Publications
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How Long Does Wolbachia Remain on Board?
Molecular Biology and Evolution . 34 ( 5 ) : 1183 - 1193
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voir la publicationMetabolic Investigation of the Mycoplasmas from the Swine Respiratory Tract
JOBIM 2016 .
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voir la publicationA Combinatorial Algorithm for Microbial Consortia Synthetic Design
Scientific Reports .
DOI: 10.1038/srep29182
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voir la publicationEnumeration of minimal stoichiometric precursor sets in metabolic networks
Algorithms for Molecular Biology . 11 ( 1 ) : 25
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voir la publicationRobustness of the Parsimonious Reconciliation Method in Cophylogeny
Lecture Notes in Computer Science . 9702 : 12
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voir la publicationComputing and Listing st-Paths in Subway Networks
CSR 2016 - 11th International Computer Science Symposium in Russia . 9691 : 102-116
Acte de congrès
voir la publicationIntroduction to the Special Theme - Tackling Big Data in the Life Sciences
Autre publication
voir la publicationInsights on the virulence of swine respiratory tract mycoplasmas through genome-scale metabolic modeling
BMC Genomics . 17 ( 1 ) : 353
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voir la publicationSNP calling from RNA-seq data without a reference genome: identification, quantification, differential analysis and impact on the protein sequence
Nucleic Acids Research .
DOI: 10.1093/nar/gkw655
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voir la publicationDegreeCox – a network-based regularization method for survival analysis
BMC Bioinformatics . 17 ( Suppl 16 ) : 109-121
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voir la publicationMultiPus: Conception de communautés microbiennes pour la production de composés d'intérêt
Jobim .
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voir la publicationOn Maximal Chain Subgraphs and Covers of Bipartite Graphs
Combinatorial Algorithms - 27th International Workshop, IWOCA 2016 . 9843 : 137-150
Acte de congrès
voir la publicationMycoplasma non-coding RNA: identification of small RNAs and targets
BMC Genomics . 23 : 1289 - 26
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voir la publicationGenome reduction and potential metabolic complementation of the dual endosymbionts in the whitefly Bemisia tabaci
BMC Genomics . 16 : 226
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voir la publicationTwo Host Clades, Two Bacterial Arsenals: Evolution through Gene Losses in Facultative Endosymbionts.
Genome Biology and Evolution . 7 ( 3 ) : 839-855
DOI: 10.1093/gbe/evv030
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voir la publicationMeDuSa: A multi-draft based scaffolder.
Bioinformatics . : pii: btv171 [Epub ahead of print]
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voir la publicationA polynomial delay algorithm for the enumeration of bubbles with length constraints in directed graphs
Algorithms for Molecular Biology . : 10
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voir la publicationMitochondrial respiration and genomic analysis provide insight into the influence of the symbiotic bacterium on host trypanosomatid oxygen consumption.
Parasitology . 142 ( 2 ) : 352-362
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voir la publicationIncremental complexity of a bi-objective hypergraph transversal problem
Fundamentals of Computation Theory (FCT2015) . 9210 : 202-213
Acte de congrès
voir la publicationEUCALYPT: efficient tree reconciliation enumerator
Algorithms for Molecular Biology . 10 ( 1 ) : 11
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voir la publicationMirinho: An efficient and general plant and animal pre-miRNA predictor for genomic and deep sequencing data
BMC Bioinformatics . 16 ( 1 ) : 179
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voir la publicationCophylogeny Reconstruction via an Approximate Bayesian Computation
Systematic Biology . 64 ( 3 ) : 416-431
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voir la publicationAnnotating arthropods genome to study and compare their metabolism: the ArthropodaCyc collection of Cyc databases powered by CycADS
13. European Conference on Computational Biology (ECCB) . : 1 p.
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voir la publicationAmortized Õ(\textbarV)-Delay Algorithm for Listing Chordless Cycles in Undirected Graphs
Lecture Notes in Computer Science . 8737 : 418-429
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voir la publicationEfficiently listing bounded length st-paths
Twenty-Fifth International Workshop on Combinatorial Algorithms (IWOCA 2014) . : in press
Acte de congrès
voir la publicationNavigating in a Sea of Repeats in RNA-seq without Drowning
WABI 2014 - 14th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics . 8701 : 82-96
Acte de congrès
voir la publicationRime: Repeat identification
Discrete Applied Mathematics . 163 ( 3 ) : 275–286
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voir la publicationTelling metabolic stories to explore metabolomics data: a case study on the yeast response to cadmium exposure
Bioinformatics . 30 ( 1 ) : 61-70
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voir la publicationAmortized Õ(|V|) -Delay Algorithm for Listing Chordless Cycles in Undirected Graphs
22th Annual European Symposium on Algorithms . 8737 : 418-429
Acte de congrès
voir la publicationA polynomial delay algorithm for the enumeration of bubbles with length constraints in directed graphs and its application to the detection of alternative splicing in RNA-seq data
Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI) .
Acte de congrès
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