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Génomes, protéomes et transcriptomes à foison
G. Perrière
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Toward community standards in the quest for orthologs
Christophe Dessimoz, Toni Gabaldon, David Roos, Erik L L Sonnhammer, Javier Herrero, Alfonso Valencia, A. Altenhoff, Rolf Apweiler, M. Ashburner, J. Blake, B. Boeckmann, A. Bridge, E. Bruford, M. Cherry, M. Conte, D. Dannie, R. Datta, B. Domelevo Entfellner, I. Ebersberger, M. Galperin, J. Joseph, T. Koestler, E. Kriventseva, O. Lecompte, J. Leunissen, S. Lewis, Benjamin Linard, M. Livstone, H.-C. Lu, M. Martin, R. Mazumder, D. Messina, V. Miele, M. Muffato, G. Perrière, M. Punta, M. Rouard, T. Schmitt, F. Schreiber, A. Silva, K. Sjolander, N. Skunca, E. Stanley, R. Szklarczyk, P. Thomas, I. Uchiyama, M. van Bel, K. Vandepoele, A. Vilella, A. Yates, E. Zdobnov
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ReNaBi-IFB : The French Bioinformatics Infrastructure
Guy Perrière
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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d’un ‘pipeline’ bio-informatique pour les biologistes
Sébastien Terrat, Richard Christen, Samuel S. Dequiedt, Pierre-Alain Maron, Christophe Mougel, Guy Perriere, Lionel Ranjard
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Bioinformatics developments for NGS data analysis at PRABI
F. Picard, Guy Perrière
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Proposals for classification methods dedicated to biological data
Anne-Muriel Arigon Chifolleau, Guy Perrière, Manolo Gouy
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Concepts et méthodes en phylogénie moléculaire
G. Perrière, Céline Brochier-Armanet
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Concepts et méchodes en phylogénie moléculaire
G. Perrière, C. Brochier-Armanet
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Analyse et exploitation de la diversité génétique des polykétides synthases de type I dans l'ADN metagénomique d'un sol
Aurélien Ginolhac, Sandrine Demanèche, Cyrille Jarrin, Patrick Robe, Fabrice Lefevre, Renaud Nalin, Guy Perrière, Timothy M. Vogel, Pascal Simonet
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Automatic Identification of Large Collections of Protein-Coding or rRNA Sequences
Anne-Muriel Arigon Chifolleau, Guy Perrière, Manolo Gouy
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Bioinformatics in the complete genome sequence era
G. Perrière
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Integrating transcription factor binding site information with gene expression datasets
I.B. Jeffery, S.F. Madden, P.A. Mcgettigan, G. Perrière, A.C. Culhane, D.G. Higgins
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Integr8 and Genome Reviews: integrated views of complete genomes and proteomes.
P. Kersey, L. Bower, L. Morris, A. Horne, R. Petryszak, C. Kanz, A. Kanapin, U. Das, K. Michoud, I. Phan, A. Gattiker, T. Kulikova, N. Faruque, K. Duggan, P. Mclaren, B. Reimholz, L. Duret, Simon Penel, I. Reuter, Rolf Apweiler
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Integrated databanks access and sequence/structure analysis services at the PBIL.
G. Perriere, C. Combet, Simon Penel, Christophe Blanchet, J. Thioulouse, C. Geourjon, J. Grassot, C. Charavay, Manolo Gouy, L. Duret, G. Deleage
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YodA from Escherichia coli is a metal-binding lipocalin-like protein
G. David, K. Blondeau, M. Schiltz, Simon Penel, A. Lewit-Bentley
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Length preferences and periodicity in beta-strands. Antiparallel edge beta-sheets are more likely to finish in non-hydrogen bonded rings
Simon Penel, R.G. Morrison, P.D. Dobson, R.J. Mortishire-Smith, A.J. Doig
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Rotamer strain energy in protein helices - quantification of a major force opposing protein folding
Simon Penel, A.J. Doig
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Stabilizing nonpolar/polar side-chain interactions in the alpha-helix
C.D. Andrew, Simon Penel, G.R. Jones, A.J. Doig
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Structure stability and folding of the alpha-helix
A.J. Doig, C.D. Andrew, D.A. Cochran, E. Hughes, Simon Penel, J.K. Sun, B.J. Stapley, D.T. Clarke, G.R. Jones
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Effect of the N1 residue on the stability of the alpha-helix for all 20 amino acids
D.A.E. Cochran, Simon Penel, A.J. Doig