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Publications

Affichage des publications 151 à 180 sur 352 au total

SNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence

Hélène Lopez-Maestre, Lilia Brinza, Camille Marchet, Janice Kielbassa, Sylvère Bastien, Mathilde Boutigny...

Nucleic Acids Research .

DOI: 10.1093/nar/gkw655

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The draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis

Carlos Vargas-Chavez, Nicolas Parisot, Clément Goubert, Patrice Baa-Puyoulet, Severine Balmand, M. Boulesteix...

Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) .

Poster

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Strong phylogenetic inertia on genome size and transposable element content among 26 species of flies

Camille Sessegolo, Nelly Burlet, Annabelle A. Haudry

Biology Letters . 12 ( 8 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0407

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Drosophila Females Undergo Genome Expansion after Interspecific Hybridization

Valèria Romero-Soriano, Nelly Burlet, Doris Vela, Antonio Fontdevila, Cristina Vieira, Maria Pilar Garciá Guerreiro

Genome Biology and Evolution . 8 ( 3 ) : 556-561

DOI: 10.1093/gbe/evw024

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No Evidence That Nitrogen Limitation Influences the Elemental Composition of Isopod Transcriptomes and Proteomes

Clémentine François, L. Duret, Laurent Simon, Florian Mermillod-Blondin, Florian Malard, Lara Konecny-Dupré...

Molecular Biology and Evolution . 33 ( 10 ) : 2605–2620

DOI: 10.1093/molbev/msw131

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Beneficial effects of group size on oxidative balance in a wild cooperative breeder

Sophie Lardy, Benjamin Rey, Karine Salin, Yann Voituron, Aurélie Cohas

Behavioral Ecology . 27 ( 6 ) : 1820–1825

DOI: 10.1093/beheco/arw114

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L'enseignement et la formation au logiciel R : un retour d'expérience

Julien Barnier

Séminaire "R à l'usage des sciences sociales" (RUSS) .

Acte de congrès

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RAR/RXR binding dynamics distinguish pluripotency from differentiation associated cis-regulatory elements

Amandine Chatagnon, Philippe Veber, Valérie Morin, Justin Bedő,, Gérard Triqueneaux, Marie Sémon...

Nucleic Acids Research . 43 ( 10 ) : 4833--4854

DOI: 10.1093/nar/gkv370

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Two Host Clades, Two Bacterial Arsenals: Evolution through Gene Losses in Facultative Endosymbionts.

Pierre-Antoine Rollat-Farnier, Diego Santos-Garcia, Qiong Rao, Marie-France Sagot, Francisco J Silva, Hélène Henri...

Genome Biology and Evolution . 7 ( 3 ) : 839-855

DOI: 10.1093/gbe/evv030

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Oxidative phosphorylation efficiency, proton conductance and reactive oxygen species production of liver mitochondria correlates with body mass in frogs

Damien Roussel, Karine Salin, Adeline Dumet, Caroline Romestaing, Benjamin Rey, Yann Voituron

Journal of Experimental Biology . 218 : 3222-3228

DOI: 10.1242/jeb.126086

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Detection of genetically isolated entities within the Mediterranean species of Bemisia tabaci: new insights into the systematics of this worldwide pest

Laurence Mouton, Olivier Gnankiné, Hélène Henri, Gabriel Terraz, Guillaume Ketoh, Thibaud Martin...

Pest Management Science . 71 ( 3 ) : 452-458

DOI: 10.1002/ps.3834

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Revisiting the link between breeding effort and oxidative balance through field evaluation of two sympatric sibling insect species

Benjamin Rey, Pierre-François Pélisson, Marie-Claude Bel-Venner, Yann Voituron, Samuel Venner

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 69 ( 3 ) : 815–822

DOI: 10.1111/evo.12586

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Résilience systémique d’un territoire composé d’activités essentielles suite à une perturbation majeure – Approches systémique et spatiale

Benjamin Rey

Thèse

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Estimating resting metabolic rate by biologging core and subcutaneous temperature in a mammal

Benjamin Rey, Lewis G Halsey, Robin Hetem, Andrea Fuller, Duncan Mitchell, Jean-Louis Rouanet

Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology . 183 : 72–77

DOI: 10.1016/j.cbpa.2015.01.012

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Unknown age in health disorders: A method to account for its cumulative effect and an application to feline viruses interactions.

Eléonore Hellard, Dominique Pontier, Aurélie Siberchicot, Frank Sauvage, David Fouchet

Epidemics . 11 : 48-55

DOI: 10.1016/j.epidem.2015.02.004

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Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) host-plant variants: two host strains or two distinct species?

Pascaline Dumas, Fabrice Legeai, Claire Lemaitre, Erwan Scaon, Marion Orsucci, Karine Labadie...

Genetica . 143 ( 3 ) : 305-316

DOI: 10.1007/s10709-015-9829-2

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Optimization of multiplexed RADseq libraries using low-cost adaptors

Hélène Henri, Marie Cariou, Gabriel Terraz, Sonia Martinez, Adil El Filali, Marine Veyssière...

Genetica . 143 ( 2 ) : 139-143

DOI: 10.1007/s10709-015-9828-3

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Combining High-Resolution Contact Data with Virological Data to Investigate Influenza Transmission in a Tertiary Care Hospital

Nicolas Voirin, Cécile Payet, Alain Barrat, Ciro Cattuto, Nagham Khanafer, Corinne Régis...

Infection Control and Hospital Epidemiology . 36 ( 3 ) : 254

DOI: 10.1017/ice.2014.53

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Générer des documents avec RMarkdown

Julien Barnier

Rencontre du groupe des utilisateurs de R sur Lyon .

Acte de congrès

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From bicycle sharing system movements to users: a typology of Vélo’v cyclists in Lyon based on large-scale behavioural dataset

Marie Vogel, Ronan Hamon, Guillaume Lozenguez, Luc Merchez, Patrice Abry, Julien Barnier...

Journal of Transport Geography . 41 : 280-291

DOI: 10.1016/j.jtrangeo.2014.07.005

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Determining the instar of a weevil larva (Coleoptera: Curculionidae) using a parsimonious method

A. Merville, A. Vallier, Samuel Venner, A. Siberchicot, D. Fouchet, A. Heddi...

European Journal of Entomology . 111 ( 4 ) : 567-573

DOI: 10.14411/eje.2014.056

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Host plant specialization matters in the epidemiology of Wolbachia across phytophagous wasps (Hymenoptera: Torymidae)

Thomas Boivin, Hélène Henri, Fabrice Vavre, Cindy Gidoin, Philippe Veber, Jean-Noël Candau...

8. International Wolbachia Conference . : np

Poster

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Host plant specialization influences the spread of endosymbiotic parthenogenesis in seed wasps (Hymenoptera: Torymidae)

Thomas Boivin, Hélène Henri, Fabrice Favre, Cindy Gidoin, Philippe Veber, Jean-Noël Candau...

IUFRO joint meeting: 7.03.06 "Integrated Management of Forest Defoliating Insects" and 7.03.01 "Cone and seed insects" .

Acte de congrès

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Thyroid status affects membranes susceptibility to free radicals and oxidative balance in skeletal muscle of Muscovy ducklings (Cairina moschata)

Benjamin Rey, Caroline Romestaing, Jacques Bodennec, Adeline Dumet, Anaïs Fongy, Claude Duchamp...

Journal of Experimental Zoology . 321A : 415-421

DOI: 10.1002/jez.1872

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Statistical handling of reproduction data for exposure-response modeling

Marie Laure Delignette-Muller, Christelle Lopes, Philippe Veber, Sandrine Charles

Environmental Science and Technology . 48 : 7544-51

DOI: 10.1021/es502009r

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Chemical immobilization and anesthesia of free-living aardvarks (orycteropus afer) with ketamine-medetomidine-midazolam and isoflurane

Benjamin Rey, M. A. Costello, A. Fuller, A. Haw, R. S. Hetem, D. Mitchell...

Journal of wildlife diseases . 50 ( 4 ) : 864-72

DOI: 10.7589/2013-07-166

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Early septic shock induces loss of oxidative phosphorylation yield plasticity in liver mitochondria

Pierre Eyenga, Damien Roussel, Jérôme Morel, Benjamin Rey, Caroline Romestaing, Loïc Teulier...

Journal of Physiology and Biochemistry . 70 ( 2 ) : 285-296

DOI: 10.1007/s13105-013-0280-5

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Ontogeny of non-shivering thermogenesis in Muscovy ducklings (Cairina moschata)

Loïc Teulier, Jean-Louis Rouanet, Benjamin Rey, Damien Roussel

Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology . 175 : 82-89

DOI: 10.1016/j.cbpa.2014.05.012

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Epidemiology of asexuality induced by the endosymbiotic Wolbachia across phytophagous wasp species: host plant specialization matters.

Thomas Boivin, Hélène Henri, Fabrice Vavre, Cindy Gidoin, Philippe Veber, Jean-Noël Candau...

Molecular Ecology Notes . 23 ( 9 ) : 2362-2375

DOI: 10.1111/mec.12737

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Specific Activation of an I-Like Element in Drosophila Interspecific Hybrids

Elias a G Carnelossi, Emmanuelle Lerat, Hélène Henri, Sonia Martinez, Claudia M A Carareto, Cristina Vieira

Genome Biology and Evolution . 6 : 1806 - 1817

DOI: 10.1093/gbe/evu141

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