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These de Clément Rezvoy - mercredi 28 septembre - 14h00 - ENS Lyon Site Monod (Amphi F)
Thèse de Marie-Pauline BEUGIN le vendredi 15 décembre 2017 à 10 h 30, amphithéâtre BU (La Doua)
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Depuis son apparition, il y a près de 4 milliards d'années, la vie sur la terre est soumise aux aléas de l'environnement. Beaucoup ont des effets néfastes. En réponse, les êtres vivants ont une propension à se diversifier. Ainsi, les descendants d'une même lignée ne sont pas tous identiques et certains d'entre eux sont plus aptes que d'autres à résister à ces aléas. Ils assurent ainsi des descendances qui pérennisent des formes de vie un peu différentes des précédentes. On voit alors se dessiner le schéma de l'évolution. Ces différences sont analysées classiquement par la statistique et le calcul des probabilités. Mais ces méthodes efficaces et robustes ne disent rien sur l'origine de cette variabilité. Or et depuis peu, des processus biologiques et écologiques produisant un hasard endogène ont été identifiés. Ils sont présents à tous les niveaux d'organisation du vivant, de la cellule à l'écosystème. Ils sont apparus spontanément et ont été sélectionnés car ils dotent les systèmes vivants (organismes, populations et communautés) d'une propriété essentielle : celle d'une assurance pour la vie. Ces processus sont à la fois des produits et des moteurs de l'évolution biologique. Dès lors, le hasard n'est plus perçu négativement, mais comme un fait essentiel à la vie et placé au cœur du vivant. En ce sens, on peut sans doute évoquer une « révolution copernicienne » dans les sciences de la vie. Cette nouvelle façon de voir le hasard et ses origines a de multiples conséquences, tant en ce qui concerne les bases fondamentales de la théorie de l'évolution, que des aspects pratiques de gestion des systèmes vivants..
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Voici le lien du site : http://biomserv.univ-lyon1.fr/GDRE-RA/
Dans le cadre du projet France Médecine Génomique annoncé par le Premier ministre en juin 2016, deux projets pilotes de plateformes de séquençage très haut débit ont été retenues : les projets SeqOIA (Paris-Île-de-France) et AURAGEN (région Auvergne Rhône Alpes). Après quelques rappels sur le contexte du plan France Médecine génomique, le projet AURAGEN sera détaillé avec ses 5 axes : pré analytique, analytique, post analytique, médico-économique et formation. Il s'agit d'un projet de génomique qui sera inclus dans le parcours de soins des patients présentant une maladie rare ou un cancer. Nous présenterons également les projets pilotes en lien avec le plan France médecine génomique et les retombées attendues tant au niveau diagnostique que de la recherche.
En apparence, il s'agit d'une question relativement simple dont on attend une réponse tout aussi simple. Dans le langage courant, ou en tout cas médiatique, la question est parfois posée sous la forme « le cancer aujourd'hui, une épidémie ? ». Le mode de vie actuel, les modifications environnementales, les expositions à des sources polluantes multiples alimentent, de manière légitime, les craintes de la population. Le vieillissement de la population induit également une augmentation du nombre de personnes atteintes de cancer, ce qui accentue la perception, réelle ou supposée, de la maladie : on rappelle que le cancer est, depuis 2004, la première cause de décès en France. Il n'existe pas de réponse universelle à la question initiale, pour de multiples raisons. La première réponse, d'ordre technique, est qu'il n'existe, pour répondre à la question, que des données observationnelles. Il n'est de ce fait pas aisé de faire le lien entre une cause et un effet. Or, parler de risque, au sens scientifique du terme, suppose la mise en évidence de facteurs de risque. Une seconde raison est que le cancer est une maladie qui a des composantes très différentes, et dont les causes possibles sont la résultante de différents facteurs (maladie multifactorielle). Une autre façon d'aborder cette question serait de décliner la problématique en trois questions : quel est le risque d'avoir un cancer (question initiale), le risque d'avoir un diagnostic de cancer (cas des localisations à forte prévalence), le risque de décéder d'un cancer. Notre exposé n'aura pas pour objectif de fournir une réponse définitive à la question posée mais plutôt de fournir des indications sur la difficulté d'y répondre. Les données du registre du cancer de l'Isère, mais aussi d'autres registres ainsi que les estimations nationales d'incidence et de mortalité serviront de support à la présentation.
Thèse de Mariona Ferrandiz Rovira - le vendredi 3 juillet 2015 à 14 h, salle des conférences BU (la Doua)
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Depuis 2015, les avancées des technologies de séquençage PacBio et Oxford Nanopore ont bouleversé les projets de séquençages génomiques. Les chromosomes bactériens et les bras chromosomiques des génomes eucaryotes peuvent être assemblés en une seule séquence. La qualité des assemblages atteint si ce n'est dépasse les assemblages de références Sanger des années 2000, les centromères et télomères alors souvent non résolus deviennent désormais analysables. Les résultats sur plusieurs espèces de bactéries, champignons et plantes seront présentés afin d'illustrer les réussites de cette rupture technologique mais aussi les cas qui restent encore non parfaitement résolus.
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La perception chimique (olfaction et gustation) est impliquée dans de nombreuses fonctions biologiques chez les mammifères terrestres. Elle permet notamment de s'alimenter, de s'orienter, de réagir aux perturbations abiotiques et biotiques de l'environnement et de structurer et coordonner la vie sexuelle et sociale. Cependant, chez les mammifères marins et plus particulièrement chez les cétacés, ces modalités sensorielles ont été extrêmement peu étudiées au profit de la communication acoustique. Nous développons actuellement des travaux de recherches visant à caractériser les capacités olfactives et gustatives de ces animaux. Notre approche pluridisciplinaire intègre 3 niveaux d'exploration: 1) Un volet en écologie chimique dont l'objectif est d'analyser et identifier les molécules émises par les individus, susceptibles d'être informatives pour les congénères ; 2) Un volet neurobiologique permettant d'explorer les organes récepteurs, les structures cérébrales et les voies nerveuses impliquées dans la perception et l'intégration des signaux chimiques (prélèvements sur des spécimens échoués) ; 3) Un volet comportemental visant à étudier, en milieu naturel, les fonctions biologiques des informations chimiques, notamment dans le cadre de l'alimentation et dans la vie sociale de ces mammifères marins. Outre son aspect fondamental, notre projet pourrait permettre, à terme, d'identifier des molécules répulsives utilisables dans le cadre de la conservation, notamment en prévention contre les menaces anthropiques qui pèsent sur les cétacés, telles que les prises accessoires dans les filets de pêche ou les collisions avec les navires.
Habilitation à diriger des recherches d'Eric Tannier - Jeudi 21 juillet 2011 - 14h00 - Amphi du CNRS
Thèse de Gwénaelle Gueguen - mardi 29 septembre 2009 - 14h00 - Amphi de Physique nucléaire - Bât Paul Dirac
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Thèse de Caroline Esnault - Vendredi 3 octobre 2008 à 14h30 - Amphithéâtre Paul Dirac
Thèse Florent Lassalle - mardi 26 novembre 2013 à 14 h, amphithéâtre Ampère bâtiment Lippmann