GECO Génomique Computationnelle et Evolutive

Equipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Évolutive

Equipe Baobab

Publications

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Molecular phylogeny of the symbiotic actinomycetes of the genus Frankia matches host-plant infection processes.

Benoit Cournoyer, Manolo Gouy, Philippe Normand

Molecular Biology and Evolution .

DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040077

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[Comparative study of two systems for the determination of the sensitivity of yeasts to antifungal agents].

M de Montclos, H. de Montclos, Jean-Pierre Flandrois

Pathologie Biologie . 40 ( 5 ) : 495-9

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Gram-positive infections in neutropenic patients: glycopeptide antibiotic choice

Monique Chomarat, Daniel Espinouse, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 29 ( 4 ) : 462-463

DOI: 10.1093/jac/29.4.462

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Comparative variation of morphological and molecular evolution through geologic time: 28S ribosomal RNA versus morphology in echinoids.

Andrew B. Smith, Bénédicte Lafay, Richard Christen

Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences (1934–1990) . 338 ( 1286 ) : 365-82

DOI: 10.1098/rstb.1992.0155

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Phylogenetic analysis of the pathogenic anaerobe Clostridium perfringens using the 16S rRNA nucleotide sequence.

Bruno Canard, Thierry Garnier, Bénédicte Lafay, Richard Christen, Stewart T. Cole

International Journal of Systematic Bacteriology . 42 ( 2 ) : 312-4

DOI: 10.1099/00207713-42-2-312

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Insect muscle actins differ distinctly from invertebrate and vertebrate cytoplasmic actins

N. Mounier, Manolo Gouy, Dominique Mouchiroud, J.C. Prudhomme

Journal of Molecular Evolution . 34 : 406-415

DOI: 10.1007/BF00162997

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Evolution of the primate beta-globin gene region: nucleotide sequence of the delta-beta-globin intergenic region of gorilla and phylogenetic relationships between African apes and man

P. Perrin-Pecontal, Manolo Gouy, V.M. Nigon, G. Trabuchet

Journal of Molecular Evolution . 34 : 17-30

DOI: 10.1007/BF00163849

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Monod's bacterial growth model revisited

J.R. Lobry, Jean-Pierre Flandrois, G. Carret, A. Pavé

Bulletin of Mathematical Biology . 54(1) : 117-122

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Maintenance requirements of Escherichia coli ATCC 25922 in the presence of sub-inhibitory concentrations of various antibiotics

J.R. Lobry, G. Carret, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 29 : 121-127

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Marinobacter hydrocarbonoclasticus gen. nov., sp. nov., a new, extremely halotolerant, hydrocarbon-degrading marine bacterium.

Michel J. Gauthier, Bénédicte Lafay, Richard Christen, Luis Fernandez, M. Acquaviva, Patricia Bonin...

International Journal of Systematic Bacteriology . 42 ( 4 ) : 568-76

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An analysis of partial 28S ribosomal RNA sequence suggests early radiations of sponges

Bénédicte Lafay, Nicole Boury-Esnault, Jean Vacelet, Richard Christen

BioSystems . 28 : 139-151

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A FORTRAN subroutine for the determination of parameter confidence limits in non-linear Models

J.R. Lobry, L. Rosso, Jean-Pierre Flandrois

Binary . 3 : 86-93

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Susceptibility to Aminoglycosides of 63 Strains of Stomatococcus mucilaginosus Isolated from Sputum

Monique Chomarat, Marie-Gabrielle Vital, Jean-Pierre Flandrois

Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology . 276 ( 1 ) : 63-67

DOI: 10.1016/S0934-8840(11)80219-7

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[Expert systems and antibiotic sensitivity test].

Jean-Pierre Flandrois, G. Carret

Annales de Biologie Clinique . 49 ( 3 ) : 166-71

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Coagulase-negative staphylococci emerging during teicoplanin therapy and problems in the determination of their sensitivity

Monique Chomarat, Daniel Espinouse, Jean-Pierre Flandrois

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 27 ( 4 ) : 475-480

DOI: 10.1093/jac/27.4.475

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Identification des organismes et construction de phylogénies moléculaires par comparaison de séquences d'acides nucléiques

Richard Christen, Bénédicte Lafay, Philippe Elbaze, Valérie Boivin, Valérie O. Cilia

Océanis : Série de documents océanographiques . 17 ( 3 ) : 239-256

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Regulation of the acetate operon in Escherichia coli: purification and functional characterization of the IclR repressor.

Jc Cortay, D. Negre, A. Galinier, B. Duclos, G. Perriere, Aj Cozzone

EMBO Journal . 10 : 675-679

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Primary structure of the intergenic region between aceK and iclR in the Escherichia coli chromosome.

A. Galinier, F. Bleicher, D. Negre, G. Perriere, B. Duclos, Aj Cozzone...

Gene . 97 : 149-150

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Comparison of estimates of Monod's growth model from the same data set

J.R. Lobry, Jean-Pierre Flandrois

Binary . 3 : 20-23

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Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 39 : 446-450

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Etude sur quatre ans des cas de yersiniose dans un service d'hépato-gastro-entérologie de la région lyonnaise

Jean-Pierre Flandrois, F. Bailly, M. Peyret, L. Descos

Médecine et Maladies Infectieuses . 21 : 371-375

DOI: 10.1016/S0399-077X(05)81308-3

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[Influence of the culture medium (Isosensitest or Mueller-Hinton) on the results of antibiotics susceptibility testing and its interpretation].

Jean-Pierre Flandrois, M. Peyret, J Zindel

Pathologie Biologie . 39 ( 5 ) : 455-60

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[Time-killing curves of Pseudomonas aeruginosa strains exposed to polymyxin B].

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 39 ( 5 ) : 446-50

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Biphasic kinetics of bacterial killing by quinolones

G. Carret, Jean-Pierre Flandrois, Jean R Lobry

Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 27 ( 3 ) : 319-327

DOI: 10.1093/jac/27.3.319

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Preparation of a Latex Reagent for the Detection of Anti-Staphylococcus aureus Ribitol Teichoic Acid Antibodies

Michèle de Montclos, Jean-Pierre Flandrois

Zentralblatt fur Bakteriologie, Mikrobiologie, und Hygiene. Series A, Medical microbiology, infectious diseases, virology, parasitology . 274 ( 1 ) : 50-60

DOI: 10.1016/S0934-8840(11)80974-6

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[Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins].

M. Peyret, G. Carret, C. Carré, G. Fardel, Jean-Pierre Flandrois

Pathologie Biologie . 38 ( 5 ) : 441-5

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Mathematical study of the sensitivity curves of Escherichia coli exposed to polymyxins

M. Peyret, Jean-Pierre Flandrois, G. Fardel

Pathologie Biologie . 38 : 441-445

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