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Publications

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Heterochronic shifts explain variations in a sequentially developing repeated pattern: Palatal ridges of muroid rodents

Sophie Pantalacci, Marie Semon, Arnaud Martin, Pascale Chevret, Vincent Laudet

16. Annual Conference of the International Society of-Development-Biologists . 126

DOI: 10.1016/j.mod.2009.06.653

Acte de congrès

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Rodent Biodiversity in Changing Environments

J-C. Auffray, Sabrina Renaud, J. Claude

Kasetsart . 43 : 83-93

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Developmental constraints revealed by co-variation within and among molar rows in two murine rodents.

Sabrina Renaud, Sophie Pantalacci, Jean-Pierre Quéré, Vincent Laudet, Jean-Christophe Auffray

Evolution and Development . 11 ( 5 ) : 590-602

DOI: 10.1111/j.1525-142X.2009.00365.x

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Comment on “Human-Specific Gain of Function in a Developmental Enhancer”

L. Duret, N. Galtier

Science . 323(5915) : 714-715

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Biased Gene Conversion and the Evolution of Mammalian Genomic Landscapes

L. Duret, N. Galtier

Annual Review of Genomics and Human Genetics . 10 : 285-311

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L’évolution des chromosomes sexuels humains

Gabriel Marais, L. Duret

Biofutur . 304 : 40-41

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Current tools for the identification of miRNA genes and their targets

N.D. Mendes, A.T. Freitas, M.-F. Sagot

Nucleic Acids Research . 2009 : 2419-2433

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Lossless filter for multiple repeats with bounded edit distance

Pierre Peterlongo, Gustavo Akio Tominaga Sacomoto, Alair Pereira Do Lago, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot

Algorithms for Molecular Biology . 4 ( 1 ) : 3

DOI: 10.1186/1748-7188-4-3

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An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals

Marília D.V. Braga, Christian Gautier, Marie-France Sagot

Algorithms for Molecular Biology . 4 ( 1 ) : 16

DOI: 10.1186/1748-7188-4-16

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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses

Stefano Colella, A. Vellozo, L. Cottret, G. Febvay, Federica Calevro, Yvan Rahbé...

8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009) . : 1-1

Acte de congrès

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Age-specific effect of heterozygosity on survival in alpine marmots, Marmota marmota.

Aurélie Cohas, Christophe Bonenfant, Bart Kempenaers, Dominique Allainé

Molecular Ecology . 18 ( 7 ) : 1491-503

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2009.04116.x

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Heterozygosity-fitness correlations revealed by neutral and cadidate gene markers in roe deer from a long-term study

A. da Silva, J.-M. Gaillard, N.Y. Yoccoz, A.J. Mark Hewison, M. Galan, T. Coulson...

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 63(2) : 403-417

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Age-specific effect of heterozygosity on survival in alpine marmots Marmota marmota

A. Cohas, C. Bonenfant, B. Kempenaers, Dominique Allainé

Molecular Ecology . 18 : 1491-1503

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The effects of experimentally manipulated yolk androgens on growth and immune function of male and female nestling collared flycatchers TextitFicedula albicollis

N. Pitala, S. Ruuskanen, T. Laaksonen, Blandine Doligez, B. Tschirren, L. Gustafsson

Journal of Avian Biology . 40(2) : 225-230

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Finding essential scales of spatial variation in ecological data: a multivariate approach

T. Jombart, S. Dray, Anne-Béatrice Dufour

Ecography . 32(1) : 161-168

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On the challenge of treating various types of variables: application for improving the measurement of functional diversity

S. Pavoine, J. Vallet, Anne-Béatrice Dufour, S. Gachet, H. Daniel

Oikos . 118(3) : 391-402

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A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.

Frédérique Billy, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Thierry Colin, Didier Bresch...

Journal of Theoretical Biology . 260 ( 4 ) : 545-62

DOI: 10.1016/j.jtbi.2009.06.026

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The concept of animals trajectories from a data analysis perspective

Clément Calenge, S. Dray, Manuela Royer-Carenzi

Ecological Informatics . 4 ( 1 ) : 34-41

DOI: 10.1016/j.ecoinf.2008.10.002

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Responding to spatial and temporal variations in predation risk: space use of a game species in a changing landsape of fear

Vincent Tolon, Stéphane Dray, Anne Loison, Achim Zeileis, Claude Fischer, Eric Baubet

Canadian Journal of Zoology . 87 : 1129-1137

DOI: 10.1139/Z09-101

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Factors affecting beech Fagus sylvatica bark stripping by red deer Cervus elaphus in a mixed forest

Christine Saint-Andrieux, Christophe Bonenfant, Carole Toïgo, Mathieu Basille, François Klein

Wildlife Biology . 15 ( 2 ) : 187-196

DOI: 10.2981/07-100

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Age-dependent relationship between horn growth and survival in wild sheep.

Christophe Bonenfant, Fanie Pelletier, Mathieu Garel, Patrick Bergeron

Journal of Animal Ecology . 78 ( 1 ) : 161-71

DOI: 10.1111/j.1365-2656.2008.01477.x

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Are abundance indices derived from spotlight counts reliable to monitor red deer population?

M. Garel, C. Bonenfant, J.-L. Hamann, F. Klein, J.-M. Gaillard

Wildlife Biology . -- : 1249-1261

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Empirical evidences of density-dependence in populations of large herbivores

C. Bonenfant, J.M. Gaillard, T. Coulson, M. Festa-Bianchet, A. Loison, M. Garel...

Advances in Ecological Research . 41 : 313-357

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Dynamics of an introduced population of mouflon Ovis aries on the sub-Antarctic 2 archipelago of Kerguelen

R. Kaeuffer, C. Bonenfant, J.-L. Chapuis, S. Devillard

Ecography . -- : 1-29

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Flock management and histomonosis in free-range turkeys in France: description and search for potential risk factors

Marie-Pierre Callait-Cardinal, Emmanuelle Gilot-Fromont, Ludovic Chossat, A. Gonthier, Claude Chauve, Lionel Zenner

Epidemiology and Infection . 138 ( 3 ) : 353–363

DOI: 10.1017/S0950268809990562

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Landscape, herd management and within-herd seroprevalence of Toxoplasma gondii in beef cattle herds from Champagne-Ardenne, France

Emmanuelle Gilot, D. Aubert, S. Belkilani, P. Hermitte, O. Gibout, R. Geers...

Veterinary Parasitology . 161 : 36-40

DOI: 10.1016/j.vetpar.2008.12.004

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Landscape herd management and within-herd seroprevalence of TextitToxoplasma gondii in beef cattle herds from Champagne-Ardenne France

Emmanuelle Gilot-Fromont, D. Aubert, S. Belkilani, P. Hermitte, O. Gibout, R. Geers...

Veterinary Parasitology . 161 : 36-40

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Iron-sulfur (Fe/S) protein biogenesis: phylogenomic and genetic studies of A-type carriers

D. Vinella, Céline Brochier-Armanet, L. Loiseau, E. Talla, F. Barras

PLoS Genetics . 5 : 261-268

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Qri7/OSGEPL the mitochondrial version of the universal Kae1/YgjD protein is essential for mitochondrial genome maintenance

J. Oberto, N. Breuil, A. Hecker, F. Farina, Céline Brochier-Armanet, E. Culetto...

Nucleic Acids Research . 37 : 5343-52

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Comparison of alignment free string distances for complete genome phylogeny

F. Guyon, Céline Brochier-Armanet, A. Guénoche

Advances in Data Analysis and Classification . 3 : 95-108

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