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Publications

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Accounting for horizontal gene transfers explains conflicting hypotheses regarding the position of aquificales in the phylogeny of Bacteria

Bastien Boussau, Laurent Guéguen, Manolo Gouy

BMC Evolutionary Biology . 8 : 272-272

DOI: 10.1186/1471-2148-8-272

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Non-homogeneous models of sequence evolution in the Bio++ suite of libraries and programs

J. Dutheil, Bastien Boussau

BMC Evolutionary Biology . 8:255 : 31-42

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Phylogenetic Characterization and Prevalence of “Spirobacillus cienkowskii ” a Red-Pigmented Spiral-Shaped Bacterial Pathogen of Freshwater Daphnia Species

J.L.M. Rodrigues, M.A. Duffy, A.J. Tessier, D. Ebert, L. Mouton, T.M. Schmidt

Applied and Environmental Microbiology . 74 : 1575-1582

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The effects of multiple infections on the expression and evolution of virulence in a daphnia-endoparasite system

F. Ben-Ami, L. Mouton, D. Ebert

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 62-7 : 1700-1711

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Quantitative risk assessment for Escherichia coli O157:H7 in frozen ground beef patties consumed by young children in French households

Marie Laure Delignette-Muller, M. Cornu

International Journal of Food Microbiology . 128 : 77-84

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Persistence of Shiga toxin-producing Escherichia coli O26 in various manure-amended soil types

B. Fremaux, C. Prigent-Combaret, Marie Laure Delignette-Muller, B. Mallen, M. Dothal, A. Gleizal...

Journal of Applied Microbiology . 104 : 296-304

DOI: 10.1111/j.1365-2672.2007.03532.x

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Fast online graph clustering via Erdos–Rényimixture

H. Zanghi, C. Ambroise, V. Miele

Pattern Recognition . 41 : 3592-3599

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Optimal release strategies for the biological control of aphids in melon greenhouses

Christelle Lopes, Thierry Spataro, Laurent Lapchin, Roger Arditi

Biological Control . 48 ( 1 ) : 12 - 21

DOI: 10.1016/j.biocontrol.2008.09.011

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From W.S. Gosset`s pieces of card (1908) to R software : analysing Macdonell`s dataset of 3000 criminals

Anne-Béatrice Dufour, J.R. Lobry

Biométrie Humaine et Anthropologie - revue de la Société de biométrie humaine . 26 : 33-39

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An agent-based model for predicting the prevalence of Trypanosoma cruzi I and II in their host and vector populations

H. Devillers, J.R. Lobry, F. Menu

Journal of Theoretical Biology . 255 : 307-315

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New insights on the relation between untreated and treated outcomes for a given therapy effect model is not necessarily linear

J.-P. Boissel, Michel Cucherat, P. Nonyc, Sylvie Chabaud, François Gueyffier, Jm. Wright...

Journal of Clinical Epidemiology . 61 : 301-307

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Meta-analysis of continuous outcomes combining individual patient data and aggregate data

Rd. Riley, Pc. Lambert, Ja. Staessen, J. Wang, François Gueyffier, L. Thijs...

Statistics in Medicine . 27(11) : 1870-1893

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Foraging and associative learning of visual signals in a parasitic wasp

Patrice Lucchetta, Carlos Bernstein, Marc Théry, Claudio Lazzari, Emmanuel Desouhant

Animal Cognition . ( 11 ) : 525-533

DOI: 10.1007/s10071-008-0144-5

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Machine learning for in silico virtual screening and chemical genomics: new strategies.

Jean-Philippe Vert, Laurent Jacob

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening . 11 ( 8 ) : 677-85

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Virtual screening of GPCRs: An in silico chemogenomics approach

Laurent Jacob, Brice Hoffmann, Véronique Stoven, Jean-Philippe Vert

BMC Bioinformatics . 9 : 363

DOI: 10.1186/1471-2105-9-363

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Recovery of king penguins from swimming induced hypothermia: effects of nutritional condition

L.G. Halsey, Y. Handrich, B. Rey, A. Fahlman, A.J. Woakes, P.J. Butler

Physiological and Biochemical Zoology . 81 : 434-441

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Mitochondrial adaptations to steatohepatitis induced by a methionine- and choline-deficient diet

C. Romestaing, M.-A. Piquet, D. Letexier, B. Rey, M. Belouze, V. Rouleau...

AJP - Endocrinology and Metabolism . 294 : 110-119

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Long-term fasting decreases mitochondrial avian UCP-mediated oxygen consumption in hypometabolic king penguins

B. Rey, L.G. Halsey, V. Dolmazon, J.L. Rouanet, D. Roussel, Y. Handrich...

AJP - Regulatory, Integrative and Comparative Physiology . 295 : R92-R100

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Growing in Antarctica a challenge for white adipose tissue development in Adélie penguin chicks (Pygoscelis adeliae)

M. Raccurt, F. Baudimont, J. Tirard, B. Rey, E. Moureaux, A. Géloën...

AJP - Regulatory, Integrative and Comparative Physiology . 295 : 1671-1679

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Speciation in fungi

Tatiana Giraud, Guislaine Refrégier, Mickaël Le Gac, Damien M. de Vienne, Michael E Hood

Fungal Genetics and Biology . 45 ( 6 ) : 791--802

DOI: 10.1016/j.fgb.2008.02.001

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Microbial-biogeography of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS)

Lionel Ranjard, Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Claudy C. Jolivet, Nicolas N. Saby, Manuel M. Martin...

Eurosoil 2008 Book of Abstracts . : 59-60

Acte de congrès

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Bacterial taxa associated with the hematophagous mite Dermanyssus gallinae detected by 16S rRNA PCR amplification and TTGE fingerprinting

Claire Valiente Moro, Jean Thioulouse, Claude Chauve, Philippe Normand, Lionel Zenner

Research in Microbiology . 160 ( 1 ) : 63-70

DOI: 10.1016/j.resmic.2008.10.006

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Spatial ordination of vegetation data using a generalization of Wartenberg's multivariate spatial correlation

S. Dray, S. Saïd, F. Débias

Journal of Vegetation Science . 19 : 45-56

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Density-dependent body condition and recruitment in a tropical ungulate

N. Gaidet, Jean-Michel Gaillard

Canadian Journal of Zoology . 86 ( 1 ) : 24-32

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Determinants of seasonal variation in activity patterns of mouflon

G. Bourgoin, M. Garel, B. van Moorter, D. Dubray, D. Maillard, E. Marty...

Canadian Journal of Zoology . 86 : 1410-1418

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Adaptation locale et optimalité des stratégies de dormance en environnement imprévisible : Développements théoriques et validation expérimentale chez le balanin de la chataîgne Curculio Elephas

Etienne Rajon

incollection . -- : 321-328

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Prolonged diapause: A trait increasing invasion speed ?

T. Mahdjoub, F. Menu

Journal of Theoretical Biology . 251 : 317-330

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Stochastic extinction and the selection of the transmission mode in microparasites.

Narges Bahi-Jaber, David Fouchet, Dominique Pontier

Journal of the Royal Society Interface . 5 ( 26 ) : 1031-9

DOI: 10.1098/rsif.2007.1326

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Impact of myxomatosis in relation to local persistence in wild rabbit populations: the role of waning immunity and the reproductive period

David Fouchet, J-S. Guitton, S. Marchandeau, D. Pontier

Journal of Theoretical Biology . 250 ( 4 ) : 593-605

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