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Publications

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Methods to estimate the optimal threshold for normally or log-normally distributed biological tests

J. Jund, Muriel Rabilloud, M. Wallon, R. Écochard

Medical Decision Making . 25 : 406-415

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Study of Cyfra 21-1, a tumor marker, in head and neck squamous cell carcinoma

P. Ceruse, Muriel Rabilloud, A. Charrie, Catherine-Marie Dubreuil, F. Disant

Annals of Otology Rhinology and Laryngology . 114 : 768-776

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Prevalence of Listeria monocytogenes in 13 dried sausage processing plants and their products

D. Thévenot, Marie Laure Delignette-Muller, S. Christieans, Christine Vernozy-Rozand

International Journal of Food Microbiology . 102 : 85-94

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Modelling the effect of a temperature shift on the lag phase duration of Listeria monocytogenes

Marie Laure Delignette-Muller, F. Baty, M. Cornu, H. Bergis

International Journal of Food Microbiology . 100 : 77-84

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De la prévalence aux valeurs prédictives: L`antibiogramme face à l`évolution de la résistance aux antibiotiques

B. Lamy, G. Carret, Jean-Pierre Flandrois, Marie Laure Delignette-Muller

Annales de Biologie Clinique . 63 : 493-502

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seq++: a package for biological sequences analysis with a range of Markov-related models

V. Miele, P.Y. Bourguignon, David Robelin, Gregory Nuel, H. Richard

Bioinformatics . 21 : 2783-2784

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Online synonymous codon usage analyses with the ade4 and seqinR packages

D. Charif, J. Thioulouse, J.R. Lobry, G. Perrière

Bioinformatics . 21 : 545-547

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Forcing reversibility in the no-strand-bias substitution model allows for the theoretical and practical identifiability of its 5 parameters from pairwise DNA sequence comparisons

O. Zagordi, J.R. Lobry

Gene . 347 : 175-182

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The true treatment benefit is unpredictable in clinical trials using surrogate outcome measured with diagnostic tests

Behrouz Kassai, N.R. Shah, A. Leizorovicz, Michel Cucherat, François Gueyffier, J.-P. Boissel

Journal of Clinical Epidemiology . 58 : 1042-1051

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Systolic and Diastolic Blood Pressure Lowering as Determinants of Cardiovascular Outcome

J.-G. Wang, J.A. Staessen, S. Franklin, R. Fagard, François Gueyffier

Hypertension . 45(5) : 907-913

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Apparent effect on blood pressure is only partly responsible for the risk reduction due to antihypertensive treatments

J.-P. Boissel, François Gueyffier, F. Boutitie, S. Pocock, R. Fagard

Fundamental & Clinical Pharmacology . 19 : 579-584

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Exploring the evolution of Wolbachia compatibility types: a simulation approach

S. Charlat, C. Calmet, Olivier Andrieu, H. Mercot

Genetics . 170 : 495-507

DOI: 10.1534/genetics.103.015198

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Interactions between inherited bacteria and their hosts: The Wolbachia paradigm

Z. Veneti, M. Reuter, H. Montenegro, E.A. Hornett, S. Charlat, D. Hurst G.D.

incollection . -- : 119-141

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Fat intake reverses the beneficial effect of low caloric intake on skeletal muscle mitochondrial H2O2 production

B. Garait, K. Couturier, S. Servais, D. Letexier, D. Perrin, C. Batandier...

Free Radical Biology and Medicine . 39 : 1249-1261

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Origin and neofunctionalization of a Drosophila paternal effect gene essential for zygote viability.

Benjamin Loppin, David Lepetit, Steve Dorus, Pierre Couble, Timothy L Karr

Current Biology - CB . 15 ( 2 ) : 87-93

DOI: 10.1016/j.cub.2004.12.071

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Functional diversity of soil microbial community, rock phosphate dissolution and growth of Acacia seyal as influenced by grass-litter and soil-feeding termite nest structure amendments

R. Duponnois, M. Paugy, Jean Thioulouse, D. Masse, Michel Le Page

Geoderma . 124 : 349-361

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MADE4: an R package for multivariate analysis of gene expression data

A.C. Culhane, J. Thioulouse, G. Perrière, D.G. Higgins

Bioinformatics . 21 : 2789-2790

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Why roe deers are not red: patterns of maternal investment in ungulates

Mark Hewison, Jean-Michel Gaillard

7th European Roe deer Meeting . : 1 p.

Acte de congrès

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Big mothers invest more in daughters - reversed sex allocation in a weakly polygynous mammal

Mark Hewison, Jean-Michel Gaillard, Petter Kjellander, Carole Toïgo, Olof Liberg, Daniel Delorme

Ecology Letters . 8 ( 4 ) : 430-437

DOI: 10.1111/j.1461-0248.2005.00743.x

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Reproductive biology of captive female eurasian lynx, Lynx lynx

Hege Berg Henriksen, Reidar Andersen, Mark Hewison, Jean-Michel Gaillard, Morten Bronndal, Stefan Jonsson...

European Journal of Wildlife Research . 51 ( 3 ) : 151-156

DOI: 10.1007/s10344-005-0104-1

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Extended life cycle in the chestnut weevil: prolonged diapause or repeated diapause?

B. Soula, F. Menu

Entomologia Experimentalis et Applicata . 115 : 333-340

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Incidence and persistence of classical swine fever in free-ranging wild boar (Sus scrofa)

S Rossi, E Fromont, Dominique Pontier, C Crucière, J Hars, Jacques Barrat...

Epidemiology and Infection . 133 ( 3 ) : 559-568

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Long-term monitoring of classical swine fever in wild boar (Sus scrofa sp) using serological data

S Rossi, M Artois, Dominique Pontier, C Crucière, J Hars, Jacques Barrat...

Veterinary Research . 36 ( 1 ) : 27-42

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Morphological evolution, ecological diversification and climate change in rodents

Sabrina Renaud, Jacques Michaux, Daniela N. Schmidt, Jean-Pierre Aguilar, Pierre Mein, Jean-Christophe Auffray

Proceedings of the Royal Society of London . 272 : 609-617

DOI: 10.1098/rspb.2004.2992

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First upper molar and mandible shape of wood mice (Apodemus sylvaticus) from northern Germany: ageing, habitat and insularity

Sabrina Renaud

Mammalian Biology: Zeitschrift für Säugetierkunde . 70 ( 3 ) : 157-170

DOI: 10.1016/j.mambio.2004.10.004

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Polymorphix: a sequence polymorphism database

E. Bazin, L. Duret, Simon Penel, N. Galtier

Nucleic Acids Research . 33 : 481-484

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A bunch of fun-guys: the whole-genome view of yeast evolution

H. Ochman, Vincent Daubin, E. Lerat

Trends in Genetics . 21 : 1-3

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Examining bacterial species under the specter of gene transfer and exchange

H. Ochman, E. Lerat, Vincent Daubin

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 102 : 6595-6599

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Les trésors cachés du génome humain

L. Duret

Pour la science . -- : 16-21

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Bioinformatics with a French accent

L.D. Hurst, L. Duret

Genome Biology . 6 : 349.1-349.3

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