Veber Philippe
Ingénieur de recherche
CNRS
Ingénieur de recherche CNRS
Publications
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Phyloformer: Fast, accurate and versatile phylogenetic reconstruction with deep neural networks
Pré-publication
voir la publicationHaemolysis overestimates plasma oxidative stress biomarkers in free-ranging roe deer
Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology . 298 : 111750
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voir la publicationEvaluation of Methods to Detect Shifts in Directional Selection at the Genome Scale
Molecular Biology and Evolution . 40 ( 2 )
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voir la publicationNeural Networks beyond explainability: Selective inference for sequence motifs
Transactions on Machine Learning Research Journal .
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voir la publicationTranscriptome-wide deregulation of gene expression by artificial light at night in tadpoles of common toads
Science of the Total Environment . 818 : 151734
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voir la publicationMeta-transcriptomics reveals stress adaptation processes in microbial communities differing in exposure history
"Ecology and Evolution: New perspectives and societal challenges" SFE2-GfÖ-EEF joint meeting, International conference on ecological sciences .
Acte de congrès
voir la publicationBayesian investigation of SARS-CoV-2-related mortality in France
Peer Community Journal . 2 ( e6 )
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voir la publicationCAARS: comparative assembly and annotation of RNA-Seq data
Bioinformatics . 35 ( 13 ) : 2199-2207
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voir la publicationDetecting adaptive convergent amino acid evolution
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 374 ( 1777 ) : 1-11
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voir la publicationMOSAIC : une plate-forme web pour l’analyse statistique des données d’écotoxicologie. Fiche Thématique N°13
: 4 p.
Response to Comment on "Robust Fit of Toxicokinetic-Toxicodynamic Models Using Prior Knowledge Contained in the Design of Survival Toxicity Tests
Environmental Science and Technology . 51 : 8202-8203
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voir la publicationRobust Fit of Toxicokinetic-Toxicodynamic Models Using Prior Knowledge Contained in the Design of Survival Toxicity Tests
Environmental Science and Technology . 51 : 4038-4045
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voir la publicationMaxTiC: Fast Ranking Of A Phylogenetic Tree By Maximum Time Consistency With Lateral Gene Transfers
DOI: 10.1101/127548
Autre publication
voir la publicationQuantitative Molecular Detection of 19 Major Pathogens in the Interdental Biofilm of Periodontally Healthy Young Adults
Frontiers in Microbiology . 7 : 840 - 840
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voir la publicationRAR/RXR binding dynamics distinguish pluripotency from differentiation associated cis-regulatory elements
Nucleic Acids Research . 43 ( 10 ) : 4833--4854
DOI: 10.1093/nar/gkv370
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voir la publicationHost plant specialization matters in the epidemiology of Wolbachia across phytophagous wasps (Hymenoptera: Torymidae)
8. International Wolbachia Conference . : np
Poster
voir la publicationStatistical handling of reproduction data for exposure-response modeling
Environmental Science and Technology . 48 : 7544-51
DOI: 10.1021/es502009r
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voir la publicationEpidemiology of asexuality induced by the endosymbiotic Wolbachia across phytophagous wasp species: host plant specialization matters.
Molecular Ecology Notes . 23 ( 9 ) : 2362-2375
DOI: 10.1111/mec.12737
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voir la publicationBioNLP Shared Task - The Bacteria Track
BMC Bioinformatics . 13 : np
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voir la publicationBioNLP Shared Task 2011 - Bacteria Gene Interactions and Renaming
Proceedings of the BioNLP Shared Task 2011 ACL Workshop . 13 9781937284091 : 65-73
Acte de congrès
voir la publicationRepair and Prediction (under Inconsistency) in Large Biological Networks with Answer Set Programming
Principles of Knowledge Representation and Reasoning .
Acte de congrès
voir la publicationLagrangian approaches for a class of matching problems in computational biology
Computers & Mathematics with Applications . 55 ( Issue 5 (March 2008) ) : 1054-1067
Article dans une revue
voir la publicationInferring the role of transcription factors in regulatory networks
BMC Bioinformatics . 9 : nc
Article dans une revue
voir la publicationDétection de domaines dans des séquences génomiques : un problème de couverture optimale
FRANCORO V/ROADEF 2007 .
Acte de congrès
voir la publicationChecking Consistency Between Expression Data and Large Scale Regulatory Networks: A Case Study
: 14
Rapport
voir la publicationOptimiser un plan d'expérience à partir de modèles qualitatifs?
Biofutur . 275 : 27-31
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voir la publicationPath-equivalent developments in acyclic weighted automata
International Journal of Foundations of Computer Science . 18 ( 4 ) : 799-812
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voir la publicationModélisation grande échelle de réseaux biologiques : vérification par contraintes booléennes de la cohérence des données
Thèse
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