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Publications

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Modeling and Predicting the Simultaneous Growth of Escherichia coli O157:H7 and Ground Beef Background Microflora for Various Enrichment Protocols

A. Vimont, Christine Vernozy-Rozand, M.-P. Montet, C. Lazizzera, C. Bavai, Marie Laure Delignette-Muller

Applied and Environmental Microbiology . 72 : 261-268

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DNA sequence drives nucleosome occupancy of yeast promoters

V. Miele, C. Vaillant, Y. d'Aubenton, David Robelin, B. Prum, C. Thermes

incollection . -- : 2783-2784

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Uncovering structure in biological networks

J.J. Daudin, Vincent Lacroix, M. Mariadassou, V. Miele, Franck Picard, S. Robin...

incollection . -- : 471-483

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Serotyping of Toxoplasma gondii in chronically infected pregnant women: predominance of type II in Europe and types I and III in Colombia (South America).

François Peyron, Jean R Lobry, Karine Musset, Josette Ferrandiz, Jorge Enrique Gomez-Marin, Eskild Petersen...

Microbes and Infection . 8 ( 9-10 ) : 2333-40

DOI: 10.1016/j.micinf.2006.03.023

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UV-Targeted Dinucleotides Are Not Depleted in Light-Exposed Prokaryotic Genomes

L. Palmeira, Laurent Guéguen, J.R. Lobry

Molecular Biology and Evolution . 23 : 2214-2219

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Persisting low monocyte human leukocyte antigen-DR expression predicts mortality in septic shock

G. Monneret, A. Lepape, N. Voirin, J. Bohé, F. Venet, A.-L. Debard...

Intensive Care Medicine . 32 : 1175-1183

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Ongoing loss of the tirant transposable element in natural populations of Drosophila simulans

M. Fablet, J.F. Donald, C. Biémont, Cristina Vieira

Gene . 375 : 54-62

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Differences in genome size between closely related species: the Drosophila melanogaster species subgroup.

Matthieu Boulesteix, Michèle Weiss, Christian Biémont

Molecular Biology and Evolution . 23 ( 1 ) : 162-7

DOI: 10.1093/molbev/msj012

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Outbreeding selects for spiteful cytoplasmic elements

J. Engelstädter, S. Charlat

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 273 : 923-929

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Evolution of Male Killer Suppression in a Natural Population

E.A. Hornett, S. Charlat, A.M.R. Duplouy, N. Davies, G.K. Roderick, N. Wedell...

PLoS Biology . 4 : 1643-1648

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The evolution of cytoplasmic incompatibility types: integrating segregation inbreeding and outbreeding

J. Engelstädter, S. Charlat, A. Pomiankowski, D. Hurst G.D.

Genetics . 172 : 2601-2611

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Dynamic optimization over infinite-time horizon: Web-building strategy in an orb-weaving spider as a case study

Samuel Venner, Iadine Chadès, Marie-Claude Bel-Venner, Alain Pasquet, François Charpillet, Raymond Leborgne

Journal of Theoretical Biology . Volume 241 ( Issue 4 ) : Pages 725-733

DOI: 10.1016/j.jtbi.2006.01.008

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How does environmental variation influence body mass, body size, and body condition? Roe deer as a case study.

Carole Toïgo, Jean-Michel Gaillard, Guy van Laere, Mark Hewison, Nicolas Morellet

Ecography . 29 ( 3 ) : 301–308

DOI: 10.1111/j.2006.0906-7590.04394.x

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Density-dependent responses of fawn cohort body mass in two contrasting roe deer populations

Peter Kjellander, Jean-Michel Gaillard, Mark Hewison

Oecologia . 146 ( 4 ) : 521-530

DOI: 10.1007/s00442-005-0188-z

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Rodrigues fruit bats (Pteropus rodricensis Megachiroptera : Pteropodidae) retain genetic diversity despite population declines and founder events

J. O'Brien, G.F. Mccracken, L. Say, T.J. Hayden

Conservation Genetics . 8 : 1073-1082

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Global trends of whole genome duplications revealed by the genome sequence of the ciliate Paramecium tetraurelia

Jean-Marc Aury, Olivier Jaillon, * Laurent Duret, Benjamin Noel, Claire Jubin, Betina M. Porcel...

Nature . 444 ( 7116 ) : 171-178

DOI: 10.1038/nature05230

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Insights into social insects from the genome of the honeybee Apis mellifera

G.M. Weinstock, G.E. Robinson, R.A. Gibbs, K.C. Worley, J.D. Evans, R. Maleszka...

Nature . 443 : 931-949

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GC Content Evolution of the Human and Mouse Genomes : Insights from the Study of Processed Pseudogenes in Regions of Different Recombination Rates.

A. Khelifi, J. Meunier, L. Duret, Dominique Mouchiroud

Journal of Molecular Evolution . 62 : 745-752

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Motif search in graphs: application to metabolic networks.

Vincent Lacroix, C.G. Fernandes, M.-F. Sagot

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 3 - n°4 : 360-368

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Longest Repeats with a Block of k Don't Cares

Maxime Crochemore, Costas S. Iliopoulos, Manal Mohamed, Marie-France Sagot

Theoretical Computer Science . 362 ( 1-3 ) : 248-254

DOI: 10.1016/j.tcs.2006.06.029

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Origin and molecular evolution of receptor tyrosine kinases with immunoglobulin-like domains.

Julien Grassot, Manolo Gouy, Guy Perrière, Guy Mouchiroud

Molecular Biology and Evolution . 23 ( 6 ) : 1232-41

DOI: 10.1093/molbev/msk007

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Phylogeography of a subterranean amphipod reveals cryptic diversity and dynamic evolution in extreme environments

T. Lefébure, C.J. Douady, Manolo Gouy, P. Trontel, J. Briolay, J. Gibert

Molecular Ecology . 15 : 1797-1806

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2006.02888.x

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Genetic diversity-fitness correlation revealed by microsatellite analyses in European alpine marmots (Marmota marmota)

A. da Silva, G. Luikart, N. G. Yoccoz, A. Cohas, Dominique Allainé

Conservation Genetics . 7 ( 3 ) : 371-382

DOI: 10.1007/s10592-005-9048-y

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Extra-pair paternity in the monogamous alpine marmot (Marmota marmota): The roles of social setting and female mate choice

A. Cohas, N.G. Yoccoz, A. da Silva, B. Goossens, Dominique Allainé

Behavioral Ecology and Sociobiology . 59 : 597-605

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Fréquences alléliques et cohérence entre marqueurs moléculaires : des outils descriptifs

T. Jombart, Katayoun Moazami-Goudarzi, Anne-Béatrice Dufour, D. Laloë

Les actes du Bureau des Ressources Génétiques . 6 : 25-39

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Mycobacterium bovis Infection

S. Mignard, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Medical Microbiology . 56 : 1033-1041

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Variation partitioning of species data matrices : estimation and comparaison of fractions

P.R. Peres-Neto, P. Legendre, S. Dray, D. Borcard

Ecology . 87 : 2614-2625

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Temporal and spatial development of red deer harvesting in Europe : biological and cultural factors

J.M. Milner, C. Bonenfant, A. Mysterud, J.-M. Gaillard, S. Csanyi, N.C. Stenseth

Journal of Applied Ecology . 43 : 721-734

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Testing five hypotheses of sexual segregation in an arctic ungulate

L. Loe, R. Irvine, C. Bonenfant, A. Stien, R. Langvatn, S. Albon...

Journal of Animal Ecology . 75 : 485-496

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Histomonas meleagridis in Turkeys: Dissemination Kinetics in Host Tissues After Cloacal Infection

K. Huber, Mc. Reynaud, Marie-Pierre Callait-Cardinal, L. Zenner

Poultry Science . 85(6) : 1008-1014

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