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Publications

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Phylogeny and biogeography of African Murinae based on mitochondrial and nuclear gene sequences, with a new tribal classification of the subfamily.

E. Lecompte, K. Aplin, C. Denys, F. Catzeflis, M. Chades, P. Chevret

BMC Evolutionary Biology . 8 : 199

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DigiPINS: A database for vertebrate exonic single nucleotide polymorphisms and its application to cancer association studies

Vincent Navratil, Simon Penel, Stephane Delmotte, Dominique Mouchiroud, Christian Gautier, Abdel Aouacheria

Biochimie . 90 ( 4 ) : 563-569

DOI: 10.1016/j.biochi.2007.09.017

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DigiPINS: a database for vertebrate exonic single nucleotide polymorphisms and its application to cancer association studies.

V. Navratil, Simon Penel, Sebastien Delmotte, D. Mouchiroud, Christian Gautier, A. Aouacheria

Biochimie . xxx : 563-569

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ISG20L2, a novel vertebrate nucleolar exoribonuclease involved in Ribosome biogenesis.

Yohann Couté, Karine Kindbeiter, Stéphane Belin, Régis Dieckmann, L. Duret, Laurent Bezin...

Molecular and Cellular Proteomics . 7 : epub ahead of print

DOI: 10.1074/mcp.M700510-MCP200

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Translational control of intron splicing in eukaryotes

Olivier Jaillon, Khaled Bouhouche, Jean-François Gout, Jean-Marc Aury, Benjamin Noel, Baptiste Saudemont...

Nature . 451 ( 7176 ) : 359-362

DOI: 10.1038/nature06495

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Biased Gene Conversion and its Impact on Human Genome Evolution

N. Galtier, L. Duret

incollection . -- : 273-277

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Enumerating precursor sets of target metabolites in a metabolic network

L. Cottret, P.V. Milreu, Vicente Acuna, A. Marchetti-Spaccamela, F. Viduani Martinez, M.F. Sagot...

WABI 2008 - 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics . 5251 : 233-244

Acte de congrès

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Evolution des organismes bactériens

Guillaume Beslon, Federica Calevro, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, Carole Knibbe, Stéphane Génieys...

Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 12 diapos

Acte de congrès

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Benchmarking RNA secondary structure comparison algorithms

Julien Allali, Yves d'Aubenton-Carafa, Cedric Chauve, Alain Denise, Christine Drevet, Pascal Ferraro...

Actes des Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématiques . : 67-68

Acte de congrès

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A small trip in the untranquil world of genomes a survey on the detection and analysis of genome rearrangement breakpoints

Claire Lemaitre, M.-F. Sagot

Theoretical Computer Science . 395 : 171-192

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Exploring the Solution Space of Sorting by Reversals, with Experiments and an Application to Evolution

Marília D.V. Braga, Marie-France Sagot, Celine Scornavacca, Eric Tannier

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 5 ( 3 ) : 348-356

DOI: 10.1109/TCBB.2008.16

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Benchmarking RNA secondary structure comparison algorithms

J. Allali, Y. d'Aubenton-Carafa, C. Chauve, A. Denise, C. Drevet, P. Ferraro...

Proc. JOBIM . : 67-68

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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analyses

Augusto Vellozo, Stefano Colella, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, Yvan Rahbé...

Integrative Post-Genomics - IPG'08 .

Acte de congrès

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Les réseaux métaboliques et génétiques

H. Charles, G. Beslon, Federica Calevro, Jean-François Boulicaut, J.M. Fayard, G. Febvay...

Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1

Acte de congrès

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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum

Hubert Charles, Federica Calevro, Stefano Colella, Jean-Michel Fayard, Gérard Febvay, Yvan Rahbé...

Séminaire INRA AgroBI .

Acte de congrès

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Annotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses

Stefano Colella, Augusto Vellozo, L. Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, Yvan Rahbé...

4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1" .

Poster

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Modes and Cuts in Metabolic Networks:Complexity and Algorithms

Vicente Acuna, F. Chierichetti, Vincent Lacroix, A. Marchetti-Spaccamela, M.-F. Sagot, L. Stougie

BioSystems . 95 - n°1 : 51-60

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Precise detection of rearrangement breakpoints in mammalian chromosomes

Claire Lemaitre, Eric Tannier, Christian Gautier, Marie-France Sagot

: 26

Rapport

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Transcriptomique

Jean-François Boulicaut, Federica Calevro, H. Charles, J.M. Fayard, G. Febvay, Olivier Gandrillon...

Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1

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Efficient representation and P-value computation for high-order Markov motifs

P. Soares da Fonseca, Christian Gautier, K.S Guimarães, M.-F. Sagot

Bioinformatics . 24 : i160-i166

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Polymorphism of the Staphylococcus aureus Panton-Valentine LeukocidinGenes and Its Possible Link with the Fitness of Community-Associated Methicillin-Resistant S. aureus

O. Dumitrescu, A. Tristan, H. Meugnier, M. Bes, Manolo Gouy, J. Etienne...

Journal of Infectious Diseases . 198 ( 5 ) : 792-794

DOI: 10.1086/590914

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Fecundity and survival in relation to resistance to oxidative stress in a free-living bird

P. Bize, G. Devevey, P. Monaghan, Blandine Doligez, P. Christe

Ecology . 89(8) : 2584-2593

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Habitat Selection and Habitat Suitability Preferences

Blandine Doligez, T. Boulinier

incollection . 3 : 1810-1830

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Spatial scale of local breeding habitat quality and adjustment of breeding decisions

Blandine Doligez, A. Berthouly, D. Doligez, Mark Tanner, V. Saladin, D. Bonfils...

Ecology . 89 : 1436-1444

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On the number of principal components: A test of dimensionality based on measurements of similarity between matrices

S. Dray

Computational Statistics and Data Analysis . 52 : 2228-2237

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Age-specific feeding cessation in male red deer during rut

A. Mysterud, C. Bonenfant, L.E. Loe, R. Langvatn, Ng. Yoccoz, / Stenseth

Journal of Zoology . 275(4) : 469-477

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Population density and sex do not influence fine-scale natal dispersal in roe deer

J.-M. Gaillard, A.J.M. Hewison, P. Kjellander, N. Pettorelli, C. Bonenfant, B. van Moorter...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 275 : 2025-2030

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The timing of male reproductive effort relative to female ovulation in a capital breeder

A. Mysterud, C. Bonenfant, L.E. Loe, R. Langvatn, N.G. Yoccoz, / Stenseth

Journal of Animal Ecology . 77(3) : 469-477

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Antibodies against Salmonella is associated with reduced reproductive success in female alpine chamois (rupicapra rupicapra)

M. Pioz, A. Loison, Patricia Gibert, J.-M. Jullien, Marc Artois, Emmanuelle Gilot-Fromont

Canadian Journal of Zoology . 86 : 1111-1120

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