Equipe Sexe et Evolution
Membres
Chargé de recherche
CNRS
Tél : 0472447932
Maître de conférences
UCBL
Tél : 0472433583
Chargée de recherche
CNRS
Comment et pourquoi la reproduction sexuée a évolué est une des grandes questions de la biologie évolutive, une des plus difficiles selon John Maynard Smith. Pendant longtemps, les chercheurs ont tenté de répondre à cette question essentiellement via la théorie. De nouvelles approches telles que l’évolution expérimentale, la génomique et les NGS, et les méthodes phylogénétiques pour étudier l’évolution des caractères sont en train de révolutionner ce domaine de recherche.
Dans notre équipe, nous utilisons certaines de ces approches pour travailler sur plusieurs axes de recherche :
- L’évolution des chromosomes sexuels. A cause de la difficulté à séquencer les chromosomes Y avec les méthodes conventionnelles, l’évolution des chromosomes sexuels est mal connue. Pour avancer sur ce sujet, nous étudions à la fois les chromosomes sexuels animaux et végétaux.
- L’évolution des systèmes sexuels des plantes. Les plantes à fleur ont des systèmes sexuels très diversifiés. Leur base génétique, leur évolution et leur impact sur la diversification des lignées sont très mal connus. Nous nous focalisons sur la dioécie (les espèces avec des sexes séparés) et sur les plantes hermaphrodites avec des systèmes d’auto-incompatibilité.
- La génomique et l’évolution phénotypique chez les plantes. Nous étudions les génomes de plantes dans différents contextes, notamment l’origine de la fleur des angispermes (que Darwin avait appelé « l’abominable mystère ») et la domestication des plantes.
- Les développements méthodologiques. Nous développons des nouvelles méthodes en bioinformatiques et en analyse phylogénétique comparative en lien avec les points 1, 2 et 3.
Notre équipe est dans une démarche de développement du bien-être au travail pour tou.te.s. Nous sommes impliqués dans la vulgarisation scientifique et le travail collaboratif pluridisciplinaire avec les sciences humaines et sociales.
Plus sur nos activités ici: http://pbil.univ-lyon1.fr/members/marais/Lab_website-sept-2020/Home.html
Publications
Affichage des publications 1 à 25 sur 25 au total
Labile sex expression in angiosperm species with sex chromosomes
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 377 ( 1850 )
Article dans une revue
voir la publicationA derived ZW chromosome system in Amborella trichopoda, representing the sister lineage to all other extant flowering plants
New Phytologist . 233 : 1636-1642
DOI: 10.1111/nph.17662
Article dans une revue
voir la publicationPulled Diversification Rates, Lineages-Through-Time Plots, and Modern Macroevolutionary Modeling
Systematic Biology .
Article dans une revue
voir la publicationMale differentiation in the marine Copepod $Oithona\ nana$ reveals the development of a new nervous ganglion and Lin12-Notch-repeat protein-associated proteolysis
Biology . 10 ( 7 ) : 657
Article dans une revue
voir la publicationDetecting sex-linked genes using genotyped individuals sampled in natural populations
Genetics . 218 ( 2 )
Article dans une revue
voir la publicationPlant genera Cannabis and Humulus share the same pair of well-differentiated sex chromosomes
New Phytologist . 231 ( 4 ) : 1599-1611
DOI: 10.1111/nph.17456
Article dans une revue
voir la publicationDetecting sex-linked genes using genotyped individuals sampled in natural populations
Pré-publication
voir la publicationAn efficient RNA-seq-based segregation analysis identifies the sex chromosomes of Cannabis sativa
Genome Research . 30 ( 2 ) : 164-172
Article dans une revue
voir la publicationThe wild grape genome sequence provides insights into the transition from dioecy to hermaphroditism during grape domestication
Genome Biology . 21 ( 1 ) : 223
Article dans une revue
voir la publicationHomme/femme, mâle/femelle : la détermination du sexe dans l’espèce humaine et le reste du vivant
Sexe & genre: De la biologie à la sociologie .
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationProgress and Prospects in Gender Visibility at SMBE Annual Meetings
Genome Biology and Evolution . 10 ( 3 ) : 901-908
DOI: 10.1093/gbe/evy056
Article dans une revue
voir la publicationOn the rarity of dioecy in flowering plants
Molecular Ecology . 26 : 1225-1241
DOI: 10.1111/mec.14020
Article dans une revue
voir la publicationSEX-DETector: a probabilistic approach to study sex chromosomes in non-model organisms
Genome Biology and Evolution . 8 : 2530-2543
DOI: 10.1093/gbe/evw172
Article dans une revue
voir la publicationIdentifying new sex-linked genes through BAC sequencing in the dioecious plant Silene latifolia
BMC Genomics . 16 : 546
Article dans une revue
voir la publicationStandard Sister Clade Comparison Fails when Testing Derived Character States
Systematic Biology . 63 ( 4 ) : 601-609
Article dans une revue
voir la publicationStatistical mechanics of two-dimensional shuffled foams: Geometry-topology correlation in small or large disorder limits
Physical Review E . 89 : 062309
Article dans une revue
voir la publicationAn angiosperm-wide analysis of the gynodioecy-dioecy pathway.
Annals of Botany . 114 : 539-548
DOI: 10.1093/aob/mcu134
Article dans une revue
voir la publicationDioecy is associated with higher diversification rates in flowering plants
Journal of Evolutionary Biology . 27 : 1478-1490
DOI: 10.1111/jeb.12385
Article dans une revue
voir la publicationPatterns of molecular evolution in dioecious and non-dioecious Silene
Journal of Evolutionary Biology . 26 : 335--46
DOI: 10.1111/jeb.12052
Article dans une revue
voir la publicationStatistical Mechanics of Two-Dimensional Shuffled Foams: Prediction of the Correlation between Geometry and Topology
Physical Review Letters . 107 : 1-5
Article dans une revue
voir la publicationMultiple Nuclear Gene Phylogenetic Analysis of the Evolution of Dioecy and Sex Chromosomes in the Genus Silene
PLoS ONE . 6 : e21915
Article dans une revue
voir la publicationSingle cells spreading on a protein lattice adopt an energy minimizing shape
Physical Review Letters . 105 ( 12 ) : 128101
Article dans une revue
voir la publicationThe role of fluctuations and stress on the effective viscosity of cell aggregates.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 106 ( 41 ) : 17271-5
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voir la publicationFrom cells to tissues: physical modelling of the collective behaviour of embryonic cells
Thèse
voir la publicationTopological and geometrical disorder correlate robustly in two-dimensional foams
Pré-publication
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