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Publications

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The effects of experimentally manipulated yolk androgens on growth and immune function of male and female nestling collared flycatchers TextitFicedula albicollis

N. Pitala, S. Ruuskanen, T. Laaksonen, Blandine Doligez, B. Tschirren, L. Gustafsson

Journal of Avian Biology . 40(2) : 225-230

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Finding essential scales of spatial variation in ecological data: a multivariate approach

T. Jombart, S. Dray, Anne-Béatrice Dufour

Ecography . 32(1) : 161-168

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On the challenge of treating various types of variables: application for improving the measurement of functional diversity

S. Pavoine, J. Vallet, Anne-Béatrice Dufour, S. Gachet, H. Daniel

Oikos . 118(3) : 391-402

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A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.

Frédérique Billy, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Thierry Colin, Didier Bresch...

Journal of Theoretical Biology . 260 ( 4 ) : 545-62

DOI: 10.1016/j.jtbi.2009.06.026

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The concept of animals trajectories from a data analysis perspective

Clément Calenge, S. Dray, Manuela Royer-Carenzi

Ecological Informatics . 4 ( 1 ) : 34-41

DOI: 10.1016/j.ecoinf.2008.10.002

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Responding to spatial and temporal variations in predation risk: space use of a game species in a changing landsape of fear

Vincent Tolon, Stéphane Dray, Anne Loison, Achim Zeileis, Claude Fischer, Eric Baubet

Canadian Journal of Zoology . 87 : 1129-1137

DOI: 10.1139/Z09-101

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Factors affecting beech Fagus sylvatica bark stripping by red deer Cervus elaphus in a mixed forest

Christine Saint-Andrieux, Christophe Bonenfant, Carole Toïgo, Mathieu Basille, François Klein

Wildlife Biology . 15 ( 2 ) : 187-196

DOI: 10.2981/07-100

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Age-dependent relationship between horn growth and survival in wild sheep.

Christophe Bonenfant, Fanie Pelletier, Mathieu Garel, Patrick Bergeron

Journal of Animal Ecology . 78 ( 1 ) : 161-71

DOI: 10.1111/j.1365-2656.2008.01477.x

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Are abundance indices derived from spotlight counts reliable to monitor red deer population?

M. Garel, C. Bonenfant, J.-L. Hamann, F. Klein, J.-M. Gaillard

Wildlife Biology . -- : 1249-1261

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Empirical evidences of density-dependence in populations of large herbivores

C. Bonenfant, J.M. Gaillard, T. Coulson, M. Festa-Bianchet, A. Loison, M. Garel...

Advances in Ecological Research . 41 : 313-357

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Dynamics of an introduced population of mouflon Ovis aries on the sub-Antarctic 2 archipelago of Kerguelen

R. Kaeuffer, C. Bonenfant, J.-L. Chapuis, S. Devillard

Ecography . -- : 1-29

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Flock management and histomonosis in free-range turkeys in France: description and search for potential risk factors

Marie-Pierre Callait-Cardinal, Emmanuelle Gilot-Fromont, Ludovic Chossat, A. Gonthier, Claude Chauve, Lionel Zenner

Epidemiology and Infection . 138 ( 3 ) : 353–363

DOI: 10.1017/S0950268809990562

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Landscape, herd management and within-herd seroprevalence of Toxoplasma gondii in beef cattle herds from Champagne-Ardenne, France

Emmanuelle Gilot, D. Aubert, S. Belkilani, P. Hermitte, O. Gibout, R. Geers...

Veterinary Parasitology . 161 : 36-40

DOI: 10.1016/j.vetpar.2008.12.004

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Landscape herd management and within-herd seroprevalence of TextitToxoplasma gondii in beef cattle herds from Champagne-Ardenne France

Emmanuelle Gilot-Fromont, D. Aubert, S. Belkilani, P. Hermitte, O. Gibout, R. Geers...

Veterinary Parasitology . 161 : 36-40

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Iron-sulfur (Fe/S) protein biogenesis: phylogenomic and genetic studies of A-type carriers

D. Vinella, Céline Brochier-Armanet, L. Loiseau, E. Talla, F. Barras

PLoS Genetics . 5 : 261-268

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Qri7/OSGEPL the mitochondrial version of the universal Kae1/YgjD protein is essential for mitochondrial genome maintenance

J. Oberto, N. Breuil, A. Hecker, F. Farina, Céline Brochier-Armanet, E. Culetto...

Nucleic Acids Research . 37 : 5343-52

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Comparison of alignment free string distances for complete genome phylogeny

F. Guyon, Céline Brochier-Armanet, A. Guénoche

Advances in Data Analysis and Classification . 3 : 95-108

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Prediction of Contiguous Regions in the Amniote Ancestral Genome

Aïda Ouangraoua, Frédéric Boyer, Andrew Mcpherson, Eric Tannier, Cedric Chauve

ISBRA 2009, 5th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications, . 5542

DOI: 10.1007/978-3-642-01551-9_18

Acte de congrès

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Multichromosomal median and halving problems under different genomic distances

Eric Tannier, Chunfang Zheng, David Sankoff

BMC Bioinformatics . 10 ( 1 ) : 120

DOI: 10.1186/1471-2105-10-120

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The evolutionary dynamics of the Helena retrotransposon revealed by sequenced Drosophila genomes.

Adriana Granzotto, Fabrício R Lopes, Emmanuelle Lerat, Cristina Vieira, Claudia M A Carareto

BMC Evolutionary Biology . 9 : 174

DOI: 10.1186/1471-2148-9-174

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Full-Length Genome Characterization of a Novel Simian Immunodeficiency Virus Lineage (SIVolc) from Olive Colobus (Procolobus verus) and New SIVwrcPbb Strains from Western Red Colobus (Piliocolobus badius badius) from the Taï Forest in Ivory Coast

Florian Liegeois, Bénédicte Lafay, Pierre Formenty, Sabrina Locatelli, Valérie Courgnaud, Eric Delaporte...

Journal of Virology . 83 ( 1 ) : 428-439

DOI: 10.1128/JVI.01725-08

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Noninvasive diagnosis and prognosis of liver cirrhosis: a comparison of biological scores elastometry and metabolic liver function tests

J. Forestier, J. Dumortier, O. Guillaud, M. Ecochard, S. Romana, O. Boillot...

European Journal of Gastroenterology & Hepatology . -- : 1-9

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The role of fluctuations and stress on the effective viscosity of cell aggregates.

Philippe Marmottant, Abbas Mgharbel, Jos Käfer, Benjamin Audren, Jean-Paul Rieu, Jean-Claude Vial...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 106 ( 41 ) : 17271-5

DOI: 10.1073/pnas.0902085106

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Patient versus general practitioner perception of problems with treatment adherence in type 2 diabetes: From adherence to concordance

Moreau Alain, Vincent Aroles, Gilbert Souweine, Marie Flori, Sylvie Erpeldinger, Sophie Figon...

European Journal of General Practice . ( 15 ) : 147-53.

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Seasonal density estimates of common large herbivores in Hwange National Park, Zimbabwe

Simon Chamaillé-Jammes, Marion Valeix, Mathieu Bourgarel, Felix Murindagomo, Hervé Fritz

African Journal of Ecology . 47 ( 4 ) : 804-808

DOI: 10.1111/j.1365-2028.2009.01077.x

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Changes in home range size of African lions in relation to pride size and prey biomass in a semi-arid savanna

A.J. Loveridge, M. Valeix, Z. Davidson, F. Murindagomo, H. Fritz, D.W. Macdonald

Ecography . 32 ( 6 ) : 953-962

DOI: 10.1111/j.1600-0587.2009.05745.x

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Does the risk of encountering lions influence African herbivore behaviour at waterholes?

M. Valeix, Hervé Fritz, A.J. Loveridge, Z. Davidson, J.E. Hunt, F. Murindagomo...

Behavioral Ecology and Sociobiology . 63 ( 10 ) : 1483-1494

DOI: 10.1007/s00265-009-0760-3

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Seasonal density estimates of common large herbivores in Hwange National Park Zimbabwe

Simon Chamaillé-Jammes, M. Valeix, M. Bourgarel, F. Murindagomo, H. Fritz

African Journal of Ecology . 47(4) : 804-808

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Behavioral adjustments of African herbivores to predation risk by lions: Spatiotemporal variations influence habitat use

Marion Valeix, A.J. Loveridge, Simon Chamaillé-Jammes, Z. Davidson, F. Murindagomo, Hervé Fritz...

Ecology . 90 ( 1 ) : 23-30

DOI: 10.1890/08-0606.1

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