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Publications

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Cassis: detection of genomic rearrangement breakpoints.

Christian Baudet, Claire Lemaitre, Zanoni Dias, Christian Gautier, Eric Tannier, Marie-France Sagot

Bioinformatics . 26 ( 15 ) : 1897-8

DOI: 10.1093/bioinformatics/btq301

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Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum

Iagc The International Aphid Genomics Consortium, Federica Calevro, Hubert Charles, Stefano Colella, Gérard Febvay, Caroline Anselme...

PLoS Biology . 8 ( 2 ) : e1000313

DOI: 10.1371/journal.pbio.1000313

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Repetition-free longest common subsequence

S.S Adi, M. Braga, C.G. Fernandes, C.E. Ferreira, F.V. Martinez, M.-F. Sagot...

Discrete Applied Mathematics . 158 ( 12 ) : 1315-1324

DOI: 10.1016/j.dam.2009.04.023

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Combination of measures distinguishes pre-miRNAs from other stem-loops in the genome of the newly sequenced Anopheles darlingi

Nuno Mendes, Ana Freitas, Ana Vasconcelos, Marie-France Sagot

BMC Genomics . 11 ( 1 ) : 529

DOI: 10.1186/1471-2164-11-529

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Genetic structure and linkage disequilibrium in 4 species of the Vitis genus

Patrice P. This, Stephane Nicolas, Alexis Dereeper, Agnès Doligez, Jean-Pierre Peros, Roberto Bacilieri...

Génoplante .

Poster

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SeaView Version 4: a Multiplatform Graphical User Interface for Sequence Alignment and Phylogenetic Tree Building

Manolo Gouy, Stéphane Guindon, Olivier Gascuel

Molecular Biology and Evolution . 27 : 221-224

DOI: 10.1093/molbev/msp259

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Coping with human disturbance: spatial and temporal tactics of the brown bear Ursus arctos

J. Martin, M. Basille, B. van Moorter, J. Kindberg, Dominique Allainé, J.E. Swenson

Canadian Journal of Zoology . 88 ( 9 ) : 875-883

DOI: 10.1139/Z10-053

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La sélection sexuelle

Frank Cézilly, Dominique Allainé

Biologie évolutive . 9782807302969 : 387-422

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Mate change in a socially monogamous mammal: evidences support the "forced divorce" hypothesis

S. Lardy, Aurélie Cohas, I. Figueroa, Dominique Allainé

Behavioral Ecology . 22 ( 1 ) : 120-125

DOI: 10.1093/beheco/arq168

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Ungulates and their management in France

D. Maillard, J.M. Gaillard, M.A.J. Hewison, Philippe Ballon, Patrick Duncan, A. Loison...

European ungulates and their management in the 21th century, Apollonio, M., Andersen, R., Putman, R. (eds) . 978-0-521-76061-4 : 441-474

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Fitness costs of reproduction depend on life speed: empirical evidence from mammalian populations

S. Hamel, J.M. Gaillard, N.G. Yoccoz, A. Loison, C. Bonenfant, S. Descamps

Ecology Letters . 13 ( 7 ) : 915-935

DOI: 10.1111/j.1461-0248.2010.01478.x

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Seroprevalence and factors associated with Toxoplasma gondii infection in wild boar ( Sus scrofa) in a Mediterranean island.

Céline Richomme, Eve Afonso, V. Tolon, Christian Ducrot, Lénaig Halos, Annie Alliot...

Epidemiology and Infection . 138 ( 9 ) : 1257-1266

DOI: 10.1017/S0950268810000117

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Transmission dynamics of Toxoplasma gondii along an urban–rural gradient

M. Lélu, Michel Langlais, Marie-Lazarine Poulle, Emmanuelle Gilot-Fromont

Theoretical Population Biology . 78 : 139-147

DOI: 10.1016/j.tpb.2010.05.005

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Additional haplogroups of Toxoplasma gondii out of Africa: population structure and mouse-virulence of strains from Gabon.

Aurélien Mercier, Sébastien Devillard, Barthélémy Ngoubangoye, Henri Bonnabau, Anne-Laure Bañuls, Patrick Durand...

PLoS Neglected Tropical Diseases . 4 ( 11 ) : e876

DOI: 10.1371/journal.pntd.0000876

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Distinct gene set in two different lineages of ammoniaoxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota

A. Spang, R. Hatzenpichler, Céline Brochier-Armanet, T. Rattei, P. Tischler, E. Spieck...

Trends Microbiol . 18(8) : 331-40

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Nitrosopumilus maritimus genome reveals unique mechanisms for nitrification and autotrophy in globally distributed marine crenarchaea

C.B. Walker, J.R. La Torre, M.G. Klotz, H. Urakawa, N. Pinel, D.J. Arp...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 ( 19 ) : 8818-23

DOI: 10.1073/pnas.0913533107

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Structure, function, and evolution of the Thiomonas spp. genome.

Florence Arsène-Ploetze, Sandrine Koechler, Marie Marchal, Jean-Yves Coppée, Michael Chandler, Violaine Bonnefoy...

PLoS Genetics . 6 ( 2 ) : e1000859

DOI: 10.1371/journal.pgen.1000859

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RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics

Eric Tannier

8. Annual RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics . 978-3-642-16181-0 : 303

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Comparative Genomics

Eric Tannier

incollection . 6938 : 1-12

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RECONSTRUCTING ORIGINS OF LOSS OF SELF-INCOMPATIBILITY AND SELFING IN NORTH AMERICAN ARABIDOPSIS LYRATA: A POPULATION GENETIC CONTEXT

John Paul Foxe, Marc Stift, Andrew Tedder, Annabelle A. Haudry, Stephen Wright, Barbara Mable

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 64 ( 12 ) : 3495 - 3510

DOI: 10.1111/j.1558-5646.2010.01094.x

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Reconstructing origins of loss of self-incompatibility and selfing in North American Arabidopsis lyrata: a population genetic context

John Paul Foxe, Marc Stift, Andrew Tedder, Annabelle A. Haudry, Stephen Wright, Barbara Mable

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 64 : 3495-3510

DOI: 10.1111/j.1558-5646.2010.01094.x

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Size-assortative pairing in Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda): a test of the prudent choice hypothesis.

Nathalie Franceschi, Jean-François Lemaître, Frank Cézilly, Loïc Bollache

Animal Behaviour . 79 ( 4 ) : 911-916

DOI: 10.1016/j.anbehav.2010.01.002

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A genetic schizophrenia-susceptibility region located between the ANKK1 and DRD2 genes

C. Dubertret, C. Bardel, N. Ramoz, P-M. Martin, J-C. Deybach, J. Adès...

Progress in Neuro-Psychopharmacology and Biological Psychiatry . 34 : 492-499

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Costs and benefits of colony size vary during the breeding cycle in Black-headed Gulls

Guillaume Péron, Jean-Dominique Lebreton, Pierre-André Crochet

Journal für Ornithologie = Journal of Ornithology . 151 ( 4 ) : 881-888

DOI: 10.1007/s10336-010-0526-8

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Age at the onset of senescence in birds and mammals is predicted by early-life performance

Guillaume Péron, Olivier Gimenez, Anne Charmantier, Jean-Michel Gaillard, Pierre-André Crochet

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 277 ( 1695 ) : 2849-2856

DOI: 10.1098/rspb.2010.0530

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Méthodologie de l’utilisation des biomarqueurs quantitatifs longitudinaux pour l’aide à la décision en médecine. Application aux PSA dans le cancer de la prostate

Fabien Subtil

Thèse

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Individual vigilance of African herbivores while drinking: the role of immediate predation risk and context

Stéphanie Périquet, Marion Valeix, Andrew Loveridge, Hillary Madzikanda, David Macdonald, Hervé Fritz

Animal Behaviour . 79 ( 3 ) : 665-671

DOI: 10.1016/j.anbehav.2009.12.016

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A Phylogenetic Model for Investigating Correlated Evolution of Substitution Rates and Continuous Phenotypic Characters

Nicolas Lartillot, Raphaël Poujol

Molecular Biology and Evolution . 28 ( 1 ) : 729 - 744

DOI: 10.1093/molbev/msq244

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A Dirichlet Process Covarion Mixture Model and Its Assessments Using Posterior Predictive Discrepancy Tests

Yan Zhou, Henner Brinkmann, Nicolas Rodrigue, Nicolas Lartillot, Herve Philippe

Molecular Biology and Evolution . 27 ( 2 ) : 371-384

DOI: 10.1093/molbev/msp248

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