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Publications

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Evolution and control of host-microbe symbiosis in arthropods: an RNAseq-based transcriptomic analysis

Yves Moné, F. Chevalier, M.C. Carpentier, N. Kremer, Patrick Mavingui, V. Raquin...

7. International Wolbachia conference . 978-2-911320-44-6

Acte de congrès

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Schwartz Formula: Is One k-Coefficient Adequate for All Children?

V. C. de Souza, Muriel Rabilloud Ferrand, P. Cochat, L. Selistre, A. Hadj-Aissa, Behrouz Kassai Koupai...

PLoS ONE . 7 : e53439

DOI: 10.1371/journal.pone.0053439

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Locally recurrent prostate cancer after initial radiation therapy: early salvage high-intensity focused ultrasound improves oncologic outcomes

S. Crouzet, F. J. Murat, P. Pommier, L. Poissonnier, G. Pasticier, O. Rouviere...

Radiotherapy & Oncology . 105 : 198--202

DOI: 10.1016/j.radonc.2012.09.014

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Fast and robust characterization of time-heterogeneous sequence evolutionary processes using substitution mapping.

Jonathan Romiguier, Emeric Figuet, Nicolas Galtier, Emmanuel J.P. Douzery, Bastien Boussau, Julien y Dutheil...

PLoS ONE . 7 ( 3 ) : e33852

DOI: 10.1371/journal.pone.0033852

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Efficient selection of branch-specific models of sequence evolution.

Julien y Dutheil, Nicolas Galtier, Jonathan Romiguier, Emmanuel J.P. Douzery, Vincent Ranwez, Bastien Boussau

Molecular Biology and Evolution . 29 ( 7 ) : 1861-1874

DOI: 10.1093/molbev/mss059

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A Phylogenomic Approach to Vertebrate Phylogeny Supports a Turtle-Archosaur Affinity and a Possible Paraphyletic Lissamphibia

Jj. Fong, Jm. Brown, Mk. Fujita, Bastien Boussau

PLoS ONE . 7 : e48990

DOI: 10.1371/journal.pone.0048990

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Evidence of diversity and recombination in Arsenophonus symbionts of the Bemisia tabaci species complex

L. Mouton, M. Thierry, H. Henri, R. Baudin, O. Gnankine, Bernard Reynaud...

BMC Microbiology . 12(Suppl 1) : 1-15

DOI: 10.1186/1471-2180-12-S1-S10

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Fitting a lognormal distribution to enumeration and absence/presence data

Natalie N. Commeau, Éric É. Parent, Marie Laure Delignette-Muller, Marie Cornu

International Journal of Food Microbiology . 155 ( 3 ) : 146 - 152

DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2012.01.023

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Modeling of Clostridium perfringens vegetative cell inactivation in beef-in-sauce products: A meta-analysis using mixed linear models

S. Jaloustre, Laurent Guillier, E. Morelli, V. Noël, Marie Laure Delignette-Muller

International Journal of Food Microbiology . 154 : 44-51

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Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations, methods and models. What should we use?

Carole Forfait-Dubuc, Sandrine Charles, Elise Billoir, Marie-Laure Delignette-Muller

Ecotoxicology . 21 : 1072--1083

DOI: 10.1007/s10646-012-0860-0

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Reappraisal of metformin efficacy in the treatment of type 2 diabetes: a meta-analysis of randomised controlled trials.

Rémy Boussageon, Irène Supper, Theodora Bejan-Angoulvant, Nadir Kellou, Michel Cucherat, Jean-Pierre Boissel...

PLoS Medicine . 9 ( 4 ) : e1001204

DOI: 10.1371/journal.pmed.1001204

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Apport de la modélisation et des populations virtuelles pour transposer les résultats des essais cliniques à la vie réelle et éclairer la décision publique

François Gueyffier, C. B. Strang, G. Berdeaux, L. R. França, P. Blin, J. Benichou...

Thérapie . 67 : 359--66

DOI: 10.2515/therapie/2012041

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Contribution of modeling approaches and virtual populations in transposing the results of clinical trials into real life and in enlightening public health decisions

François Gueyffier, Cb. Strang, G. Berdeaux, Lr. Franca, P. Blin, J. Massol

Thérapie . 67 : 367--74

DOI: 10.2515/therapie/2012042

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Virtual Patients and Sensitivity Analysis of the Guyton Model of Blood Pressure Regulation: Towards Individualized Models of Whole-Body Physiology

R. Moss, T. Grosse, I. Marchant, N. Lassau, François Gueyffier, S. R. Thomas

PLoS Computational Biology . 8 : e1002571

DOI: 10.1371/journal.pcbi.1002571

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Efficacy of a home-based intervention programme on the physical activity level and functional ability of older people using domestic services: A randomised study

M. Bonnefoy, F. Boutitie, Catherine Mercier, François Gueyffier, C. Carre, G. Guetemme...

Journal of Nutrition, Health & Aging . 16 : 370--377

DOI: 10.1007/s12603-011-0352-6

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Impact of the early reduction of cyclosporine on renal function in heart transplant patients: a French randomised controlled trial.

Pascale Boissonnat, Ségolène Gaillard, Catherine Mercier, Michel Redonnet, Bernard Lelong, Marie-Françoise Mattei...

Trials . 13 ( 1 ) : 231

DOI: 10.1186/1745-6215-13-231

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Paternity and Dominance Loss in Male Breeders: The Cost of Helpers in a Cooperatively Breeding Mammal

S. Lardy, A. Cohas, E. Desouhant, M. Tafani, Dominique Allainé

PLoS ONE . 7 : 1-6

DOI: 10.1371/journal.pone.0029508

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Search for a gene expression signature of breast cancer local recurrence in young women.

Nicolas Servant, Marc Bollet, Hans Halfwerk, Kevin Bleakley, Bas Kreike, Laurent Jacob...

Clinical Cancer Research . 18 ( 6 ) : 1704-15

DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-11-1954

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tirant, a newly discovered active endogenous retrovirus in Drosophila simulans.

Abdou Akkouche, Rita Rebollo, Nelly Burlet, Caroline Esnault, Sonia Martinez, Barbara Viginier...

Journal of Virology . 86 ( 7 ) : 3675-3681

DOI: 10.1128/JVI.07146-11

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Mod/Resc Parsimony Inference: Theory and application

Igor Nor, Danny Hermelin, Sylvain Charlat, Jan Engelstadter, Max Reuter, Olivier Duron...

Information and Computation . 213 : 23-32

DOI: 10.1016/j.ic.2011.03.008

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Evaluation of fluoroquinolone reduced dosage regimens in elderly patients by using pharmacokinetic modelling and Monte Carlo simulations

B. Leroy, M. Uhart, P. Maire, Laurent Bourguignon

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 67 : 2207--2212

DOI: 10.1093/jac/dks195

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Relationship between benzodiazepines use and falls in the elderly: A multicenter study in three geriatric centers of a university hospital

M. Uhart, E. Odouard, C. Carlier, P. Maire, M. Ducher, Laurent Bourguignon

Annales Pharmaceutiques Françaises . 70 : 46-52

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Alteration of mitochondrial efficiency affects oxidative balance, development and growth in frog (Rana temporaria) tadpoles

Karine Salin, Émilien Luquet, Benjamin Rey, Damien Roussel, Yann Voituron

Journal of Experimental Biology . 215 : 863-869

DOI: 10.1242/jeb.062745

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Selective upregulation of lipid metabolism in skeletal muscle of foraging juvenile king penguins: an integrative study

Loïc Teulier, Cyril Dégletagne, Benjamin Rey, Jérémy Tornos, Céline Keime, Marc de Dinechin...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 279 ( 1737 ) : 2464-2472

DOI: 10.1098/Rspb.2011.2664

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Linkage to the mating-type locus across the genus microbotryum: insights into nonrecombining chromosomes

Elsa Petit, Tatiana Giraud, Damien M. de Vienne, Marco A Coelho, Gabriela Aguileta, Joelle J. Amselem...

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 66 ( 11 ) : 3519-3533

DOI: 10.1111/j.1558-5646.2012.01703.x

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Making use of harvest information to examine alternative management scenarios : a body weight-structured model for wild boar

M. Gamelon, Jean-Michel Gaillard, S. Servanty, O. Gimenez, C. Toigo, E. Baubet...

Journal of Applied Ecology . 49 : 833--841

DOI: 10.1111/j.1365-2664.2012.02160.x

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Statistical evaluation of parameters estimating autocorrelation and individual heterogeneity in longitudinal studies

Sandra Hamel, Nigel Yoccoz, Jean-Michel Gaillard

Methods in Ecology and Evolution . 3 ( 4 ) : 731-742

DOI: 10.1111/j.2041-210X.2012.00195.x

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