.1072-1083.
Fox DR, Billoir E, Charles S, Delignette-Muller M-L, Lopes C (2012)
What to do with NOECS/NOELS - prohibition or innovation?, Integr Environ Assess Manag, vol. 8 pp.764-766.
Jaloustre S, Guillier L, Morelli E, Noël V, Delignette-Muller M-L (2012)
Modeling of Clostridium perfringens vegetative cell inactivation in beef-in-sauce products: A meta-analysis using mixed linear models, International Journal of Food Microbiology, vol. 154 pp.44-51.
Jubeaux G, Simon R, Salvador A, Lopes C, Lacaze E, Quéau H, Chaumot A, Geffard O (2012)
Vitellogenin-like protein measurement in caged Gammarus fossarum males as a biomarker of endocrine disruptor exposure: inconclusive experience, Aquatic Toxicology, vol. 122 pp.9-18.
Lopes C, Persat H, Babut M (2012)
Transfer of PCBs from bottom sediment to freshwater river fish: a food-web modelling approach in the Rhone River (France) in support of sediment management, Ecotoxicology and Environmental Safety, vol. 81 pp.17-26.
![]() | Pavé A (2012) Modélisation des systèmes vivants de la cellule à l`écosystème, , 2012 |
![]() | Pavé A (2012) Modélisation living systems: from cell to ecosystem, , 2012 |
Bigot T, Daubin V, Perrière G (2011)
Tpms: a Tree Pattern-matching Utility for Querying Gene Trees Collections, Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), pp.111-112.
Billoir E, Delhaye H, Clément B, Delignette-Muller M-L, Charles S (2011)
Bayesian modelling of daphnid responses to time-varying cadmium exposure in laboratory aquatic microcosms, Ecotoxicology and Environmental Safety, vol. 74 pp.693-702.
Cornu M, Billoir E, Bergis H, Beaufort A, Zuliani V (2011)
Modeling microbial competition in food: Application to the behavior of Listeria monocytogenes and lactic acid flora in pork meat products, Food Microbiology, vol. 28 pp.639-647.
Coulaud R, Geffard O, Xuereb B, Lacaze E, Quéau H, Garric J, Charles S, Chaumot A (2011)
In situ feeding assay with Gammarus fossarum (Crustacea): Modelling the influence of confounding factors to improve water quality biomonitoring, Water Research, vol. 45 pp.6417-6429.
Delignette-Muller M-L, Forfait C, Billoir E, Charles S (2011)
A NEW PERSPECTIVE ON THE DUNNETT PROCEDURE : FILLING THE GAP BETWEEN NOEC/LOEC AND ECx CONCEPTS, Environmental Toxicology and Chemistry, vol. 30 pp.2888-2891.
Fox DR, Billoir E (2011)
Individual versus population effects in concentration-response modeling, Integrated Environmental Assessment and Management, vol. 7 pp.501-502.
Jaloustre S (2011)
Appréciation quantitative des risques pour l`évaluation de mesures de maîtrise sanitaire dans une filière agro alimentaire. Application à Clostridium perfringens en restauration hospitalière .
Jaloustre S, Cornu M, Morelli E, Noël C, Delignette-Muller M-L (2011)
Bayesian modeling of Clostridium perfringens growth in beef-in-sauce products, Food Microbiology, vol. 28 pp.311-320.
Kielbassa J, Charles S, Delignette-Muller M-L (2011)
The importance of incorporating age and sex when backcalculating length in bullhead Cottus gobio, Journal of Fish Biology, vol. 78 pp.1492-1507.
Kribs-Zaleta CM, Jusot JF, Vanhems P, Charles S (2011)
Modeling Nosocomial Transmission of Rotavirus in Pediatric Wards, Bulletin of Mathematical Biology, vol. 73 pp.1413-1442.
Lopes C, Perga ME, Peretti A, Roger MC, Persat H, Babut M (2011)
Is PCBs concentration variability between and within freshwater fish species explained by their contamination pathways?, Chemosphere, vol. 85 pp.502-508.
![]() | Pavé A (2011) La course de la gazelle. Biologie et écologie à l`épreuve du hasard., , 2011 |
Van Oudenhove L, Billoir E, Boulay R, Bernstein C, Cerda X (2011)
Temperature limits trail following behaviour through pheromone decay in ants, Naturwissenschaften, vol. 98 pp.1009-1017.
Billoir E, Denis J-B, Commeau N, Cornu M, Zuliani V (2010)
Probabilistic Modeling of the Fate of Listeria Monocytogenes in Diced Bacon During the Manufacturing Process, Risk Analysis, vol. 31(2) pp.237-254.
Ducrot V, Billoir E, Péry A-RR, Garric J, Charles S (2010)
From Individual to Population Level Effects of Toxicants in the Tubicifid Branchiura sowerbyi Using Threshold Effect Models in a Bayesian Framework, Environmental Science & Technology, vol. 44(9) pp.3566-3571.
Ducrot V, Teixeira-Alves M, Lopes C, Delignette-Muller M-L, Charles S, Lagadic L (2010)
Development of partial life-cycle experiments to assess the effects of endocrine disruptors on the freshwater gastropod Lymnaea stagnalis: a case-study with vinclozolin, Ecotoxicology, vol. 19(7) pp.1312-1321.
Kielbassa J, Delignette-Muller M-L, Pont D, Charles S (2010)
Application of a temperature-dependent von Bertalanffy growth model to bullhead Cottus gobio, Ecological Modelling, vol. 221 pp.2475-2481.
Lévêque C, Mounolou JC, Pavé A, Schmidt-Lainé C (2010)
A propos des introductions d`espèces, Etudes Rurales, vol. 185 pp.219-234.
Lopes C, Spataro T, Arditi R (2010)
Comparison of spatially implicit and explicit approaches to model plant infestation by insect pests, Ecological Complexity, vol. 7 pp.1-12.
![]() | Pave A (2010) On the Origins and Dynamics of Biodiversity: the role of change, Springer, 2010 |
![]() | Pavé A, Fornet G (2010) Amazonie: Une aventure scientifique et humaine du CNRS, Galaade Editions, 2010 |
Billoir E, da Silva Ferrão-Filho A, Delignette-Muller M-L, Charles S (2009)
DEBtox theory and matrix population models as helpful tools in understanding the interaction between toxic cyanobacteria and zooplankton, Journal of Theoretical Biology, vol. 258 pp.380-388.
Charles S, Billoir E, Lopes C, Chaumot A (2009)
Matrix Population Models as Relevant Modeling Tools in Ecotoxicology
in: Ecotoxicology Modeling, , pp.261-298.
Lopes C, Charles S, Vollat B, Garric J (2009)
Toxicity of ivermectin on cladocerans: comparison of toxic effects on daphnia and ceriodaphnia species, Environmental Toxicology and Chemistry, vol. 28(10) pp.2160-2166.
Lopes C, Spataro T, Lapchin L, Arditi R (2009)
Optimal release strategies for the biological control of aphids in melon greenhouses, Biological Control, vol. 48 pp.12-21.
Macedo-Rouet M, Ney M, Charles S, Lallich-Boidin G (2009)
Students performance and satisfaction with Web vs. paper-based practice quizzes and lecture notes, Computers & Education, vol. 53 pp.375-384.
Billoir E (2008)
Modélisation dynamique et inférence bayésienne pour l`analyse de données en écotoxicologie .
Billoir E, Delignette-Muller M-L, Péry A-RR, Charles S (2008)
A Bayesian Approach to Analyzing Ecotoxicological Data, Environmental Science & Technology, vol. 42(23) pp.8978-8984.
Billoir E, Delignette-Muller M-L, Péry A-RR, Geffard O, Charles S (2008)
Statistical cautions when estimating DEBtox parameters, Journal of Theoretical Biology, vol. 254 pp.55-64.
Charles S, Subtil F, Kielbassa J, Pont D (2008)
An individual-based model to describe a bullhead population dynamics including temperature variations, Ecological Modelling, vol. 215 pp.377-392.
Schmidt-Lainé C, Pavé A (2008)
La modélisation au coeur de la démarche scientifique et à la confluence des disciplines, Les Cahiers du musée des Confluences, vol. pp.21-34.
Vautrin E, Genieys S, Charles S, Vavre F (2008)
Do vertically transmitted symbionts co-existing in a single host compete or cooperate? A modelling approach, Journal of Evolutionary Biology, vol. 21 pp.145-161.
Billoir E, Péry ARR, Charles S (2007)
Integrating the lethal and sublethal effects of toxic compounds into the population dynamics of Daphnia magna : A combinaison of the DEBtox and matrix population models, Ecological Modelling, vol. 203 pp.207-214.
Ducrot V, Péry ARR, Mons R, Charles S, Garric J (2007)
Dynamic engergy budgets as a basis to model population-level effects of zinc-spiked sediments in the gastropod Valvata piscinalis, Environmental Toxicology and Chemistry, vol. 26 pp.1774-1783.
Lopes C (2007)
Dynamique d`un système hôte-parasitoïde en environnement spatialement hétérogène et lutte biologique. Application au puceron Aphis gossypii et au parasitoïde Lysiphlebus testaceipes en serre de melons. .
Lopes C, Spataro T, Doursat C, Lapchin L, Arditi R (2007)
An implicit approach to model plant infestation by insect pests, Journal of Theoretical Biology, vol. 248 pp.164-178.
Pavé A (2007)
"Eau et territoires: quelles priorités pour la recherche ?", Natures Sciences Sociétés, vol. 15 pp.424-426.
Pavé A (2007)
Necessity of chance: biological roulettes and biodiversity, Comptes rendus biologies, vol. 330(3) pp.189-198.
Vautrin E, Charles S, Genieys S, Vavre F (2007)
Evolution and invasion dynamics of multiple infections with Wolbachia investigated using matrix based models., Journal of Theoretical Biology, vol. 245 pp.197-209.
Charles S, Mallet J -P, Persat H (2006)
Population dynamics of grayling: Modelling temperature and discharge effects, Mathematical Modelling of Natural Phenomena, vol. 1 pp.33-48.
Chaumot A, Milioni N, Abdoli A, Pont D, Charles S (2006)
First step of a modeling approach to evalue spatial heterogeneity in fish (Cottus gobio) population dynamics, Ecological Modelling, vol. 197 pp.263-273.
Deceliere G, Letrillard Y, Charles S, Biémont C (2006)
TESD : a transposable element dynamics simulation environment, Bioinformatics, vol. 22 pp.2702-2703.
Macedo-Rouet M, Charles S, Ney M, Batier C, Humblot L, Marquez E, Lallich-Boidin G (2006)
Un dispositif Web pour l`enseignement des mathématiques à l`université - quels impacts sur la performance et la motivation des étudiants ?, Sciences et Technologies de l`Information et de la Communication pour l`Education et la Formation, vol. 13 pp.277-312.
Pavé A (2006)
By way of introduction: Modelling living systems their diversity and their complexity: some methodological and theoretical problems, Comptes rendus biologies, vol. 329(1) pp.3-12.
Décelière G, Charles S, Biémont C (2005)
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