Statistiques et Modélisation pour les Sciences de la Santé
Subtil Fabien
Maître de conférences - praticien hospitalier
UCBL
Tél : 33 04 72 11 52 38
Activité de recherche
Recherche actuelle
Identification de profils de trajectoires typiques dans les études cliniques ou épidémiologiques
Une trajectoire est constituée par les mesures longitudinales d’un biomarqueur chez un individu. L’identification de profils typiques de trajectoire permet de classer les individus, et d’avoir une meilleure connaissance de l’hétérogénéité naturelle entre les patients. Le lien entre les groupes de trajectoire et le pronostique peut ensuite être recherché, ainsi que des facteurs prédisposant à l’appartenance à un groupe donné.
Deux travaux principaux ont été menés dans cette thématique de recherche.
Application à la recherche de facteurs cliniques prédisant la réponse à un traitement antihypertenseur
Recherche des facteurs de réponse au traitement lorsque la réponse est évaluée par des mesures répétées de pression artérielle. Travail réalisé en partenariat avec le Pr Gueyffier de l’équipe EMET.
Adaptation des méthodes à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage
Participation aux tâches 3 (KmlCov) et 5 (KmlVar) de l’ANR IDOL (responsable : C. Genolini, Bordeaux ; financement obtenu en 2012).
Travail fondamental d’adaptation des méthodes usuelles de classification de trajectoires à des biomarqueurs binaires ou résultant d’un comptage.
Projets de recherche
Utilisation des trajectoires typiques pour établir le diagnostic précoce de maladies
Utilisation de la méthodologie d’identification de trajectoires typiques pour évaluer la capacité d’un biomarqueur longitudinal à établir un diagnostic précoce. L’application portera sur l’analyse des variations de β-HCG suite à un premier curetage de mole hydatiforme pour le diagnostic d’échec du curetage.
Prise en compte des conséquences cliniques dans le choix des tests diagnostiques
Le choix d’un test diagnostique (ou de son seuil) repose très fréquemment sur l’analyse de sa courbe ROC. Le succès de cet outil en a fait oublier la non prise en compte de la prévalence et des conséquences cliniques des erreurs de classement (maladie non détectée ou traitement à tort). Ces paramètres impactent pourtant grandement le bénéfice espéré en population de la stratégie diagnostique.
Le travail de recherche visera à adapter de façon simple les courbes ROC pour prendre en compte ces deux facteurs. L’objectif est que cet outil aussi populaire en recherche clinique soit désormais, par des modifications simples, utilisé de façon rationnelle en termes de prise de décision médicale.
Etablissement de seuils pour la médecine personnalisée
La médecine personnalisée repose sur des biomarqueurs qui orientent le choix de la stratégie de traitement. Aujourd’hui, les seuils de décision associés à ces biomarqueurs tiennent compte du caractère répondeur ou non du patient au traitement, mais rarement de la qualité de vie. La thématique de recherche portera sur les méthodes de prise en compte de l’état de santé futur d’un patient dans le choix du seuil optimal d’un biomarqueur prédictif, et sur l’intérêt de la prise en compte de ce paramètre.
Activités d'enseignement
Enseignements au sein du Master Santé Publique
M2 UE " Modéle linéaire et linéaires généralisé " : TD. M2 UE " Inférence Fréquentiste et Bayésienne, Paramétrique et non Paramétrique " : cours et TD sur les méthodes d’estimations en situation de paramètres multiples. M2 UE " Modélisation diagnostique et pronostique. Propriétés prédictives des modèles " : cours/TD M2 UE " Modèles linéaires et linéaires généralisés à effets mixtes " : cours/TD M2 UE " Méthodes statistiques pour les essais cliniques " : cours/TD
Enseignements au sein de l’INSA de Lyon
4ème année, module " Modèle linéaire généralisé " : cours. 5ème année, module " Statistique bayésienne et applications " : cours et TD/TP.
Enseignements au sein de la Faculté de Médecine Lyon Sud Charles Mérieux
PASS, UE " Evaluation des méthodes d’analyse appliquées aux sciences de la vie et de la santé " : cours et ED.
PASS, UE " Projet d'études " . FGSM 2, UE " Biomédecine quantitative " : cours.
DFGSM1, UE "Formation générale à la recherche" : cours.
Conférences d’internat pour la préparation à l’ECN.
Formation LBBE
Formation continue sur l'inférence bayésienne
Publications
Affichage des publications 31 à 60 sur 163 au total
Circulating H3K27 Methylated Nucleosome Plasma Concentration: Synergistic Information with Circulating Tumor DNA Molecular Profiling
Biomolecules . 13 ( 8 ) : 1255
DOI: 10.3390/biom13081255
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voir la publicationCross-cultural adaptation of the CRS-PRO questionnaire into French
Journal of Otolaryngology - Head and Neck Surgery . 52 ( 1 ) : 77
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voir la publicationKinetics of functional recovery after foot and ankle surgery. Comparison of EFAS and SF36 scores
Orthopaedics & Traumatology: Surgery & Research . : 103637
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voir la publicationCoordinated prospective follow-up of Lynch syndrome is able to detect the majority of incident cancers
Digestive and Liver Disease .
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voir la publicationReal‐life challenges using personalized prognostic scoring systems in acute myeloid leukemia
Cancer Medicine . 12 ( 5 ) : 5656-5660
DOI: 10.1002/cam4.5408
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voir la publicationDistinct Immune Reconstitution Profiles Captured by Immune Functional Assays at 6 Months Post Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation
Transplantation and Cellular Therapy . 29 ( 2 ) : 94.e1-94.e13
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voir la publicationDiagnostic endoscopic submucosal dissection for colorectal lesions with suspected deep invasion
Endoscopy . 55 ( 02 ) : 192-197
DOI: 10.1055/a-1866-8080
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voir la publicationPeripheral but not axial muscle mass is associated with early mortality in bone metastatic lung cancer patients at diagnosis
Joint Bone Spine . : 105613
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voir la publicationPerformance of 11 Host Biomarkers Alone or in Combination in the Diagnosis of Late-Onset Sepsis in Hospitalized Neonates: The Prospective EMERAUDE Study
Biomedicines . 11 ( 6 ) : 1703
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voir la publicationInvestigating the Long-term Effect of Pregnancy on the Course of Multiple Sclerosis Using Causal Inference
Neurology . 100 ( 12 ) : e1296-e1308
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voir la publicationPrognosis of Old Intensive Care COVID-19 Patients at a Glance: The Senior COVID Study
Turkish Journal of Anaesthesiology and Reanimation . 50 ( Supp1 ) : S57-S61
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voir la publicationDiagnostic endoscopic submucosal dissection for colorectal lesions with suspected deep invasion
Endoscopy . 55 ( 02 ) : 192-197
DOI: 10.1055/a-1866-8080
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voir la publicationSenior-COVID-Rea Cohort Study: A Geriatric Prediction Model of 30-day Mortality in Patients Aged over 60 Years in ICU for Severe COVID-19
Aging and disease . 13 ( 2 ) : 614
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voir la publicationPerformance of 11 host biomarkers alone or in combination in the diagnosis of late-onset sepsis in hospitalized neonates: the prospective EMERAUDE study
Research Square - Preprint .
Article dans une revue
voir la publicationPerformance Evaluation of Host Biomarker Combinations for the Diagnosis of Serious Bacterial Infection in Young Febrile Children: A Double-Blind, Multicentre, Observational Study
Journal of Clinical Medicine . 11 ( 21 ) : 6563
DOI: 10.3390/jcm11216563
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voir la publicationEndoscopic characterization of colorectal neoplasia with different published classifications: comparative study involving CONECCT classification
Endoscopy International Open . 10 ( 01 ) : E145 - E153
DOI: 10.1055/a-1613-5328
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voir la publicationSMAD2/3 mediate oncogenic effects of TGF-β in the absence of SMAD4
Communications Biology . 5 ( 1 ) : 1068
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voir la publicationEffects of opioid-free anesthesia on postoperative morphine consumption after bariatric surgery
Journal of Clinical Anesthesia . 81 : 110906
Article dans une revue
voir la publicationSporadic nonfunctional pancreatic neuroendocrine tumors: Risk of lymph node metastases and aggressiveness according to tumor size: A multicenter international study
Surgery . 172 ( 3 ) : 975-981
Article dans une revue
voir la publicationWhat is the effectiveness and safety of mirtazapine versus escitalopram in alleviating cancer-associated poly-symptomatology (the MIR-P study)? A mixed-method randomized controlled trial protocol
BMC Palliative Care . 21 ( 1 ) : 84
Article dans une revue
voir la publicationEndoscopic submucosal dissection combined with clip for closure of gastrointestinal fistulas including those refractory to previous therapy
Endoscopy . 54 ( 07 ) : 700-705
DOI: 10.1055/a-1641-7938
Article dans une revue
voir la publicationDécollement des attaches orthodontiques : évaluation du facteur temps et du type de dent
L' Orthodontie francaise . 93 ( 4 ) : 401-418
Article dans une revue
voir la publicationRCP dédiée à l’onco-gériatrie : décisions et suivi à quatre mois
Bulletin du Cancer . 109 ( 6 ) : 659-669
Article dans une revue
voir la publicationManagement and Outcome of COVID-19 Positive and Negative Patients in French Emergency Departments During the First COVID-19 Outbreak: A Prospective Controlled Cohort Study
Western Journal of Emergency Medicine . 23 ( 6 ) : 897-906
Article dans une revue
voir la publicationImpact of smoking cessation on healing after foot and ankle surgery
Orthopaedics & Traumatology: Surgery & Research . 108 ( 7 ) : 103338
Article dans une revue
voir la publicationChanges over time in anxiety, depression, and stress symptoms among healthcare workers in French emergency departments during the first COVID-19 outbreak
Journal of Affective Disorders . 316 : 194-200
Article dans une revue
voir la publicationGeneral practice and associated health conditions in patients aged 65 years or over.
Gériatrie et psychologie & neuropsychiatrie du vieillissement .
Article dans une revue
voir la publicationFluconazole in hypercalciuric patients with increased 1,25(OH)(2)D levels: the prospective, randomized, placebo-controlled, double-blind FLUCOLITH trial
Trials . 23 ( 1 ) : 499
Article dans une revue
voir la publication[Adherence to recommendations after comprehensive geriatric assessment by mobile geriatric team during 500 home visits]
Gériatrie et psychologie & neuropsychiatrie du vieillissement . 20 ( 2 ) : 208-216
Article dans une revue
voir la publicationPrognosis of Old Intensive Care COVID-19 Patients at a Glance: The Senior COVID Study
Turkish Journal of Anaesthesiology and Reanimation . 50 ( Supp1 ) : S57-s61
Article dans une revue
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