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Publications

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The ade4 Package-II: Two-table and K-table Methods

S. Dray, Anne-Béatrice Dufour, D. Chessel

The R Journal . 7 : 47-52

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Toxoplasmosis in prey species and consequences for prevalence in feral cats: not all prey species are equal.

E. Afonso, P. Thulliez, D. Pontier, Emmanuelle Gilot-Fromont

Parasitology . 134 ( Pt.14 ) : 1963-71

DOI: 10.1017/S0031182007003320

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Prevalence of Toxoplasma Gondii in small mammals from the ardennes region France

Eve Afonso, M.-L. Poulle, M. Lemoine, I. Villena, D. Aubert, Emmanuelle Gilot-Fromont

Folia Parasitologica . 54 : 313-314

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Modélisation grande échelle de réseaux biologiques : vérification par contraintes booléennes de la cohérence des données

Philippe Veber

Thèse

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Qualitative response of interaction networks: application to the validation of biological models

Anne Siegel, Carito Guziolowski, Philippe Veber, Ovidiu Radulescu, Michel Le Borgne

6th International Congress on Industrial and Applied Mathematics. ICIAM 07 . : nc

Acte de congrès

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Checking Consistency Between Expression Data and Large Scale Regulatory Networks: A Case Study

Carito Guziolowski, Philippe Veber, Michel Le Borgne, Ovidiu Radulescu, Anne Siegel

Journal of Biological Physics and Chemistry . 7 : 37-43

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Path-equivalent developments in acyclic weighted automata

Mathieu Giraud, Philippe Veber, Dominique Lavenier

International Journal of Foundations of Computer Science . 18 ( 4 ) : 799-812

DOI: 10.1142/S012905410700498X

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Identification de motifs dans les réseaux métaboliques

Vincent Lacroix

Thèse

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Natal dispersal of European hare in France

Y. Bray, S. Devillard, E. Marboutin, B. Mauvy, R. Péroux

Journal of Zoology . 273 : 426-434

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An archaeal orthologue of the universal protein Kae1 is an iron metalloprotein which exhibits atypical DNA-binding properties and apurinic-endonuclease activity in vitro.

Arnaud Hecker, Nicolas Leulliot, Danièle Gadelle, Marc Graille, Anthony Justome, Pierre Dorlet...

Nucleic Acids Research . 35 ( 18 ) : 6042-51

DOI: 10.1093/nar/gkm554

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Early archives of genetically-restricted proviral DNA in the female genital tract after heterosexual transmission of HIV-1

Nicolas Chomont, Hakim Hocini, Gérard Grésenguet, Céline Brochier-Armanet, Hicham Bouhlal, Laurent Andréoletti...

AIDS. Official journal of the international AIDS Society . 21 : 153--162

DOI: 10.1097/QAD.0b013e328011f94b

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Phylogenomics of the archaeal flagellum: rare horizontal gene transfer in a unique motility structure

Elie Desmond-Le Quéméner, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo

BMC Evolutionary Biology . 7 : 53-70

DOI: 10.1186/1471-2148-7-106

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Grinding up wheat: a massive loss of nucleotide diversity since domestication

A. Haudry, A. Cenci, C. Ravel, T. Bataillon, D. Brunel, C. Poncet...

Molecular Biology and Evolution . 24 : 1506-1517

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Dealing with missing phase and missing data in phylogeny-based analysis.

Claire Bardel, Pascal Croiseau, Emmanuelle Génin

BMC Proceedings . 1 Suppl 1 ( 1 ) : S22

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Data Mining Neural Nets Trees -- Problems 2 and 3 of Genetic Analysis Workshop 15

A. Ziegler, A.L. Destefano, R. König, C. Bardel, D. Brinza, S. Bull...

Genetic Epidemiology . 31 : S51-S60

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Climate changes and post-nuptial migration strategy by two reedbed passerines

Guillaume Péron, Pierre-Yves Henry, Pascal Provost, Olivier Dehorter, Romain Julliard

Climate Research . 35 : 147-157

DOI: 10.3354/cr00721

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Mitspieler der Evolution

C. Biémont, Cristina Vieira

Spektrum der Wissenschaft . S44 : 44-49

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Identification and molecular characterization of new STLV-1 and STLV-3 strains in wild-caught nonhuman primates in Cameroon

Florian Liegeois, Bénédicte Lafay, William M. Switzer, Sabrina Locatelli, Eitel Mpoudi-Ngolé, Severin Loul...

Virology . 371 ( 2 ) : 405-417

DOI: 10.1016/j.virol.2007.09.037

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Evaluation of the models handling heterotachy in phylogenetic inference

Yan Zhou, Nicolas Rodrigue, Nicolas Lartillot, Herve Philippe

BMC Evolutionary Biology . 7 : 206-219

DOI: 10.1186/1471-2148-7-206

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Suppression of Long-Branch Attraction Artefacts in the Animal Phylogeny Using a Site-Heterogeneous Model

Nicolas Lartillot, Henner Brinkmann, Herve Philippe

BMC Evolutionary Biology . 7 ( Suppl 1 ) : S4

DOI: 10.1186/1471-2148-7-S1-S4

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Interference competition and temporal niche shifts: elephants and herbivore communities at waterholes

Marion Valeix, Simon Chamaillé-Jammes, Hervé Fritz

Oecologia . 153 ( 3 ) : 739-748

DOI: 10.1007/s00442-007-0764-5

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Elephant management: why can’t we throw out the babies with the artificial bathwater?

Simon Chamaillé-Jammes, M. Valeix, H. Fritz

Diversity and Distributions . 13 ( 6 ) : 663-665

DOI: 10.1111/j.1472-4642.2007.00415.x

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Genotype-phenotype correlations in hereditary hemorrhagic telangiectasia : Data from the French-Italian HHT network

Gaetan Lesca, Carla Olivieri, Nelly Burnichon, Fabio Pagella, Marie-France Carette, Brigitte Gilbert-Dussardier...

Genetics in Medicine . 9 ( 1 ) : 14-22

DOI: 10.1097/GIM.0b013e31802d8373

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Dynamique d'un système hôte-parasitoïde en environnement spatialement hétérogène et lutte biologique Application au puceron Aphis gossypii et au parasitoïde Lysiphlebus testaceipes en serre de melons

Christelle Lopes

Thèse

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Effect of natural iron fertilization on carbon sequestration in the Southern Ocean

Stéphane Blain, Bernard Queguiner, Leanne Armand, Sauveur Belviso, Bruno Bombled, Laurent Bopp...

Nature . 446 ( 7139 ) : 1070-1075

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Comparison of docetaxel- and vinca alkaloid-based chemotherapy in the first-line treatment of advanced non-small cell lung cancer: a meta-analysis of seven randomized clinical trials.

Jean-Yves Douillard, Silvy Laporte, Frank Fossella, Vassilis Georgoulias, Jean-Louis Pujol, Kaoru Kubota...

Surgical Oncology . 2 ( 10 ) : 939-46

DOI: 10.1097/JTO.0b013e318153fa2b

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[Meta-analyses or megatrials: same level of proof?]

Patrick Mismetti, Michel Cucherat, Silvy Laporte

La Presse Médicale . 36 ( 3 Pt 2 ) : 524-30

DOI: 10.1016/j.lpm.2007.01.019

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Maintenance in the chicken genome of the retroviral-like cENS gene family specifically expressed in early embryos

Emmanuelle Lerat, Anne-Marie Birot, Jacques Samarut, Anne Mey

Journal of Molecular Evolution . 65 ( 3 ) : 215-227

DOI: 10.1007/s00239-007-9001-4

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Predictions for whole genome 2D display according to size and sequence composition

Bénédicte Lafay, Jean-François Mercier, Christine Kingsburry, Gary W. Slater

3rd SCOPE meeting on Microbial Environmental Genomics (MicroEnGenIII ) .

Acte de congrès

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Genetic diversity and phylogeographic clustering of SIVcpzPtt in wild chimpanzees in Cameroon.

Fran van Heuverswyn, Yingying Li, Elizabeth Bailes, Cecile Neel, Bénédicte Lafay, Brandon F Keele...

Virology . 368 ( 1 ) : 155-71

DOI: 10.1016/j.virol.2007.06.018

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