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Publications

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Roseobacter algicola sp. nov., a new marine bacterium isolated from the phycosphere of the toxin-producing dinoflagellate Prorocentrum lima.

Bénédicte Lafay, Raymond Ruimy, Catherine Rausch de Traubenberg, Violette Breittmayer, Michel J. Gauthier, Richard Christen

International Journal of Systematic Bacteriology . 45 ( 2 ) : 290-6

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A combined morphological and molecular approach to the phylogeny of asteroids (Asteroidea: Echinodermata)

Bénédicte Lafay, Richard Christen, Andrew B. Smith

Systematic Biology . 44 ( 2 ) : 190-208

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Co-inertia analysis of amino-acid physico-chemical properties and protein composition with the ADE package

J. Thioulouse, J.R. Lobry

Bioinformatics . 11 : 321-329

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Properties of a general model of DNA evolution under no-strand-bias conditions

J.R. Lobry

Journal of Molecular Evolution . 40 : 326-330

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Convenient Model To Describe the Combined Effects of Temperature and pH on Microbial Growth

L. Rosso, J.R. Lobry, S. Bajard, Jean-Pierre Flandrois

Applied and Environmental Microbiology . 61 : 610-616

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DE software: multivariate analysis and graphical display of environmental data

J. Thioulouse, S. Doledec, D. Chessel, J.M. Olivier

incollection . -- : 57-62

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Multivariate analysis of spatial patterns: a unified approach to local and global structures

J. Thioulouse, D. Chessel, S. Champely

Environmental and Ecological Statistics . 2 : 1-14

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Larval development variation and adult emergence in the chestnut weevil Curculio elephas Gyllenhal (Col. Curculionidae)

F. Menu, D Debouzie

J. Appl. Ent. . 119 : 279-284

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Statistical analysis of vertebrate sequences reveals that long genes are scarce in GC-rich isochores

L. Duret, Dominique Mouchiroud, Christian Gautier

Journal of Molecular Evolution . 40 : 308-317

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Finding flexible patterns in a text - An application to 3D matching

M-F. Sagot, Alain Viari, J. Pothier, H. Soldano

Computer Applications in the Biosciences . 11 : 59-70

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Multiple Sequence Comparison:A Peptide Matching Approach

M-F. Sagot, Alain Viari, H. Soldano

incollection . 937 : 366-385

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Small-subunit rRNA sequences and whole DNA relatedness concur for the reassignment of Pasteurella piscicida (Snieszko et al.) Janssen and Surgalla to the genus Photobacterium as Photobacterium damsela subsp. piscicida comb. nov.

Gilles Gauthier, Bénédicte Lafay, Raymond Ruimy, Violette Breittmayer, Jean-Louis Nicolas, Richard Christen

International Journal of Systematic Bacteriology . 45 ( 1 ) : 139-44

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Ophiuroid phylogeny and higher taxonomy: morphological, molecular and palaeontological perspectives

Andrew B. Smith, Gordon L.J. Paterson, Bénédicte Lafay

Zoological Journal of the Linnean Society . 114 : 213-243

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Accuracy of microbial growth predictions with square root and polynomial models

Jean-Pierre Flandrois, M. Delignette-Muller

International Journal of Food Microbiology . 27 ( 2-3 ) : 139-146

DOI: 10.1016/0168-1605(94)00158-3

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L1 (LINE-1) retrotransposable elements provide a "fossil" record of the phylogenetic history of murid rodents.

K. Usdin, Pascale C Chevret, F. Catzeflis, R. Verona, A. Furano

Molecular Biology and Evolution . 12 ( 1 ) : 73-82

DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040192

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Amplification of the ancient murine Lx family of long interspersed repeated DNA occurred during the murine radiation

Anthony V. Furano, Bruce E. Hayward, Pascale C Chevret, François Catzeflis, Karen Usdin

Journal of Molecular Evolution . 38 ( 1 )

DOI: 10.1007/bf00175491

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Molecular phylogeny of the Praomys complex (Rodentia: Murinae): a study based on DNA/DNA hybridization experiments.

Pascale C Chevret, Laurent Granjon, Jean-Marc Duplantier, Christiane Denys, François M Catzeflis

Zoological Journal of the Linnean Society . 112 ( 4 ) : 425-442

DOI: 10.1006/zjls.1994.1052

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Rearrangement of CCND1 (BCL1/PRAD1) 3' untranslated region in mantle-cell lymphomas and t(11q13)-associated leukemias

R. Rimokh, F. Berger, C. Bastard, B. Klein, M. French, E. Archimbaud...

Blood . 83 : 3689-3696

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NRSub: a non-redundant data base for the Bacillus subtilis genome

G. Perrière, Manolo Gouy, T. Gojobori

Nucleic Acids Research . 22 ( 25 ) : 5525-5529

DOI: 10.1093/nar/22.25.5525

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Hydrophobicity expressivity and aromaticity are the major trends of amino-acid usage in 999 Escherichia coli chromosome-encoded genes

J.R. Lobry, Christian Gautier

Nucleic Acids Research . 22 : 3174-3180

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HOVERGEN: a database of homologous vertebrate genes

L. Duret, Dominique Mouchiroud, Manolo Gouy

Nucleic Acids Research . 22 ( 12 ) : 2360-2365

DOI: 10.1093/nar/22.12.2360

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Molecular Phylogenetic Analysis of Nitrobacter spp

S. Orso, Manolo Gouy, E. Navarro, P. Normand

International Journal of Systematic Bacteriology . 44 ( 1 ) : 83-86

DOI: 10.1099/00207713-44-1-83

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Heterogeneity of hepatitis C virus genotypes in France

D. Qu, O. Hantz, Manolo Gouy, L. Vitvitski, J.S. Li, F. Berby...

Journal of General Virology . 75 ( Pt 5) : 1063-1070

DOI: 10.1099/0022-1317-75-5-1063

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Modèles de taille et de forme : Que choisir ?

Anne-Béatrice Dufour, M. Pagès

Revue de Statistique Appliquée . 42 : 5-18

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Phylogenetic analysis and assessment of the genera Vibrio, Photobacterium, Aeromonas, and Plesiomonas deduced from small-subunit rRNA sequences.

Raymond Ruimy, Violette Breittmayer, Philippe Elbaze, Bénédicte Lafay, Odile Boussemart, Michel Gautier...

International Journal of Systematic Bacteriology . 44 ( 3 ) : 416-26

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Mathematical model of the interactions between Micrococcus spp. and Pseudomonas aeruginosa on agar surface

J.-P. Flandrois, Catherine Chapuis

The Journal of applied bacteriology . 77 ( 6 ) : 727-732

DOI: 10.1111/j.1365-2672.1994.tb02826.x

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[Post-antibiotic effect of three aminoglycosides against Klebsiella pneumoniae].

M de Montclos, M. Guinet, Jean-Pierre Flandrois, Catherine Chapuis

Pathologie Biologie . 42 ( 5 ) : 419-24

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An accurate diffusion method for determining bacterial sensitivity to antibiotics

M. Delignette-Muller, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 34 ( 1 ) : 73-81

DOI: 10.1093/jac/34.1.73

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Molecular phylogeny of Eubacteria: a new multiple tree analysis method applied to 15 sequence data sets questions the monophyly of Gram-positive bacteria

N. Galtier, Manolo Gouy

Research in Microbiology . 145 ( 7 ) : 531-541

DOI: 10.1016/0923-2508(94)90030-2

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