Equipe Modélisation et Ecotoxicologie Prédictives
Membres
Professeur des universités
UCBL
Tél : 330472432900
Doctorante
UCBL
Maître de conférences
UCBL
Tél : 330472448051
Professeur d'université émérite
UCBL
Tél : 0472448142
Post-doc
UCBL
Les activités de recherches de l’équipe MEPS visent à proposer des approches intégrées de modélisation mathématique et statistique pour prédire les effets de perturbations environnementales à différents niveaux d’organisation biologique, ainsi que leurs conséquences (fonctionnelles et évolutives), que ce soit sur la fitness individuelle, la dynamique des populations, des communautés et/ou des écosystèmes. Afin d’obtenir des modèles génériques à fort pouvoir prédictif, l’équipe s’attache en particulier à la compréhension du fonctionnement et pas seulement à la description extensive des systèmes complexes considérés. Ainsi, les modèles développés respectent le principe de parcimonie, pour veiller à rester suffisamment simples et donc limiter les effets « boîte noire ». Une attention particulière est donnée à la robustesse, et donc le caractère généralisable, des connaissances produites, dans l’objectif d’une meilleure acceptabilité de la modélisation pour aider à la prise de décision en évaluation du risque environnemental.
Cette réduction de la complexité des systèmes pour produire des modèles pertinents ne doit pas en occulter les éléments essentiels de fonctionnement, afin qu’ils restent des outils de compréhension des mécanismes sous-jacents aux processus de perturbation et aux effets observés sur les tissus, les organismes, les populations, les communautés et les écosystèmes. Ces modèles, mécanistes, doivent en outre intégrer la dimension temporelle, incontournable dès lors que l’on parle de processus dynamiques. En parallèle, il faut prendre en compte des critères complémentaires d’effet à court et à long terme pour répondre tout autant à des problématiques de remédiation et de restauration de milieux, que de prédiction dynamique et intégrative des effets sur plusieurs générations.
Dans ce contexte, les problématiques actuelles de l’équipe MEPS concernent :
- Le développement de modèles mécanistes à base physiologique, de type et toxico-cinétique / toxico-dynamique (TKTD), pour proposer des outils de prédiction et de diagnostic de la qualité des milieux ;
- La plasticité des réponses individuelles à un (ou une combinaison de) facteur(s) de stress (par ex., contamination et/ou réchauffement climatique) et des effets des phénomènes d’adaptation sur la dynamique à long terme des populations ;
- La prédiction de la distribution de sensibilité d’une communauté d’espèces à des contaminants en intégrant la variabilité inter-espèces sur divers paramètres biologiques d’intérêt et pas uniquement sur une concentration critique ;
- Le développement de la plateforme MOSAIC (MOdeling and StAtistical tools for ecotoxICology, http://mosaic.univ-lyon1.fr) qui propose une collection d’outils d’analyse et de modélisation de données en écotoxicologie.
Publications
Affichage des publications 1 à 30 sur 98 au total
Keeping modelling notebooks with TRACE: Good for you and good for environmental research and management support
Environmental Modelling & Software . 136 : 104932
Articles
voir la publicationThe added value of Bayesian inference for estimating biotransformation rates of organic contaminants in aquatic invertebrates
Aquatic Toxicology . 234 : 105811
Articles
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 2—Evaluating the Relevance of Using a Molt Cycle Temperature‐Dependent Model as a Reference to Assess Toxicity in Freshwater Monitoring
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 678-691
DOI: 10.1002/etc.4656
Articles
voir la publicationImpact of solvents on the in vitro genotoxicity of TMPTA in human HepG2 cells
Toxicology in Vitro . 69 : 105003
Articles
voir la publicationIn Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 1—Gauging the Confounding Influence of Temperature and Water Hardness
Environmental Toxicology and Chemistry . 39 ( 3 ) : 667-677
DOI: 10.1002/etc.4655
Articles
voir la publicationA Bayesian framework for estimating parameters of a generic toxicokinetic model for the bioaccumulation of organic chemicals by benthic invertebrates: Proof of concept with PCB153 and two freshwater species
Ecotoxicology and Environmental Safety . 180 : 33-42
Articles
voir la publicationRecommendations to address uncertainties in environmental risk assessment using toxicokinetic-toxicodynamic models
Scientific Reports . 9 ( 1 )
Articles
voir la publicationtRophicPosition , an r package for the Bayesian estimation of trophic position from consumer stable isotope ratios
Methods in Ecology and Evolution . 9 ( 6 ) : 1592-1599
Articles
voir la publicationMOSAIC: a web-interface for statistical analyses in ecotoxicology
Environmental Science and Pollution Research . 25 ( 12 ) : 11295-11302
Articles
voir la publicationAssessment of the in vitro genotoxicity of TiO 2 nanoparticles in a regulatory context
Nanotoxicology . : 1 - 18
Articles
voir la publicationCombined effect of temperature and ammonia on molecular response and survival of the freshwater crustacean Gammarus pulex
Ecotoxicology and Environmental Safety . 137 : 42-48
Articles
voir la publicationLes PCB dans le Rhône
PCB, environnement et santé . 978-2-7430-2005-7
Chapitres de livres
voir la publicationModelling survival: exposure pattern, species sensitivity and uncertainty
Scientific Reports . 6 : 29178
DOI: 10.1038/srep29178
Articles
voir la publicationMechanistic modelling of daphnid-algae dynamics within a laboratory microcosm
Ecological Modelling . 320 : 213–230
Articles
voir la publicationOptimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis
Regulatory Toxicology and Pharmacology . 81 : 47-56
Articles
voir la publicationModelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm
Ecotoxicology and Environmental Safety . 128 : 252-65
Articles
voir la publicationMOSAIC_SSD: A new web tool for species sensitivity distribution to include censored data by maximum likelihood
Ecotoxicology and Environmental Safety . 33 ( 9 ) : 2133 - 2139
DOI: 10.1002/etc.2644
Articles
voir la publicationHierarchical modelling of species sensitivity distribution: development and application to the case of diatoms exposed to several herbicides
Ecotoxicology and Environmental Safety . 114 : 212-221
Articles
voir la publicationEarly problematic eating behaviours are associated with lower fruit and vegetable intake and less dietary variety at 4–5 years of age. A prospective analysis of three European birth cohorts
British Journal of Nutrition . 114 ( 5 ) : 763-771
Articles
voir la publicationCadmium sulfide quantum dots induce oxidative stress and behavioral impairments in the marine clam Scrobicularia plana
Environmental Toxicology and Chemistry . 34 : 1659-64
Articles
voir la publicationA Toolbox for Nonlinear Regression in R: The Package nistools
Journal of Statistical Software . 66 : 1-21
Articles
voir la publicationConstructing Time-Resolved Species Sensitivity Distributions Using a Hierarchical Toxico-Dynamic Model
Environmental Science and Technology . 49 ( 20 ) : 12465-12473
Articles
voir la publicationBiochemical and behavioural responses of the marine polychaete Hediste diversicolor to cadmium sulfide quantum dots (CdS QDs): waterborne and dietary exposure
Chemosphere . 100 : 63-70
Articles
voir la publicationStatistical handling of reproduction data for exposure-response modeling
Environmental Science and Technology . 48 : 7544-51
DOI: 10.1021/es502009r
Articles
voir la publicationApproche méthodologique pour faire évoluer la pédagogie en TD vers un apprentissage actif soutenu par des TICE
Colloque annuel AIPU (Association Internationale de Pédagogie Universitaire) . : 157-165
Actes de congrès
voir la publicationDevelopment and validation of an OECD reproductive toxicity test guideline with the pond snail Lymnaea stagnalis (Mollusca, Gastropoda)
Regulatory Toxicology and Pharmacology . 70 ( 3 ) : 605-614
Articles
voir la publicationEcological Modeling for the Extrapolation of Ecotoxicological Effects Measured during in Situ Assays in Gammarus
Environmental Science and Technology . 48 ( 11 ) : 6428-6436
DOI: 10.1021/es501126g
Articles
voir la publicationCaged Gammarus fossarum (crustacea) as a robust tool for the characterization of bioavailable contamination levels in continental waters. Toward the determination of threshold values
Water Research . 47 ( 2 ) : p. 650 - p. 660
Articles
voir la publicationThe molecular signal for the adaptation to cold temperature during early life on Earth
Biology Letters . 9 ( 5 ) : 20130608
Articles
voir la publicationLife-history phenology strongly influences population vulnerability to toxicants: a case study with the mudsnail Potamopyrgus antipodarum.
Environmental Toxicology and Chemistry . 32 ( 8 ) : 1727-36
DOI: 10.1002/etc.2235
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