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Thèse de Leandro Ishi Soares de Lima le mardi 23 avril 2019 à 14 h, salle Fontannes (bâtiment Darwin D, La doua)
Thèse de Béatrice Donati le mercredi 12 novembre 2014 à 10 h - amphithéâtre Physique Nucléaire bâtiment Paul Dirac (Doua)
(travail en collaboration avec A. Arribas-Gil, Univ. Carlos III, Madrid) Dans cet exposé, je parlerai tout d'abord de l'alignement statistique de 2 séquences, qui permet d'aligner ces séquences sans choisir a priori les paramètres de l'alignement. Ces paramètres sont en fait déterminés par maximum de vraisemblance, dans un modèle d'évolution de ces deux séquences. Dans un second temps, je montrerai commen on peut modifier l'algorithme d'alignement statistique pour prendre en compte la non indépendance dans l'évolution des sites de la séquence. J'illustre ces résultats sur une paire de séquences "jouet" (alpha-globine humaine HBA1 et pseudo-gène HBPA1).