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Publications

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A Markovian Approach for the Analysis of the Gene Structure

C. Melodelima, Laurent Guéguen, Christian Gautier, D. Piau

Prague stringology conference . 19 ( 1 ) : 19-35

Acte de congrès

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A computational prediction of isochores based on hidden Markov models

C. Melodelima, Laurent Guéguen, D. Piau, Christian Gautier

Gene . 385 : 41-49

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Potential of a 16S rRNA-based taxonomic microarray for analyzing the rhizosphere effects of maize on Agrobacterium spp. and bacterial communities

Hervé Sanguin, B. Remenant, Arnaud Dechesne, J. Thioulouse, Timothy M. Vogel, Xavier Nesme...

Applied and Environmental Microbiology . 72 ( 6 ) : 4302-4312

DOI: 10.1128/AEM.02686-05

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Biological effects of native and exotic plant residues on plant growth microbial biomass and N availability under controlled conditions

M.D. Diallo, R. Duponnois, A. Guisse, S. Sall, J.-L. Chotte, J. Thioulouse

European Journal of Soil Biology . 42 : 238-246

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Litter-forager termite mounds enhance the ectomycorrhizal symbiosis between Acacia holosericea A. Cunn. Ex G. Don and Scleroderma dictyosporum isolates

R. Duponnois, K. Assigbetse, H. Ramanankierana, M. Kisa, Jean Thioulouse, Michel Le Page

FEMS Microbiology Ecology . 56 : 292-303

DOI: 10.1111/j.1574-6941.2006.00089.x

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A multivariate approach to integrating Datasets using made4 and ade4

A.C. Culhane, J. Thioulouse

R News . -- : 1-15

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Displacement of an herbaceous plant species community by mycorrhizal and non-mycorrhizal Gmelina arborea, an exotic tree, grown in a microcosm experiment

A. Sanon, P. Martin, Jean Thioulouse, Christian Plenchette, Rodolphe Spichiger, Michel Le Page...

Mycorrhiza . 16 ( 2 ) : 125-132

DOI: 10.1007/s00572-005-0024-7

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The Ectomycorrhizosphere Effect Influences Functional Diversity of Soil Microflora

N. Ramanankierana, N. Rakotoarimanga, J. Thioulouse, K. Marija, E. Randrianjohany, L. Ramaroson...

International Journal of Soil Science . 1 : 8-19

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Development of cellular immune responses to Plasmodium falciparum blood stage antigens from birth to 36 months of age in Cameroon

J.Y. Le Hesran, N. Fievet, J. Thioulouse, P. Personne, B. Maubert, S. M'Bidias...

Acta Tropica . 98 : 261-269

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TESD : a transposable element dynamics simulation environment

G. Deceliere, Y. Letrillard, Sandrine Charles, C. Biémont

Bioinformatics . 22 : 2702-2703

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Artifical transfer and morphological description of virus particles associated with superparasitism behaviour in a parasitoid wasp.

Julien Varaldi, M. Ravallec, C. Labrosse, M. Lopez-Ferber, M. Boulétreau, Frédéric Fleury

Journal of Insect Physiology . 52 ( 11-12 ) : 1202-1212

DOI: 10.1016/j.jinsphys.2006.09.002

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Superparasitism evolution: adaptation or manipulation?

Sylvain Gandon, Ana R Rivero, Julien Varaldi

The American Naturalist . 167 ( 1 ) : E1-E22

DOI: 10.1086/498398

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The virus infecting the parasitoid Leptopilina boulardi exerts a specific action on superparasitism behaviour

Julien Varaldi, S. Petit, M. Boulétreau, Frédéric Fleury

Parasitology . 132 : 747-756

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Mate-guarding strategies and male competitive ability: results from a field study in an orb-weaving spider

Marie-Claude Bel-Venner, Samuel Venner

Animal Behaviour . 71 : 1315-1322

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Efficient Likelihood Computations with Nonreversible Models of Evolution

Bastien Boussau, Manolo Gouy

Systematic Biology . 55 ( 5 ) : 756-768

DOI: 10.1080/10635150600975218

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Modeling and Predicting the Simultaneous Growth of Escherichia coli O157:H7 and Ground Beef Background Microflora for Various Enrichment Protocols

A. Vimont, Christine Vernozy-Rozand, M.-P. Montet, C. Lazizzera, C. Bavai, Marie Laure Delignette-Muller

Applied and Environmental Microbiology . 72 : 261-268

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DNA sequence drives nucleosome occupancy of yeast promoters

V. Miele, C. Vaillant, Y. d'Aubenton, David Robelin, B. Prum, C. Thermes

incollection . -- : 2783-2784

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Uncovering structure in biological networks

J.J. Daudin, Vincent Lacroix, M. Mariadassou, V. Miele, Franck Picard, S. Robin...

incollection . -- : 471-483

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Serotyping of Toxoplasma gondii in chronically infected pregnant women: predominance of type II in Europe and types I and III in Colombia (South America).

François Peyron, Jean R Lobry, Karine Musset, Josette Ferrandiz, Jorge Enrique Gomez-Marin, Eskild Petersen...

Microbes and Infection . 8 ( 9-10 ) : 2333-40

DOI: 10.1016/j.micinf.2006.03.023

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UV-Targeted Dinucleotides Are Not Depleted in Light-Exposed Prokaryotic Genomes

L. Palmeira, Laurent Guéguen, J.R. Lobry

Molecular Biology and Evolution . 23 : 2214-2219

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Persisting low monocyte human leukocyte antigen-DR expression predicts mortality in septic shock

G. Monneret, A. Lepape, N. Voirin, J. Bohé, F. Venet, A.-L. Debard...

Intensive Care Medicine . 32 : 1175-1183

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Ongoing loss of the tirant transposable element in natural populations of Drosophila simulans

M. Fablet, J.F. Donald, C. Biémont, Cristina Vieira

Gene . 375 : 54-62

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Differences in genome size between closely related species: the Drosophila melanogaster species subgroup.

Matthieu Boulesteix, Michèle Weiss, Christian Biémont

Molecular Biology and Evolution . 23 ( 1 ) : 162-7

DOI: 10.1093/molbev/msj012

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Outbreeding selects for spiteful cytoplasmic elements

J. Engelstädter, S. Charlat

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 273 : 923-929

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Evolution of Male Killer Suppression in a Natural Population

E.A. Hornett, S. Charlat, A.M.R. Duplouy, N. Davies, G.K. Roderick, N. Wedell...

PLoS Biology . 4 : 1643-1648

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The evolution of cytoplasmic incompatibility types: integrating segregation inbreeding and outbreeding

J. Engelstädter, S. Charlat, A. Pomiankowski, D. Hurst G.D.

Genetics . 172 : 2601-2611

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Dynamic optimization over infinite-time horizon: Web-building strategy in an orb-weaving spider as a case study

Samuel Venner, Iadine Chadès, Marie-Claude Bel-Venner, Alain Pasquet, François Charpillet, Raymond Leborgne

Journal of Theoretical Biology . Volume 241 ( Issue 4 ) : Pages 725-733

DOI: 10.1016/j.jtbi.2006.01.008

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How does environmental variation influence body mass, body size, and body condition? Roe deer as a case study.

Carole Toïgo, Jean-Michel Gaillard, Guy van Laere, Mark Hewison, Nicolas Morellet

Ecography . 29 ( 3 ) : 301–308

DOI: 10.1111/j.2006.0906-7590.04394.x

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Density-dependent responses of fawn cohort body mass in two contrasting roe deer populations

Peter Kjellander, Jean-Michel Gaillard, Mark Hewison

Oecologia . 146 ( 4 ) : 521-530

DOI: 10.1007/s00442-005-0188-z

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Rodrigues fruit bats (Pteropus rodricensis Megachiroptera : Pteropodidae) retain genetic diversity despite population declines and founder events

J. O'Brien, G.F. Mccracken, L. Say, T.J. Hayden

Conservation Genetics . 8 : 1073-1082

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