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Publications

Affichage des publications 3061 à 3090 sur 6000 au total

A polynomial delay algorithm for the enumeration of bubbles with length constraints in directed graphs and its application to the detection of alternative splicing in RNA-seq data

Gustavo Akio Tominaga Sacomoto, Vincent Lacroix, Marie-France Sagot

Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) .

Acte de congrès

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Telling Stories Fast

Michele Borassi, Pierluigi Crescenzi, Vincent Lacroix, Andrea Marino, Marie-France Sagot, Paulo Vieira Milreu

12th International Symposium Experimental Algorithms (SEA) . 7933 : 200-211

Acte de congrès

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Predicting the proteins of Angomonas deanei, Strigomonas culicis and their respective endosymbionts reveals new aspects of the trypanosomatidae family

Maria Cristina Machado Motta, Allan Cezar de Azevedo Martins, Silvana Sant'Anna de Souza, Carolina Moura Costa Catta-Preta, Rosane Silva, Cecilia Coimbra Klein...

PLoS ONE . 8 ( 4 ) : e60209

DOI: 10.1371/journal.pone.0060209

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Génomes, protéomes et transcriptomes à foison

G. Perrière

Pour la science . 433 : 38--39

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Bioinformatique : cours et cas pratique

Gilbert Deléage, Manolo Gouy

978-2-10-058751-3

Ouvrage

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Comparing parent-offspring regression with frequentist and Bayesian animal models to estimate heritability in wild populations: a simulation study for Gaussian and binary traits

P. De Villemereuil, Olivier Gimenez, Blandine Doligez

Methods in Ecology and Evolution . 4 : 260-275

DOI: 10.1111/2041-210x.12011

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A la recherche du juste dosage : statistique appliquée à l'analyse de la cocaïne

Laurence Dujourdy, C. Charvoz, M. Dalmasso, Anne-Béatrice Dufour

Annales Pharmaceutiques Françaises . 71 ( 3 ) : 193-200

DOI: 10.1016/j.pharma.2013.01.005

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Mycobacterium bourgelatii sp. nov., a rapidly growing, non-chromogenic species isolated from the lymph nodes of cattle.

Véronique Guérin-Faublée, Jean-Pierre Flandrois, Catherine Pichat, Maria Laura Boschiroli, Brigitte Lamy

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 63 ( Pt 12 ) : 4669-74

DOI: 10.1099/ijs.0.051979-0

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Candida albicans and non- Candida albicans fungemia in an institutional hospital during a decade

Jean-Pierre Flandrois, Laurence Parmeland, Mathieu Gazon, Claude Guérin, Laurent Argaud, Jean-Jacques Lehot...

Medical Mycology . 51 ( 1 ) : 33-37

DOI: 10.3109/13693786.2012.686673

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Diminution of 2,3,5-triphenyltetrazolium chloride toxicity on Listeria monocytogenes growth by iron source addition to the culture medium

T. Junillon, Jp. Flandrois

Food Microbiology . 38 : 1--5

DOI: 10.1016/j.fm.2013.07.005

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A guide for using functional diversity indices to reveal changes in assembly processes along ecological gradients

N. Mason, F. de Bello, D. Mouillot, S. Pavoine, S. Dray

Journal of Vegetation Science . 24 : 794--806

DOI: 10.1111/jvs.12013

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Fitness consequences of northward dispersal as possible adaptation to climate change, using experimental translocation of a migratory passerine

C. Bürger, A. Nord, J. A. Nilsson, E. Gilot-Fromont, C. Both

PLoS ONE . 8 : e83176

DOI: 10.1371/journal.pone.0083176

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Experimental infection of pregnant Pyrenean chamois (Rupicapra pyrenaica) with border disease virus subtype 4.

Claire Martin, Véronique Duquesne, Jean-Michel Guibert, Coralie Pulido, Emmanuelle Gilot-Fromont, Philippe Gibert...

Journal of wildlife diseases . 49 ( 1 ) : 55-68

DOI: 10.7589/2011-09-260

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Mesotoga infera sp. nov., a mesophilic member of the order Thermotogales, isolated from an underground gas storage aquifer.

Wajdi Ben Hania, Anne Postec, Thomas Aüllo, Anthony Ranchou-Peyruse, Gaël Erauso, Céline Brochier-Armanet...

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 63 ( Pt 8 ) : 3003-8

DOI: 10.1099/ijs.0.047993-0

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Metagenomics of Kamchatkan hot spring filaments reveal two new major (hyper)thermophilic lineages related to Thaumarchaeota

L. Eme, Lj. Reigstad, A. Spang, A. Lanzen, T. Weinmaier, T. Rattei...

Research in Microbiology . 164 : 425--38

DOI: 10.1016/j.resmic.2013.02.006

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Théorie des Codes : compression, cryptage, correction, 2e edition

Jean-Guillaume Dumas, Jean-Louis Roch, Eric Tannier, Sébastien Varrette

9782100599110 : 384

Ouvrage

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The genome of the medieval Black Death agent (extended abstract)

Ashok Rajaraman, Eric Tannier, Cedric Chauve

Pré-publication

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Gene tree correction guided by orthology

Manuel Lafond, Magali Semeria, Krister M. Swenson, Eric Tannier, Nadia El-Mabrouk

BMC Bioinformatics . 14 ( Suppl 15 ) : S5

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Duplication, Rearrangement and Reconciliation: A Follow-Up 13 Years Later

Cedric Chauve, Nadia El-Mabrouk, Laurent Gueguen, Magali Semeria, Eric Tannier

Models and Algorithms for Genome Evolution . 19 : 47-62

Chapitre d'ouvrage

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The rhizome of the multidrug-resistant Enterobacter aerogenes genome reveals how new "killer bugs" are created because of a sympatric lifestyle.

Seydina Diene, Vicky Merhej, Mireille Henry, Adil El Filali, Véronique Roux, Catherine Robert...

Molecular Biology and Evolution . 30 ( 2 ) : 369-83

DOI: 10.1093/molbev/mss236

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Resistance of Drosophila suzukii to the larval parasitoids Leptopilina heterotoma and Asobara japonica is related to haemocyte load

Mathilde Poyet, Sebastien Havard, Geneviève Prevost, Olivier Chabrerie, Géraldine Doury, Patricia Gibert...

Physiological Entomology . 38 ( 1 ) : 45 - 53

DOI: 10.1111/phen.12002

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Initial symbiont contact orchestrates host-organ-wide transcriptional changes that prime tissue colonization.

Natacha Kremer, Eva E R Philipp, Marie-Christine Carpentier, Caitlin A Brennan, Lars Kraemer, Melissa A Altura...

Cell Host and Microbe . 14 ( 2 ) : 183-94

DOI: 10.1016/j.chom.2013.07.006

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Animals in a bacterial world, a new imperative for the life sciences.

Margaret Mcfall-Ngai, Michael G Hadfield, Thomas C G Bosch, Hannah V Carey, Tomislav Domazet-Lošo, Angela E Douglas...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 110 ( 9 ) : 3229-36

DOI: 10.1073/pnas.1218525110

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Utilization of Machine-Learning Methodologies in Order to Understand Complex Evolutionary and Functional Links among Bacterial Genomes

Olivier Poirion, Bénédicte Lafay

IFCS2013 Book of abstracts . : p. 203

Acte de congrès

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Tracing the origin of megaplasmids and secondary chromosomes in bacterial genomes

Olivier Poirion, Laurent Krähenbühl, Bénédicte Lafay

SBME . : A049 363

Acte de congrès

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Visualization and analysis of an interconnected network of genomic elements

Olivier Poirion, Bénédicte Lafay

AdO'13: Apprentissage et données Omiques - Atelier de la conférence d'apprentissage Francophone CAp'13 - PFIA 2013 8ème Plate-Forme Intelligence Artificielle . : AdO-13_paper_6

Acte de congrès

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Reconstructing the Phylogenetic History of Long-Term Effective Population Size and Life-History Traits Using Patterns of Amino Acid Replacement in Mitochondrial Genomes of Mammals and Birds

Benoit Nabholz, Nicole Uwimana, Nicolas Lartillot

Genome Biology and Evolution . 5 ( 7 ) : 1273 - 1290

DOI: 10.1093/gbe/evt083

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Transcriptome Characterisation of the Ant Formica exsecta with New Insights into the Evolution of Desaturase Genes in Social Hymenoptera

Hélène E Badouin, Khalid Belkhir, Emma Gregson, Juan Galindo, Liselotte Sundström, Stephen Martin...

PLoS ONE . 8 ( 7 ) : e68200

DOI: 10.1371/journal.pone.0068200

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Seasonal Diet and Prey Preference of the African Lion in a Waterhole-Driven Semi-Arid Savanna

Zeke Davidson, Marion Valeix, Freya van Kesteren, Andrew Loveridge, Jane Hunt, Felix Murindagomo...

PLoS ONE . 8 ( 2 ) : e55182

DOI: 10.1371/journal.pone.0055182

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Efficient Exploration of the Space of Reconciled Gene Trees.

Gergely J Szöllosi, Wojciech Rosikiewicz, Bastien Boussau, Eric Tannier, Vincent Daubin

Systematic Biology . 62 ( 6 ) : 901-912

DOI: 10.1093/sysbio/syt054

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