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Publications

Affichage des publications 91 à 120 sur 4428 au total

Codiversification of gut microbiota with humans

Taichi Suzuki, J. Liam Fitzstevens, Victor Schmidt, Hagay Enav, Kelsey Huus, Mirabeau Mbong Ngwese...

Science . 377 ( 6612 ) : 1328-1332

DOI: 10.1126/science.abm7759

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The era of reference genomes in conservation genomics

Giulio Formenti, Kathrin Theissinger, Carlos Fernandes, Iliana Bista, Aureliano Bombarely, Christoph Bleidorn...

Trends in Ecology & Evolution . 37 ( 3 ) : 197-202

DOI: 10.1016/j.tree.2021.11.008

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The era of reference genomes in conservation genomics

Florian Maumus, Giulio Formenti, Kathrin Theissinger, Carlos Fernandes, Iliana Bista, Aureliano Bombarely...

Trends in Ecology & Evolution .

DOI: 10.1016/j.tree.2021.11.008

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A review of modelling approaches for ecological risk assessment of pesticides

Floriane Larras, Sandrine Charles, Arnaud Chaumot, Céline Pélosi, Morgane Le Gall, Laure Mamy...

SETAC Europe 32nd annual meeting .

Poster

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Ghost lineages can invalidate or even reverse findings regarding gene flow

Théo Tricou, Eric Tannier, Damien M. de Vienne

Plos Biology . 20 ( 9 ) : e3001776

DOI: 10.1371/journal.pbio.3001776

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Protein conformational space at the edge of allostery: turning a nonallosteric malate dehydrogenase into an “allosterized” enzyme using evolution-guided punctual mutations

Antonio Iorio, Céline Brochier-Armanet, Caroline Mas, Fabio Sterpone, Dominique Madern

Molecular Biology and Evolution . 39 ( 9 ) : msac186

DOI: 10.1093/molbev/msac186

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GOntact: using chromatin contacts to infer Gene Ontology enrichments for cis -regulatory elements

Alexandre Laverré, Eric Tannier, Philippe Veber, Anamaria Necsulea

DOI: 10.1101/2022.06.13.495495

Pré-publication

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Unravelling the environmental correlates influencing the seasonal biodiversity of aquatic Heteropteran assemblages in northern Africa

Noura Slimani, Eric Guilbert, James White, Matthew Hill, Paul Wood, Moncef Boumaïza...

Limnologica . : 126021

DOI: 10.1016/j.limno.2022.126021

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Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective

Laure Mamy, Stéphane Pesce, Wilfried Sanchez, Marcel Amichot, Joan Artigas, Stéphanie Aviron...

: 1408 p.

DOI: 10.17180/0gp2-cd65

Rapport

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Compensatory recruitment allows amphibian population persistence in anthropogenic habitats

Hugo Cayuela, Benjamin Monod-Broca, Jean-François Lemaître Lemaître, Aurélien Besnard, Jérôme Gippet, Benedikt Schmidt...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 119 ( 38 )

DOI: 10.1073/pnas.2206805119

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Prevalence of major digestive and respiratory helminths in dogs and cats in France: results of a multicenter study

Gilles Bourgoin, Marie-Pierre Callait-Cardinal, Emilie Bouhsira, Bruno Polack, Patrick Bourdeau, Clarisse Roussel Ariza...

Parasites & Vectors . 15

DOI: 10.1186/s13071-022-05368-7

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Editorial: Advances in Statistical Ecology: New Methods and Software

Gilles Guillot, Ali Arab, Janine Bärbel Illian, Stéphane Dray

Frontiers in Ecology and Evolution . 9

DOI: 10.3389/fevo.2021.828919

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Sex‐specific body mass ageing trajectories in adult Asian elephants

Lucas Lalande, Virpi Lummaa, Htoo Aung, Win Htut, U. Kyaw Nyein, Vérane Berger...

Journal of Evolutionary Biology . 35 ( 5 ) : 752-762

DOI: 10.1111/jeb.14008

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An Improved Codon Modeling Approach for Accurate Estimation of the Mutation Bias

Thibault Latrille, Nicolas Lartillot

Molecular Biology and Evolution . 39

DOI: 10.1093/molbev/msac005

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Distinct evolutionary trajectories of SARS-CoV-2-interacting proteins in bats and primates identify important host determinants of COVID-19

Marie Cariou, Léa Picard, Laurent Guéguen, Stéphanie Jacquet, Andrea Cimarelli, Oliver Fregoso...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 119 ( 35 )

DOI: 10.1073/pnas.2206610119

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Extreme mitochondrial DNA divergence underlies genetic conflict over sex determination

Patrice David, Cyril Degletagne, Nathanaelle Saclier, Aurel Jennan, Philippe Jarne, Sandrine Plénet...

Current Biology - CB . 32 ( 10 ) : 2325-2333.e6

DOI: 10.1016/j.cub.2022.04.014

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Senior-COVID-Rea Cohort Study: A Geriatric Prediction Model of 30-day Mortality in Patients Aged over 60 Years in ICU for Severe COVID-19

C. Falandry, L. Bitker, P. Abraham, F. Subtil, V. Collange, B. Balança...

Aging and disease . 13 ( 2 ) : 614-623

DOI: 10.14336/ad.2021.1004

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Interpretation of the results of Q fever ELISA tests in domestic ruminants : a user-friendly Shiny appli-cation based on latent class models in a Bayesian framework

T. Lurier, Marie Laure Delignette-Muller, Elsa Jourdain, Florence Ayral, Elodie Rousset

ESCCAR International congress on Rickettsiae and 9th Meeting of the European Society for Chlamydia Research (ESCR) .

Acte de congrès

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Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Synthèse de l’expertise scientifique collective

Sophie Leenhardt, Laure Mamy, Stéphane Pesce, Wilfried Sanchez, Anne Laure Achard, Marcel Amichot...

: 136 p.

DOI: 10.17180/gfkj-e861

Rapport

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Upper upper Albian (Mortoniceras rostratum Zone) cephalopods from Clansayes (Drôme, south-eastern France).

Romain Jattiot, Jens Lehmann, Benjamin Latutrie, Amane Tajika, Emmanuelle Vennin, Pauline Vuarin...

Acta Geologica Polonica . 72 ( 2 ) : 187-233

DOI: 10.24425/agp.2021.139308

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Evaluation using latent class models of the diagnostic performances of three ELISA tests commercialized for the serological diagnosis of Coxiella burnetii infection in domestic ruminants

T. Lurier, Elodie Rousset, Patrick Gasqui, Carole Sala, Clément Claustre, David Abrial...

ESCCAR International congress on Rickettsiae and 9th Meeting of the European Society for Chlamydia Research (ESCR) . : #231

Poster

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Coxiella burnetii within- and between-herd true seroprevalence assessment in domestic ruminants in France accounting for diagnostic uncertainty with latent class

T. Lurier, Elodie Rousset, Carole Sala, Kristel Gache, Marie Laure Delignette-Muller, Elsa Jourdain...

ESCCAR International congress on Rickettsiae and 9th Meeting of the European Society for Chlamydia Research (ESCR) . : #232

Poster

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Telomeres as a sentinel of population decline in the context of global warming

Jean-François Lemaître Lemaître, Jean-Michel Gaillard, Eric Gilson

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 119 ( 35 )

DOI: 10.1073/pnas.2211349119

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FAIR data pipeline: provenance-driven data management for traceable scientific workflows

Sonia Natalie Mitchell, Andrew Lahiff, Nathan Cummings, Jonathan Hollocombe, Bram Boskamp, Ryan Field...

Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences . 380 ( 2233 )

DOI: 10.1098/rsta.2021.0300

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Complex model calibration through emulation, a worked example for a stochastic epidemic model

Michael Dunne, Hossein Mohammadi, Peter Challenor, Rita Borgo, Thibaud Porphyre, Ian Vernon...

Epidemics . 39 : 100574

DOI: 10.1016/j.epidem.2022.100574

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Exact Bayesian inference of epidemiological parameters from mortality data: application to African swine fever virus

David Ewing, Christopher Pooley, Kokouvi Gamado, Thibaud Porphyre, Glenn Marion

Journal of the Royal Society Interface . 19 ( 188 )

DOI: 10.1098/rsif.2022.0013

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Species-Specific Molecular Barriers to SARS-CoV-2 Replication in Bat Cells

Sophie-Marie Aicher, Felix Streicher, Maxime Chazal, Delphine Planas, Dongsheng Luo, Julian Buchrieser...

Journal of Virology . 96 ( 14 )

DOI: 10.1128/jvi.00608-22

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