Statistics and Modelling for Health Sciences

Biostatistics Health Group

Subtil Fabien

Maître de conférences - praticien hospitalier

UCBL

Address: 162 avenue Lacassagne
69424 LYON cedex 03

Tel: 33 04 72 11 52 38

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Activité de recherche

Recherche actuelle

Identification de profils de trajectoires typiques dans les études cliniques ou épidémiologiques

Une trajectoire est constituée par les mesures longitudinales d’un biomarqueur chez un individu. L’identification de profils typiques de trajectoire permet de classer les individus, et d’avoir une meilleure connaissance de l’hétérogénéité naturelle entre les patients. Le lien entre les groupes de trajectoire et le pronostique peut ensuite être recherché, ainsi que des facteurs prédisposant à l’appartenance à un groupe donné.
Deux travaux principaux ont été menés dans cette thématique de recherche.

Application à la recherche de facteurs cliniques prédisant la réponse à un traitement antihypertenseur
Recherche des facteurs de réponse au traitement lorsque la réponse est évaluée par des mesures répétées de pression artérielle. Travail réalisé en partenariat avec le Pr Gueyffier de l’équipe EMET.

Adaptation des méthodes à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage
Participation aux tâches 3 (KmlCov) et 5 (KmlVar) de l’ANR IDOL (responsable : C. Genolini, Bordeaux ; financement obtenu en 2012).
Travail fondamental d’adaptation des méthodes usuelles de classification de trajectoires à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage.

 

 

Projets de recherche

Utilisation des trajectoires typiques pour établir le diagnostic précoce de maladies

Utilisation de la méthodologie d’identification de trajectoires typiques pour évaluer la capacité d’un biomarqueur longitudinal à établir un diagnostic précoce. L’application portera sur l’analyse des variations de β-HCG suite à un premier curetage de mole hydatiforme pour le diagnostic d’échec du curetage.

Prise en compte des conséquences cliniques dans le choix des tests diagnostiques

Le choix d’un test diagnostique (ou de son seuil) repose très fréquemment sur l’analyse de sa courbe ROC. Le succès de cet outil en a fait oublier la non prise en compte de la prévalence et des conséquences cliniques des erreurs de classement (maladie non détectée ou traitement à tort). Ces paramètres impactent pourtant grandement le bénéfice espéré en population de la stratégie diagnostique.
Le travail de recherche visera à adapter de façon simple les courbes ROC pour prendre en compte ces deux facteurs. L’objectif est que cet outil aussi populaire en recherche clinique soit désormais, par des modifications simples, utilisé de façon rationnelle en termes de prise de décision médicale.

Etablissement de seuils pour la médecine personnalisée

La médecine personnalisée repose sur des biomarqueurs qui orientent le choix de la stratégie de traitement. Aujourd’hui, les seuils de décision associés à ces biomarqueurs tiennent compte du caractère répondeur ou non du patient au traitement, mais rarement de la qualité de vie. La thématique de recherche portera sur les méthodes de prise en compte de l’état de santé futur d’un patient dans le choix du seuil optimal d’un biomarqueur prédictif, et sur l’intérêt de la prise en compte de ce paramètre.

 

 

Activités d'enseignement

Enseignements au sein du Master Santé Publique

- M2 UE " Modéle linéaire et linéaires généralisé " : TD.
- M2 UE " Inférence Fréquentiste et Bayésienne, Paramétrique et non Paramétrique " : cours et TD sur les méthodes d’estimations en situation de paramètres multiples.
- M2 UE " Modélisation diagnostique et pronostique. Propriétés prédictives des modèles " : cours/TD
- M2 UE " Modèles linéaires et linéaires généralisés à effets mixtes " : cours/TD
- M2 UE " Méthodes statistiques pour les essais cliniques " : cours/TD

 

Enseignements au sein de l’INSA de Lyon


- 4ème année, module " Modèle linéaire généralisé " : cours.
- 5ème année, module " Statistique bayésienne et applications " : cours et TD/TP.

Enseignements au sein de la Faculté de Médecine Lyon Sud Charles Mérieux

- PASS, UE " Evaluation des méthodes d’analyse appliquées aux sciences de la vie et de la santé " : cours et ED.

- PASS, UE " Projet d'études " .
- FGSM 2, UE " Biomédecine quantitative " : cours.

- DFGSM1, UE "Formation générale à la recherche" : cours.

- Conférences d’internat pour la préparation à l’ECN.

Formation LBBE

Formation continue sur l'inférence bayésienne

Publications

Display of 1 to 30 publications on 163 in total

Mental Health Consequences of the COVID‐19 Outbreak Among Emergency Department Healthcare Workers

Marion Douplat, Fabien Subtil, Anne Termoz, Laurent Jacquin, Frédéric Verbois, Veronique Potinet...

BioMed Research International . 2024 ( 1 )

DOI: 10.1155/2024/8871959

Journal article

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Facteurs influençant la date d’arrivée du jeune patient au cabinet d’orthodontie : une étude sur 456 cas

Guillaume Gomez, Fabien Subtil, Sarah Gebeile-Chauty

L' Orthodontie francaise . 95 ( 2 ) : 153-168

DOI: 10.1684/orthodfr.2024.153

Journal article

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Long‐term psycho‐traumatic consequences of the COVID‐19 health crisis among emergency department healthcare workers

Marion Douplat, Marie Curtet, Anne Termoz, Fabien Subtil, Mad Hélénie Elsensohn, Stéphanie Mazza...

Stress and Health . 40 ( 5 ) : e087444

DOI: 10.1002/smi.3478

Journal article

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SPIDOL study protocol for the assessment of intrathecal ziconotide antalgic efficacy for severe refractory neuropathic pain due to spinal cord lesions

Andrei Brinzeu, Julien Berthiller, Nathalie Perreton, Fabien Subtil, Caroline Gervaise, Jacques Luaute...

Trials . 25 ( 1 ) : 595

DOI: 10.1186/s13063-024-08387-0

Journal article

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Endovascular thrombectomy for acute ischaemic stroke with established large infarct (TENSION): 12-month outcomes of a multicentre, open-label, randomised trial

Götz Thomalla, Jens Fiehler, Fabien Subtil, Susanne Bonekamp, Anne Hege Aamodt, Blanca Fuentes...

The Lancet Neurology . 23 ( 9 ) : 883-892

DOI: 10.1016/S1474-4422(24)00278-3

Journal article

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Real-World efficacy and safety of combination nivolumab plus ipilimumab for Untreated, Unresectable, pleural Mesothelioma: The Meso-Immune (GFPC 04–2021) trial

Olivier Bylicki, Florian Guisier, Arnaud Scherpereel, Catherine Daniel, Aurélie Swalduz, Emmanuel Grolleau...

Lung Cancer . 194 : 107866

DOI: 10.1016/j.lungcan.2024.107866

Journal article

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Accurate height and length estimation in hospitalized children not fulfilling WHO criteria for standard measurement: a multicenter prospective study

Carole Ford Chessel, Julien Berthiller, Isabelle Haran, Lyvonne Tume, Christelle Bourgeaud, Michael Tsapis...

European Journal of Pediatrics . 183 ( 10 ) : 4275-4286

DOI: 10.1007/s00431-024-05692-3

Journal article

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Value of green sign and chicken skin aspects for detecting malignancy of colorectal neoplasia in a prospective characterization study

Pierre Lafeuille, Jérôme Rivory, Alexandru Lupu, Florian Rostain, Jeremie Jacques, Thimothee Wallenhorst...

Endoscopy International Open . 12 ( 07 ) : E924-E931

DOI: 10.1055/a-2350-9631

Journal article

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Efficacy of pharmacological interventions for ADHD: protocol for an updated systematic review and dose–response network meta-analysis

Mikail Nourredine, Lucie Jurek, Georgia Salanti, Andrea Cipriani, Fabien Subtil, Orestis Efthimiou...

Systematic Reviews . 13 ( 1 ) : 256

DOI: 10.1186/s13643-024-02675-1

Journal article

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Cost-effectiveness of endovascular thrombectomy for acute ischemic stroke with established large infarct in Germany: a decision tree and Markov model

Sophie Gottschalk, Hans-Helmut König, Fabien Subtil, Susanne Bonekamp, Angelique Denis, Anne Hege Aamodt...

Journal of Neurointerventional Surgery . 193 : jnis-2024-021837

DOI: 10.1136/jnis-2024-021837

Journal article

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Bioreactance assessment of cardiac output lacks reliability for the follow-up of patients with pulmonary hypertension

Ségolène Turquier, Laure Huot, Medhi Lamkhioued, Fabien Subtil, Julie Traclet, Kais Ahmad...

PLoS ONE . 19 ( 5 ) : e0298727

DOI: 10.1371/journal.pone.0298727

Journal article

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Traction-assisted endoscopic submucosal dissection for resection of ileocecal valve neoplasia: a French retrospective multicenter case series

Clara Yzet, Timothée Wallenhorst, Jérémie Jacques, Mariana Figueiredo Ferreira, Jérôme Rivory, Florian Rostain...

Endoscopy .

DOI: 10.1055/a-2316-4910

Journal article

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Systematic Resection of the Visible Scar After Incomplete Endoscopic Resection of Rectal Neuroendocrine Tumors

Loïc Cheminel, Alexandru Lupu, Timothée Wallenhorst, Vincent Lepilliez, Sarah Leblanc, Jérémie Albouys...

The American Journal of Gastroenterology . 119 ( 2 ) : 378-381

DOI: 10.14309/ajg.0000000000002516

Journal article

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Feasibility of a screening and prevention procedure for risks associated with dysphagia in older patients in geriatric units: the DYSPHAGING pilot study protocol

O. Durlach, S. Tripoz-Dit-Masson, N. Massé-Deragon, F. Subtil, Z. Niasse-Sy, C. Herledan...

BMJ Open . 14 ( 4 ) : e081333

DOI: 10.1136/bmjopen-2023-081333

Journal article

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Correlation between antifungal clinical practices and a new clinical decision support system ANTIFON-CLIC® for the treatment of invasive candidiasis: a retrospective multicentre study

A. L. Bienvenu, M. Cour, P. Pavese, C. Guichon, V. Leray, C. Chapuis...

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 79 ( 6 ) : 1407-1412

DOI: 10.1093/jac/dkae118

Journal article

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Safety and Patient-Reported outcomes of atezolizumab plus chemotherapy with or without bevacizumab in stage IIIB/IV non-squamous non-small cell lung cancer with EGFR mutation, ALK rearrangement or ROS1 fusion progressing after targeted therapies (GFPC 06-

Lyria Amari, Pascale Tomasini, Emmanuelle Dantony, Gaëlle Rousseau-Bussac, Charles Ricordel, Laurence Bigay Game...

Lung Cancer . 193 : 107843

DOI: 10.1016/j.lungcan.2024.107843

Journal article

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Comprehensive Ophthalmological Evaluation in Atopic Dermatitis

Anaïs Valeille, Coralie Ouilhon, Fabien Subtil, Florence Hacard, Coline Jaulent, Fréderic Bérard...

Dermatology . : 1-9

DOI: 10.1159/000536233

Journal article

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Risk factors for laryngeal lesions in adult acute respiratory distress syndrome: A STROBE-compliant French case-control study

L. Meguerditchian-Hoffmeyer, P. Philouze, F. Carsuzaa, Fabien Subtil, L. Fath, M. Fieux

European Annals of Otorhinolaryngology, Head and Neck Diseases .

DOI: 10.1016/j.anorl.2024.02.011

Journal article

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Surgery of primary lung carcinoid tumors at metastatic stage: A national study from the French Group of Endocrine Tumors ( GTE ) and ENDOCAN‐RENATEN network

Lucie Duponchelle, Eric Baudin, Fabien Subtil, Christine Do Cao, Eric Dansin, Marine Perrier...

Journal of Neuroendocrinology . 35 ( 10 )

DOI: 10.1111/jne.13331

Journal article

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Clustering of trajectories with mixed effects classification model: Inference taking into account classification uncertainties

Charlotte Dugourd, Amna Abichou-Klich, René Ecochard, Fabien Subtil

Statistics in Medicine . 42 ( 25 ) : 4570-4581

DOI: 10.1002/sim.9876

Journal article

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Mental health in hospitals: A cross-sectional study of the representations of professionals in a French university hospital

Ludivine Nohales, P. Leblanc, L. Rodriguez-Borlado-Salazar, N. Guibert, M. Ottavy, F. Subtil...

Archives des Maladies Professionnelles et de L'Environnement . 84 ( 3 ) : 101703

DOI: 10.1016/j.admp.2022.101703

Journal article

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Atezolizumab with or without bevacizumab and platinum-pemetrexed in patients with stage IIIB/IV non-squamous non-small cell lung cancer with EGFR mutation, ALK rearrangement or ROS1 fusion progressing after targeted therapies: A multicentre phase II open-

Olivier Bylicki, Pascale Tomasini, Gervais Radj, Florian Guisier, Isabelle Monnet, Charles Ricordel...

European Journal of Cancer . 183 : 38-48

DOI: 10.1016/j.ejca.2023.01.014

Journal article

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Endovascular thrombectomy for acute ischaemic stroke with established large infarct: multicentre, open-label, randomised trial

Martin Bendszus, Jens Fiehler, Fabien Subtil, Susanne Bonekamp, Anne Hege Aamodt, Blanca Fuentes...

The Lancet . 402 ( 10414 ) : 1753-1763

DOI: 10.1016/S0140-6736(23)02032-9

Journal article

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GFPC 06-2018 : étude de phase II, multicentrique, ouverte et non randomisée évaluant l’association sel de platine-pémétrexed-atézolizumab (±bévacizumab) pour les patients atteints d’un cancer du poumon non à petites cellules non épidermoïde

Olivier Bylicki, P Tomasini, G Radj, Florian Guisier, I. Monnet, C Ricordel...

27e Congrès de Pneumologie de Langue Française . 15 ( 1 ) : 35-36

DOI: 10.1016/j.rmra.2022.11.524

Conference paper

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ASO Visual Abstract: The Need of Centralization for Small Intestinal Neuroendocrine Tumor Surgery—A Cohort Study from the GTE-Endocan-RENATEN Network, the CentralChirSINET Study

Maroin Kalifi, Sophie Deguelte, Matthieu Faron, Pauline Afchain, Louis de Mestier, Thierry Lecomte...

Annals of Surgical Oncology . 31 ( 2 ) : 1144-1145

DOI: 10.1245/s10434-023-14382-7

Journal article

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Survival and modelled cancer antigen-125 ELIMination rate constant K score in ovarian cancer patients in first-line before poly(ADP-ribose) polymerase inhibitor era: A Gynaecologic Cancer Intergroup meta-analysis

Pauline Corbaux, Benoit You, Rosalind M. Glasspool, Nozomu Yanaihara, Anna V. Tinker, Kristina Lindemann...

European Journal of Cancer . 191

DOI: 10.1016/j.ejca.2023.112966

Journal article

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The Need for Centralization for Small Intestinal Neuroendocrine Tumor Surgery: A Cohort Study from the GTE-Endocan-RENATEN Network, the CentralChirSINET Study

Maroin Kalifi, Sophie Deguelte, Matthieu Faron, Pauline Afchain, Louis de Mestier, Thierry Lecomte...

Annals of Surgical Oncology . 30 ( 13 ) : 8528-8541

DOI: 10.1245/s10434-023-14276-8

Journal article

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Surgery of primary lung carcinoid tumors at metastatic stage: A national study from the French Group of Endocrine Tumors ( GTE ) and ENDOCAN‐RENATEN network

Lucie Duponchelle, Eric Baudin, Fabien Subtil, Christine Do Cao, Eric Dansin, Marine Perrier...

Journal of Neuroendocrinology . 35 ( 10 )

DOI: 10.1111/jne.13331

Journal article

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ANTIFON-CLIC®, a new clinical decision support system for the treatment of invasive aspergillosis: is it clinically relevant?

A.-L. Bienvenu, V. Leray, C. Guichon, S. Bourget, C. Chapuis, A. Duréault...

Annales Pharmaceutiques Françaises .

DOI: 10.1016/j.pharma.2023.11.002

Journal article

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Circulating H3K27 Methylated Nucleosome Plasma Concentration: Synergistic Information with Circulating Tumor DNA Molecular Profiling

Emmanuel Grolleau, Julie Candiracci, Gaelle Lescuyer, David Barthelemy, Nazim Benzerdjeb, Christine Haon...

Biomolecules . 13 ( 8 ) : 1255

DOI: 10.3390/biom13081255

Journal article

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