GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive

Brochier-Armanet Céline

Professeure des universités

UCBL

Adresse : 43 bd du 11 novembre 1918
69622 VILLEURBANNE cedex

Tél : 33 04 26 23 44 76

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Publications

Affichage des publications 91 à 120 sur 130 au total

Pendant trois milliards d'années les micro-organismes sont les seuls habitants de la terre

J.C. Bertrand, Céline Brochier-Armanet, Manolo Gouy, F. Westall

incollection . 2-35311-022-3 9782353110223 : 94-U259

Chapitre d'ouvrage

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On the last common ancestor and early evolution of eukaryotes: reconstructing the history of mitochondrial ribosomes.

Elie Desmond, Celine Brochier-Armanet, Patrick Forterre, Simonetta Gribaldo

Research in Microbiology . 162 ( 1 ) : 53-70

DOI: 10.1016/j.resmic.2010.10.004

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A eukaryotic-like sulfiredoxin involved in oxidative stress responses and in the reduction of the sulfinic form of 2 Cys-peroxiredoxin in the cyanobacterium Anabaena PCC 7120

C. Boileau, L. Eme, Céline Brochier-Armanet, A. Janicki, C-C. Zhang, A. Latifi

New Phytologist . 191 : 1108-1118

DOI: 10.1111/j.1469-8137.2011.03774.x

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Characterization of heterotrophic prokaryote subgroups in the Sfax coastal solar salterns by combining flow cytometry cell sorting and phylogenetic analysis

Hana Trigui, Salma Masmoudi, Céline Brochier-Armanet, Aude Barani, Gérald Grégori, Michel Denis...

Extremophiles . 15 : 347-358

DOI: 10.1007/s00792-011-0364-5

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Specificity shifts in the rRNA and tRNA nucleotide targets of archaeal and bacterial m5U methyltransferases.

Sylvie Auxilien, Anette Rasmussen, Simon Rose, Céline Brochier-Armanet, Clotilde Husson, Dominique Fourmy...

RNA . 17 ( 1 ) : 45-53

DOI: 10.1261/rna.2323411

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Concepts et méthodes en phylogénie moléculaire

G. Perrière, Céline Brochier-Armanet

Springer . 978-2-287-99047-2

Ouvrage

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Biosynthesis of wyosine derivatives in tRNA: an ancient and highly diverse pathway in Archaea.

Valérie de Crécy-Lagard, Céline Brochier-Armanet, Jaunius Urbonavicius, Bernard Fernandez, Gabriela Phillips, Benjamin Lyons...

Molecular Biology and Evolution . 27 ( 9 ) : 2062-77

DOI: 10.1093/molbev/msq096

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Concepts et méchodes en phylogénie moléculaire

G. Perrière, C. Brochier-Armanet

incollection . -- : 63-65

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The Pseudomonas aeruginosa patatin-like protein PlpD is the archetype of a novel Type V secretion system

R. Salacha, F. Kovacic, Céline Brochier-Armanet, S. Wilhelm, J. Tommassen, A. Filloux...

Environmental Microbiology . 12 ( 6 ) : 1498-512

DOI: 10.1111/j.1462-2920.2010.02174.x

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The origin of eukaryotes and their relationship with the Archaea: are we at a phylogenomic impasse?

Simonetta Gribaldo, Anthony M. Poole, Vincent Daubin, Patrick Forterre, C. Brochier-Armanet

Nature Reviews Microbiology . 8 ( 10 ) : 743-753

DOI: 10.1038/nrmicro2426

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Distinct gene set in two different lineages of ammoniaoxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota

A. Spang, R. Hatzenpichler, Céline Brochier-Armanet, T. Rattei, P. Tischler, E. Spieck...

Trends Microbiol . 18(8) : 331-40

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Nitrosopumilus maritimus genome reveals unique mechanisms for nitrification and autotrophy in globally distributed marine crenarchaea

C.B. Walker, J.R. La Torre, M.G. Klotz, H. Urakawa, N. Pinel, D.J. Arp...

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 107 ( 19 ) : 8818-23

DOI: 10.1073/pnas.0913533107

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Structure, function, and evolution of the Thiomonas spp. genome.

Florence Arsène-Ploetze, Sandrine Koechler, Marie Marchal, Jean-Yves Coppée, Michael Chandler, Violaine Bonnefoy...

PLoS Genetics . 6 ( 2 ) : e1000859

DOI: 10.1371/journal.pgen.1000859

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Phylogeny of prokaryotes: does it exist and why should we care?

Simonetta Gribaldo, Céline Brochier-Armanet

Research in Microbiology . 160 : 513-21

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Happy together: genomic insights into the unique Nanoarchaeum/Ignicoccus association.

Patrick Forterre, Simonetta Gribaldo, Céline Brochier-Armanet

Journal of Biology . 8 ( 1 ) : 7

DOI: 10.1186/jbiol110

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Qri7/OSGEPL the mitochondrial version of the universal Kae1/YgjD protein is essential for mitochondrial genome maintenance

J. Oberto, N. Breuil, A. Hecker, F. Farina, Céline Brochier-Armanet, E. Culetto...

Nucleic Acids Research . 37 : 5343-52

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Comparison of alignment free string distances for complete genome phylogeny

F. Guyon, Céline Brochier-Armanet, A. Guénoche

Advances in Data Analysis and Classification . 3 : 95-108

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Iron-sulfur (Fe/S) protein biogenesis: phylogenomic and genetic studies of A-type carriers

D. Vinella, Céline Brochier-Armanet, L. Loiseau, E. Talla, F. Barras

PLoS Genetics . 5 : 261-268

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Qri7/OSGEPL, the mitochondrial version of the universal Kae1/YgjD protein, is essential for mitochondrial genome maintenance.

Jacques Oberto, Norman Breuil, Arnaud Hecker, Francesca Farina, Céline Brochier-Armanet, Emmanuel Culetto...

Nucleic Acids Research . : epub ahead of print

DOI: 10.1093/nar/gkp557

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Acquisition of a bacterial RumA-type tRNA(uracil-54, C5)-methyltransferase by Archaea through an ancient horizontal gene transfer.

Jaunius Urbonavicius, Sylvie Auxilien, Hélène Walbott, Kalliopi Trachana, Béatrice Golinelli-Pimpaneau, Céline Brochier-Armanet...

Molecular Microbiology . 67 ( 2 ) : 323-35

DOI: 10.1111/j.1365-2958.2007.06047.x

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Acquisition of a bacterial RumA-type tRNA(uracil-54 C5)methyltransferase by Archaea through an ancient horizontal gene transfer

J. Urbonavicius, S. Auxilien, H. Walbott, K. Trachana, B. Golinelli-Pimpaneau, Céline Brochier-Armanet...

Molecular Microbiology . 67 : 323-335

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Giant viruses giant chimeras: The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes

D. Moreira, Céline Brochier-Armanet

BMC Evolutionary Biology . 8 : 1-7

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A DNA topoisomerase IB in Thaumarchaeota testifies for the presence of this enzyme in the last common ancestor of Archaea and Eucarya.

Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre

Biol Direct . 3 : 54

DOI: 10.1186/1745-6150-3-54

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Les Archaea : évolution et diversité du troisième domaine du vivant

Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre, Céline Brochier-Armanet

Bulletin - Société Française de Microbiologie . 23 ( 3 ) : 137-145

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Metagenome Annotation Using a Distributed Grid of Undergraduate Students

P. Hingamp, Céline Brochier-Armanet, E. Talla, D. Gautheret, D. Thieffry, C. Herrmann

PLoS Biology . 6 : 239-241

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Mesophilic crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota.

Céline Brochier-Armanet, Bastien Boussau, Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre

Nature Reviews Microbiology . 6 ( 3 ) : 245-252

DOI: 10.1038/nrmicro1852

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In vitro detection of the enzymatic activity of folate-dependent tRNA(U54 C5)methyltransferase

J. Urbonavicius, Céline Brochier-Armanet, S. Skouloubris, H. Myllykallio, H. Grosjean

Methods in Enzymology . 25 : 103-19

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In vitro detection of the enzymatic activity of folate-dependent tRNA (Uracil-54,-C5)-methyltransferase: evolutionary implications.

Jaunius Urbonavicius, Céline Brochier-Armanet, Stéphane Skouloubris, Hannu Myllykallio, Henri Grosjean

Methods in Enzymology . 425 : 103-19

DOI: 10.1016/S0076-6879(07)25004-9

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Comparative RNomics and modomics in mollicutes: prediction of gene function and evolutionary implications

V. de Crécy-Lagard, C. Marck, Céline Brochier-Armanet, H. Grosjean

IUBMB Life . 59 : 634-58

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