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Publications

Affichage des publications 1 à 30 sur 4208 au total

A Bayesian Mutation–Selection Framework for Detecting Site-Specific Adaptive Evolution in Protein-Coding Genes

Nicolas Rodrigue, Thibault Latrille, Nicolas Lartillot

Molecular Biology and Evolution . 38 ( 3 ) : 1199-1208

DOI: 10.1093/molbev/msaa265

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Universal probabilistic programming offers a powerful approach to statistical phylogenetics

Fredrik Ronquist, Jan Kudlicka, Viktor Senderov, Johannes Borgström, Nicolas Lartillot, Daniel Lundén...

Communications Biology . 4 ( 1 )

DOI: 10.1038/s42003-021-01753-7

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Quantifying the impact of changes in effective population size and expression level on the rate of coding sequence evolution

Thibault Latrille, Nicolas Lartillot

Theoretical Population Biology . 142 : 57-66

DOI: 10.1016/j.tpb.2021.09.005

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Inferring Long-Term Effective Population Size with Mutation–Selection Models

Thibault Latrille, Vincent Lanore, Nicolas Lartillot

Molecular Biology and Evolution . 38 ( 10 ) : 4573-4587

DOI: 10.1093/molbev/msab160

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Reconstructing the History of Variation in Effective Population Size along Phylogenies

Mathieu Brevet, Nicolas Lartillot

Genome Biology and Evolution . 13 ( 8 )

DOI: 10.1093/gbe/evab150

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Long-Lived Species of Bivalves Exhibit Low MT-DNA Substitution Rates

Mathieu Mortz, Aurore Levivier, Nicolas Lartillot, France Dufresne, Pierre Blier

Frontiers in Molecular Biosciences . 8

DOI: 10.3389/fmolb.2021.626042

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Cytotype Affects the Capability of the Whitefly Bemisia tabaci MED Species To Feed and Oviposit on an Unfavorable Host Plant

Sylvain Benhamou, Isabelle Rahioui, Hélène Henri, Hubert Charles, Pedro da Silva, Abdelaziz Heddi...

mBio .

DOI: 10.1128/mBio.00730-21

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Biopesticide Evaluation from Lab to Greenhouse Scale of Essential Oils Used against Macrosiphum euphorbiae

Lana Dunan, Tara Malanga, Philippe Bearez, Sylvain Benhamou, Lucie Monticelli, Nicolas Desneux...

Agriculture . 11 ( 9 ) : 867

DOI: 10.3390/agriculture11090867

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Revisiting animal photo-identification using deep metric learning and network analysis

Vincent Miele, Gaspard Dussert, Bruno Spataro, Simon Chamaillé-Jammes, Dominique Allainé, Christophe Bonenfant

Methods in Ecology and Evolution . 12 ( 5 ) : 863-873

DOI: 10.1111/2041-210X.13577

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Genetic Variability, Population Differentiation, and Correlations for Thermal Tolerance Indices in the Minute Wasp, Trichogramma cacoeciae

Michela Ion Scot, Lucas Margris, Nadine Sellier, Sylvie Warot, Flavio Gatti, Fabio Siccardi...

Insects .

DOI: 10.3390/insects12111013

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CPCN - BILAN DE MANDATURE 2016 – 2021

Olivier Coutard, Pierre-Olivier Amblard, Claude Amra, Brigitte Bacroix, Pascal Barone, Yannick Barthe...

Pré-publication

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Infections by Transovarially Transmitted DMelSV in Drosophila Have No Impact on Ovarian Transposable Element Transcripts but Increase Their Amounts in the Soma

Marlène Roy, Barbara Viginier, Camille Mayeux, Maxime Ratinier, Marie Fablet

Genome Biology and Evolution . 13 ( 9 )

DOI: 10.1093/gbe/evab207

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Natural Selection beyond Life? A Workshop Report

Sylvain Charlat, André Ariew, Pierrick Bourrat, María Ferreira Ruiz, Thomas Heams, Philippe Huneman...

Life . 11 ( 10 ) : 1051

DOI: 10.3390/life11101051

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The Worldwide Invasion of Drosophila suzukii Is Accompanied by a Large Increase of Transposable Element Load and a Small Number of Putatively Adaptive Insertions

Vincent Mérel, P. Gibert, Inessa Buch, Valentina Rodriguez Rada, Arnaud Estoup, Mathieu Gautier...

Molecular Biology and Evolution . 38 ( 10 ) : 4252-4267

DOI: 10.1093/molbev/msab155

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Phenotypic and Transcriptomic Responses to Stress Differ According to Population Geography in an Invasive Species

Pierre Marin, Angelo Jaquet, Justine Picarle, Marie Fablet, Vincent Merel, Marie-Laure Delignette-Muller...

Genome Biology and Evolution . 13 ( 9 ) : evab208

DOI: 10.1093/gbe/evab208

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CPCN - BILAN DE MANDATURE 2016 – 2021

Olivier Coutard, Pierre-Olivier Amblard, Claude Amra, Brigitte Bacroix, Pascal Barone, Yannick Barthe...
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3D models related to the publication: Patterns of bilateral asymmetry and allometry in Late Devonian Polygnathus conodonts

Catherine Girard, Anne‐lise Charruault, Ronan Ledevin, Sabrina Renaud

MorphoMuseum . 7 ( 2 )

DOI: 10.18563/journal.m3.126

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Applying comparative methods to different databases: lessons from demographic analyses across mammal species

Jean-Michel Gaillard, Victor Ronget, Jean-François Lemaître, Christophe Bonenfant, Guillaume Péron, Pol Capdevila...

Demographic Methods across the Tree of Life .

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Demographic Methods Across the Tree of Life

Roberto Salguero-Gómez, Marlène Gamelon

Ouvrage

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Efficient use of demographic data: Integrated Population Models

Marlène Gamelon, Stefan Vriend, Marcel E. Visser, Caspar A. Hallmann, Suzanne T. E. Lommen, Eelke Jongejans

Demographic Methods across the Tree of Life .

Chapitre d'ouvrage

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Longitudinal demographic data collection

Marlène Gamelon, Josh Firth, Mathilde Le Moullec, William K Petry, Roberto Salguero-Gómez

Demographic Methods across the Tree of Life .

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La place de la statistique dans les nouveaux programmes du baccalauréat 2021

Frédérique Letué, Anne-Béatrice Dufour, Antoine D. Rolland

52èmes Journées de la statistique de la SFdS .

Acte de congrès

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Are human natal sex ratio differences across the world adaptive? A test of Fisher's principle

Mathieu Douhard, Stéphane Dray

Biology Letters . 17 ( 3 )

DOI: 10.1098/rsbl.2020.0620

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Quantifying fixed individual heterogeneity in demographic parameters: Performance of correlated random effects for Bernoulli variables

Rémi Fay, Matthieu Authier, Sandra Hamel, Stéphanie Jenouvrier, Martijn van de Pol, Emmanuelle Cam...

Methods in Ecology and Evolution .

DOI: 10.1111/2041-210x.13728

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Many lifetime growth trajectories for a single mammal

Lara Veylit, Bernt‐erik Sæther, Jean‐michel Gaillard, Eric Baubet, Marlène Gamelon

Ecology and Evolution .

DOI: 10.1002/ece3.8164

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3D models related to the publication: Wild versus lab house mice: Effects of age, diet, and genetics on molar geometry and topography

S. Renaud, Caroline Romestaing, Yoland Savriama

MorphoMuseum . 7 : e141

DOI: 10.18563/journal.m3.141

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A derived ZW chromosome system in Amborella trichopoda, representing the sister lineage to all other extant flowering plants

Jos Käfer, Adam Bewick, Amélie Andres‐robin, Garance Lapetoule, Alex Harkess, José Caïus...

New Phytologist .

DOI: 10.1111/nph.17662

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The Transposable Element Environment of Human Genes Differs According to Their Duplication Status and Essentiality

Margot Correa, Emmanuelle Lerat, Etienne Birmelé, Franck Samson, Bérengère Bouillon, Kévin Normand...

Genome Biology and Evolution . 13 ( 5 )

DOI: 10.1093/gbe/evab062

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Massive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes

Laurent Duret, Diamantis Sellis, Frédéric Guérin, Olivier Arnaiz, Walker Pett, Emmanuelle Lerat...

Plos Biology . 19 ( 7 ) : e3001309

DOI: 10.1371/journal.pbio.3001309

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Massive colonization of protein-coding exons by selfish genetic elements in Paramecium germline genomes

Diamantis Sellis, Frédéric Guérin, Olivier Arnaiz, Walker Pett, Emmanuelle Lerat, Nicole Boggetto...

Plos Biology . 19 ( 7 ) : e3001309

DOI: 10.1371/journal.pbio.3001309

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