Showing results 141 to 160 on 1605 in total
Le virus Nipah (NiV) est un pathogène émergent responsable d'un nombre élevé de décès chez l'homme en Asie et a été inclus dans le système mondial d'alerte précoce de l'OMS, de l'OIE et de la FAO. Les chauves-souris du genre Pteropus sont le principal réservoir du NiV et sa transmission à l'interface chauve-souris-homme fait intervenir de nombreux facteurs écologiques, environnementaux et socio-culturels. Des approches intégrées sont donc nécessaires pour comprendre et contrôler avec succès le risque d'épidémies. De 2012 à 2016, nous avons combiné des recherches sur l'écologie des chauves-souris (phénologie reproductive, dynamique des populations et alimentation), les perceptions et les pratiques humaines (études ethnographiques et études sur les connaissances, les attitudes et les pratiques) et des études sur la circulation du NiV dans les populations de chauves-souris et humaines (surveillance du virus dans l'urine des chauves-souris et sérologie humaine) afin de mieux comprendre le risque potentiel d'émergence du NiV au Cambodge. Nos résultats suggèrent que le virus circule de façon saisonnière chez les chauves-souris mais n'ont pas révélé de transmission chez les personnes exposées. Nous avons identifié des voies de transmission potentielles vers l'homme, comme des fruits consommés par les chauves-souris et récoltés par l'homme lorsque le NiV circule. Ce qui nous permet de faire des recommandations pour limiter le risque d'émergence du NiV chez l'Homme.
Les arbres permettent de modéliser des situations variées en biologie : l'architecture des plantes ou de leur système racinaire, les lignées cellulaires, ou encore la structure secondaire de l'ARN. Savoir traiter des données arborescentes peut donc permettre de résoudre des questions biologiques. Afin de comparer ces données, on peut munir l'espace des arbres d'une métrique, dite distance d'édition. A l'ère des données massives, le problème est alors de calculer en un temps raisonnable la matrice des distances 2 à 2 de la base de données dont on dispose. Je présenterai une stratégie de compression avec perte des arbres qui permet de résoudre au moins partiellement ce problème de complexité temporelle. Nous verrons que cela a des implications sur l'analyse et la modélisation des architectures de certaines plantes.
-
-
Animal bodies house trillions of bacteria, which can influence host behavior in ways that have far-reaching implications for host ecology and evolution. Recent studies have revealed surprising roles for bacteria in shaping behavior across many animal taxa. But questions remain and recent perspective papers have emphasized the need of studying the interactions between microbiota and host behavior. Although it has long been posited that microbiota can influence host behaviour by affecting chemical cues that animals use to communicate, this purported relationship has only recently received renewed attention owing to the advent of new sequencing technologies. My work takes place into this framework, and I will present various results that link microbiota and odor cues in birds and mammals.Odeurs et microbiote chez les vertébrésDepuis quelques années, le rôle des bactéries dans l'écologie et l'évolution des animaux suscite un grand intérêt théorique. Néanmoins, bien que les bactéries semblent jouer un rôle fondamental dans la valeur adaptative des individus, la communauté scientifique vient tout juste de découvrir l'ampleur de leur diversité et fonctions. En particulier, il a été suggéré que le microbiote pouvait être, en partie, responsable de la production des odeurs corporelles utilisées par les animaux pour communiquer avec leurs conspécifiques. Etant donné l'importance de la communication chimique à travers le règne animal, l'altération des odeurs par le microbiote pourrait être une force qui façonne de nombreux comportements. Cependant, malgré l'intérêt que ce sujet suscite, très peu d'études se sont, jusqu'à présent, penchées sur cette question. Mes travaux de recherches se placent dans ce contexte théorique, et je présenterai différents résultats sur les signaux odeurs et le lien avec le microbiote chez les oiseaux et les mammifères.
Short biography: Biochemistry undergraduate at Oxford, then bioinformatics masters at Imperial College London. Followed by comparative genomics of mosquito immunity PhD also at Imperial. Then OrthoDB-orthology postdoc in Geneva participating in the i5k arthropod genomes initiative, and mosquito comparative genomics Marie Curie fellowship at MIT with return phase back in Geneva. Now assistant professor at the University of Lausanne since September 2017 and Swiss Institute of Bioinformatics Group Leader since 2018.
-
.