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Publications

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Interpretation of the results of ELISA tests commercialized for the serological diagnosis of Coxiella burnetii infection in domestic ruminants: a user-friendly Shiny application based on latent class models in a Bayesian framework

T. Lurier, Marie Laure Delignette-Muller, Florence Ayral, Elsa Jourdain, Elodie Rousset

31st WORLD BUIATRICS CONGRESS .

Acte de congrès

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Evaluation using latent class models of the diagnostic performances of three ELISA tests commercialized for the serological diagnosis of Coxiella burnetii infection in domestic ruminants

Thibaut Lurier, Elodie Rousset, Patrick Gasqui, Carole Sala, Clément Claustre, David Abrial...

31st World Buitatrics congress .

Acte de congrès

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Efficacy of a targeted selective treatment in dairy herds affected by clinical dictyocaulosis.

T. Lurier, Thomas Hilaire, Philippe Camuset, G. Bourgoin, Marie-Anne Arcangioli

31st WORLD BUIATRICS CONGRESS .

Acte de congrès

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Lack of efficacy of fenbendazole against Giardia duodenalis in a naturally infected population of dogs in France

Hugo Kaufmann, Lionel Zenner, Slimania Benabed, Marie-Thérèse Poirel, G. Bourgoin

Parasite . 29 : 49

DOI: 10.1051/parasite/2022048

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[Adherence to recommendations after comprehensive geriatric assessment by mobile geriatric team during 500 home visits]

A. Pauget, N. Jomard, A. Termoz, F. Subtil, V. Chambard, B. Galamand...

Gériatrie et psychologie & neuropsychiatrie du vieillissement . 20 ( 2 ) : 208-216

DOI: 10.1684/pnv.2022.1036

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Prognosis of Old Intensive Care COVID-19 Patients at a Glance: The Senior COVID Study

C. H. Vacheron, L. Bitker, F. Thiolliere, F. Subtil, P. Ábrahám, V. Collange...

Turkish Journal of Anaesthesiology and Reanimation . 50 ( Supp1 ) : S57-s61

DOI: 10.5152/tjar.2022.21321

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BrumiR: A toolkit for de novo discovery of microRNAs from sRNA-seq data

Carol Moraga, Evelyn Sanchez, Mariana Galvão Ferrarini, Rodrigo A Gutierrez, Elena A Vidal, Marie-France Sagot

GigaScience . 11

DOI: 10.1093/gigascience/giac093

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The DeepFaune initiative: a collaborative effort towards the automatic identification of the French fauna in camera-trap images

Noa Rigoudy, Abdelbaki Benyoub, Aurélien Besnard, Carole Birck, Yoann Bollet, Yoann Bunz...

DOI: 10.1101/2022.03.15.484324

Pré-publication

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Larval density in the invasive Drosophila suzukii : immediate and delayed effects on life-history traits

Alicia Reyes-Ramírez, Zaïnab Belgaidi, Patricia Gibert, Thomas Pommier, Aurélie Siberchicot, Laurence Mouton...

DOI: 10.1101/2022.10.06.511120

Pré-publication

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Differentiation of thermal reaction norms between marginal and core populations of a northward expanding parasitoid

Emilie Delava, Frederic Fleury, Patricia Gibert

DOI: 10.1101/2022.04.26.489532

Pré-publication

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Structure génétique et morphométrie crânienne dans le genre Arvicola

P Chevret, S. Renaud, Jean-Pierre Quéré, Johan R. Michaux

Arvicola .

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Chapter 6: Using Latent Block Models to Detect Structure in Ecological Networks

Julie J. Aubert, Pierre M Barbillon, Sophie Donnet, Vincent Miele

Statistical Approaches for Hidden Variables in Ecology. . : 117-134

DOI: 10.1002/9781119902799.ch6

Chapitre d'ouvrage

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High-throughput genomics and transcriptomics to decipher host-symbiont molecular dialogue in the cereal weevil Sitophilus oryzae andSodalis pierantonius endosymbiotic association

Nicolas Parisot, Mariana Galvão Ferrarini, Clément Goubert, Carlos Vargas-Chávez, Agnès Vallier, Benjamin Gillet...

ISS 2022 - 10th Congress of the International Symbiosis Society .

Poster

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Interbacterial Transfer of Carbapenem Resistance and Large Antibiotic Resistance Islands by Natural Transformation in Pathogenic Acinetobacter

Anne-Sophie Godeux, Elin Svedholm, Samuel Barreto, Anaïs Potron, Samuel Venner, Xavier Charpentier...

mBio . 13 ( 1 ) : e02631-21

DOI: 10.1128/mbio.02631-21

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Integrative Phylogenetics: Tools for Palaeontologists to Explore the Tree of Life

Raquel López-Antoñanzas, Jonathan Mitchell, Tiago Simões, Fabien Condamine, Robin Aguilée, Pablo Peláez-Campomanes...

Biology . 11 ( 8 ) : 1185

DOI: 10.3390/biology11081185

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Codiversification of gut microbiota with humans

Taichi Suzuki, J. Liam Fitzstevens, Victor Schmidt, Hagay Enav, Kelsey Huus, Mirabeau Mbong Ngwese...

Science . 377 ( 6612 ) : 1328-1332

DOI: 10.1126/science.abm7759

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A review of modelling approaches for ecological risk assessment of pesticides

Floriane Larras, Sandrine Charles, Arnaud Chaumot, Céline Pélosi, Morgane Le Gall, Laure Mamy...

SETAC Europe 32nd annual meeting .

Poster

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Ghost lineages can invalidate or even reverse findings regarding gene flow

Théo Tricou, Eric Tannier, Damien M. de Vienne

PLoS Biology . 20 ( 9 ) : e3001776

DOI: 10.1371/journal.pbio.3001776

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Protein conformational space at the edge of allostery: turning a nonallosteric malate dehydrogenase into an “allosterized” enzyme using evolution-guided punctual mutations

Antonio Iorio, Céline Brochier-Armanet, Caroline Mas, Fabio Sterpone, Dominique Madern

Molecular Biology and Evolution . 39 ( 9 ) : msac186

DOI: 10.1093/molbev/msac186

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GOntact: using chromatin contacts to infer Gene Ontology enrichments for cis -regulatory elements

Alexandre Laverré, Eric Tannier, Philippe Veber, Anamaria Necsulea

DOI: 10.1101/2022.06.13.495495

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Unravelling the environmental correlates influencing the seasonal biodiversity of aquatic Heteropteran assemblages in northern Africa

Noura Slimani, Eric Guilbert, James White, Matthew Hill, Paul Wood, Moncef Boumaïza...

Limnologica . : 126021

DOI: 10.1016/j.limno.2022.126021

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Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective

Laure Mamy, Stéphane Pesce, Wilfried Sanchez, Marcel Amichot, Joan Artigas, Stéphanie Aviron...

: 1408 p.

DOI: 10.17180/0gp2-cd65

Rapport

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Compensatory recruitment allows amphibian population persistence in anthropogenic habitats

Hugo Cayuela, Benjamin Monod-Broca, Jean-François Lemaître Lemaître, Aurélien Besnard, Jérôme Gippet, Benedikt Schmidt...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 119 ( 38 )

DOI: 10.1073/pnas.2206805119

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Prevalence of major digestive and respiratory helminths in dogs and cats in France: results of a multicenter study

G. Bourgoin, Marie-Pierre Callait-Cardinal, Emilie Bouhsira, Bruno Polack, Patrick Bourdeau, Clarisse Roussel Ariza...

Parasites & Vectors . 15

DOI: 10.1186/s13071-022-05368-7

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Editorial: Advances in Statistical Ecology: New Methods and Software

Gilles Guillot, Ali Arab, Janine Bärbel Illian, Stéphane Dray

Frontiers in Ecology and Evolution . 9

DOI: 10.3389/fevo.2021.828919

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Sex‐specific body mass ageing trajectories in adult Asian elephants

Lucas Lalande, Virpi Lummaa, Htoo Aung, Win Htut, U. Kyaw Nyein, Vérane Berger...

Journal of Evolutionary Biology . 35 ( 5 ) : 752-762

DOI: 10.1111/jeb.14008

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An Improved Codon Modeling Approach for Accurate Estimation of the Mutation Bias

Thibault Latrille, Nicolas Lartillot

Molecular Biology and Evolution . 39

DOI: 10.1093/molbev/msac005

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Distinct evolutionary trajectories of SARS-CoV-2-interacting proteins in bats and primates identify important host determinants of COVID-19

Marie Cariou, Léa Picard, Laurent Guéguen, Stéphanie Jacquet, Andrea Cimarelli, Oliver Fregoso...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 119 ( 35 )

DOI: 10.1073/pnas.2206610119

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Extreme mitochondrial DNA divergence underlies genetic conflict over sex determination

Patrice David, Cyril Degletagne, Nathanaelle Saclier, Aurel Jennan, Philippe Jarne, Sandrine Plénet...

Current Biology - CB . 32 ( 10 ) : 2325-2333.e1-e6

DOI: 10.1016/j.cub.2022.04.014

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