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Publications

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Antibodies against Salmonella is associated with reduced reproductive success in female alpine chamois (Rupicapra rupicapra)

Maryline Pioz, Anne Loison, Philippe Gibert, Jean-Michel Jullien, Marc Artois, Emmanuelle Gilot-Fromont

Canadian Journal of Zoology . 86 ( 10 ) : 1111-1120

DOI: 10.1139/Z08-089

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Heterozygosity and parasite intensity: lung parasites in the water frog hybridization complex

Pierre Joly, Vanessa Guesdon, Emmanuelle Gilot-Fromont, Sandrine Plénet, Odile Grolet, Jean-François Guégan...

Parasitology . 135 ( 1 ) : 95-104

DOI: 10.1017/S0031182007003599

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Exact Transcriptome Reconstruction from Short Sequence Reads

Vincent Lacroix, M. Sammeth, R. Guigo, A. Bergeron

International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) . 5251 : 50-63

DOI: 10.1007/978-3-540-87361-7_5

Acte de congrès

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Identification de motifs dans les réseaux métaboliques : définitions algorithmes et application au métabolisme d’Escherichia coli

Vincent Lacroix

Edilivre . 978-2-35607-642-7

Ouvrage

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Home range of the European rabbit (Oryctolagus cuniculus) in three contrasting French populations

S. Devillard, J. Aubineau, F. Berger, Y. Léonard, A. Roobrouck, S. Marchandeau

Mammalian Biology: Zeitschrift für Säugetierkunde . 73 : 128-137

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A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya.

Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre

Biol Direct . 3 : 54

DOI: 10.1186/1745-6150-3-54

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Les Archaea : évolution et diversité du troisième domaine du vivant

Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre, Céline Brochier-Armanet

Bulletin - Société Française de Microbiologie . 23 ( 3 ) : 137-145

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Metagenome Annotation Using a Distributed Grid of Undergraduate Students

P. Hingamp, Céline Brochier-Armanet, E. Talla, D. Gautheret, D. Thieffry, C. Herrmann

PLoS Biology . 6 : 239-241

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Reactive Stochastic Local Search Algorithms for the Genomic Median Problem

R. Lenne, Christine Solnon, T. Stützle, Eric Tannier, M. Birattari

European Conference on Evolutionary Computation in Combinatorial Optimization (EvoCOP) . 4972 : 266-276

DOI: 10.1007/978-3-540-78604-7_23

Acte de congrès

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A Methodological Framework for the Reconstruction of Contiguous Regions of Ancestral Genomes and its Application to Mammalian Genomes

Eric Tannier, Cedric Chauve

: 26

Rapport

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Mating system and recombination affect molecular evolution in four Triticeae species

A. Haudry, A. Cenci, C. Guilhaumon, E. Paux, S. Poirier, S. Santoni...

Genetics Research . 90 : 97-109

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Full molecular characterization of a simian immunodeficiency virus, SIVwrcpbt from Temminck's red colobus (Piliocolobus badius temminckii) from Abuko Nature Reserve, The Gambia

Sabrina Locatelli, Bénédicte Lafay, Florian Liegeois, Nelson Ting, Eric Delaporte, Martine Peeters

Virology . 376 ( 1 ) : 90-100

DOI: 10.1016/j.virol.2008.01.049

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Prevalence and genetic diversity of simian immunodeficiency virus infection in wild-living red colobus monkeys (Piliocolobus badius badius) from the Taï forest, Côte d'Ivoire SIVwrc in wild-living western red colobus monkeys.

Sabrina Locatelli, Florian Liegeois, Bénédicte Lafay, Amy D Roeder, Michael W Bruford, Pierre Formenty...

Infection, Genetics and Evolution . 8 ( 1 ) : 1-14

DOI: 10.1016/j.meegid.2007.08.004

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A Site- and Time-Heterogeneous Model of Amino Acid Replacement

Samuel Blanquart, Nicolas Lartillot

Molecular Biology and Evolution . 25 ( 5 ) : 842-858

DOI: 10.1093/molbev/msn018

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Etude des patrons d'évolution asymétrique dans les séquences d'ADN

Anamaria Necsulea

Thèse

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Topological and geometrical disorder correlate robustly in two-dimensional foams

Catherine Quilliet, Shirin Ataei Talebi, David Rabaud, Jos Kaefer, Simon Cox, François Graner

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Resource variability, aggregation and direct density dependence in an open context: the local regulation of an African elephant population

Simon Chamaillé-Jammes, Hervé Fritz, Marion Valeix, Felix Murindagomo, Jean Clobert

Journal of Animal Ecology . 77 ( 1 ) : 135–144

DOI: 10.1111/j.1365-2656.2007.01307.x

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Fluctuations in abundance of large herbivore populations: insights into the influence of dry season rainfall and elephant numbers from long-term data

Marion Valeix, Hervé Fritz, Simon Chamaillé-Jammes, M. Bourgarel, F. Murindagomo

Animal Conservation . 11 : 391-400

DOI: 10.1111/j.1469-1795.2008.00194.x

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The role of water abundance thermoregulation perceived predation risk and interference competition in water access by African herbivores

M. Valeix, H. Fritz, R. Matsika, F. Matsvimbo, H. Madzikanda

African Journal of Ecology . 46 : 402-410

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Clustered Multi-Task Learning: A Convex Formulation

Laurent Jacob, Francis Bach, Jean-Philippe Vert

Pré-publication

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Greater response to placebo in children than in adults: a systematic review and meta-analysis in drug-resistant partial epilepsy.

Sylvain Rheims, Michel Cucherat, Alexis Arzimanoglou, Philippe Ryvlin

PLoS Medicine . 5 ( 8 ) : e166

DOI: 10.1371/journal.pmed.0050166

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Ciclesonide noninferiority to placebo on growth velocity

Behrouz Kassai, Michel Cucherat, G. Bellon

Pediatrics . 122 : 676-677

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Modelling Evolution of Regulatory Networks in Artificial Bacteria

Yolanda Sanchez-Dehesa, David P. Parsons, Jose Maria Pena, Guillaume Beslon

Mathematical Modelling of Natural Phenomena . 3 : 27-66

DOI: 10.1051/mmnp:2008054

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Additional molecular support for the new chordate phylogeny.

Frédéric Delsuc, Georgia Tsagkogeorga, Nicolas Lartillot, Herve Philippe

Genesis - The Journal of Genetics and Development . 46 ( 11 ) : 592-604

DOI: 10.1002/dvg.20450

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Assessing the exceptionality of network motifs

Franck Picard, Jean-Jacques Daudin, Michel Koskas, Sophie Schbath, Stephane Robin

Journal of Computational Biology . 15 ( 1 ) : 1-20

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Assessing the exceptionality of network motifs

Franck Picard, J.-J. Daudin, M. Koskas, S. Schbath, S. Robin

Journal of Computational Biology . 15 : 1-20

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A mixture model for random graphs

J.-J. Daudin, Franck Picard, S. Robin

Statistics and Computing . 18 : 173-183

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A mixture model for random graphs

Jean-Jacques Daudin, Franck Picard, Stephane Robin

Statistics and Computing . 18 ( 2 ) : 173-183

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[Some interpretation of regional estimates of the incidence of cancer in France over the period 1980-2005.]

Marc Colonna, Nadine Bossard, Nicolas Mitton, Laurent Remontet, Aurélien Belot, Patricia Delafosse...

Epidemiology and Public Health / Revue d'Epidémiologie et de Santé Publique . 56 ( 6 ) : 434-40

DOI: 10.1016/j.respe.2008.10.001

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