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Publications

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Ecomic - RMQs : Cartographie de la diversité microbienne des sols à l'échelle de la France

Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Claudy C. Jolivet, Dominique D. Arrouays, Nicolas N. Saby, Jean J. Thioulouse...

4ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM) . : 1 p.

Acte de congrès

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Diversité des communautés microbiennes telluriques à l'échelle du territoire national

Samuel S. Dequiedt, Mélanie M. Lelievre, Claudy C. Jolivet, Manuel Martin, Nicolas Saby, Dominique Arrouays...

Journées d'Etude des Sols . : 151-152

Acte de congrès

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Rhizosphere microbiota interfers with plant-plant interactions

A. Sanon, Z. N. Andrianjaka, Y. Prin, R. Bally, J. Thioulouse, G. Comte...

Plant and Soil . ( 321 ) : 259-278

DOI: 10.1007/s11104-009-0010-5

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Multivariate analysis of the spatial patterns of 8 trace elements using the French soil monitoring network data

N.P.A. Saby, J. Thioulouse, C. Jolivet, C. Ratié, Line Boulonne, A. Bispo...

Science of the Total Environment . 407 : 5644-5652

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Responses of Pinus halepensis growth soil microbial catabolic functions and phosphate-solubilizing bacteria after rock phosphate amendment and ectomycorrhizal inoculation

L. Ouahmane, J.C. Revel, M. Hafidi, J. Thioulouse, Y. Prin, A. Galiana...

Plant and Soil . 320 (1-2) : 169-179

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Empirical Evidence of Density‐Dependence in Populations of Large Herbivores

Christophe Bonenfant, Jean-Michel Gaillard, Tim Coulson, Marco Festa-Bianchet, Anne Loison, Mathieu Garel...

Advances in Ecological Research . 41 : 313-357

DOI: 10.1016/S0065-2504(09)00405-X

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Memory keeps you at home: a mechanistic model for home range emergence

B. van Moorter, D. Visscher, S. Benhamou, L. Börger, M-S. Boyce, Jean-Michel Gaillard

Oikos . 188 ( 5 ) : 641--652

DOI: 10.1111/j.1600-0706.2008.17003.x

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What determines global positioning system fix success when monitoring free-ranging mouflon?

G. Bourgoin, M. Garel, D. Dubray, D. Maillard, J.-M. Gaillard

European Journal of Wildlife Research . 55 : 603-613

DOI: 10.1007/s10344-009-0284-1

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Adaptive dynamics of dormancy duration variability: evolutionary trade-off and priority effect lead to suboptimal adaptation.

Sébastien Gourbière, Fréderic Menu

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 63 ( 7 ) : 1879-92

DOI: 10.1111/j.1558-5646.2009.00731.x

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Using Dynamic Stochastic Modelling to Estimate Population Risk Factors in Infectious Disease: The Example of FIV in 15 Cat Populations

D. Fouchet, G. Leblanc, F. Sauvage, M. Guiserix, H. Poulet, D. Pontier

PLoS ONE . 4(10) : 1-13

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Emergence of infectious diseases: when hidden pathogens break out

D. Pontier, M. Guiserix, D. Fouchet, F. Sauvage

Comptes Rendus Biologies . 332(6) : 539-547

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Heterochronic shifts explain variations in a sequentially developing repeated pattern: Palatal ridges of muroid rodents

Sophie Pantalacci, Marie Semon, Arnaud Martin, Pascale Chevret, Vincent Laudet

16. Annual Conference of the International Society of-Development-Biologists . 126

DOI: 10.1016/j.mod.2009.06.653

Acte de congrès

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Rodent Biodiversity in Changing Environments

J-C. Auffray, Sabrina Renaud, J. Claude

Kasetsart . 43 : 83-93

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Developmental constraints revealed by co-variation within and among molar rows in two murine rodents.

Sabrina Renaud, Sophie Pantalacci, Jean-Pierre Quéré, Vincent Laudet, Jean-Christophe Auffray

Evolution and Development . 11 ( 5 ) : 590-602

DOI: 10.1111/j.1525-142X.2009.00365.x

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Comment on “Human-Specific Gain of Function in a Developmental Enhancer”

L. Duret, N. Galtier

Science . 323(5915) : 714-715

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Biased Gene Conversion and the Evolution of Mammalian Genomic Landscapes

L. Duret, N. Galtier

Annual Review of Genomics and Human Genetics . 10 : 285-311

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L’évolution des chromosomes sexuels humains

Gabriel Marais, L. Duret

Biofutur . 304 : 40-41

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Current tools for the identification of miRNA genes and their targets

N.D. Mendes, A.T. Freitas, M.-F. Sagot

Nucleic Acids Research . 2009 : 2419-2433

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Lossless filter for multiple repeats with bounded edit distance

Pierre Peterlongo, Gustavo Akio Tominaga Sacomoto, Alair Pereira Do Lago, Nadia Pisanti, Marie-France Sagot

Algorithms for Molecular Biology . 4 ( 1 ) : 3

DOI: 10.1186/1748-7188-4-3

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An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals

Marília D.V. Braga, Christian Gautier, Marie-France Sagot

Algorithms for Molecular Biology . 4 ( 1 ) : 16

DOI: 10.1186/1748-7188-4-16

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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses

Stefano Colella, A. Vellozo, L. Cottret, G. Febvay, Federica Calevro, Yvan Rahbé...

8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009) . : 1-1

Acte de congrès

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Age-specific effect of heterozygosity on survival in alpine marmots, Marmota marmota.

Aurélie Cohas, Christophe Bonenfant, Bart Kempenaers, Dominique Allainé

Molecular Ecology . 18 ( 7 ) : 1491-503

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2009.04116.x

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Heterozygosity-fitness correlations revealed by neutral and cadidate gene markers in roe deer from a long-term study

A. da Silva, J.-M. Gaillard, N.Y. Yoccoz, A.J. Mark Hewison, M. Galan, T. Coulson...

Evolution - International Journal of Organic Evolution . 63(2) : 403-417

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Age-specific effect of heterozygosity on survival in alpine marmots Marmota marmota

A. Cohas, C. Bonenfant, B. Kempenaers, Dominique Allainé

Molecular Ecology . 18 : 1491-1503

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The effects of experimentally manipulated yolk androgens on growth and immune function of male and female nestling collared flycatchers TextitFicedula albicollis

N. Pitala, S. Ruuskanen, T. Laaksonen, Blandine Doligez, B. Tschirren, L. Gustafsson

Journal of Avian Biology . 40(2) : 225-230

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Finding essential scales of spatial variation in ecological data: a multivariate approach

T. Jombart, S. Dray, Anne-Béatrice Dufour

Ecography . 32(1) : 161-168

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On the challenge of treating various types of variables: application for improving the measurement of functional diversity

S. Pavoine, J. Vallet, Anne-Béatrice Dufour, S. Gachet, H. Daniel

Oikos . 118(3) : 391-402

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A pharmacologically based multiscale mathematical model of angiogenesis and its use in investigating the efficacy of a new cancer treatment strategy.

Frédérique Billy, Benjamin Ribba, Olivier Saut, Hélène Morre-Trouilhet, Thierry Colin, Didier Bresch...

Journal of Theoretical Biology . 260 ( 4 ) : 545-62

DOI: 10.1016/j.jtbi.2009.06.026

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The concept of animals trajectories from a data analysis perspective

Clément Calenge, S. Dray, Manuela Royer-Carenzi

Ecological Informatics . 4 ( 1 ) : 34-41

DOI: 10.1016/j.ecoinf.2008.10.002

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Responding to spatial and temporal variations in predation risk: space use of a game species in a changing landsape of fear

Vincent Tolon, Stéphane Dray, Anne Loison, Achim Zeileis, Claude Fischer, Eric Baubet

Canadian Journal of Zoology . 87 : 1129-1137

DOI: 10.1139/Z09-101

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