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- Sujet de thèse : Impact de l’hybridation sur la régulation des éléments transposables
+Publications -Publications
article :
Lima L, Sinaimeri B, Sacomoto G, Lopez-Maestre H, Marchet C, Miele V, Sagot MF, Lacroix V (2017)
Playing hide and seek with repeats in local and global de novo transcriptome assembly of short RNA-seq reads, Algorithms for Molecular Biology, vol. 12 pp.2-2.
Lopez-Maestre H, Carnelossi EA, Lacroix V, Burlet N, Mugat B, Chambeyron S, Carareto CM, Vieira C (2017)
Identification of misexpressed genetic elements in hybrids between Drosophila-related species, Scientific reports, vol. 7 pp.40618-40618.
Romero-Soriano V, Modolo L, Lopez-Maestre H, Mugat B, Pessia E, Chambeyron S, Vieira C, Garcia Guerreiro MP (2017)
Transposable Element Misregulation Is Linked to the Divergence between Parental piRNA Pathways in Drosophila Hybrids, Genome biology and evolution, vol. 9 pp.1450-1470.
Lerat E, Fablet M, Modolo L, Lopez-Maestre H, Vieira C (2016)
TEtools facilitates big data expression analysis of transposable elements and reveals an antagonism between their activity and that of piRNA genes, Nucleic Acids Research, vol. 45 pp.e17-e17.
Lopez-Maestre H, Brinza L, Marchet C, Kielbassa J, Bastien S, Boutigny M, Monnin D, El Filali A, Carareto CM, Vieira C, Picard F, Kremer N, Vavre F, Sagot MF, Lacroix V (2016)
SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification quantification differential analysis and impact on the protein sequence, Nucleic Acids Research, vol. 44 pp.e148-e148.
phdthesis :
Lopez-Maestre H (2017)
Analyses et méthodes pour les données transcriptomiques issues d’espèces non modèles variation de l’expression des éléments transposables (et des gènes) et variants nucléotidiques .
