GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Baobab

Peres Sabine

Professeur des universités

UCBL

Adresse : 43 bd du 11 novembre 1918
69622 VILLEURBANNE cedex

Tél : 04 72 44 81 42

Courriel

Systems biology - Biological networks modelling

Metabolic Pathway Analysis

  • Constraint-based modelling
  • Logic programming
  • Thermodynamics

Cancer metabolism

  • Metabolic rerouting
  • Dynamic modelling
  • Metabolic therapies

Publications

Affichage des publications 31 à 44 sur 44 au total

Human-Scale Metabolic Network of Central Carbon Metabolism: application to serine metabolism from glutamine in Cancer Cells

Bertrand Beauvoit, Sophie Colombie, Razanne Issa, Jean-Pierre Mazat, Christine Nazaret, Sabine Pérès

advances in Systems and Synthetic Biology .

Acte de congrès

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Cell cycle progression is regulated by intertwined redox oscillators

Jorgelindo da Veiga Moreira, Sabine Pérès, Jean-Marc Steyaert, Erwan Bigan, Loïc Paulevé, Marcel Levy Nogeira...

Theoretical Biology and Medical Modelling . 12 ( 1 ) : 10

DOI: 10.1186/s12976-015-0005-2

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SAT-Based Metabolics Pathways Analysis without Compilation

Sabine Pérès, Morterol Martin, Laurent Simon

CMSB 2014 .

Acte de congrès

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Systematic study of a metabolic network

Bertrand P Beauvoit, Sophie Colombié, Jean-Pierre Mazat, Christine Nazaret, Sabine Pérès

advances in Systems and Synthetic Biology . 978-2-7598-1201-1 : 173 p.

Acte de congrès

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Elementary Flux Modes Analysis of Functional Domain Networks Allows a Better Metabolic Pathway Interpretation

Sabine Pérès, Liza L. Felicori, Franck Molina

PLoS ONE . 8 ( 10 )

DOI: 10.1371/journal.pone.0076143

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Analysis of metabolic networks using elementary flux modes

Sabine Pérès

Advances in systems and synthetic biology . : 165--170

Acte de congrès

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Analysis of the variability of human normal urine by 2D-GE reveals a "public" and a "private" proteome

Laurence Molina, Nicolas Salvetat, Randa Ben Ameur, Sabine Pérès, Nicolas Sommerer, Faycal Jarraya...

Journal of Proteomics . 75 ( 1 ) : 70 - 80

DOI: 10.1016/j.jprot.2011.06.031

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ACoM: A classification method for elementary flux modes based on motif finding

Sabine Pérès, Francois Vallee, Marie M. Beurton-Aimar, Jean-Pierre Mazat

BioSystems . 103 ( 3 ) : 410-419

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Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury, Marie Francoise M. F. Gautier, Pierre Larmande, Sabine Pérès, Frédéric F. de Lamotte, Franck Molina...

JOBIM2010 .

Acte de congrès

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Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury, Marie Francoise M. F. Gautier, Pierre Larmande, Sabine Pérès, Frédéric F. de Lamotte, Franck Molina...

18. Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) .

Acte de congrès

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Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury, Marie Francoise M. F. Gautier, Pierre Larmande, Sabine Pérès, Frédéric F. de Lamotte, Franck Molina...

Séminaire Génomique Végétale .

Acte de congrès

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Géographie des interfaces. Une nouvelle vision du territoire

C. Lampin-Maillet, Sabine Pérès, J.P. Ferrier, P. Allard

978-2-7592-0857-9 : 168

Ouvrage

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Structure et modélisation des réseaux métaboliques

Jean-Pierre Mazat, Christine Nazaret, Sabine Pérès

Biofutur . ( 275 ) : 29-33

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Mycotoxin fumonisin B-1 selectively down-regulates the basal IL-8 expression in pig intestine: in vivo and in vitro studies

S Bouhet, E Le Dorze, Sabine Pérès, Jm Fairbrother, Isabelle P. Oswald

Food and Chemical Toxicology . 44 ( 10 ) : 1768-1773

Article dans une revue

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