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Publications

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ROSO : A Software to Search Optimized Oligonucleotide Probes for Microarrays

Nancie Reymond, Hubert Charles, Guillaume Beslon, Laurent Duret, Jean-Michel Fayard

10. International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) .

Poster

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Comparative sequence analysis of the X-inactivation center region in mouse, human, and bovine.

C. Chureau, M. Prissette, A. Bourdet, Valérie Barbe, L. Cattolico, L. Jones...

Genome Research . 12 : 894-908

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Vanishing GC-Rich Isochores in Mammalian Genomes

L. Duret, M. Sémon, G. Piganeau, Dominique Mouchiroud, N. Galtier

Genetics . 162 : 1837-1848

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Comparative sequence analysis of the X-inactivation center region in mouse human and bovine

C. Chureau, M. Prissette, A. Bourdet, Valérie Barbe, Laurence Cattolico, L. Jones...

Genome Research . 12 : 894-908.

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Evolution of synonymous codon usage in metazoans

L. Duret

Current Opinion in Genetics and Development . 12 : 640-649

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A Basis for Repeated Motifs in Pattern Discovery and Text Mining

Nadia Pisanti, Maxime Crochemore, Roberto Grossi, Marie-France Sagot

Rapport

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Gene finding in eukaryotes

C. Mathé, Thomas Schiex, P. Rouzé, P. Blayo, M.-F. Sagot

incollection . -- : 27-43

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Current methods of gene prediction their strengths and weaknesses

C. Mathé, M.-F. Sagot, Thomas Schiex, P. Rouzé

Nucleic Acids Research . 30 : 4103-4117

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Occurrence probability of structured motifs in random sequences

S. Robin, J.J. Daudin, H. Richard, M.-F. Sagot, S. Schbath

Journal of Computational Biology . 9 ( 6 ) : 761-773

DOI: 10.1089/10665270260518254

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NUREBASE: database of nuclear hormone receptors

J. Duarte, G. Perrière, V. Laudet, M. Robinson-Rechavi

Nucleic Acids Research . 30 : 364-368

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Automatic RNA secondary structure prediction with a comparative approach

F. Tahi, Manolo Gouy, M. Regnier

Journal of Computational Chemistry . 26 ( 5 ) : 521-530

DOI: 10.1016/S0097-8485(02)00012-8

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Functional and evolutionary analysis of a eukaryotic parasitic genome

Christian Vivarès, Manolo Gouy, F. Thomarat, G. Metenier

Current Opinion in Microbiology . 5 : 499-505

DOI: 10.1016/S1369-5274(02)00356-9

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Effect of phenotypic and genotypic quality on juvenile alpine marmots survival: preliminary results

A. da Silva, Dominique Allainé

Fourth International Marmot Conference . -- : 157-164

Acte de congrès

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Variation in survival rates of the monogamous alpine marmot (Marmota marmota) : effects of sex age year and climate factors

E. Farand, Dominique Allainé, J. Coulon

Canadian Journal of Zoology . 80 : 342-349

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Dominance relationships male turnover and other factors influencing reproductive success of female alpine marmots (Marmota marmota)

W. King, Dominique Allainé

Canadian Journal of Zoology . 80 : 2137-2143

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Public information and breeding habitat selection in a wild bird population

Blandine Doligez, E. Danchin, Jean Clobert

Science . 297 : 1168-1170

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Influence of changes in nasal ventilation on workload during submaximal field running

M. Bourdin, P. Sallet, Anne-Béatrice Dufour, J.R. Lacour

Journal of Sports Medicine and Physical Fitness . 42 : 495-499

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Time to exhaustion is related to lactate exchange and removal abilities

Laurent Messonnier, H. Freund, C. Denis, D. Dormois, Anne-Béatrice Dufour, J.R. Lacour

International Journal of Sports Medicine . 23 : 433-438

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Within-plot relationships between tree species occurrences and hydrological soil constraints: an example in French Guiana investigated through canonical correlation analysis

R. Pélissier, S. Dray, D. Sabatier

Plant Ecology . 162 : 143-156

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Serosurvey for Newcastle disease and avian influenza A virus antibodies in great cormorants from France.

Marc Artois, R. Manvell, Emmanuelle Gilot-Fromont, J.B. Schweyer

Journal of wildlife diseases . -- : 169-171

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Male sterility thermal threshold in Drosophila: D. simulans appears more cold-adapted than its sibling D. melanogaster

M. Chakir, A. Chafik, B. Moreteau, Patricia Gibert, J.R. David

Genetica . 114 : 195-205

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Phenotypic plasticity of adult size and pigmentation in Drosophila : thermosensitive periods during development in two sibling species

M. Chakir, A. Chafik, Patricia Gibert, J.R. David

Journal of Thermal Biology . 26 : 351-361

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Phenotypic plasticity of body pigmentation in Drosophila: influence of a developmental thermoperiodic regime in two sibling species

G. Pétavy, B. Moreteau, Patricia Gibert, J.R. David

Physiological Entomology . 27 : 124-135

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The relative abundance of dinucleotides in transposable elements in five species

E. Lerat, P. Capy, C. Biémont

Molecular Biology and Evolution . 19 : 964-967

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Codon usage by transposable elements and their host genes in five species

E. Lerat, P. Capy, C. Biémont

Journal of Molecular Evolution . 54 : 625-637

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Comparative genomic mapping in mammals

G. Bronner, B. Spataro, Christian Gautier

Médecine/Sciences . 18 : 767-774

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Modeling comparative mapping using objects and associations

G. Bronner, B. Spataro, M. Page, Christian Gautier, F. Rechenmann

Computers and Chemistry . 26 : 413-420

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Hill-Robertson interference is a minor determinant of variations in codon bias across Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans genomes

Gabriel Marais, G. Piganeau

Molecular Biology and Evolution . 19 : 1399-1406

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AtSKtheta a plant homologue of SGG/GSK-3 marks developing tissues in Arabidopsis thaliana

R. Tavares, J. Vidal, A. van Lammeren, M. Kreis

Plant Molecular Biology . 50 : 261-271

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Non-purified anti-peptide sera generate tissue specific artefacts in immunohistochemical staining of Arabidopsis thaliana

R. Tavares, J. Vidal, A. van Lammeren, M. Kreis

Plant Science . 162 : 309-314

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