Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 33 04 72 43 29 00
Doctorante
CNRS
Ingénieure d'études CDD
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 33 04 72 44 80 51
Stagiaire
UCBL
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 151 à 180 sur 189 au total
Ecotoxicology and population dynamics: on the use of DEBtox models in a Leslie modelling approach
Ecological Modelling . 188 : 30-40
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voir la publicationThe Dynamics of Transposable Elements in Structured Populations
Genetics . 169 : 467-474
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voir la publicationAre well-designed Web sites efficient for learning mathematics at the undergraduate level?
11th EARLI biennal conference . : 472
Acte de congrès
voir la publicationEcotoxicologie aquatique et modélisation des effets biologiques. Rapport final
: 55
Rapport
voir la publicationFood availability effect on population dynamics of the midge Chironomus riparius: a Leslie modeling approach
Ecological Modelling . 175 ( 3 ) : 217-229
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voir la publicationLes modèles matriciels de type Leslie : Une approche couplée Mathématiques et Statistiques
incollection . -- : 377-392
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voir la publicationMathématiques et Informatique du Vivant " : une formation interdisciplinaire qui voit le jour grâce au LMD
21ème congrès de l'AIPU (Association internationale de pédagogie universitaire) . : 1820-1822
Acte de congrès
voir la publicationUn site web pour l`enseignement interdisciplinaire des Mathématiques en Biologie
EIAH (Environnement Informatique d`Apprentissage Humain) . -- : 445-452
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voir la publicationQuelques problèmes statistiques rencontrés dans l`estimation de la température minimale de croissance de Listeria monocytogenes
Revue de Statistique Appliquée . LI : 59-71
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voir la publicationLes étudiants en première année à l`Université des Sciences : innover pour motiver
20ème Congrès AIPU (Association Internationale de Pédagogie Universitaire) . : 157-165
Acte de congrès
voir la publicationEcotoxicology and spatial modeling in population dynamics: an illustration with brown trout
Environmental Toxicology and Chemistry . 22 : 958-969
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voir la publicationDo migratory or demographic disruptions rule the population impact of pollution in spatial networks?
Theoretical Population Biology . 64 : 473-480
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voir la publicationUn site web pour l'enseignement interdisciplinaire des mathématiques en biologie
EIAH 2003 (Environnements Informatiques pour l'Apprentissage Humain) . : 8 pages
Acte de congrès
voir la publicationUn site web pour l'enseignement inter-disciplinaire des Mathématiques en Biologie
Environnements Informatiques pour l'Apprentissage Humain 2003 . http://atief.org ; http://www.inrp.fr : 445-452
Acte de congrès
voir la publicationUsing aggregation methods to assess toxicant effects on population dynamics in spatial systems
Ecological Applications . 12 : 1771-1784
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voir la publicationHost Patch Selection Induced by Parasitism: Basic Reproduction Ratio R0 and Optimal Virulence
Theoretical Population Biology . 62 : 97-109
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voir la publicationA mathematical model describing the thermal virus inactivation
Vaccine . 19 : 3575-3582
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voir la publicationUsing variables aggregation methods to assess toxicant effects on fish populations in river networks
10th annual meeting of SETAC Europe, Brighton, GBR, 21-25 mai 1999 .
Acte de congrès
voir la publicationDiscussion et commentaires - La planification des expériences : choix des traitements et dispositif expérimental
Journal de la Société Française de Statistique . 141 : 59-64
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voir la publicationAnnual spawning migrations in modelling brown trout population dynamics inside an arborescent river network
Ecological Modelling . 133 : 15-31
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voir la publicationEmergence of individual behaviour at the population level. Effects of density-dependent migration on population dynamics
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série III, Sciences de la vie . 323 : 119-127
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voir la publicationAggregation and emergence in ecological modelling: integration of ecological levels
Ecological Modelling . 127 : 11-20
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voir la publicationArtificial intelligence and meaning--some philosophical aspects of decision-making
Acta Biotheoretica . 48 : 173-179
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voir la publicationDevelopment of an ecotoxicological model in an arborescent river network: an attempt with a brown trout population
Challenges in applied population biology AAB meeting Aspects of Applied Biology 53, University London, GBR, 8-9 juillet 1999 . : 131-136
Acte de congrès
voir la publicationDevelopment of an ecotoxicological model in an arborescent river network: an attempt with a brown trout population
Aspects of Applied Biology - Challenges in applied population biology . 53 : 131-136
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voir la publicationDynamics Of Transposable Elements Under The Selection Model
Genetical Research . 74 : 159-164
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voir la publicationGrowth modelling in accordance with daily water temperature in European grayling (Thymallus thymallus L.)
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences . 56 : 994-1000
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voir la publicationBehavioral choices based on patch selection: a model using aggregation methods
Mathematical Biosciences . 157 : 189-216
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voir la publicationPopulation Dynamics Modelling in an Hierarchical Arborescent River Network: An Attempt with Salmo trutta
Acta Biotheoretica . 46 : 223-234
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voir la publicationA density dependent model describing Salmo trutta population dynamics in an arborescent river network. Effects of dams and channelling
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série III, Sciences de la vie . 321 : 979-990
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