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Publications

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Les mathématiques au secours de la faune aquatique

Arnaud Chaumot, S. Charles, C. Schmidt Laine, B. Chocat

Rhône-Alpes et l'environnement : 100 questions pour la recherche . : 124-125

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High-throughput sequencing of complete human mtDNA genomes from the Caucasus and West Asia: high diversity and demographic inferences.

Ivan Nasidze, Anna Schönberg, Christoph Theunert, Mingkun Li, Mark Stoneking

European Journal of Human Genetics .

DOI: 10.1038/ejhg.2011.62

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Y-Chromosomal Variation in Sub-Saharan Africa: Insights Into the History of Niger-Congo Groups

C. de Filippo, C. Barbieri, M. Whitten, S. Mpoloka, E. Gunnarsdottir, K. Bostoen...

Molecular Biology and Evolution . 28 ( 3 ) : 1255-1269

DOI: 10.1093/molbev/msq312

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Larger mitochondrial DNA than Y-chromosome differences between matrilocal and patrilocal groups from Sumatra

Ellen Dröfn Gunnarsdóttir, Madhusudan Nandineni, Mingkun Li, Sean Myles, David Gil, Brigitte Pakendorf...

Nature Communications . 2 : 228

DOI: 10.1038/ncomms1235

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When cats' ways of life interact with their viruses: A study in 15 natural populations of owned and unowned cats \textitFelis silvestris catus

E. Hellard, D. Fouchet, H. Santin-Janin, B. Tarin, V. Badol, C. Coupier...

Preventive veterinary medicine . 101 : 250-264

DOI: 10.1016/j.prevetmed.2011.04.020

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Natal dispersal of European hare in a high-density population

Alexis Avril, Yves Léonard, Jérôme Letty, Régis Péroux, Jean-Sébastien Guitton, Dominique Pontier

Mammalian Biology: Zeitschrift für Säugetierkunde . 76 : 148-156

DOI: 10.1016/j.mambio.2010.07.001

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The predictive value of the maximum likelihood estimator of the number of contributors to a DNA mixture

H. Haned, L. Pène, F. Sauvage, D. Pontier

Forensic Science International: Genetics . 5 : 281-284

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Substitution rate variation at human CpG sites correlates with non-CpG divergence, methylation level and GC content

Carina Mugal, Hans Ellegren

Genome Biology . 12 ( 6 ) : R58

DOI: 10.1186/gb-2011-12-6-r58

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Quantitative and functional analyses of CD4+CD25+FoxP3+ regulatory T cells in chronic phase chronic myeloid leukaemia patients at diagnosis and on imatinib mesylate

E. Bachy, J. Bernaud, Pascal Roy, D. Rigal, F-E. Nicolini

British Journal of Haematology . 153 : 129-143

DOI: 10.1111/j.1365-2141.2010.08453.x

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Protein mass spectra data analysis for clinical biomarker discovery

Pascal Roy, C. Truntzer, D. Maucort-Boulch, T. Jouve, Nicolas Molinari

Briefings in Bioinformatics . 12 ( 2 ) : 176-186

DOI: 10.1093/bib/bbq019

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Analysis of the variability of human normal urine by 2D-GE reveals a "public" and a "private" proteome

Laurence Molina, Nicolas Salvetat, Randa Ben Ameur, Sabine Pérès, Nicolas Sommerer, Faycal Jarraya...

Journal of Proteomics . 75 ( 1 ) : 70 - 80

DOI: 10.1016/j.jprot.2011.06.031

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ACoM: A classification method for elementary flux modes based on motif finding

Sabine Pérès, Francois Vallee, Marie M. Beurton-Aimar, Jean-Pierre Mazat

BioSystems . 103 ( 3 ) : 410-419

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Lactase persistence in central Asia: phenotype, genotype, and evolution.

Evelyne Heyer, Lionel Brazier, Laure Ségurel, Tatiana Hegay, Frédéric Austerlitz, Lluis Quintana-Murci...

Human Biology . 83 ( 3 ) : 379-92

DOI: 10.3378/027.083.0304

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The Case of the Fickle Fingers: How the PRDM9 Zinc Finger Protein Specifies Meiotic Recombination Hotspots in Humans

Laure Ségurel, Ellen Miranda Leffler, Molly M. Przeworski

PLoS Biology . 9 ( 12 ) : e1001211

DOI: 10.1371/journal.pbio.1001211

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Genomic Species Are Ecological Species as Revealed by Comparative Genomics in Agrobacterium tumefaciens

Florent Lassalle, Tony Campillo, Ludovic Vial, Jessica Baude, Denis Costechareyre, David Chapulliot...

Genome Biology and Evolution . 3 ( 3 ) : 762-781

DOI: 10.1093/gbe/evr070

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“ArthropodaCyc”: a BioCyc database powered by CycADS to study and compare the metabolism of arthropods

Patrice Baa-Puyoulet, Augusto Vellozo, Jaime Huerta-Cepas, Gérard Febvay, Toni Gabaldon, Marie-France Sagot...

5. Annual Arthropod Genomics Symposium “Arthropod Genomics 2011: Exploring Diversity, Relating Similarity” . : 33 p.

Poster

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Molecular Variability and Evolution of the Pectate Lyase (pel-2) Parasitism Gene in Cyst Nematodes Parasitizing Different Solanaceous Plants

Barbara Geric Stare, Didier Fouville, S Sirca, Aurore Gallot-Le Grand, G. Urek, Eric Grenier

Journal of Molecular Evolution . 72 ( 2 ) : 169-181

DOI: 10.1007/s00239-010-9413-4

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Conséquences démographiques des Effets Allee comportementaux dans les systèmes hôte-parasitoïde

Anaïs Bompard, Isabelle Amat, Xavier Fauvergue, Thierry Spataro

Entomological Society of America, Canada and British Columbia joint annual meeting .

Acte de congrès

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Solid lipid nanoparticles suspension versus commercial solutions for dermal delivery of minoxidil

Karine Padois, Celine Cantieni, Valerie Bertholle, Claire Bardel, Fabrice Pirot, Francoise Faison

International Journal of Pharmaceutics . 416 ( 1 ) : 300 - 304

DOI: 10.1016/j.ijpharm.2011.06.014

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Side effects of fungicides on the abundance and the species diversity of the natural populations of Drosophila and their hymenopterous parasitoids in orchards

J-M. Delpuech, Roland Allemand

Phytoparasitica . 39 : 429-435

DOI: 10.1007/s12600-011-0180-6

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Design, recruitment, logistics, and data management of the GEHA (Genetics of Healthy Ageing) project

A. Skytthe, S. Valensin, B. Jeune, E. Cevenini, Frédéric Balard, Matthias Beekmann...

Experimental Gerontology . 46 ( 11 ) : 934-945

DOI: 10.1016/j.exger.2011.08.005

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Biogeographical patterns of soil molecular microbial biomass as influenced by soil characteristics and management

S. Dequiedt, Nicolas P. A. Saby, M. Lelievre, C. Jolivet, J. Thioulouse, B. Toutain...

Global Ecology and Biogeography . 20 : 641-652

DOI: 10.1111/j.1466-8238.2010.00628.x

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SIMULTANEOUS ANALYSIS OF A SEQUENCE OF PAIRED ECOLOGICAL TABLES: A COMPARISON OF SEVERAL METHODS

J. Thioulouse

Annals of Applied Statistics . 5 ( 4 ) : 2300-2325

DOI: 10.1214/10-AOAS372

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In situ feeding assay with Gammarus fossarum (Crustacea): Modelling the influence of confounding factors to improve water quality biomonitoring

Romain Coulaud, Olivier Geffard, Benoît Xuereb, Emilie Lacaze, Herve Queau, Jeanne Garric...

Water Research . 45 ( 19 ) : 6417 - 6429

DOI: 10.1016/j.watres.2011.09.035

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MODÉLISATION EN (ÉCO)TOXICOLOGIE :

Alexandre R.R. Pery, P. Hubert, Sandrine Charles, J. Devillers, P. Ciffroy, O. Perceval...

incollection . -- : 423-427

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Bayesian modelling of daphnid responses to time-varying cadmium exposure in laboratory aquatic microcosms

Elise Billoir, Hélène Delhaye, Bernard Clément, Marie Laure Delignette-Muller, Sandrine Charles

Ecotoxicology and Environmental Safety . 74 ( 4 ) : 693-702

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2010.10.023

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The importance of incorporating age and sex when backcalculating length in bullhead Cottus gobio

J. Kielbassa, Sandrine Charles, Marie Laure Delignette-Muller

Journal of Fish Biology . 78 : 1492-1507

DOI: 10.1111/j.1095-8649.2011.02956.x

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Does a parthenogenesis-inducing Wolbachia induce vestigial cytoplasmic incompatibility?

Ken Kraaijeveld, Barbara M Reumer, Laurence Mouton, Natacha Kremer, Fabrice Vavre, Jacques J.M. van Alphen

The Science of Nature Naturwissenschaften . 98 ( 3 ) : 175-80

DOI: 10.1007/s00114-010-0756-x

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RNA-seq without a reference genome: a comparison of the mapping and the assembly approaches

M.-C. Carpentier, J. Charif, Vincent Lacroix, Marie-France Sagot, Fabrice Vavre

JOBIM .

Acte de congrès

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DNA double-strand breaks induced by mammographic screening procedures in human mammary epithelial cells

Catherine Colin, Clément Devic, Alain Noel, Muriel Rabilloud, Marie-Thérèse Zabot, Sylvie Pinet-Isaac...

International Journal of Radiation Biology . 87 ( 11 ) : 1103-1112

DOI: 10.3109/09553002.2011.608410

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