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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses
Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons .
Acte de congrès
voir la publicationCycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases
1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE .
Acte de congrès
voir la publicationAcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis
6. International Symbiosis Society (ISS) Congress .
Acte de congrès
voir la publicationAcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses
8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009) .
Acte de congrès
voir la publicationBenchmarking RNA secondary structure comparison algorithms
Proc. JOBIM . : 67-68
Article dans une revue
voir la publicationEfficient representation and P-value computation for high-order Markov motifs
Bioinformatics . 24 : i160-i166
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voir la publicationDevelopment of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analyses
Integrative Post-Genomics - IPG'08 .
Acte de congrès
voir la publicationLes réseaux métaboliques et génétiques
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationEnumerating precursor sets of target metabolites in a metabolic network
WABI 2008 - 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics . 5251 : 233-244
Acte de congrès
voir la publicationCaractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum
Séminaire INRA AgroBI .
Acte de congrès
voir la publicationEvolution des organismes bactériens
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 12 diapos
Acte de congrès
voir la publicationAnnotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses
4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1" .
Poster
voir la publicationBenchmarking RNA secondary structure comparison algorithms
Actes des Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématiques . : 67-68
Acte de congrès
voir la publicationModes and Cuts in Metabolic Networks:Complexity and Algorithms
BioSystems . 95 - n°1 : 51-60
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voir la publicationA small trip in the untranquil world of genomes a survey on the detection and analysis of genome rearrangement breakpoints
Theoretical Computer Science . 395 : 171-192
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voir la publicationPrecise detection of rearrangement breakpoints in mammalian chromosomes
: 26
Rapport
voir la publicationExploring the Solution Space of Sorting by Reversals, with Experiments and an Application to Evolution
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 5 ( 3 ) : 348-356
DOI: 10.1109/TCBB.2008.16
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voir la publicationTranscriptomique
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationA multiple layer model to compare RNA secondary structures
Software: Practice and Experience . 38 ( 8 ) : 775-792
DOI: 10.1002/spe.846
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voir la publicationIndexing gapped-factors using a tree
International Journal of Foundations of Computer Science . 19 ( 1 ) : 71-87
Article dans une revue
voir la publicationLossless filter for multiple repetitions with Hamming distance
Journal of Discrete Algorithms . 6 ( 3 ) : 497-509
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voir la publicationPrecise detection of rearrangement breakpoints in mammalian chromosomes
BMC Bioinformatics . 9 ( 1 ) : 286
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voir la publicationDevelopment of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses
Integrative Post-Genomics - IPG'08 . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationAn introduction to metabolic networks and their structural analysis.
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 5 ( 4 ) : 594-617
DOI: 10.1109/TCBB.2008.79
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voir la publicationAnnotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses
4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationEvolution des organismes bactériens
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant" . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationCaractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum
Séminaire INRA AgroBI . : 1-1
Acte de congrès
voir la publicationEfficient learning of Bayesian network classifiers:An extension to the TAN classifie
20th Australian Joint Conference on Artificial Intelligence . 4830 : 16-25
Acte de congrès
voir la publicationThe solution space of sorting by reversals
3rd International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA 2007) . 4463 : 293-304
Acte de congrès
voir la publicationEvolution under Reversals: Parsimony and Conservation of Common Intervals
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics . 4 : 301-309
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