Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 43 29 00
Doctorante
CNRS
Ingénieure d'études CDD
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 80 51
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 211 à 225 sur 225 au total
Development of an ecotoxicological model in an arborescent river network: an attempt with a brown trout population
Aspects of Applied Biology - Challenges in applied population biology . 53 : 131-136
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voir la publicationDynamics Of Transposable Elements Under The Selection Model
Genetical Research . 74 : 159-164
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voir la publicationGrowth modelling in accordance with daily water temperature in European grayling (Thymallus thymallus L.)
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences . 56 : 994-1000
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voir la publicationBehavioral choices based on patch selection: a model using aggregation methods
Mathematical Biosciences . 157 : 189-216
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voir la publicationPopulation Dynamics Modelling in an Hierarchical Arborescent River Network: An Attempt with Salmo trutta
Acta Biotheoretica . 46 : 223-234
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voir la publicationA density dependent model describing Salmo trutta population dynamics in an arborescent river network. Effects of dams and channelling
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série III, Sciences de la vie . 321 : 979-990
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voir la publicationReappraisal of the effect of temperature on the growth kinetics of Aeromonas salmonicida
Letters in Applied Microbiology . 25 : 363-366
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voir la publicationThe particular behaviour of Listeria monocytogenes under sub-optimal conditions
International Journal of Food Microbiology . 29 ( 2-3 ) : 201-211
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voir la publicationModélisation à visée prévisionnelle de la cinétique de croissance d`une population de Listeria monocytogenes
incollection . -- : 377-392
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voir la publicationDifferential growth of Listeria monocytogenes at 4 and 8°C: Consequences for the Shelf Life of Chilled Products
Journal of Food Protection . 59 ( 9 ) : 944-949
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voir la publicationThe particular behaviour of Listeria monocytogenes under sub-optimal conditions
International Journal of Food Microbiology . 29 : 201-211
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voir la publicationEpitopic Regions for Antibodies against Tumor Necrosis Factor α
Journal of Biological Chemistry . 270 ( 33 ) : 19509-19515
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voir la publicationConvenient Model To Describe the Combined Effects of Temperature and pH on Microbial Growth
Applied and Environmental Microbiology . 61 ( 2 ) : 610-616
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voir la publicationEpitopic Regions for Antibodies against Tumor Necrosis Factor alpha
Journal of Biological Chemistry . 270 : 19509-19515
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voir la publicationConvenient Model To Describe the Combined Effects of Temperature and pH on Microbial Growth
Applied and Environmental Microbiology . 61 : 610-616
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