Penel Simon
Ingénieur d'études
CNRS
Intérêts :
Phylogénomique, génomique comparative, coévolution multi-échelle, réconciliation phylogénétique, représentation d'arbres, clustering de séquences, web.
Base de données HOGENOM : http://hogenom.univ-lyon1.fr/
Logiciel Thirdkind : https://github.com/simonpenel/thirdkind/wiki
Développement:
Rust :
https://crates.io/crates/light_phylogeny
https://crates.io/crates/thirdkind
Node.js, D3.js, Docker :
https://gitlab.in2p3.fr/penel/docker-hogenom-compose
Participation à d'autres projets :
https://gitlab.com/vmiele/silix/
https://project.inria.fr/treerecs/
Formation:
Université Joseph Fourrier, Grenoble
https://www.theses.fr/1997GRE10132
Publications
Affichage des publications 31 à 36 sur 36 au total
Determination of alpha-helix N1 energies after addition of N1 N2 and N3 preferences to helix/coil theory
Protein Science . 9 : 750-754
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voir la publicationPeriodicity in alpha-helix lengths and C-capping preferences
Journal of Molecular Biology . 293 : 1211-1219
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voir la publicationSide-chain structures in the first turn of the alpha-helix
Journal of Molecular Biology . 287 : 127-143
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voir la publicationDetergent binding in trigonal crystals of OmpF porin from Escherichia coli
Biochimie . 80 : 543-551
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voir la publicationNeutron crystallographic evidence of lipase-colipase complex activation by a micelle
EMBO Journal . 16 : 5531-5536
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voir la publicationMAINDEX - manual indexation for area-detector crystallographic data
Journal of Applied Crystallography . 30 : 206-206
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