Equipe Ecologie Quantitative et Evolutive des Communautés
Thioulouse Jean
Directeur de recherche
CNRS
Batiment Mendel, 1er étage. Bureau 11.048
Page biblio: Vous pouvez visiter ma page biblio ici :https://jthome.thioulouse.fr/ref/
Recherche reproductible: Liste d'articles avec reproductibilité des calculs:
https://jthome.thioulouse.fr/Reproducible_Research/
https://pbil.univ-lyon1.fr/members/thioulouse/RRBibJT/
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=fr&user=1sjOJvSAAAAJO
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7664-05980
IdHAL: https://cv.archives-ouvertes.fr/jean-thioulouse
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Jean-Thioulouse
Livre ade4: Multivariate Analysis of Ecological Data with ade4
https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-8850-1
https://www.amazon.fr/Multivariate-Analysis-Ecological-Data-Ade4/dp/1493988484/
Reproductibilité de l'article Evol. Biol. 2021:
Overcoming the Spurious Groups Problem in Between-Group PCA
Activités de recherche
Mon activité de recherche est centrée sur l’innovation dans le domaine de la méthodologie statistique en biologie. Ces dernières années, je me suis plus particulièrement intéressé aux méthodes d’analyse statistique de la diversité bactérienne et de la diversité des macro−invertébrés aquatiques dans diverses conditions. J’ai cependant poursuivi des développements méthodologiques en informatiques, conduisant à la diffusion de logiciels, ainsi que des activités de consultation et de formation
Le package R ade4 :ade4
Le package R adegraphics :adegraphics
Le package R ade4TkGUI :ade4TkGUI
Publications
Affichage des publications 91 à 120 sur 153 au total
Une nouvelle analyse multi-temporelle d`images satellitales les residus de l`Analyse en Composantes Principales. Un cas d`etude: une serie d`images Landsat Thematic Mapper de la Camargue France.
International Journal of Remote Sensing . 25 : 1925-1938
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voir la publicationRelationship of nematode communities to human demographics and environment in agricultural fields and fallow lands in Senegal.
Journal of Tropical Ecology . 19 : 279-290
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voir la publicationProcustean co-inertia analysis for the linking of multivariate datasets
Ecoscience . 10 : 110-119
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voir la publicationCo-inertia analysis and the linking of ecological tables
Ecology . 84 ( 11 ) : 3078-3089
DOI: 10.1890/03-0178
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voir la publicationComparing and classifying one-dimensional spatial patterns: an application to laser altimeter profiles
Remote Sensing of Environment . 85 ( 4 ) : 453-462
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voir la publicationIntegrated databanks access and sequence/structure analysis services at the PBIL.
Nucleic Acids Research . 31 ( 13 ) : 3393-3399
DOI: 10.1093/nar/gkg530
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voir la publicationRelationship between spatial and genetic distance in Agrobacterium spp. in 1 cubic centimeter of soil.
Applied and Environmental Microbiology . 69 : 1482-1487
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voir la publicationUse of Correspondence Discriminant Analysis to predict the subcellular location of bacterial proteins
Computer Methods and Programs in Biomedicine . 70 : 99-105
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voir la publicationComparing and classifying one-dimensional spatial patterns: an application to laser altimeter profiles.
Remote Sensing of Environment . 85 : 453-462
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voir la publicationRelationships between Staphylococcus aureus genetic background, virulence factors, agr groups (alleles), and human disease
Infection and Immunity . 70 ( 2 ) : 631-641
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voir la publicationRelationships between Staphylococcus aureus genetic background virulence factors agr groups (alleles) and human disease.
Infection and Immunity . 70 : 631-641
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voir la publicationInteractions between ectomycorrhizal symbiosis and fluorescent pseudomonads on Acacia holosericea: isolation of mycorrhiza helper bacteria (MHB) from a Soudano-Sahelian soil
FEMS Microbiology Ecology . 41 : 37-46
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voir la publicationUse and misuse of correspondence analysis in codon usage studies
Nucleic Acids Research . 30 : 4548-4555
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voir la publicationA mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 52 : 573-586
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voir la publicationA mathematical method for determining genome divergence and species delineation using AFLP
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 52 : 573-586
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voir la publicationThe diet of feral cats (Felis catus L.) at five sites on the Grande Terre, Kerguelen archipelago
Polar Biology . 25 : 833-837
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voir la publicationExperimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics
Genetics Selection Evolution . 33 : S319-S338
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voir la publicationCharacterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints: biological and methodological variability.
Applied and Environmental Microbiology . 67 ( 10 ) : 4479-87
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voir la publicationExperimental and theoretical evaluation of typing methods based upon random amplification of genomic restriction fragments (AFLP) for bacterial population genetics
Genetics Selection Evolution . 33 ( 1 ) : 319-338
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voir la publicationCharacterization of bacterial and fungal soil communities by automated ribosomal intergenic spacer analysis fingerprints : biological and methodological variability
Applied and Environmental Microbiology . 67 ( 10 ) : 4479-4487
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voir la publicationThe mycorrhizal soil infectivity and arbuscular mycorrhizal fungal spore communities in soils of different aged fallows in Senegal
Applied Soil Ecology . 17 : 239-251
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voir la publicationMycorrhizal soil infectivity and AM fungal spore communities of different aged fallows in Senegal
Applied Soil Ecology . 17 : 239-251
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voir la publicationSuccessional trends in the characteristics of soil nematodes communities in cropped and fallow lands in Senegal (Sonkorong)
Applied Soil Ecology . 14 : 5-15
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voir la publicationA soil microscale study to reveal the heterogeneity of Hg (II) impact on indigenous bacteria by quantification of adapted phenotypes and analysis of community DNA fingerprints
FEMS Microbiology Ecology . 31 : 107-115
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voir la publicationRecherche de méthodes de gestion des peuplements de nématodes phytoparasites par les facteurs du sol en zone soudano-sahélienne au Sénégal
Étude et Gestion des Sols . 7 ( 4 ) : 261-270
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voir la publicationRelationships between abiotic and biotic soil properties during fallow periods in the sudanian zone of Senegal
Applied Soil Ecology . 14 : 89-101
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voir la publicationIdentification of birds as biological markers along a neotropical urban-rural gradient using co-inertia analysis
Journal of Environmental Management . 59 : 121-140
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voir la publicationHeterogeneous cell density and genetic structure of bacterial pools associated with various microenvironments as determined by enumeration and DNA fingerprinting approach (RISA)
Microbial ecology . 39 : 263-272
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voir la publicationA soil microscale study to reveal the heterogeneity of Hg(II) impact on indigenous bacteria by quantification of adapted phenotypes and analysis of community DNA fingerprints
FEMS Microbiology Ecology . 31 ( 2 ) : 107-115
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voir la publicationEctomycorrhization of six Acacia auriculiformis provenances from Australia Papua New Guinea and Senegal in glasshouse conditions: effect on the plant growth and on the multiplication of plant parasitic nematodes
Australian Journal of Experimental Agriculture . 40 : 443-450
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