Février
ANNULE --- Anton Nekrutenko (Professor, Penn State University, USA)
Salle à préciser
Galaxy : a comprehensive approach for supporting accessible, reproducible, and transparent computational research in the life sciences
Increased reliance on computational approaches in the life sciences has revealed grave concerns about how accessible and reproducible computation-reliant results truly are. Galaxy http://galaxyproject.org web site, an open web-based platform for genomic research, addresses these problems. Galaxy automatically tracks and manages data provenance and provides (…)
Tjalling JAGER
salle de formation du PRABI
Simplifying biology. Process-based models for toxicant effects and how
to apply them.
Living organisms are complex systems, and stressing them with toxicants
only increases the complexity. In ecotoxicology, the common strategy for
addressing toxic effects is to accept this complexity and provide
descriptions of parts of the response of the system. Such descriptions
will not advance our understanding and cannot address the problems of
environmental risk assessment. Complexity is of (…)
herve colinet (Unité d’Écologie et de Biogéographie, Université catholique de Louvain)
Salle de formation du PRABI
Cold tolerance plasticity in Drosophila melanogaster : molecular correlates and metabolomic fingerprints
Temperature affects all aspects of organism’s biological organization and this is particularly true for cold-blooded animals. These organisms possess diverse responses for dealing with thermal stress, they can adapt genetically (i.e. long evolutionary process) and/or they can acclimate (i.e. short-term phenotypic adjustments). Adaptive responses to thermal stress typically involve a range (…)
Philippe Veber (LBBE)
Salle de formation du PRABI
Exploration de données fonctionnelles dans un (grand) réseau de régulation
Dans cet exposé je présenterai une démarche pour intégrer des données de génomique fonctionnelle, basée sur un modèle qualitatif d’interactions moléculaires. Ce modèle s’appuie sur une représentation des systèmes dynamiques sous la forme d’un graphe dont les sommets représentent des molécules et les arcs des interactions (activations ou inhibitions) entre elles. Il définit une notion de compatibilité entre un tel graphe et des (…)
