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Publications

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Tanglegrams are misleading for visual evaluation of tree congruence

Damien M. de Vienne

Pré-publication

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Complex ecological interactions of Staphylococcus aureus in tampons during menstruation

Isaline Jacquemond, Anaëlle Muggeo, Gery Lamblin, Anne Tristan, Yves Gillet, Pierre Adrien Bolze...

Scientific Reports . 8 ( 1 ) : 9942

DOI: 10.1038/s41598-018-28116-3

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Multivariate Analysis of Ecological Data with ade4

Jean Thioulouse, Stéphane Dray, Anne-Béatrice Dufour, Aurélie Siberchicot, Thibaut Jombart, Sandrine Pavoine

DOI: 10.1007/978-1-4939-8850-1

Ouvrage

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Maternal reproductive senescence shapes the fitness consequences of the parental age difference in ruffed lemurs

Morgane Tidière, Xavier Thevenot, Adamantia Deligiannopoulou, Guillaume Douay, Mylisa Whipple, Aurélie Siberchicot...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 285 ( 1886 ) : 20181479

DOI: 10.1098/rspb.2018.1479

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Modelling allometry: statistical and biological considerations – a reply to Packard

Christophe Pélabon, Morgane Tidière, Jean-François Lemaître, Jean-Michel Gaillard

Biological Journal of the Linnean Society . 125 ( 3 ) : 664-671

DOI: 10.1093/biolinnean/bly141

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Selective laser sintering of porcelain

A. Danezan, Gaëlle Delaizir, Nicolas Tessier-Doyen, G. Gasgnier, Jm. Gaillard, P. Duport...

Journal of the European Ceramic Society . 38 ( 2 ) : 769-775

DOI: 10.1016/j.jeurceramsoc.2017.09.034

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Robust Frankia phylogeny, species delineation and intraspecies diversity based on Multi-Locus Sequence Analysis (MLSA) and Single-Locus Strain Typing (SLST) adapted to a large sample size

Adrien C Pozzi, Hector Bautista-Guerrero, Sophie S. Abby, Aude P Herrera-Belaroussi, Danis Abrouk, Philippe Normand...

Systematic and Applied Microbiology . 41 ( 4 ) : 311-323

DOI: 10.1016/j.syapm.2018.03.002

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Chauves-souris et services écosystémiques : que nous apprend l'ADN contenu dans le guano?

Orianne Tournayre, Maxime Galan, Jean-Baptiste Pons, Eric Pierre, Maxime Leuchtmann, Dominique Pontier...

Congrès Ecolo’Tech .

Acte de congrès

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Histoire évolutive et taxonomie intégrative dans le genre Gerbillus (Rodentia: Muridae)

Laurent Granjon, Gauthier Dobigny, Pascale C Chevret, Arame Ndiaye

Bulletin de la société d'histoire naturelle de l'Afrique du Nord . 74 : 43-55

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Divergent in shape and convergent in function: adaptive evolution of the mandible in Sub-Antarctic mice

Sabrina Renaud, Ronan Ledevin, Benoît Pisanu, Jean-Louis Chapuis, Petra Quillfeldt, Emilie A. Hardouin

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 72 ( 4 ) : 878-892

DOI: 10.1111/evo.13467

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Assessing the composition of fragmented agglutinated foraminiferal assemblages in ancient sediments: comparison of counting and area-based methods in Famennian samples (Late Devonian)

Catherine Girard, Anne-Béatrice Dufour, Anne-Lise Charruault, Sabrina Renaud

Journal of Micropalaeontology . 37 ( 1 ) : 87-95

DOI: 10.5194/jm-37-87-2018

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Life History Traits Impact the Nuclear Rate of Substitution but Not the Mitochondrial Rate in Isopods

Nathanaëlle Saclier, Clémentine François, Lara Konecny-Dupré, Nicolas Lartillot, Laurent Guéguen, L. Duret...

Molecular Biology and Evolution . 35 ( 12 ) : 2900-2912

DOI: 10.1093/molbev/msy184

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PRDM9 Methyltransferase Activity Is Essential for Meiotic DNA Double-Strand Break Formation at Its Binding Sites

Boubou Diagouraga, Julie Clément, L. Duret, Jan Kadlec, Bernard de Massy, Frédéric Baudat

Molecular Cell . 69 ( 5 ) : 853 - 865.e6

DOI: 10.1016/j.molcel.2018.01.033

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Codon Usage Bias in Animals: Disentangling the Effects of Natural Selection, Effective Population Size, and GC-Biased Gene Conversion

Nicolas Galtier, Camille Roux, Marjolaine Rousselle, Jonathan Romiguier, Emeric Figuet, Sylvain Glemin...

Molecular Biology and Evolution . 35 ( 5 ) : 1092 - 1103

DOI: 10.1093/molbev/msy015

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Geometric medians in reconciliation spaces

Katharina Huber, Vincent Moulton, Marie-France Sagot, Blerina Sinaimeri

Information Processing Letters . 136 : 96 - 101

DOI: 10.1016/j.ipl.2018.04.001

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Reconfiguration of graphs with connectivity constraints

Nicolas Bousquet, Arnaud Mary

WAOA 2018 - International Workshop on Approximation and Online Algorithms . 11312 : 295-309

DOI: 10.1007/978-3-030-04693-4_18

Acte de congrès

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Genomic study of a novel magnetotactic Alphaproteobacteria uncovers the multiple ancestry of magnetotaxis

Caroline Monteil, Guy Perrière, Nicolas Menguy, Nicolas Ginet, Béatrice Alonso, Nicolas Waisbord...

Environmental Microbiology .

DOI: 10.1111/1462-2920.14364

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Extreme halophilic archaea derive from two distinct methanogen Class II lineages

Monique Aouad, Najwa Taïb, Anne Oudart, Michel Lecocq, Manolo Gouy, Céline Brochier-Armanet

Molecular Phylogenetics and Evolution . 127 : 46-54

DOI: 10.1016/j.ympev.2018.04.011

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The repeatability of cognitive performance: a meta-analysis

Maxime Cauchoix, P K y Chow, J O van Horik, C M Atance, E. Barbeau, Gladys Barragan-Jason...

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 373 : 1756

DOI: 10.6084/m9.figshare.c.4153862

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Highly Reduced Genome of the New Species Mycobacterium uberis, the Causative Agent of Nodular Thelitis and Tuberculoid Scrotitis in Livestock and a Close Relative of the Leprosy Bacilli

Andrej Benjak, Charlotte Avanzi, Yvonne Benito, Franck Breysse, Christophe Chartier, Maria-Laura Boschiroli...

MSphere . 3 ( 5 ) : e00405-18

DOI: 10.1128/mSphere.00405-18

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Changing patterns of human migrations shaped the global population structure of Mycobacterium tuberculosis in France

Maxime Barbier, Oana Dumitrescu, Catherine Pichat, Gérard Carret, Anne-Sophie Ronnaux-Baron, Ghislaine Blasquez...

Scientific Reports . 8 ( 1 ) : 5855

DOI: 10.1038/s41598-018-24034-6

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Tsunami sedimentary deposits of Crete records climate during the ‘Minoan Warming Period’ (≈3350 yr BP)

Christophe Lécuyer, François Atrops, Romain Amiot, Delphine Angst, Valérie Daux, Jean-Pierre Flandrois...

The Holocene .

DOI: 10.1177/0959683617752840

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Integrating spatial and phylogenetic information in the fourth‐corner analysis to test trait–environment relationships

Joao Braga, Cajo J.F. ter Braak, Wilfried Thuiller, Stéphane Dray

Ecology . 99 ( 12 ) : 2667-2674

DOI: 10.1002/ecy.2530

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Regulated hunting re-shapes the life history of brown bears

Richard Bischof, Christophe Bonenfant, Inger Maren Rivrud, Andrea Zedrosser, Andrea Friebe, Tim Coulson...

Nature Ecology & Evolution . 2 ( 1 ) : 116 - 123

DOI: 10.1038/s41559-017-0400-7

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Avis de l’Anses relatif à une évaluation du risque lié au dépeuplement d’élevages porcins, opérations mises en œuvre en cas de foyers de PPA en élevage

Claude Saegerman, Eric Baubet, Catherine C. Belloc, Eric Collin, Claude Fischer, Jean Hars...

: 21 p.

Rapport

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Comparison of Three Methods to Assess the Potential for Bushpig-Domestic Pig Interactions at the Wildlife—Livestock Interface in Uganda

Ariane Payne, Peter Ogweng, Alfred Ojok, Eric Etter, Emmanuelle Gilot-Fromont, Charles Masembe...

Frontiers in Veterinary Science . 5 ( 295 ) : 1-13

DOI: 10.3389/fvets.2018.00295

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Genetic Characterization of Toxoplasma gondii DNA Samples Isolated From Humans Living in North America: An Unexpected High Prevalence of Atypical Genotypes

Christelle Pomares, Sébastien Devillard, Tyson Holmes, Tudor Rares Olariu, Cynthia Press, Raymund Ramirez...

Journal of Infectious Diseases . 218 ( 11 ) : 1783-1791

DOI: 10.1093/infdis/jiy375

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Phylogenetic signal from rearrangements in 18 Anopheles species by joint scaffolding extant and ancestral genomes

Yoann Anselmetti, Wandrille Duchemin, Eric Tannier, Cedric Chauve, Sèverine Bérard

BMC Genomics . 19 ( S2 ) : 1-15

DOI: 10.1186/s12864-018-4466-7

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Helena and BS: two travellers between the genera Drosophila and Zaprionus

M C Simão, Annabelle A. Haudry, A Granzotto, N de Setta, C M A Carareto

Genome Biology and Evolution .

DOI: 10.1093/gbe/evy184

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Development of a PCR-RFLP assay to identify Drosophila melanogaster among field-collected larvae

Vincent Raquin, Hélène Henri, Marine Vallat, François Leulier, Patricia Gibert, Natacha Kremer

Ecology and Evolution . 8 ( 20 ) : 10067 - 10074

DOI: 10.1002/ece3.4453

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