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Evolution de réseaux génétiques in silico
Abstract
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La nouvelle phylogenies des eucaryotes: les protistes trouvent un foyer
Résumé
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Mise en évidence de facteurs génétiques de risque en utilisant des phylogénies d'haplotypes
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Prominent use of distal 5' transcription start sites and discovery of a large number of additional exons in ENCODE regions
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Pratiques de soins dans le cancer colorectal, approche descriptive et intérêt de différents modèles de survie pour l'étude des pratiques diagnostiques et thérapeutiques
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Two studies of diversity in Arabidopsis lyrata: Diversity in pericentromeric genes Testing for an arms race at an imprinted locus, MEDEA
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Titre à venir
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La nouvelle phylogenies des eucaryotes : les protistes trouvent un foyer
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Associer les mesures d'effets sur les individus et les populationsnpour mieux évaluer la qualité des milieux aquatiques.
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CONTRASTING NEANDERTAL AND MODERN HUMAN GENETIC DIVERSITY: FROM NUCLEOTIDES TO GENOMES
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Statistique pour les microarrays CGH multipatients. Segmentations jointes dans des signaux gaussiens multivariés.
RésuméJe profiterai de ce séminaire pour présenter aux différentes équipes mes travaux de recherche et les projets sur lesquels j'ai l'intention de m'investir à court et moyen terme.Dans un premier temps, j'expliquerai le contexte applicatif de mon travail, à savoir la recherche d'aberrations chromosomiques à l'aide de la technologie des microarrays CGH. C'est une technologie qui a été principalement développée pour ses applications à l'étude des génomes tumoraux, mais sa disponilibité a rendu possible l'investigation des défauts chromosomiques de petite taille sur les populations humaines. Ces études de génétique humaine ont permis la découverte de nouveaux marqueurs génétiques, les CNV pour Copy Number Variants qui concerneraient 12% du génome humain. En plus d'avoir permis d'établir de véritable portraits moléculaires des tumeurs, les microarrays CGH ont donné un éclairage nouveau à toutes les études classique de génétique humaine (association/liaison).D'un point de vue statistique, les modèles sur lesquels je travaille sont des modèles de segmentation, ou de détection de ruptures dans un signal gaussien. La difficulté nouvelle étant de segmenter plusieurs signaux simultanément afin de prendre en compte plusieurs patients. Cette problématique soulève deux questions majeures : une question de modélisation, comment modéliser des segmentations jointes, et une question algorithmique, comment estimer la position des ruptures en une complexité raisonnable.Dans un dernier temps, j'évoquerai l'application croissante de la technologie des tiling arrays aux CGH, et discuterai les problèmes méthodologiques posés par cette nouvelle technologie.
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Origin and evolution of metabolic pathways: general mechanisms and case studies
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Theoretical studies on the interplay between Y-chromosome degeneration and the evolution of dosage compensation
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Titre à venir
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MHC dissimilarity drives female choice in tree shrews (Tupaia belangeri).
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Titre à venir
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Génomique de populations humaines: selection naturelle, modes de vie et pathogènes.
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Modélisation de la non observance à un traitement oral. Application aux anti-cancéreux.
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A game-theoretical approach to studying the evolution of metabolism.
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Metabolic Pathway Analysis - Theory and Applications.
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