GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive

Marais Gabriel

Directeur de recherche

CNRS

Adresse : 43 bd du 11 novembre 1918
69622 VILLEURBANNE cedex

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Publications

Affichage des publications 31 à 60 sur 87 au total

The Evolution of Sex Chromosomes and Dosage Compensation in Plants

A. Muyle, R. Shearn, Gabriel Marais

Genome Biology and Evolution . 9 : 627-645

DOI: 10.1093/gbe/evw282

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SEX-DETector: a probabilistic approach to study sex chromosomes in non-model organisms

A. Muyle, Jos Käfer, N. Zemp, S. Mousset, Franck Picard, Gabriel Marais

Genome Biology and Evolution . 8 : 2530-2543

DOI: 10.1093/gbe/evw172

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Life Histories, Axes of Variation in

Aline Muyle, Gabriel Marais

The Encyclopedia of Evolutionary Biology . 2 : 480-492

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Evolution of sex-biased gene expression in a dioecious plant

N. Zemp, R. Tavares, A. Muyle, D. Charlesworth, Gabriel Marais, A. Widmer

Nature Plants . 2 : 16168

DOI: 10.1038/nplants.2016.168

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Identifying new sex-linked genes through BAC sequencing in the dioecious plant Silene latifolia

Nicolas Blavet, Hana Blavet, Aline Muyle, Jos Käfer, Radim Cegan, Clothilde Deschamps...

BMC Genomics . 16 : 546

DOI: 10.1186/s12864-015-1698-7

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An angiosperm-wide analysis of the gynodioecy-dioecy pathway.

Mathilde Dufaÿ, P. Champelovier, J Käfer, Jean-Pierre Henry, Sylvain Mousset, Gabriel A.B. Marais

Annals of Botany . 114 : 539-548

DOI: 10.1093/aob/mcu134

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Reductive genome evolution at both ends of bacterial population size spectrum

Bérénice Batut, Carole Knibbe, Gabriel Marais, Vincent Daubin

Nature Reviews Microbiology . 12 ( 12 ) : 841-850

DOI: 10.1038/nrmicro3331

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Dioecy is associated with higher diversification rates in flowering plants

Jos Käfer, Hugo J de Boer, Sylvain Mousset, Anneleen Kool, Mathilde Dufaÿ, Gabriel A.B. Marais

Journal of Evolutionary Biology . 27 : 1478-1490

DOI: 10.1111/jeb.12385

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A Haploid System of Sex Determination in the Brown Alga Ectocarpus sp.

Sophia S. Ahmed, J. Mark Cock, Eugenie Pessia, Remy Luthringer, Alexandre Cormier, Marine Robuchon...

Current Biology - CB . 24 ( 17 ) : 1945-1957

DOI: 10.1016/j.cub.2014.07.042

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Sex uncovered: the evolutionary biology of reproductive systems

T. Schwander, Gabriel Marais, D. Roze

Journal of Evolutionary Biology . 27 : 1287-91

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Patterns of molecular evolution in dioecious and non-dioecious Silene

J. Kafer, M. Talianova, T. Bigot, E. Michu, L. Guéguen, A. Widmer...

Journal of Evolutionary Biology . 26 : 335--46

DOI: 10.1111/jeb.12052

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The evolution of X chromosome inactivation in mammals: the demise of Ohno's hypothesis?

E. Pessia, J. Engelstadter, G. Marais

Cellular and Molecular Life Sciences . 71 : 1383--1394

DOI: 10.1007/s00018-013-1499-6

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Simulating evolutionary scenarios to test whether they can induce reductive evolution

Bérénice Batut, Mathilde Dumond, Gabriel Marais, Guillaume Beslon, Carole Knibbe

SMBE 2012 : Society for Molecular Biology and Evolution .

Poster

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Evidence for Widespread GC-biased Gene Conversion in Eukaryotes

Eugénie Pessia, Alexandra Popa, Sylvain Mousset, Clément Rezvoy, Laurent Duret, G. Marais

Genome Biology and Evolution . 4 : 787-794

DOI: 10.1093/gbe/evs052

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Repeated evolution of testis-specific new genes: the case of telomere-capping genes in Drosophila.

Raphaëlle Dubruille, Gabriel A.B. Marais, Benjamin Loppin

Int J Evol Biol . 2012 : 708980

DOI: 10.1155/2012/708980

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Rapid De Novo Evolution of X Chromosome Dosage Compensation in Silene latifolia a Plant with Young Sex Chromosomes

A. Muyle, N. Zemp, C. Deschamps, Sylvain Mousset, A. Wildmer, Gabriel Marais

PLoS Biology . 10 ( 4 ) : e1001308

DOI: 10.1371/journal.pbio.1001308

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Mammalian X chromosome inactivation evolved as a dosage-compensation mechanism for dosage-sensitive genes on the X chromosome

E. Pessia, T. Makino, M. Bailly-Bechet, A. Mclysaght, Gabriel Marais

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 109 ( 14 ) : 5346-5351

DOI: 10.1073/pnas.1116763109

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Structural, functional and evolutionary analysis of the unusually large stilbene synthase gene family in grapevine (Vitis vinifera)

C. Parage, R. Tavares, S. Réty, R. Baltenweck-Guyot, A. Poutaraud, L. Renault...

Plant Physiology . 160 : 1407-1419

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Multiple Nuclear Gene Phylogenetic Analysis of the Evolution of Dioecy and Sex Chromosomes in the Genus Silene

Gabriel Marais, A. Forrest, E. Kamau, Jos Käfer, Vincent Daubin, D. Charlesworth

PLoS ONE . 6 : e21915

DOI: 10.1371/journal.pone.0021915

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Comparative high-throughput transcriptome sequencing and development of SiESTa, the \textitSilene EST annotation database

N. Blavet, D. Charif, C. Oger-Desfeux, Gabriel Marais, A. Widmer

BMC Genomics . 12 : 1-11

DOI: 10.1186/1471-2164-12-376

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Evolution Moléculaire

L. Duret, T. Bataillon, N. Bierne, Vincent Daubin, J. Dutheil, Christian Gautier...

Biologie évolutive . 978-2-8041-0161-9 : 114-173

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Specialization of a Drosophila Capping Protein Essential for the Protection of Sperm Telomeres

R. Dubruille, G.A. Orsi, L. Delabaere, E. Cortier, P. Couble, Gabriel Marais...

Current Biology - CB . 20 : 1-10

DOI: 10.1016/j.cub.2010.11.013

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Specialization of a Drosophila capping protein essential for the protection of sperm telomeres.

Raphaëlle Dubruille, Guillermo A Orsi, Lætitia Delabaere, Elisabeth Cortier, Pierre Couble, Gabriel A.B. Marais...

Current Biology - CB . 20 ( 23 ) : 2090-9

DOI: 10.1016/j.cub.2010.11.013

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Can Intra-Y Gene Conversion Oppose the Degeneration of the Human Y Chromosome? A Simulation Study

Gabriel Marais, P.R.A. Campos, I. Gordo

Genome Biology and Evolution . 2 : 347-357

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Structure and evolution of Apetala3 a sex-linked gene in Silene latifolia

R. Cegan, Gabriel Marais, H. Kubekova, N. Blavet, A. Widmer, B. Vyskot...

BMC Plant Biology . 10 : 1-10

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Chromosomal Redistribution of Male-Biased Genes in Mammalian Evolution with Two Bursts of Gene Gain on the X Chromosome

Y.E. Zhang, M.D. Vibranovski, P. Landback, Gabriel Marais, M. Long

PLoS Biology . 8 ( 10 ) : 1-13

DOI: 10.1371/journal.pbio.1000494

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Footprints of Inversions at Present and Past Pseudoautosomal Boundaries in Human Sex Chromosomes

Claire Lemaitre, Marília D.V. Braga, Christian Gautier, M.-F. Sagot, Eric Tannier, Gabriel Marais

Genome Biology and Evolution . 1(1) : 56-66

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L’évolution des chromosomes sexuels humains

Gabriel Marais, L. Duret

Biofutur . 304 : 40-41

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