UMR CNRS 5558 Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive

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  FORMATION

  2005 depuis novembre Préparation au Doctorat : « Dynamique des éléments transposables chez des populations naturelles d’Anopheles gambiae : analyse du polymorphisme d’insertion » Université Claude Bernard Lyon1.

  2005 Master 2ème année : Evolution Moléculaire et Génétique des Populations, options Concepts en évolution, Génomique marine, Phylogénomique et Phylogénie Moléculaire, et Cytogénétique Moléculaire ; Université Pierre et Marie Curie (Paris VI). Mention Assez Bien.

  2004 Maîtrise Biologie Cellulaire et Physiologie, mention Génétique, options Structure et Dynamique du Génome, et Méthodes d’Etude des Caractères et des Maladies Monogéniques et Multifactoriels ; Université Pierre et Marie Curie (Paris VI). Mention Bien.

  2003 Licence Biologie Cellulaire et Physiologie, option Génétique, Informatique et Régulation ; Université Pierre et Marie Curie (Paris VI).

  2002 D.E.U.G. Sciences de la Vie, option Chimie Industrielle ; Université Pierre et Marie Curie (Paris VI).

  1999/2001 D.U.T. Génie Biologique, option Analyses Biologiques et Biochimiques ; I.U.T. de Créteil (Paris XII).

  1999/2001 D.U.T. Génie Biologique, option Analyses Biologiques et Biochimiques ; I.U.T. de Créteil (94).

  1999 Baccalauréat Scientifique, spécialité Sciences de la Vie et de la Terre ; Lycée F. Villon, Paris XIVème.

  INFORMATIQUE

  Interrogation de bases de données ADN et protéines (Blastn, BlastX,…), définition d’oligonucléotides, analyse de séquences (Sequencher, Sequence Navigator, DNA Strider, Bioedit, Mega2.1, Phylip), analyses statistiques (R, GenAlEx, JMP 7.0). Logiciels de bureautique (Word, Excel, Power Point).

  LANGUES

  Anglais, assez bonnes connaissances. Russe, niveau scolaire, séjour linguistique à Moscou en 1995.

  EXPERIENCE PROFESSIONNELLE

  2005, depuis novembre Doctorat UMR CNRS 5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Université Claude Bernard Lyon1, Equipe Génomes et Populations, « Dynamique des éléments transposables chez des populations naturelles d’Anopheles gambiae : analyse du polymorphisme d’insertion », sous la direction de C. Biémont. (définition d’oligonucléotides, amplification et purification d’acides nucléiques, Transposon Display, clonage, analyse de séquences, interrogation de bases de données).

  2005 Stage obligatoire, UMR : « Systématique, Adaptation, Evolution ». Equipe Génétique et Evolution (responsable D. Higuet), Université Pierre et Marie Curie (Paris VI). « Caractérisation d’éléments transposables actifs de type copia chez Rimicaris exoculata », sous la direction de E. Bonnivard. (Southern blot, RT-PCR).

  2004, juin à septembre Stage d’été, Station de Génétique Végétale, Ferme du Moulon Gif-sur-Yvette 94) (responsable D. De Vienne). « Contribution des éléments transposables à l’évolution des espèces cultivées : approches méthodologiques et application au maïs » sous la direction de M. Tenaillon. (AFLP) .

  2003, juin à août Stage d’été, UMR « Systématique, Adaptation, Evolution ». Equipe « Génétique et Evolution » (responsable D. Higuet). Université Pierre et Marie Curie (Paris VI). « Recherche d’éléments transposables de type copia chez des espèces de crustacés » sous la direction de E. Bonnivard (Amplification, clonage et séquençage de fragments d’éléments transposables).

  2002, juin à septembre Technicien de laboratoire, Service de « Génétique Moléculaire » (responsable X.Jeunemaître). Hôpital Européen GEORGES POMPIDOU, Paris. (Séquençage automatique direct ; recherche des mutations par analyse d’éléctrophorégrammes).

  2001, avril à juin Stage obligatoire, Service de « Génétique Moléculaire » (responsable X. Jeunemaître). Hôpital Européen GEORGES POMPIDOU, Paris. « Recherche de mutations du gène ABCC6 chez des patients atteints de Pseudoxanthome élastique : Analyse d’haplotypes en vue de vérifier la consanguinité dans une famille de patients, confirmation de l’existence d’un pseudogène ».

  2000, août Agent administratif, Régie Principale, Hôpital BROUSSAIS, Paris, Saisie informatique.

  1999, août Agent administratif, Caisse des admissions, Hôpital BROUSSAIS, Paris, Saisie informatique.

  COMMUNICATIONS ORALES

  Esnault C., Boulesteix M., Biémont C. : Anopheles gambiae est-elle en cours de spéciation ? XVème Congrès National sur les Eléments Transposables. Rennes, juillet 2007.

  Esnault C., Boulesteix M., Duchemin J.B., Koffi A., Chandre F., Dabire R., M.J. Donnelly, Robert V., Simard F., F. Tripet, Fontenille D., Biémont C. : Is Anopheles gambiae under incipient speciation ? Vth European Congress on Tropical Medicine and International Health. Amsterdam, mai 2007.

  Biémont C., Esnault C. : Genetic differenciation in Anopheles gambiae revealed by transposon display, Workshop on Transposable Elements. Universitat Autònoma de Barcelona, mars 2007.

  Esnault C., Boulesteix M., Biémont C. : Les parasites du génome, marqueurs de différenciation des populations, Axe Interactions Durables. Lyon, février 2007.

  Esnault C., Boulesteix M., Duchemin J.B., Koffi A., Chandre F., Dabire R., Robert V., Simard F., Fontenille D., Biémont C. : poster Différenciation génétique entre les formes moléculaires M et S des populations africaines d’Anopheles gambiae. Analyse par Transposon Display, Journée Génétique et Génomique Evolutive. Lyon, janvier 2007.

  Boulesteix M., Esnault C. : Polymorphisme d’insertion d’éléments transposables dans les populations naturelles d’Anopheles gambiae. Structuration des populations. Séminaire IRD de Montpellier, novembre 2007.

  Esnault C., Boulesteix M., Biémont C. : Le Transposon Display : une nouvelle approche de mesure moléculaire pour les études populationnelles, Journée GomeBIO. Lyon, octobre 2006.

  Esnault C., Boulesteix M., Biémont C. : poster Insertion polymorphism of the Aara8 transposable element in An. gambiae revealed by Transposon Display. XIVème congrès Eléments Transposables. Clermond Ferrand, juillet 2006.

  PUBLICATIONS

  Germain D. P., Nau V., Esnault C., Jeunemaitre X., Bruneval P. : Pseudoxanthoma elasticum : molecular investigations in a consanguineous family further supports the existence of pseudogenes (psi-ABCC6) homologous to the ABCC6 gene. Gene Funct. Dis. 2 : 208-213, 2001.

  ENSEIGNEMENTS

  2007 Encadrement d’un stage volontaire M1 Biologie Cellulaire et Moléculaire, 4 semaines.

  2007 Cours et TD de Statistiques, dans le cadre du DU « Semestre d’accompagnement aux Sciences », 27h, niveau Licence1, Université Claude Bernard Lyon1.

  2007 Encadrement d’un stage BTS de Biotechnologies 2ème année, 6 semaines.

  2006 Encadrement d’un stage BTS de Biotechnologies 1ère année, 8 semaines.

  2006 TP de Génétique Quantitative (ANOVA) dans le cadre du module « Outils statistiques pour la Biologie », 8h, niveau Licence2, Université Claude Bernard Lyon1.

  2006 et 2007 Cours d’Initiation à la Génétique des Populations, 2 x 4h, niveau Licence3, Institut Catholique d’Enseignement Supérieur (ICES) de la Roche sur Yon.

  2006 et 2007 Cours et TD de Biologie et Génétique de l’Evolution, 2 x 12h, niveau Licence3, Institut Catholique d’Enseignement Supérieur (ICES) de la Roche sur Yon.

  DIVERS

  Pratique de la photographie numérique et du roller, participation à l’association Macadam Roller

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  Dynamique des éléments transposables chez des populations naturelles d’ Anopheles gambiae : analyse du polymorphisme d’insertion

  Dans le but d’utilisation en lutte biologique, la demande de fabrication d’un moustique vecteur d’un gène de résistance au Plasmodium est forte. L’obtention d’un tel moustique génétiquement modifié nécessite la mise au point d’un système de transformation stable. Or un tel système met habituellement en jeu des éléments transposables (ET) dont la principale caractéristique est de se déplacer dans les génomes de façon autonome ou non. Avant toute transformation d’un organisme par ce genre de vecteur et son relachage dans la nature, il est indispensable de connaître la dynamique des ET du génome hôte ainsi bien évidemment que la structuration des populations hôtes. Or, les populations de moustiques sont encore très mal connues et peu d’études de distribution des insertions d’ET du génome de l’Anophèle sont disponibles. Pourtant le génome d’ Anopheles gambiae possède 33% de séquences répétées. Grâce au séquençage du génome complet de l’Anophèle, toute l’information sur les séquences des ET est disponible. Trois axes de recherche se détachent :

  * L’analyse du polymorphisme d’insertion de quelques éléments transposables de populations d’ An. gambiae d’origine géographique différente (Sénégal, Cameroun, Burkina Faso, Côte d’Ivoire, Niger, Bénin, Madagascar et îles voisines, Mali, Ghana).

  * L’analyse de l’expression de certains éléments par northern blots et RT-PCR quantitative au cours de différents stades de développement, aux niveaux somatique et germinal, puis selon les populations, va être menée. L’objectif est de relier le profil d’expression avec des considérations physiologiques, voire écologiques.

  * La charge totale en ET et la taille des génomes d’espèces proches du complexe Anopheles seront estimées dans le but de comprendre le scénario évolutif reliant ces ET à ces espèces.

  

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