Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 43 29 00
Doctorante
CNRS
Ingénieure d'études CDD
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 80 51
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 225 au total
Determination of biomarkers threshold values and illustration of their use for the diagnostic in large-scale freshwater biomonitoring surveys
Environmental Sciences Europe . 34 ( 1 ) : 115
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voir la publicationInterest of a multispecies approach in active biomonitoring: Application in the Meuse watershed
Science of the Total Environment . 808 : 152148
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voir la publicationGeneric Solving of Physiologically-based Kinetic Models in Support of Next Generation Risk Assessment Due to Chemicals
Journal of Exploratory Research in Pharmacology . 8 ( 2 ) : 140-154
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voir la publicationChemical effects on ecological interactions within a model-experiment loop
Peer Community Journal . 3 : e3
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voir la publicationrbioacc: An R-package to analyze toxicokinetic data
Ecotoxicology and Environmental Safety . 242 : 113875
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voir la publicationA meta-analysis of ecotoxicological models used for plant protection product risk assessment before their placing on the market
Science of the Total Environment . 844 : 157003
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voir la publicationAvancées récentes dans le développement du test des comètes chez la moule zébrée (Dreissena polymorpha) et son application en biosurveillance environnementale
Séminaire du GDR Ecotoxicologie Aquatique .
Poster
voir la publicationMesure de l’activité N-acétyl-β-D-Glucosaminidase chez l’amphipode Gammarus fossarum : variabilité physiologique et utilisation en contexte d’écotoxicologie
Colloque annuel de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA) .
Poster
voir la publicationImplementation of Model-Based Dose Adjustment of Tobramycin in Adult Patients with Cystic Fibrosis
Pharmaceutics . 14 ( 8 ) : 1750
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voir la publicationOrgan-specific accumulation of cadmium and zinc in Gammarus fossarum exposed to environmentally relevant metal concentrations
Environmental Pollution . 308 : 119625
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voir la publicationImprovements in Estimating Bioaccumulation Metrics in the Light of Toxicokinetic Models and Bayesian Inference
Archives of Environmental Contamination and Toxicology . 83 ( 4 ) : 339-348
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voir la publicationA review of modelling approaches for ecological risk assessment of pesticides
SETAC Europe 32nd annual meeting .
Poster
voir la publicationImpacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective
: 1408 p.
DOI: 10.17180/0gp2-cd65
Rapport
voir la publicationImpacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Synthèse de l’expertise scientifique collective
: 136 p.
DOI: 10.17180/gfkj-e861
Rapport
voir la publicationNew perspectives on the calculation of bioaccumulation metrics for active substances in living organisms
Integrated Environmental Assessment and Management . 18 : 10-18
Article dans une revue
voir la publicationA critical review of effect modeling for ecological risk assessment of plant protection products
Environmental Science and Pollution Research . 29 : 43448-43500
Article dans une revue
voir la publicationRecent advances in the development of the comet assay on the hemocytes of zebra mussels and its application in field studies for evaluating environmental genotoxicity
International Comet Assay Workshop - 14th annual meeting .
Acte de congrès
voir la publicationPredicting characterization factors of chemical substances from a set of molecular descriptors based on machine learning algorithms
Peer Community In Ecotoxicology and Environmental Chemistry . : 100001
Autre publication
voir la publicationTaking full advantage of modelling to better assess environmental risk due to xenobiotics
Environmental Science and Pollution Research .
Article dans une revue
voir la publicationGeneric Solving of One-compartment Toxicokinetic Models
Journal of Exploratory Research in Pharmacology .
Article dans une revue
voir la publicationKeeping modelling notebooks with TRACE: Good for you and good for environmental research and management support
Environmental Modelling & Software . 136 : 104932
Article dans une revue
voir la publicationOne and multi-compartments toxico-kinetic modeling to understand metals’ organotropism and fate in Gammarus fossarum
Environment International . 156 : 106625
Article dans une revue
voir la publicationThe added value of Bayesian inference for estimating biotransformation rates of organic contaminants in aquatic invertebrates
Aquatic Toxicology . 234 : 105811
Article dans une revue
voir la publicationAccumulation-depuration data collection in support of toxicokinetic modelling
Pré-publication
voir la publicationHow to account for the uncertainty from standard toxicity tests in species sensitivity distributions: An example in non-target plants
PLoS ONE .
Article dans une revue
voir la publicationApplication of General Unified Threshold Models of Survival Models for Regulatory Aquatic Pesticide Risk Assessment Illustrated with an Example for the Insecticide Chlorpyrifos
Integrated Environmental Assessment and Management . 17 ( 1 ) : 243-258
DOI: 10.1002/ieam.4327
Article dans une revue
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 1—Gauging the Confounding Influence of Temperature and Water Hardness
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 667-677
DOI: 10.1002/etc.4655
Article dans une revue
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 2—Evaluating the Relevance of Using a Molt Cycle Temperature‐Dependent Model as a Reference to Assess Toxicity in Freshwater Monitoring
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 678-691
DOI: 10.1002/etc.4656
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voir la publicationModèles de croissance des micro-organismes, in Micro-organismes & biodiversité
Textes et documents pour la classe . 1130 : 60-63
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