Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 43 29 00
Doctorante
CNRS
Ingénieure d'études CDD
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 80 51
Stagiaire
UCBL
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 121 à 150 sur 189 au total
Student's Performance and Satisfaction with Web vs. paper-based practice quizzes and lecture notes
Computers and Education . 53 ( 2 ) : 375-384
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voir la publicationDEBtox theory and matrix population models as helpful tools in understanding the interaction between toxic cyanobacteria and zooplankton
Journal of Theoretical Biology . 258 ( 3 ) : 380
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voir la publicationToxicity of ivermectin on cladocerans: comparison of toxic effects on daphnia and ceriodaphnia species
Environmental Toxicology and Chemistry . 28(10) : 2160-2166
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voir la publicationMatrix Population Models as Relevant Modeling Tools in Ecotoxicology
incollection . 2 : 261-298
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voir la publicationChronic effects of ivermectin on Daphnia magna and Ceriodaphnia dubia: between-species and between-strains comparisons
SETAC Europe 18th Annual Meeting . : 1
Poster
voir la publicationChronic effects of ivermectin chronic effects of ivermectin on daphnia magna and ceriodaphnia dubia: between-species and between-strains comparisons
SETAC Europe 18th Annual Meeting . : 1
Poster
voir la publicationStatistical cautions when estimating DEBtox parameters
Journal of Theoretical Biology . 254 ( 1 ) : 55-64
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voir la publicationAn individual-based model to describe a Bullhead population dynamic including temperature variations
Ecological Modelling . 215 : 377-392
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voir la publicationPollution, stochasticity and spatial heterogeneity in the dynamics of an age-structured population of brown trout living in a river network
Demographic toxicity: Methods in ecological risk assessment . 978-0-19-533296-4 : 168-183
Chapitre d'ouvrage
voir la publicationPopulation Dynamics of Grayling: Modelling Temperature and Discharge Effects
Mathematical Modelling of Natural Phenomena . 1 ( 1 ) : 31-48
DOI: 10.1051/mmnp:2006002
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voir la publicationAn individual-based model to describe a bullhead population dynamics including temperature variations
Ecological Modelling . 215 : 377-392
Article dans une revue
voir la publicationDo vertically transmitted symbionts co-existing in a single host compete or cooperate? A modelling approach
Journal of Evolutionary Biology . 21 : 145-161
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voir la publicationOptimal release strategies for the biological control of aphids in melon greenhouses
Biological Control . 48 ( 1 ) : 12 - 21
Article dans une revue
voir la publicationA bayesian approach to analyse ecotoxicological data
Environmental Science and Technology . 42 ( 23 ) : 8978-8984
DOI: 10.1021/es801418x
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voir la publicationDynamic energy budget as a basis to model population-level effects of zinc-spiked sediments in the gastropod valvata piscinalis
Environmental Toxicology and Chemistry . 26 ( 8 ) : 1774-1783
Article dans une revue
voir la publicationIntegrating the lethal and sublethal effects of toxic compounds into the population dynamics of Daphnia magna: A combination of the DEBtox and matrix population models
Ecological Modelling . 203 ( 3-4 ) : 204-214
Article dans une revue
voir la publicationStochasticity and spatial heterogeneity in population dynamics: implications for ecotoxicological risk assessment
SETAC Europe 17th Annual Meeting, Porto, Portugal, PRT, 20-24 May 2007 . : 1
Acte de congrès
voir la publicationEvolution and invasion dynamics of multiple infections with Wolbachia investigated using matrix based models.
Journal of Theoretical Biology . 245 : 197-209
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voir la publicationAn individual-based model for describing the bullhead population dynamics in a river network
The 6th european conference on ecological modelling ECEM 07, Trieste, ITA, 27-30 novembre 2007 . : 1
Acte de congrès
voir la publicationAn implicit approach to model plant infestation by insect pests
Journal of Theoretical Biology . 248 ( 1 ) : 164 - 178
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voir la publicationDynamic energy budget as a basis to model population-level effects of zinc-spiked sediments in the gastropod Valvata piscinalis.
Environmental Toxicology and Chemistry . 26 ( 8 ) : 1774-1783
DOI: 10.1897/06-556R.1
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voir la publicationIntegrating the lethal and sublethal effects of toxic compounds into the population dynamics of Daphnia magna : A combinaison of the DEBtox and matrix population models
Ecological Modelling . 203 : 207-214
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voir la publicationDynamique d'un système hôte-parasitoïde en environnement spatialement hétérogène et lutte biologique Application au puceron Aphis gossypii et au parasitoïde Lysiphlebus testaceipes en serre de melons
Thèse
voir la publicationPopulation dynamics of grayling : modelling temperature and discharge effects.
Mathematical Modelling of Natural Phenomena . 1 ( 1 ) : 33-48
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voir la publicationTESD : a transposable element dynamics simulation environment
Bioinformatics . 22 : 2702-2703
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voir la publicationFirst step of a modeling approach to evalue spatial heterogeneity in fish (Cottus gobio) population dynamics
Ecological Modelling . 197 : 263-273
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voir la publicationUn dispositif web pour l'enseignement des mathématiques à l'université : quels impacts sur la performance et la motivation des étudiants ?
STICEF (Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication pour l'Éducation et la Formation) . 13 : 17 pages
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voir la publicationFirst step of a modeling approach to evaluate spatial heterogeneity in a fish (Cottus gobio) population dynamics
Ecological Modelling . 197 : 263-273
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voir la publicationPopulation dynamics of grayling: Modelling temperature and discharge effects
Mathematical Modelling of Natural Phenomena . 1 : 33-48
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voir la publicationEcotoxicology and population dynamics: Using DEBtox models in a Leslie modeling approach
Ecological Modelling . 188 ( 1 ) : 30-40
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