Groupe de travail NGS
Objectifs :
Le groupe de travail NGS est organisé par le LBBE et rassemble des analystes (chercheurs, ingénieurs, étudiants) de la région lyonnaise (LBBE, CGpMC, LHENA, …) qui s’intéressent aux données provenant des nouvelles technologies de séquencage (NGS). Il se réunit une fois par mois pour discuter des projets de chacun, de la bibliographie en cours, et des animations proposées (congrès, workshops, formations). Les thèmes abordés sont centrés autour de l’analyse de ces données (informatique, algorithmique, statistique, biologique).
Une liste de diffusion est mise en place : ngs@listes.univ-lyon1.fr
Lieu des réunions :
Depuis l’arrêt de tramway (La Doua), marcher jusqu’à l’entrée nord du bâtiment "Gregoire Mendel" (suivre les points rouges sur l’image ci-dessous). Le Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (UMR CNRS 5558) se trouve aux 1er et 2ème étage. Il y a un interphone à l’entrée du laboratoire. Composer le 044 pour contacter le secrétariat. Les réunions ont lieu habituellement dans la salle de réunion du 2ème étage
Prochaines réunions 2012-2013 :
14 Mars 9:15 salle de formation : Annabelle Haudry Genetique des populations
Précedentes réunions 2012-2013 :
4 Fevrier 9:30 salle de reunion du haut : Aline Myule & Gabriel Marais Transcriptome
22 Fevrier 9:30 salle de reunion du haut : Annabelle Haudry sur la génétique des populations
11 Janvier 9:30 salle de reunion du haut : Guy Perriere Métagénomique, F. Mifsud Transcriptome et etude de l’obesite chez des souris
18 Décembre 9:30 salle de reunion du haut : Tristan Lefebure & Vincent Lacroix : transcriptomique des populations
29 Novembre 9:30 salle de reunion du haut : Vincent Navratil : développement de workflows & Galaxy
10 Octobre 9h30 salle de reunion du haut : Emmanuelle Lerat sur ChipSeq, Aurélie Laugraud sur Méthylome
26 Septembre 9h30 salle de reunion du haut : Franck Picard, Modèles linéaires généralisés et analyse différentielle pour le RNASeq
Précedentes réunions 2011-2012 :
mardi 10 Juillet 9h30-11h30 Salle de Reunion du haut
vendredi 4 mai 9h30-11h30 (mappability, GC effect) Vincent Miele, Franck Picard
vendredi 2 mars 2012, 9h30-11h30 Gerard Benoit (cgphimc), transcriptome / regulation / cinetique
mardi 17 janvier 2012, transcriptome assembly
merdredi 16 novembre 2011, coverage
merdredi 9 novembre 2011, transcriptome assembly
mercredi 26 octobre 2011
Contact : franck(dot)picard(at)univ-lyon1.fr
