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Publications

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Long-term effects of yolk androgens on phenotype and parental feeding behavior in a wild passerine

S. Ruuskanen, Blandine Doligez, L. Gustafsson, T. Laaksonen

Behavioral Ecology and Sociobiology . 66 : 1201--1211

DOI: 10.1007/s00265-012-1373-9

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Simplified detection of food-borne pathogens: An in situ high affinity capture and staining concept

T. Junillon, A. Vimont, D. Mosticone, B. Mallen, F. Baril, C. Rozand...

Journal of Microbiological Methods . 91 : 501--505

DOI: 10.1016/j.mimet.2012.09.015

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Assessing species and community functional responses to environmental gradients: which multivariate methods?

M. Kleyer, Stéphane Dray, F. de Bello, J. Leps, Jr. Pakeman, B. Strauss...

Journal of Vegetation Science . 23 : 805--821

DOI: 10.1111/j.1654-1103.2012.01402.x

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Disentangling plant trait responses to livestock grazing from spatio-temporal variation: the partial RLQ approach

D. Wesuls, J. Oldeland, S. Dray

Journal of Vegetation Science . 23 : 98-113

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Predator-prey spatial game as a tool to understand the effects of protected areas on harvester-wildlife interactions

V. Tolon, J. Martin, Stéphane Dray, A. Loison, C. Fischer, E. Baubet

Ecological Applications . 22 : 648-657

DOI: 10.1890/11-0422.1

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Assessing the effects of spatial contingency and environmental filtering on metacommunity phylogenetics

P-R. Peres-Neto, M-A. Leibold, Stéphane Dray

Ecology . 93 : S14-S30

DOI: 10.1890/11-0494.1

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Improved testing of species traits-environment relationships in the fourth-corner problem

C. Terbraak, A. Cormont, Stéphane Dray

Ecology . 93 : 1525--1526

DOI: 10.1890/12-0126.1

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Mise au point d'un modèle de diagnostic des interactions entre structures paysagères, infrastructures de transports terrestres et espèces emblématiques : le cas du Lynx dans le massif jurassien

J.M. Gaillard, A. Hemery, C. Bonenfant, M. Basille, E. Marboutin, Isabelle Mauz...

: 123

Rapport

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Effects of spatial scale and sample size in GPS-based species distribution models: are the best models trivial for red deer management?

L. E. Loe, Christophe Bonenfant, E. L. Meisingset, A. Mysterud

European Journal of Wildlife Research . 58 : 195--203

DOI: 10.1007/s10344-011-0563-5

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Quantitative estimation of the viability of Toxoplasma gondii oocysts in soil.

Maud Lélu, Isabelle Villena, Marie-Laure Dardé, Dominique Aubert, Régine Geers, Emilie Dupuis...

Applied and Environmental Microbiology . 78 ( 15 ) : 5127-32

DOI: 10.1128/AEM.00246-12

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The Life Cycle of Toxoplasma gondii in the Natural Environment

Emmanuelle Gilot-Fromont, Maud Lélu, Marie-Laure Dardé, Céline Richomme, D. Aubert, Eve Afonso...

Toxoplasmosis - Recent Advances . 978-953-51-0746-0 : 3-36

DOI: 10.5772/48233

Chapitre d'ouvrage

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Modelling the dynamics of host-parasite interactions: basic principles

Pauline Ezanno, Elisabeta Vergu, Michel Langlais, Emmanuelle Gilot-Fromont

New Frontiers of Molecular Epidemiology of Infectious Diseases . 978-94-007-2113-5 : 79-101

DOI: 10.1007/978-94-007-2114-2_5

Chapitre d'ouvrage

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Modelling and simulating generic RNA-Seq experiments with the flux simulator.

Thasso Griebel, Benedikt Zacher, Paolo Ribeca, Emanuele Raineri, Vincent Lacroix, Roderic Guigó...

Nucleic Acids Research . 40 ( 20 ) : 10073-10083

DOI: 10.1093/nar/gks666

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Les défis de la systématique face au monde microbien

Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo

incollection . 328 : 49-52

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Comparative genomic analysis of the DUF71/COG2102 family predicts roles in diphthamide biosynthesis and B12 salvage

V. de Crécy-Lagard, F. Forouhar, Céline Brochier-Armanet, L. Tong, Jf. Hunt

Biology Direct . 7 : 1--13

DOI: 10.1186/1745-6150-7-32

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Preserving Inversion Phylogeny Reconstruction

Matthias Bernt, Kun-Mao Chao, Jyun-Wei Kao, Martin Middendorf, Eric Tannier

WABI 2012 - 12th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics . : 1-13

DOI: 10.1007/978-3-642-33122-0_1

Acte de congrès

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Distinct evolutionary strategies of human leucocyte antigen loci in pathogen-rich environments

A. Sanchez-Mazas, Jean-François Lemaitre, M. Currat

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 367 : 830--9

DOI: 10.1098/rstb.2011.0312

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Genome Sequence of Coxiella burnetii 109, a Doxycycline-Resistant Clinical Isolate

Laetitia Rouli, Jean-Marc Rolain, Adil El Filali, Catherine Robert, Didier Raoult

Journal of Bacteriology . 194 ( 24 ) : 6939-6939

DOI: 10.1128/JB.01856-12

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The alpha-globin genotype does not influence sickle cell disease severity in a retrospective cross-validation study of the pediatric severity score

Pascal Joly, C. Pondarré, C. Bardel, A. Francina, C. Martin

European Journal of Haematology . 88 : 61-67

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Ability of European parasitoids (Hymenoptera) to control a new invasive Asiatic pest, Drosophila suzukii

Stan Chabert, Roland Allemand, Mathilde Poyet, Patrice Eslin, Patricia Gibert

Biological Control . 63 ( 1 ) : 40 - 47

DOI: 10.1016/j.biocontrol.2012.05.005

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Spatial heterogeneity in mortality and its impact on the population dynamics of Eurasian woodcocks

Guillaume Peron, Yves Ferrand, Rémi Choquet, Roger Pradel, François Gossmann, Claudine Bastat...

Population Ecology . 54 ( 2 ) : 305-312

DOI: 10.1007/s10144-012-0309-6

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Modulation of Symbiont Lipid A Signaling by Host Alkaline Phosphatases in the Squid-Vibrio Symbiosis

B. Rader, Natacha Kremer, M. Apicella, W. Goldman, M. Mcfall-Ngai

mBio . 3 ( 3 )

DOI: 10.1128/mBio.00093-12

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Detecting predators and locating competitors while foraging: an experimental study of a medium-sized herbivore in an African savanna

Olivier Pays, Pierrick Blanchard, Marion Valeix, Simon Chamaillé-Jammes, Patrick Duncan, Stéphanie Périquet...

Oecologia . 169 ( 2 ) : 419-430

DOI: 10.1007/s00442-011-2218-3

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Influence of prey dispersion on territory and group size of African lions: a test of the resource dispersion hypothesis

Marion Valeix, Andrew Loveridge, David Macdonald

Ecology . 93 ( 11 ) : 2490-2496

DOI: 10.1890/12-0018.1

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African ungulates and their drinking problems: hunting and predation risks constrain access to water

William-Georges Crosmary, Marion Valeix, Hervé Fritz, Hillary Madzikanda, Steeve Côté

Animal Behaviour . 83 ( 1 ) : 145-153

DOI: 10.1016/j.anbehav.2011.10.019

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Spatial processes driving soil microbial community assembly on a wide scale

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Samuel Dequiedt, Nicolas N. Saby, Jean Thioulouse, Claudy C. Jolivet, Mélanie M. Lelievre...

4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment .

Acte de congrès

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Phylo-MCOA: a fast and efficient method to detect outlier genes and species in phylogenomics using multiple co-inertia analysis

Damien M. de Vienne, Sébastien Ollier, Gabriela Aguileta

Molecular Biology and Evolution . 29 ( 6 ) : 1587--1598

DOI: 10.1093/molbev/msr317

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