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Thomas Bigot
former member (2007–2016)
phone: (+33)1 45 68 83 21
Institut Pasteur
27 rue du Docteur Roux
75015 Paris
Building: Centre François Jacob Office: 17B

Docteur
Ingénieur de Recherche
2013−2016 : projet Ancestrome

  • Recherche

    Mes missions au sein du projet Ancestrome :
    - réécriture de méthodes pour les optimiser ;
    - intégration de nouveaux objets / méthodes au sein du projet Bio++ ;
    - packaging (paquets deb/rpm, cmake) ;
    - unification des méthodes développées, mutualisation.

  • Enseignement

    I have been teaching different bioinformatics courses at UCBL, from 2009 to 2016. They are detailed in the French version of this website.

  • Thèse de doctorat (2009–2013) : «Recherche automatisée de motifs dans les arbres phylogénétiques»

    I did a PhD supevised by Guy Perrière about phylogenic tree pattern matching. I developped the tpms suite, which allows to manage phylogenic trees collections. For instance :

    - detect peculiar patterns in the trees,
    - root them using new criteria,
    - detect incongruencies that can be infered as horizontal gene transfers.

    This program is available on github

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