Ecologie Evolutive

Le département d'Ecologie Evolutive rassemble des compétences complémentaires en écologie comportementale, dynamique des populations, biologie des populations, écologie communautaire et méthodologie (statistiques et modélisation). Les recherches menées dans le département visent à étudier la façon dont les espèces animales évoluent dans un environnement variable en comprenant les causes de l'évolution des traits, des adaptations et des interactions. Pour cela, nous considérons différents niveaux d'organisation : individus, populations, communautés. Comme les organismes ne peuvent pas être considérés comme isolés des autres facteurs biotiques, nous considérons les pathogènes mais aussi les espèces en compétition au sein des communautés.

Nous étudions comment les individus s'adaptent à leur environnement qui est largement impacté par les pressions anthropiques, et comment les traits d’histoire de vie et le comportement évoluent en réponse à ces pressions. Bien que nous nous intéresserons principalement au phénotype, nous considérons de plus en plus le lien mécaniste entre le génotype et le phénotype. Nous développons le cadre théorique de notre discipline par une approche conceptuelle et de modélisation. En parallèle, nous testons les hypothèses qui découlent des prédictions théoriques par des approches expérimentales, comparatives et observationnelles sur différents modèles biologiques (insectes, oiseaux, mammifères). Les approches expérimentales sont développées en laboratoire (modèles insectes) et en milieu naturel (modèles oiseaux, insectes et mammifères). Les études observationnelles et comparatives concernent principalement les vertébrés. Nos approches s'intéressent également, et de plus en plus, aux mécanismes des réponses adaptatives. En plus des approches classiques d'analyse démographique et de changement de traits, des méthodes d'écophysiologie, d'écologie chimique et de biologie moléculaire sont utilisées.

Notre département porte également plusieurs suivis à long terme sur les populations sauvages de différentes espèces. Ces études à long terme offrent un moyen précieux de comprendre comment les facteurs biotiques et abiotiques affectent les traits d’histoire de vie des individus, et le fonctionnement des populations naturelles. Cinq populations d'espèces de mammifères sont ainsi suivies depuis plusieurs années (plus de 40 ans pour les chevreuils, 30 ans pour les marmottes des Alpes, 25 ans pour les chats, 16 ans pour les zèbres et 20 ans pour les impalas). Deux de nos sites d'étude, La Sassière dans le Parc national de la Vanoise (marmottes des Alpes) et le Parc national du Hwange, ont été certifiés "Site d'Etude en Ecologie Globale" (SEEG), et deux (ZA "Hwange" et ZA "Antarctique et sub-Antarctique") ont été certifiés "Zone Atelier" par le CNRS.

Le département d'écologie évolutive est également largement impliqué dans les activités de formation. Enfin, nous avons également des relations socio-économiques fortes. Nous abordons des questions d'intérêt sociétal majeur (réchauffement climatique, santé publique) et nous collaborons donc étroitement avec des partenaires socio-économiques (Office Français de la Biodiversité, Parc National de la Vanoise, Parc National de Hwange au Zimbabwe, Office National des Forêts, etc.) et participons à des événements grand public et médiatiques.

Publications

Affichage des publications 961 à 990 sur 2315 au total

An R package for analyzing survival using continuous-time open capture-recapture models

D. Fouchet, H. Santin-Janin, F. Sauvage, Ng. Yoccoz, D. Pontier

Methods in Ecology and Evolution . 7 : 518-528

DOI: 10.1111/2041-210x.12497

2016

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Network Analysis Shows Asymmetrical Flows within a Bird Metapopulation

Emilio R. Rojas, Cédric Sueur, Pierre-Yves Henry, Blandine Doligez, Gérard Wey, Olivier Dehorter...

PLoS ONE . 11 ( 11 ) : e0166701

DOI: 10.1371/journal.pone.0166701

2016

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Low but contrasting neutral genetic differentiation shaped by winter temperature in European great tits

Mélissa Lemoine, Kay Lucek, Charles Perrier, Verena Saladin, Frank Adriaensen, Emilio Barba...

Biological Journal of the Linnean Society . 118 ( 3 ) : 668-685

DOI: 10.1111/bij.12745

2016

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Effect of an anti-malaria drug on behavioural performance on a problem-solving task: An experiment in wild great tits

L. Cauchard, B. Angers, N. J. Boogert, Blandine Doligez

Behavioural Processes . 133 : 24-30

DOI: 10.1016/j.beproc.2016.10.012

2016

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Molecular phylogeny of the highly diversified catfish subfamily Loricariinae (Siluriformes, Loricariidae) reveals incongruences with morphological classification

R. Covain, S. Fisch-Muller, C. Oliveira, J. H. Mol, J. I. Montoya-Burgos, Stéphane Dray

Molecular Phylogenetics and Evolution . 94 : 492-517

DOI: 10.1016/j.ympev.2015.10.018

2016

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Inferring the timing of territoriality and rut in male roe deer from movements?

Nicolas Morellet, Christophe Bonenfant, Vincent Miele, Marco Heurich, Stefano Focardi

8. EURODEER meeting .

2016

Acte de congrès

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Mate choice for neutral and MHC genetic characteristics in Alpine marmots: different targets in different contexts?

Mariona Ferrandiz-Rovira, Dominique Allainé, Marie-Pierre Callait-Cardinal, Aurélie Cohas

Ecology and Evolution . 6 ( 13 ) : 4243-4257

2016

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Contemporary variations of immune responsiveness during range expansion of two invasive rodents in Senegal

Christophe Diagne, Emmanuelle Gilot-Fromont, Stéphane Cornet, Laëtitia Husse, Souleymane Doucouré, Ambroise Dalecky...

Oikos . 126 ( 3 ) : 435 - 446

DOI: 10.1111/oik.03470

2016

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A nonlethal sampling method to obtain, generate and assemble whole blood transcriptomes from small, wild mammals

Z Huang, Aurore Gallot, Nga Lao, Sébastien Puechmaille, Nicole Foley, D Jebb...

Molecular Ecology Resources . 16 ( 1 ) : 150 - 162

DOI: 10.1111/1755-0998.12447

2016

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Trophic interactions may reverse the demographic consequences of inbreeding

Anaïs Bompard, Isabelle Amat, Xavier Fauvergue, Thierry Spataro

Ecology . 97 ( 11 ) : 3131 - 3142

DOI: 10.1002/ecy.1544

2016

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Age-specific survival in the socially monogamous alpine marmot (Marmota marmota): evidence of senescence

V. Berger, J. F. Lemaître, Pierre Dupont, D. Allainé, J. M. Gaillard, A. Cohas

Journal of Mammalogy . 97 : 992-1000

DOI: 10.1093/jmammal/gyw028

2016

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Effects of daily fluctuating temperatures on the Drosophila–Leptopilina boulardi parasitoid association

Emilie Delava, Frédéric Fleury, Patricia Gibert

Journal of Thermal Biology . 60 : 95 - 102

DOI: 10.1016/j.jtherbio.2016.06.012

2016

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Phylogeny and adaptation shape the teeth of insular mice

Ronan Ledevin, Pascale Chevret, Guila Ganem, Janice Britton-Davidian, Emilie A Hardouin, Jean-Louis Chapuis...

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 283 ( 1824 ) : 20152820

DOI: 10.1098/rspb.2015.2820

2016

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Interactive vocal communication at the nest by parent Great Tits Parus major

Ingrid C. A. Boucaud, Pénélope A. Valère, Mélissa L. N. Aguirre Smith, Blandine Doligez, Laure Cauchard, Fanny Rybak...

Ibis . 158 ( 3 ) : 630-644

DOI: 10.1111/ibi.12374

2016

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Interspecific interference competition at the resource patch scale: do large herbivores spatially avoid elephants while accessing water?

Nicolas Ferry, Stéphane Dray, Hervé Fritz, Marion Valeix

Journal of Animal Ecology . 85 ( 6 ) : 1574-1585

DOI: 10.1111/1365-2656.12582

2016

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Phylogeography of Toxoplasma gondii points to a South American origin.

Emilie Bertranpetit, Thibaut Jombart, Emmanuel Paradis, Hilda Pena, Jitender Dubey, Chunlei Su...

Infection, Genetics and Evolution . 48 : 150-155

DOI: 10.1016/j.meegid.2016.12.020

2016

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All or nothing: Survival, reproduction and oxidative balance in Spotted Wing Drosophila (Drosophila suzukii) in response to cold

Christophe Plantamp, Katleen Salort, Patricia Gibert, Adeline Dumet, Gladys Mialdea, Nathalie Mondy...

Journal of Insect Physiology . 89 : 28-36

DOI: 10.1016/j.jinsphys.2016.03.009

2016

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Reproductive costs in terrestrial male vertebrates: insights from bird studies

Josefa Bleu, Marlène Gamelon, Bernt-Erik Saether

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences . 283 ( 1823 )

DOI: 10.1098/rspb.2015.2600

2016

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Ecophysiological responses of Gammarus pulex to the combined effects of temperature and ammonia

Youn Henry, Christophe Piscart, Hervé Colinet, Sandrine Charles

26th Annual Meeting SETAC Europe .

2016

Poster

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Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Sandrine Charles, Virginie Ducrot, Didier Azam, Rachel Benstead, Denise Brettschneider, Karel de Schamphelaere...

Regulatory Toxicology and Pharmacology . 81 : 47-56

DOI: 10.1016/j.yrtph.2016.07.012

2016

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Modelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm

Dominique Lamonica, Bernard Clement, Sandrine Charles, Christelle Lopes

Ecotoxicology and Environmental Safety . 128 : 252-65

DOI: 10.1016/j.ecoenv.2016.02.008

2016

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Influence of oxidative homeostasis on bacterial density and cost of infection in Drosophila–Wolbachia symbioses

David Monnin, Natacha Kremer, C. Berny, Hélène Henri, Adeline Dumet, Yann Voituron...

Journal of Evolutionary Biology . 29 : 1211-1222

DOI: 10.1111/jeb.12863

2016

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Linking demographic responses and life history tactics from longitudinal data in mammals

Marlène Gamelon, Jm. Gaillard, O. Gimenez, T. Coulson, S. Tuljapurkar, E. Baubet

Oikos . 125 ( 3 ) : 395--404

DOI: 10.1111/oik.02582

2016

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Invasion speeds of Triatoma dimidiata, vector of Chagas disease: An application of orthogonal polynomials method

Mohammed Mesk, Tewfik Mahdjoub, Sébastien Gourbière, Jorge E. Rabinovich, Frédéric Menu

Journal of Theoretical Biology . 395 : p. 126–143

DOI: 10.1016/j.jtbi.2016.01.017

2016

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The host specificity of ape malaria parasites can be broken in confined environments

Barthélémy Ngoubangoye, Larson Boundenga, Céline Arnathau, Illich Manfred Mombo, Durand Patrick, Thierry-Audrey Tsoumbou...

International Journal for Parasitology . 46 ( 11 ) : 737-744

DOI: 10.1016/j.ijpara.2016.06.004

2016

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Quantifying the role of weather on seasonal influenza

M. Roussel, D. Pontier, J.M. Cohen, B. Lina, D. Fouchet

BMC Public Health . 16 : 441

DOI: 10.1186/s12889-016-3114-x

2016

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Le raisonnement évolutionniste en médecine

Luc. Périno, Jean-François Lemaître, D. Pontier

Médecine . : 122-127

DOI: 10.1684/med.2016.35

2016

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Morphological response of planktic foraminifers to habitat modifications associated with the emergence of the Isthmus of Panama

D.N. Schmidt, A.G.M. Caromel, O. Seki, J.W.B. Rae, Sabrina Renaud

Marine Micropaleontology . 128 : 28-38

DOI: 10.1016/j.marmicro.2016.08.003

2016

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Selective disappearance of individuals with high levels of glycated haemoglobin in a free-living bird

Charlotte Récapet, Adélaïde Sibeaux, Laure Cauchard, Blandine Doligez, Pierre Bize

Biology Letters . 12 ( 8 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0243

2016

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Food supplementation mitigates dispersal-dependent differences in nest defence in a passerine bird

Charlotte Récapet, Grégory Daniel, Joëlle Taroni, Pierre Bize, Blandine Doligez

Biology Letters . 12 ( 5 )

DOI: 10.1098/rsbl.2016.0097

2016

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An R package for analyzing survival using continuous-time open capture-recapture models

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Low but contrasting neutral genetic differentiation shaped by winter temperature in European great tits

Effect of an anti-malaria drug on behavioural performance on a problem-solving task: An experiment in wild great tits

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Effects of daily fluctuating temperatures on the Drosophila–Leptopilina boulardi parasitoid association

Phylogeny and adaptation shape the teeth of insular mice

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Interspecific interference competition at the resource patch scale: do large herbivores spatially avoid elephants while accessing water?

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All or nothing: Survival, reproduction and oxidative balance in Spotted Wing Drosophila (Drosophila suzukii) in response to cold

Reproductive costs in terrestrial male vertebrates: insights from bird studies

Ecophysiological responses of Gammarus pulex to the combined effects of temperature and ammonia

Optimizing the design of a reproduction toxicity test with the pond snail Lymnaea stagnalis

Modelling algae-duckweed interaction under chemical pressure within a laboratory microcosm

Influence of oxidative homeostasis on bacterial density and cost of infection in Drosophila–Wolbachia symbioses

Linking demographic responses and life history tactics from longitudinal data in mammals

Invasion speeds of Triatoma dimidiata, vector of Chagas disease: An application of orthogonal polynomials method

The host specificity of ape malaria parasites can be broken in confined environments

Quantifying the role of weather on seasonal influenza

Le raisonnement évolutionniste en médecine

Morphological response of planktic foraminifers to habitat modifications associated with the emergence of the Isthmus of Panama

Selective disappearance of individuals with high levels of glycated haemoglobin in a free-living bird

Food supplementation mitigates dispersal-dependent differences in nest defence in a passerine bird

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